← Back to branch summary

~kovalp/siesta/4.0

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Tests/Reference/TranSiesta-TBTrans/ts_fast/ts_fast_elec.out

  • Committer: Nick Papior
  • Date: 2018-06-15 20:21:25 UTC
  • Revision ID: nickpapior@gmail.com-20180615202125-400x08iaa2v85250
Updated all Transiesta+TBtrans tests for 4.0

Since this 4.0 update implements new tabulated values
a lot of the tests changed values.

This commit only deals with TranSiesta+TBtrans tests.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Tests/Reference/TranSiesta-TBTrans/ts_fast/ts_fast_elec.out
1
 
Siesta Version: siesta-trunk-479
2
 
Architecture  : atto-intel12-openmpi
3
 
Compiler flags: /share/apps/openmpi-1.6.5-intel/bin/mpif90 -w  -O2 -mp
4
 
PP flags      : -DCDF -DMPI -DTRANSIESTA  -DTRANSIESTA
 
1
Siesta Version  : siesta-4.0--578
 
2
Architecture    : x86_64-linux-n-62-25-35
 
3
Compiler version: GNU Fortran (GCC) 7.3.0
 
4
Compiler flags  : mpif90 -m64 -fPIC -O3 -march=native -ftree-vectorize -fexpensive-optimizationns -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fno-second-underscore
 
5
PP flags        : -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/build-tools/1.0/include -I/zdatta/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/zlib/1.2.11/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/numactl/2.0.11/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/libxml2/2.9.7/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hwloc/1.11.9/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openmpi/3.0.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/szip/2.1.1/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hdf5-serial/1.8.18/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/netcdf-serial/4.6.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/scalapack/204/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openblas/0.2.20/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/elpa/2017.05.003/gnu-7.3.0/include -DSIESTA__ELPA -DMPI -D1 -DFC_HAVE_ABORT -DCDF -DSIESTA__MRRR -DTRANSIESTA  -DTRANSIESTA
5
6
PARALLEL version
6
7
TRANSIESTA support
7
8
NetCDF support
8
9
 
9
 
* Running on    4 nodes in parallel
10
 
>> Start of run:   3-OCT-2015   4:59:53
 
10
* Running on    8 nodes in parallel
 
11
>> Start of run:  13-JUN-2018  22:48:40
11
12
 
12
13
                           ***********************       
13
14
                           *  WELCOME TO SIESTA  *       
131
132
               qyuk:    0.0000    
132
133
               qwid:   0.10000E-01
133
134
                rcs:    0.0000    
134
 
            lambdas:   1.00000    
 
135
            lambdas:    1.0000    
135
136
-------------------------------------------------------------------------------
136
137
L=0  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
137
138
L=1  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
239
240
redata: Number of Atomic Species         =        1
240
241
redata: Charge density info will appear in .RHO file
241
242
redata: Write Mulliken Pop.              =     Atomic and Orbital charges
242
 
redata: Mesh Cutoff                      =   350.0000  Ry
 
243
redata: Matel table size (NRTAB)         =     1024
 
244
redata: Mesh Cutoff                      =   350.0000 Ry
243
245
redata: Net charge of the system         =     0.0000 |e|
244
246
redata: Min. number of SCF Iter          =        0
245
247
redata: Max. number of SCF Iter          =      300
317
319
New_DM. Step:     1
318
320
Initializing Density Matrix...
319
321
New grid distribution:   1
320
 
           1       1:   15    1:    8    1:   23
321
 
           2       1:   15    1:    8   24:   45
322
 
           3       1:   15    9:   15    1:   23
323
 
           4       1:   15    9:   15   24:   45
 
322
           1       1:   15    1:    8    1:   12
 
323
           2       1:   15    1:    8   13:   23
 
324
           3       1:   15    1:    8   24:   34
 
325
           4       1:   15    1:    8   35:   45
 
326
           5       1:   15    9:   15    1:   12
 
327
           6       1:   15    9:   15   13:   23
 
328
           7       1:   15    9:   15   24:   34
 
329
           8       1:   15    9:   15   35:   45
324
330
 
325
331
InitMesh: MESH =    30 x    30 x    90 =       81000
326
332
InitMesh: (bp) =    15 x    15 x    45 =       10125
327
333
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =   350.000   388.144 Ry
328
 
