Major cleanup of the readGeometry / loadCheckPoint / setSpatialDomain functions. 
- added consistency checks for spatial domain at loading of geometry or checkpoint
- added warning messages for attempts to change spatial domain when already set
- GeometryInfo setup of snapshot & checkpoint controllers ic changed from a "push" approach when setting the spatial domain to "pull" when instatiating the snapshot / checkpoint controller. 
- added warning message if snapshot / checkpoint controller is instantiated before spatial domain is set