~ubuntu-branches/ubuntu/utopic/ncbi-blast+/utopic

Viewing all changes in revision 5.

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Aaron M. Ucko, Aaron M. Ucko, Andreas Tille
  • Date: 2011-08-28 18:45:19 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20110828184519-9mz9mh6hg2osir8u
Tags: 2.2.25-4
[ Aaron M. Ucko ]
* Team upload.
* debian/patches/support_other_cpus: belatedly add a descriptive header.
* debian/patches/hurd_fixes: new; fix hurd-specific issues.
  (In conjunction with the following change, finally closes: #629656.)
* debian/control:
  - Build-Depends += libc0.3-dev (>= 2.13-9~) [hurd-i386] to avoid #630180.
  - Declare both binary packages as Multi-Arch: foreign.
* debian/patches/fix_lib_deps: new; ensure that all libraries link against
  all direct dependencies.  (Break the dependency loop between libxblast
  and libxalgoblastdbindex by having the former provide only the C++ BLAST
  API, leaving the C core only in libblast.)  (Closes: #633567.)
* debian/rules: tweak LDFLAGS, supplying -Wl,--as-needed across the
  board (as it is now safe to do so) and adding -Wl,--enable-new-dtags
  to allow LD_LIBRARY_PATH to override the private rpath.
* debian/patches/no_multiarch_rpath: new; avoid redundant rpath entries
  on multiarch systems (courtesy of overzealous logic to ensure
  executables will be able to find libstdc++.)

[ Andreas Tille ]
* Enhances: t-coffee (as stated in tasks file)

expand all expand all

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context: