~ubuntu-branches/ubuntu/quantal/libpal-java/quantal

// TOCDSampleInformation.java

//

// (c) 1999-2004 PAL Development Core Team

//

// This package may be distributed under the

// terms of the Lesser GNU General Public License (LGPL)

 

package pal.misc;

 

/**

 * <p>Title: TOCDSampleInformation </p>

 * <p>Description: A wrapper over the old style TimeOrderCharacterData object for the new SampleInformation object </p>

 * @author Matthew Goode

 * @version 1.0

 */

 

public class TOCDSampleInformation implements SampleInformation {

  private final TimeOrderCharacterData base_;

        private final boolean hasTimes_;

        public TOCDSampleInformation(TimeOrderCharacterData base) {

                this.base_ = base;

                this.hasTimes_ = base.hasTimes();

  }

        public int getNumberOfSamples() {

          return base_.getOrdinalCount();

        }

        public int getSampleOrdinal(String leafID) {

          return base_.getTimeOrdinal(leafID);

        }

 

        public double getHeight(int sample) {

          if(hasTimes_) {

                        return base_.getOrdinalTime( sample );

                }

                return sample;

        }

        public int getHeightUnits() {

          if(hasTimes_) {

                  return base_.getUnits();

                }

                return Units.SAMPLE;

        }

 

        public double getMaxHeight() {

                if(hasTimes_) {

                        return base_.getMaximumTime();

                } else {

                  return base_.getOrdinalCount()-1;

                }

        }

 

}