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  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Barry deFreese
  • Date: 2006-07-19 23:28:07 UTC
  • mfrom: (1.1.5 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20060719232807-et3cdmcjgmnyleyx
Tags: 6.1.20060507-3ubuntu1
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--$Revision: 6.0 $
 
1
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2
2
--**********************************************************************
3
3
--
4
4
--  Biological Macromolecule 3-D Structure Data Types for MMDB,
176
176
BEGIN
177
177
 
178
178
EXPORTS Biostruc-graph, Biomol-descr, Residue-graph,
179
 
        Molecule-id, Residue-id, Atom-id;
 
179
        Molecule-id, PCSubstance-id, Residue-id, Atom-id;
180
180
 
181
181
IMPORTS Pub FROM NCBI-Pub
182
182
        BioSource FROM NCBI-BioSource
269
269
        descr                   SEQUENCE OF Biomol-descr OPTIONAL,
270
270
        seq-id                  Seq-id OPTIONAL,
271
271
        residue-sequence        SEQUENCE OF Residue,
272
 
        inter-residue-bonds     SEQUENCE OF Inter-residue-bond OPTIONAL }
 
272
        inter-residue-bonds     SEQUENCE OF Inter-residue-bond OPTIONAL, 
 
273
        sid                     PCSubstance-id OPTIONAL }
273
274
   
274
275
Molecule-id ::= INTEGER
275
276
 
 
277
-- Pubchem substance id
 
278
 
 
279
PCSubstance-id ::= INTEGER
 
280
 
276
281
-- Residues may be assigned a text-string name as well as an id number. PDB 
277
282
-- assigned residue numbers appear as the residue name.
278
283