fix some ADB device errors found in MEGA job testing

1) The test_app function needed updating because due to the way
shell scripts work, "set -e" can't be honored in that function.
eg: http://paste.ubuntu.com/6332997/

2) add retry logic for run-autopilot-tests.sh

We are seeing devices disappear for a bit after reboot. This
doesn't happen in production, but has been seen at home. Its likely
related to MTP coming up on the device which temporarily kills ADB.

Why it doesn't happen in production must be related to how the jobs
are structured slightly differently.

This includes a new "log_error" function. This makes it easier to
go back and see how often these flaky things are happening. eg:

  http://10.97.9.20:8080/job/tmp-trusty-touch-mako/5/artifact/clientlogs/runner-errors.txt/*view*/

That test had to be repeated for some odd reason.

3) reboot-and-wait should make sure device is online first:
example failure w/o the fix:

  http://10.97.9.20:8080/job/tmp-trusty-touch-mako/2/console