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~ubuntu-branches/ubuntu/raring/samtools/raring

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Viewing changes to bgzf.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2009-09-14 21:58:36 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090914215836-27bfc2lrtr0xfnhz
Tags: 0.1.6~dfsg-1
* New upstream release.
* Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
  - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
    and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
  - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
  - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
bgzf.h
1
 
/*
2
 
 * The Broad Institute
3
 
 * SOFTWARE COPYRIGHT NOTICE AGREEMENT
4
 
 * This software and its documentation are copyright 2008 by the
5
 
 * Broad Institute/Massachusetts Institute of Technology. All rights are reserved.
6
 
 *
7
 
 * This software is supplied without any warranty or guaranteed support whatsoever.
8
 
 * Neither the Broad Institute nor MIT can be responsible for its use, misuse,
9
 
 * or functionality.
10
 
 */
 
1
/* The MIT License
 
2
 
 
3
   Copyright (c) 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
 
4
 
 
5
   Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
 
6
   of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
 
7
   in the Software without restriction, including without limitation the rights
 
8
   to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
 
9
   copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
 
10
   furnished to do so, subject to the following conditions:
 
11
 
 
12
   The above copyright notice and this permission notice shall be included in
 
13
   all copies or substantial portions of the Software.
 
14
 
 
15
   THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
 
16
   IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
 
17
   FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
 
18
   AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
 
19
   LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
 
20
   OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
 
21
   THE SOFTWARE.
 
22
*/
11
23
 
12
24
#ifndef __BGZF_H
13
25
#define __BGZF_H
113
125
 */
114
126
void bgzf_set_cache_size(BGZF *fp, int cache_size);
115
127
 
 
128
int bgzf_check_EOF(BGZF *fp);
 
129
 
116
130
#ifdef __cplusplus
117
131
}
118
132
#endif