Changes to further standards compliance

Brought about by the use of extra compiler checks, notably by g95 and
the '-std=f2003 -fall-intrinsics' setting in gfortran.

Apart from syntax and visibility issues, non-standard declarations
such as "real*8" have been removed.

Also, the building of the MPI interfaces has been updated to properly
include 8-byte integers.

(Declarations in the code in Util are not fully updated yet)