ExtMesh (bp) on 0 =    67 x    60 x    79 =      317580
 
334
ExtMesh (bp) on 0 =    67 x    60 x    68 =      273360
329
335
New grid distribution:   2
330
 
           1       1:   15    1:   15   12:   23
331
 
           2       1:   15    1:   15   24:   35
332
 
           3       1:   15    1:   15    1:   11
333
 
           4       1:   15    1:   15   36:   45
 
336
           1       1:   15    1:    8    1:   11
 
337
           2       1:   15    1:    9   12:   23
 
338
           3       1:   15   10:   15   12:   23
 
339
           4       1:   15    1:    6   24:   35
 
340
           5       1:   15    9:   15    1:   11
 
341
           6       1:   15    1:    7   36:   45
 
342
           7       1:   15    7:   15   24:   35
 
343
           8       1:   15    8:   15   36:   45
334
344
New grid distribution:   3
335
 
           1       1:   15    1:   15    1:   12
336
 
           2       1:   15    1:   15   24:   34
337
 
           3       1:   15    1:   15   13:   23
338
 
           4       1:   15    1:   15   35:   45
 
345
           1       1:   15    1:    8    1:   12
 
346
           2       1:   15    9:   15    1:   12
 
347
           3       1:   15    1:    8   24:   34
 
348
           4       1:   15    9:   15   13:   23
 
349
           5       1:   15    1:    8   13:   23
 
350
           6       1:   15    1:    8   35:   45
 
351
           7       1:   15    9:   15   24:   34
 
352
           8       1:   15    9:   15   35:   45
339
353
Setting up quadratic distribution...
340
 
ExtMesh (bp) on 0 =    67 x    67 x    68 =      305252
341
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 2700
342
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                 6733
 
354
ExtMesh (bp) on 0 =    67 x    60 x    67 =      269340
 
355
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1320
 
356
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                 3435
343
357
 
344
358
stepf: Fermi-Dirac step function
345
359
 
346
360
siesta: Program's energy decomposition (eV):
347
 
siesta: Ebs     =       -16.713637
 
361
siesta: Ebs     =       -16.713642
348
362
siesta: Eions   =        59.121965
349
363
siesta: Ena     =        14.419061
350
364
siesta: Ekin    =        42.916678
358
372
siesta: Emeta   =         0.000000
359
373
siesta: Emolmec =         0.000000
360
374
siesta: Ekinion =         0.000000
361
 
siesta: Eharris =       -36.732873
 
375
siesta: Eharris =       -36.732878
362
376
siesta: Etot    =       -34.486372
363
377
siesta: FreeEng =       -34.486680
364
378
 
365
379
   scf: iscf   Eharris(eV)      E_KS(eV)   FreeEng(eV)    dDmax  Ef(eV)
366
380
   scf:    1      -36.7329      -34.4864      -34.4867  0.22280 -4.5609
367
 
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       0.061  10.87
 
381
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       0.014   8.05
368
382
   scf:    2      -36.7330      -34.5538      -34.5541  0.21611 -4.5640
369
383
   scf:    3      -36.7349      -36.7349      -36.7352  0.00000 -4.6627
370
384
 
371
385
SCF Convergence by dMax criterion
372
 
max |DM_out - DM_in|:     0.00000275
 
386
max |DM_out - DM_in|:     0.00000265
373
387
SCF cycle converged after    3 iterations
374
388
 
375
389
Using DM_out to compute the final energy and forces
387
401
----------------------------------------
388
402
   Max    0.000000    constrained
389
403
 
390
 
Stress-tensor-Voigt (kbar):      131.59      131.59      137.65        0.00        0.00        0.00
391
 
(Free)E + p*V (eV/cell)      -41.1536
 
404
Stress-tensor-Voigt (kbar):      131.52      131.52      137.57        0.00        0.00        0.00
 
405
(Free)E + p*V (eV/cell)      -41.1511
392
406
Target enthalpy (eV/cell)      -36.7352
393
 
 
 
407
 
394
408
mulliken: Atomic and Orbital Populations:
395
409
 
396
410
Species: H                   
654
668
 246  1  -4.02  -4.02  -4.02
655
669
 247  1  -5.47  -5.36  -3.88
656
670
 248  1  -5.62  -5.17  -3.92
657
 
