Further improve test independence.

Remove many test interdependencies by giving local window.flags variables
to modules that need it.

Use loadFixture everywhere instead of duplicating code, including in the
jujuTests.utils object itself.

Mark the remaining test interdependencies and defects, to be fixed later.

Remove a meaningless test at the bottom of test_startup.js.bottom .

Add removal of generated test_startup.js file to Makefile "clean" entry.

R=gary.poster, bac
CC=
https://codereview.appspot.com/10383047