Use Eigen2's newer StdVector implementation if it is available.

This should fix the build with libc++ (ie. recent versions of FreeBSD and OS
X at least), as Eigen2's default StdVector implementation reimplements
std::vector in an incompatible way.

Defining EIGEN_USE_NEW_STDVECTOR makes Eigen >= 2.0.6 use the new
implementation that does not have these problems and is the default in
Eigen3.