 249  1  -5.49  -5.33  -3.89
 
671
 249  1  -5.50  -5.33  -3.89
658
672
 250  1  -5.60  -5.20  -3.91
659
673
 251  1  -4.02  -4.02  -4.02
660
674
 252  1  -5.60  -5.20  -3.91
661
675
 253  1  -7.39  -7.22  -4.91
662
 
 254  1  -5.49  -5.33  -3.89
 
676
 254  1  -5.50  -5.33  -3.89
663
677
 255  1  -4.02  -4.02  -4.02
664
 
 256  1  -5.49  -5.33  -3.89
 
678
 256  1  -5.50  -5.33  -3.89
665
679
 257  1  -5.60  -5.20  -3.91
666
680
 258  1  -5.52  -5.30  -3.89
667
681
 259  1  -5.57  -5.24  -3.90
681
695
 273  1  -4.02  -4.02  -4.02
682
696
 274  1  -5.55  -5.27  -3.90
683
697
 275  1  -5.55  -5.27  -3.90
684
 
siesta: Fermi energy =      -4.662672 eV
 
698
siesta: Fermi energy =      -4.662670 eV
685
699
 
686
700
siesta: Program's energy decomposition (eV):
687
 
siesta: Ebs     =       -17.024015
 
701
siesta: Ebs     =       -17.024020
688
702
siesta: Eions   =        59.121965
689
703
siesta: Ena     =        14.419061
690
 
siesta: Ekin    =        39.410739
 
704
siesta: Ekin    =        39.410734
691
705
siesta: Enl     =       -10.693960
692
 
siesta: DEna    =         0.511166
 
706
siesta: DEna    =         0.511167
693
707
siesta: DUscf   =         0.008294
694
708
siesta: DUext   =         0.000000
695
709
siesta: Exc     =       -21.268189
698
712
siesta: Emeta   =         0.000000
699
713
siesta: Emolmec =         0.000000
700
714
siesta: Ekinion =         0.000000
701
 
siesta: Eharris =       -36.734854
702
 
siesta: Etot    =       -36.734854
703
 
siesta: FreeEng =       -36.735162
 
715
siesta: Eharris =       -36.734859
 
716
siesta: Etot    =       -36.734859
 
717
siesta: FreeEng =       -36.735166
704
718
 
705
719
siesta: Final energy (eV):
706
 
siesta:  Band Struct. =     -17.024015
707
 
siesta:       Kinetic =      39.410739
 
720
siesta:  Band Struct. =     -17.024020
 
721
siesta:       Kinetic =      39.410734
708
722
siesta:       Hartree =       5.773411
709
723
siesta:    Ext. field =       0.000000
710
724
siesta:   Exch.-corr. =     -21.268189
711
725
siesta:  Ion-electron =     -40.257024
712
726
siesta:       Ion-ion =     -20.393790
713
727
siesta:       Ekinion =       0.000000
714
 
siesta:         Total =     -36.734854
 
728
siesta:         Total =     -36.734859
715
729
 
716
730
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
717
 
siesta:     0.082133    0.000000    0.000000
718
 
siesta:     0.000000    0.082133    0.000000
719
 
siesta:     0.000000    0.000000    0.085912
 
731
siesta:     0.082086    0.000000    0.000000
 
732
siesta:     0.000000    0.082086    0.000000
 
733
siesta:     0.000000    0.000000    0.085863
720
734
 
721
735
siesta: Cell volume =         52.983633 Ang**3
722
736
 
723
737
siesta: Pressure (static):
724
738
siesta:                Solid            Molecule  Units
725
 
siesta:          -0.00090825         -0.00090825  Ry/Bohr**3
726
 
siesta:          -0.08339285         -0.08339285  eV/Ang**3
727
 
siesta:        -133.61151283       -133.61151551  kBar
728
 
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =         -36.580434
729
 
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =         -36.580434
730
 
>> End of run:   3-OCT-2015   4:59:54
 
739
siesta:          -0.00090774         -0.00090774  Ry/Bohr**3
 
740
siesta:          -0.08334537         -0.08334537  eV/Ang**3
 
741
siesta:        -133.53544229       -133.53544497  kBar
 
742
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =         -36.580439
 
743
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =         -36.580439
 
744
>> End of run:  13-JUN-2018  22:48:40
 
745
Job completed