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Viewing changes to debian/tigr-glimmer.1

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Andreas Tille, Charles Plessy, Andreas Tille
  • Date: 2008-04-22 11:59:07 UTC
  • mfrom: (3.1.1 lenny)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080422115907-rpsy3kgts0vu6lxq
Tags: 3.02-1
http://bugs.debian.org/385258
[ Charles Plessy ]
* debian/watch:
  - Replaced by the new one written by Nelson (Closes: #385258)

[ Andreas Tille ]
*  New upstream version
* Group maintenance by Debian-Med team
  - DM-Upload-Allowed: Yes
  - Vcs tags
  - Use correct address as Uploader: Steffen Moeller <moeller@debian.org>
* Standards-Version: 3.7.3 (no changes needed)
* debhelper >= 5
* Moved Homepage from long description to control fields
* Removed [Biology] from short description

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added added

removed removed

Lines of Context:
debian/tigr-glimmer.1
 
1
.TH TIGR-GLIMMER 1 "April 16, 2008"
 
2
.SH NAME
 
3
tigr-glimmer \- runs various programs of the TIGR Glimmer suite
 
4
.SH SYNOPSIS
 
5
.B tigr-glimmer
 
6
.B program
 
7
[arguments]
 
8
.SH DESCRIPTION
 
9
This manual page documents briefly the
 
10
.B tigr-glimmer
 
11
wrapper to the TIGR Glimmer programs.
 
12
This manual page was written for the Debian GNU/Linux distribution
 
13
because upstream does not provide this wrapper and it was invented
 
14
for Debian to avoid conflicts with other packages that might cause
 
15
a name space polution.
 
16
.PP
 
17
\fBtigr-glimmer\fP is just a wrapper that invokes the various programs in
 
18
the TIGR Glimmer software package. You can get more detailed documentation
 
19
in /usr/share/doc/tigr-glimmer.  Please note that the documentation there
 
20
is a part of the former version Glimmer 2.  The version Glimmer 3 has
 
21
some features that were described in the notes.pdf document inside
 
22
the documentation directory.
 
23
.PP
 
24
The following programs are included: anomaly, build-fixed, build-icm,
 
25
entropy-profile, entropy-score, extract, glimmer3, long-orfs, multi-extract,
 
26
score-fixed, start-codon-distrib, test, uncovered and window-acgt.
 
27
.SH OPTIONS
 
28
There are no options.
 
29
.SH EXAMPLES
 
30
.IP tigr-glimmer\ build-icm
 
31
.IP tigr-glimmer\ long-orfs
 
32
.SH SEE ALSO
 
33
For the pre previously packaged version Glimmer2 some text files from
 
34
the documentation were turned to man pages for the Debian GNU/Linux
 
35
distribution by Steffen Moeller <moeller@debian.org>
 
36
.br
 
37
.SH AUTHORS
 
38
This manual page was written by Andreas Tille <tille@debian.org>, for
 
39
the Debian GNU/Linux system (but may be used by others).