~nipy-developers/nipy/fff2

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
GSL dependencies
================
gsl_vector_free                    ---> 153
gsl_vector_get                     ---> 151
gsl_matrix_get                     ---> 138
gsl_vector_alloc                   ---> 100
gsl_matrix_free                    ---> 98
gsl_vector_calloc                  ---> 96
gsl_vector_set                     ---> 87
gsl_vector_long_get                ---> 82
gsl_vector_memcpy                  ---> 80
gsl_vector_long_set                ---> 74
gsl_matrix_set                     ---> 72
gsl_matrix_calloc                  ---> 68
gsl_matrix_alloc                   ---> 49
gsl_matrix_memcpy                  ---> 44
gsl_vector_long_free               ---> 43
gsl_vector_long_alloc              ---> 42
gsl_vector_scale                   ---> 40
gsl_matrix_get_row                 ---> 37
gsl_vector_long_calloc             ---> 35
gsl_vector_set_zero                ---> 35
gsl_vector_add                     ---> 28
gsl_matrix_set_row                 ---> 22
gsl_vector_set_all                 ---> 21
gsl_matrix_set_zero                ---> 19
gsl_blas_daxpy                     ---> 19
gsl_matrix_long_get                ---> 18
gsl_vector_long_set_all            ---> 16
gsl_stats_mean                     ---> 13
gsl_matrix_add                     ---> 12
gsl_blas_ddot                      ---> 11
gsl_matrix_scale                   ---> 11
gsl_vector_sub                     ---> 11
gsl_vector_long_memcpy             ---> 9
gsl_matrix_row                     ---> 9
gsl_vector_long_set_zero           ---> 8
gsl_vector_add_constant            ---> 7
gsl_vector_mul                     ---> 7
gsl_vector_long_max                ---> 7
gsl_vector_div                     ---> 7
gsl_matrix_div_elements            ---> 6
gsl_matrix_mul_elements            ---> 6
gsl_blas_dgemv                     ---> 6
gsl_matrix_long_free               ---> 6
gsl_permutation_alloc              ---> 6
gsl_finite                         ---> 5
gsl_matrix_set_all                 ---> 5
gsl_rng_free                       ---> 5
gsl_sf_lngamma                     ---> 5
gsl_matrix_set_identity            ---> 4
gsl_ran_gaussian                   ---> 4
gsl_blas_dsymv                     ---> 4
gsl_rng_alloc                      ---> 4
gsl_rng_env_setup                  ---> 4
gsl_permutation_free               ---> 4
gsl_stats_variance_with_fixed_mean ---> 3
gsl_matrix_long_alloc              ---> 3
gsl_rng_set                        ---> 3
gsl_stats_absdev_m                 ---> 3
gsl_sort_vector_index              ---> 3
gsl_vector_long_min                ---> 3
gsl_sf_psi                         ---> 3
gsl_stats_sd_with_fixed_mean       ---> 3
gsl_sort_vector                    ---> 3
gsl_rng_uniform_int                ---> 3
gsl_isinf                          ---> 3
gsl_blas_dger                      ---> 3
gsl_matrix_column                  ---> 3
gsl_isnan                          ---> 3
gsl_matrix_long_calloc             ---> 3
gsl_matrix_get_col                 ---> 3
gsl_vector_long_add                ---> 3
gsl_matrix_set_col                 ---> 3
gsl_rng_uniform                    ---> 3
gsl_sort_vector_long               ---> 2
gsl_matrix_long_memcpy             ---> 2
gsl_linalg_SV_decomp               ---> 2
gsl_blas_dsyr2                     ---> 2
gsl_ran_gaussian_pdf               ---> 2
gsl_matrix_submatrix               ---> 2
gsl_block_free                     ---> 2
gsl_matrix_sub                     ---> 2
gsl_permutation_get                ---> 2
gsl_vector_max                     ---> 2
gsl_matrix_transpose_memcpy        ---> 2
gsl_matrix_svd                     ---> 2
gsl_vector_view_array              ---> 2
gsl_linalg_cholesky_decomp         ---> 2
gsl_matrix_view_array              ---> 2
gsl_pow_2                          ---> 2
gsl_blas_dgemm                     ---> 2
gsl_stats_variance                 ---> 2
gsl_block_long_free                ---> 2


In-house GSL-related routines
=============================
gsl_matrix_fromPyArray              ---> 38
gsl_vector_long_toPyArray           ---> 25
gsl_vector_fromPyArray              ---> 24
gsl_vector_toPyArray                ---> 22
gsl_matrix_toPyArray                ---> 20
gsl_vector_long_fromPyArray         ---> 15
gsl_vector_list_from_mxArray_delete ---> 7
gsl_vector_list_from_mxArray_new    ---> 5
_gsl_vector_fromPyArrayIter_update  ---> 4
gsl_matrix_const_toPyArray          ---> 3
_gsl_vector_fromPyArrayIter         ---> 3
_gsl_vector_fromPtr                 ---> 3
gsl_vector_from_mxArray             ---> 3
gsl_matrix_long_toPyArray           ---> 3
_gsl_vector_copy_fromPtr            ---> 3
gsl_matrix_long_fromPyArray         ---> 3
gsl_vector_long_const_toPyArray     ---> 2
_gsl_vector_toPyArrayIter_update    ---> 2
gsl_vector_const_toPyArray          ---> 2
gsl_matrix_long_const_toPyArray     ---> 2
gsl_vector_const_to_mxArray         ---> 1
gsl_vector_to_mxArray               ---> 0