← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/karmic/commons-math/karmic

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/test/org/apache/commons/math/stat/inference/OneWayAnovaTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-03-15 20:20:21 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090315202021-zto3nmvqgcf3ami4
Tags: upstream-1.2
Import upstream version 1.2

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/test/org/apache/commons/math/stat/inference/OneWayAnovaTest.java
 
1
/*
 
2
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
 
3
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
 
4
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
 
5
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
 
6
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
 
7
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
 
8
 * 
 
9
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 
10
 * 
 
11
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 
12
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
 
13
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
 
14
 * See the License for the specific language governing permissions and
 
15
 * limitations under the License.
 
16
 */
 
17
package org.apache.commons.math.stat.inference;
 
18
 
 
19
import junit.framework.Test;
 
20
import junit.framework.TestCase;
 
21
import junit.framework.TestSuite;
 
22
 
 
23
import java.util.ArrayList;
 
24
import java.util.List;
 
25
 
 
26
/**
 
27
 * Test cases for the OneWayAnovaImpl class.
 
28
 *
 
29
 * @version $Revision$ $Date$
 
30
 */
 
31
 
 
32
public class OneWayAnovaTest extends TestCase {
 
33
 
 
34
    protected OneWayAnova testStatistic = new OneWayAnovaImpl();
 
35
    
 
36
    private char[] wrongArray = { 'a', 'b', 'c' };
 
37
    private double[] emptyArray = {};
 
38
 
 
39
    private double[] classA =
 
40
            {93.0, 103.0, 95.0, 101.0, 91.0, 105.0, 96.0, 94.0, 101.0 };
 
41
    private double[] classB =
 
42
            {99.0, 92.0, 102.0, 100.0, 102.0, 89.0 };
 
43
    private double[] classC =
 
44
            {110.0, 115.0, 111.0, 117.0, 128.0, 117.0 };
 
45
 
 
46
    public OneWayAnovaTest(String name) {
 
47
        super(name);
 
48
    }
 
49
 
 
50
    public void setUp() {
 
51
    }
 
52
 
 
53
    public static Test suite() {
 
54
        TestSuite suite = new TestSuite(OneWayAnovaTest.class);
 
55
        suite.setName("TestStatistic Tests");
 
56
        return suite;
 
57
    }
 
58
 
 
59
    public void testAnovaFValue() throws Exception {
 
60
        // Target comparison values computed using R version 2.6.0 (Linux version)
 
61
        List threeClasses = new ArrayList();
 
62
        threeClasses.add(classA);
 
63
        threeClasses.add(classB);
 
64
        threeClasses.add(classC);
 
65
 
 
66
        assertEquals("ANOVA F-value",  24.67361709460624,
 
67
                 testStatistic.anovaFValue(threeClasses), 1E-12);
 
68
 
 
69
        List twoClasses = new ArrayList();
 
70
        twoClasses.add(classA);
 
71
        twoClasses.add(classB);
 
72
        
 
73
        assertEquals("ANOVA F-value",  0.0150579150579,
 
74
                 testStatistic.anovaFValue(twoClasses), 1E-12);
 
75
 
 
76
        // now try some input hashes which should fail
 
77
        List wrongContents = new ArrayList();
 
78
        wrongContents.add(classC);
 
79
        wrongContents.add(wrongArray);
 
80
        try {
 
81
            testStatistic.anovaFValue(wrongContents);
 
82
            fail("non double[] hash value for key classX, IllegalArgumentException expected");
 
83
        } catch (IllegalArgumentException ex) {
 
84
            // expected
 
85
        }  
 
86
 
 
87
        List emptyContents = new ArrayList();
 
88
        emptyContents.add(emptyArray);
 
89
        emptyContents.add(classC);
 
90
        try {
 
91
            testStatistic.anovaFValue(emptyContents);
 
92
            fail("empty array for key classX, IllegalArgumentException expected");
 
93
        } catch (IllegalArgumentException ex) {
 
94
            // expected
 
95
        }  
 
96
 
 
97
        List tooFew = new ArrayList();
 
98
        tooFew.add(classA);
 
99
        try {
 
100
            testStatistic.anovaFValue(tooFew);
 
101
            fail("less than two classes, IllegalArgumentException expected");
 
102
        } catch (IllegalArgumentException ex) {
 
103
            // expected
 
104
        }  
 
105
    }
 
106
    
 
107
 
 
108
    public void testAnovaPValue() throws Exception {
 
109
        // Target comparison values computed using R version 2.6.0 (Linux version)
 
110
        List threeClasses = new ArrayList();
 
111
        threeClasses.add(classA);
 
112
        threeClasses.add(classB);
 
113
        threeClasses.add(classC);
 
114
 
 
115
        assertEquals("ANOVA P-value", 6.959446E-06,
 
116
                 testStatistic.anovaPValue(threeClasses), 1E-12);
 
117
 
 
118
        List twoClasses = new ArrayList();
 
119
        twoClasses.add(classA);
 
120
        twoClasses.add(classB);
 
121
        
 
122
        assertEquals("ANOVA P-value",  0.904212960464,
 
123
                 testStatistic.anovaPValue(twoClasses), 1E-12);
 
124
 
 
125
    }
 
126
 
 
127
    public void testAnovaTest() throws Exception {
 
128
        // Target comparison values computed using R version 2.3.1 (Linux version)
 
129
        List threeClasses = new ArrayList();
 
130
        threeClasses.add(classA);
 
131
        threeClasses.add(classB);
 
132
        threeClasses.add(classC);
 
133
 
 
134
        assertTrue("ANOVA Test P<0.01", testStatistic.anovaTest(threeClasses, 0.01));
 
135
 
 
136
        List twoClasses = new ArrayList();
 
137
        twoClasses.add(classA);
 
138
        twoClasses.add(classB);
 
139
        
 
140
        assertFalse("ANOVA Test P>0.01", testStatistic.anovaTest(twoClasses, 0.01));
 
141
    }
 
142
 
 
143
}
 
 
b'\\ No newline at end of file'