~florian-rathgeber/fluidity/femtools-python-ctypes

This merge from element-numbering branch implements trace spaces as a 
mesh_type.
This required to change the interface of allocate_element to
allocate_element(element, ele_num, ngi, type, stat)
where ele_num is the element numbering type. Therefore I had to change the 
interface in various places.

Added trace spaces as a mesh type to mesh_options.rn*, and included it
as an option in shallow water options. This hasn't been included in
Fluidity yet (could do if there was a demand for it) so no changes to
fluidity_options.rn*.

Added Test_Trace_Space.F90 to tools, which tests allocating the mesh
in populate state from options, and then does some numbering checks on
the resulting field.

Bon appetit!