~ubuntu-branches/ubuntu/intrepid/ncbi-tools6/intrepid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to api/seqport.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2008-03-19 19:42:00 UTC
  • mfrom: (1.1.8 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080319194200-7t0o0fgni3pijh1x
Tags: 6.1.20080302-1
* New upstream release
* debian/lib{ncbi6,vibrant6a}.symbols: update and clean up.
* debian/lib{ncbi,vibrant}6-dev.install: ship new headers.
* debian/ncbi-tools-bin.docs, doc/man/tbl2asn.1: belatedly ship
  tbl2asn.txt, and restore tbl2asn.1's reference thereto.
* doc/man/*.1: correct usage of ' and -.
* doc/man/{blast,cleanasn,nps2gps,tbl2asn}.1: resync with help output.
* debian/control: tighten dependencies between binary packages.
* debian/{control,rules}: require cdbs 0.4.51; drop workaround for #462130.
* debian/{control,rules,*.override}: rename Lintian overrides to
  $pkg.lintian-overrides and employ dh_lintian from debhelper (>= 6.0.7)
  in lieu of custom logic.
* debian/*.doc-base*: modernize (and correct) section assignments per
  doc-base 0.8.10: science -> Science/Biology, net -> System/Administration.
* debian/makemenu: drop obsolete Encoding key from generated .desktop files.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
29
29
*   
30
30
* Version Creation Date: 7/13/91
31
31
*
32
 
* $Revision: 6.58 $
 
32
* $Revision: 6.59 $
33
33
*
34
34
* File Description:  Ports onto Bioseqs
35
35
*
40
40
*
41
41
*
42
42
* $Log: seqport.h,v $
 
43
* Revision 6.59  2008/02/12 18:56:52  bollin
 
44
* Made ReverseSeqData and ComplementSeqData extern
 
45
*
43
46
* Revision 6.58  2007/05/30 18:10:06  kans
44
47
* added KNOWN_GAP_AS_PLUS to distinguish known-length from unknown-length gaps, use for validation
45
48
*
1059
1062
NLM_EXTERN FloatHi MolWtForStr (CharPtr str);
1060
1063
 
1061
1064
 
 
1065
 
 
1066
NLM_EXTERN Boolean LIBCALL ReverseSeqData (Uint1 seqtype, Int4 seqlen, SeqDataPtr sdp);
 
1067
NLM_EXTERN Boolean ComplementSeqData (Uint1 seqtype, Int4 seqlen, SeqDataPtr sdp);
 
1068
 
 
1069
 
1062
1070
#ifdef __cplusplus
1063
1071
}
1064
1072
#endif