← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/karmic/ncbi-tools6/karmic

« back to all changes in this revision

Viewing changes to network/wwwblast/docs/blast_program.html

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2005-03-27 12:00:15 UTC
  • mfrom: (2.1.2 hoary)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20050327120015-embhesp32nj73p9r
Tags: 6.1.20041020-3
http://bugs.debian.org/295110
* Fix FTBFS under GCC 4.0 caused by inconsistent use of "static" on
  functions.  (Closes: #295110.)
* Add a watch file, now that we can.  (Upstream's layout needs version=3.)

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
network/wwwblast/docs/blast_program.html
 
1
<head>
 
2
<title>Programs available for the BLAST search</title>
 
3
<BODY bgcolor="FFFFFF" link="0000FF" vlink="ff0000" text="000000" >  
 
4
<!-- Changed by: Sergei Shavirin,  2-Apr-1996 -->
 
5
</head>
 
6
<h1 align="center">Programs available for the BLAST search</h1>
 
7
<hr>
 
8
<p>
 
9
The NCBI <b>BLAST</b> family of programs includes:
 
10
<p>
 
11
<dl>
 
12
<dt><b>blastp</b> 
 
13
<dd>compares an amino acid query sequence against a protein sequence 
 
14
database
 
15
<p>
 
16
<dt><b>blastn</b> 
 
17
<dd>compares a nucleotide query sequence against a nucleotide sequence 
 
18
database
 
19
<p>
 
20
<dt><b>blastx</b> 
 
21
<dd>compares a nucleotide query sequence translated in all reading frames 
 
22
against a protein sequence database
 
23
<p>
 
24
<dt><b>tblastn</b> 
 
25
<dd>compares a protein query sequence against a nucleotide sequence database 
 
26
dynamically translated in all reading frames
 
27
<p>
 
28
<dt><b>tblastx</b> 
 
29
<dd>compares the six-frame translations of a nucleotide query sequence
 
30
against the six-frame translations of a nucleotide sequence database.
 
31
Please note that tblastx program cannot be used with the nr database on the BLAST Web page.
 
32
<p>
 
33
</ul>
 
34
<hr>
 
35
</body>
 
36
</html>