~ubuntu-branches/debian/sid/pftools/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/coils.prf

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2017-03-31 14:01:39 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20170331140139-povxg86r196gejfa
Tags: upstream-3+dfsg
ImportĀ upstreamĀ versionĀ 3+dfsg

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
ID   COILS; MATRIX.
 
2
AC   PS60001;
 
3
DE   Coiled-coil region.
 
4
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=7; TOPOLOGY=CIRCULAR; 
 
5
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=7; 
 
6
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6890; R2=0.03483765; TEXT='NScore'; 
 
7
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=153; N_SCORE=6.0; MODE=1; 
 
8
MA   /DEFAULT: E0=0; B0=0; D=-50; I=-50; B1=0; E1=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; M0=-5; I0=-50;
 
9
MA   /M: SY='a'; M=-2,-16,3,-13,-27,0,-4,-2,14,-7,9,10,-7,-3,-18,-7,-6,-7,6,-3,6,-16;
 
10
MA   /M: SY='b'; M=-2,8,-6,7,4,-4,-3,-2,-7,3,-12,-6,-2,-2,2,-2,-1,-4,-4,-3,-6,1;
 
11
MA   /M: SY='c'; M=-4,4,-2,2,0,-1,-1,-2,-6,-1,-11,-8,3,-3,2,0,0,-3,-5,-3,-6,3;
 
12
MA   /M: SY='d'; M=7,-14,-2,-12,-22,1,-4,0,-1,-13,24,2,-17,-3,-13,-16,-5,-2,0,4,8,-14;
 
13
MA   /M: SY='e'; M=-10,1,-5,-7,19,-4,-3,-5,-6,2,-10,-6,-2,-3,5,0,-2,0,-6,-4,-5,1;
 
14
MA   /M: SY='f'; M=-2,1,-2,2,-3,-4,-1,-2,-6,-2,-10,-7,5,-3,1,3,-1,-3,-5,-3,-6,3;
 
15
MA   /M: SY='g'; M=-6,1,-5,0,8,-5,-4,-4,-7,1,-9,-6,2,-3,5,1,-4,-1,-5,-4,-6,3;
 
16
//