~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/bmagic/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/html/a00141.html

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Roberto C. Sanchez
  • Date: 2010-01-24 14:45:39 UTC
  • mfrom: (4.1.6 sid)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20100124144539-4ipk5rt64dpp38hl
Tags: 3.6.3-1
* New upstream release
* debian/patches/config.guess.patch: drop obsolete patch
* Add ${misc:Depends} as requested by lintian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
2
 
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=UTF-8">
3
 
<title>BitMagic: bmvmin.h Source File</title>
4
 
<link href="doxygen.css" rel="stylesheet" type="text/css">
5
 
<link href="tabs.css" rel="stylesheet" type="text/css">
6
 
</head><body>
7
 
<!-- Generated by Doxygen 1.5.5 -->
8
 
<div class="navigation" id="top">
9
 
  <div class="tabs">
10
 
    <ul>
11
 
      <li><a href="index.html"><span>Main&nbsp;Page</span></a></li>
12
 
      <li><a href="modules.html"><span>Modules</span></a></li>
13
 
      <li><a href="namespaces.html"><span>Namespaces</span></a></li>
14
 
      <li><a href="classes.html"><span>Data&nbsp;Structures</span></a></li>
15
 
      <li class="current"><a href="files.html"><span>Files</span></a></li>
16
 
      <li><a href="examples.html"><span>Examples</span></a></li>
17
 
    </ul>
18
 
  </div>
19
 
<h1>bmvmin.h</h1><a href="a00095.html">Go to the documentation of this file.</a><div class="fragment"><pre class="fragment"><a name="l00001"></a>00001 <span class="comment">/*</span>
20
 
<a name="l00002"></a>00002 <span class="comment">Copyright(c) 2002-2005 Anatoliy Kuznetsov(anatoliy_kuznetsov at yahoo.com)</span>
21
 
<a name="l00003"></a>00003 <span class="comment"></span>
22
 
<a name="l00004"></a>00004 <span class="comment">Permission is hereby granted, free of charge, to any person </span>
23
 
<a name="l00005"></a>00005 <span class="comment">obtaining a copy of this software and associated documentation </span>
24
 
<a name="l00006"></a>00006 <span class="comment">files (the "Software"), to deal in the Software without restriction, </span>
25
 
<a name="l00007"></a>00007 <span class="comment">including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, </span>
26
 
<a name="l00008"></a>00008 <span class="comment">publish, distribute, sublicense, and/or sell copies of the Software, </span>
27
 
<a name="l00009"></a>00009 <span class="comment">and to permit persons to whom the Software is furnished to do so, </span>
28
 
<a name="l00010"></a>00010 <span class="comment">subject to the following conditions:</span>
29
 
<a name="l00011"></a>00011 <span class="comment"></span>
30
 
<a name="l00012"></a>00012 <span class="comment">The above copyright notice and this permission notice shall be included </span>
31
 
<a name="l00013"></a>00013 <span class="comment">in all copies or substantial portions of the Software.</span>
32
 
<a name="l00014"></a>00014 <span class="comment"></span>
33
 
<a name="l00015"></a>00015 <span class="comment">THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, </span>
34
 
<a name="l00016"></a>00016 <span class="comment">EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES </span>
35
 
<a name="l00017"></a>00017 <span class="comment">OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. </span>
36
 
<a name="l00018"></a>00018 <span class="comment">IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, </span>
37
 
<a name="l00019"></a>00019 <span class="comment">DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, </span>
38
 
<a name="l00020"></a>00020 <span class="comment">ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR </span>
39
 
<a name="l00021"></a>00021 <span class="comment">OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.</span>
40
 
<a name="l00022"></a>00022 <span class="comment"></span>
41
 
<a name="l00023"></a>00023 <span class="comment">For more information please visit:  http://bmagic.sourceforge.net</span>
42
 
<a name="l00024"></a>00024 <span class="comment"></span>
43
 
<a name="l00025"></a>00025 <span class="comment">*/</span>
44
 
<a name="l00026"></a>00026 
45
 
<a name="l00027"></a>00027 <span class="preprocessor">#ifndef BMVMIN__H__INCLUDED__</span>
46
 
<a name="l00028"></a>00028 <span class="preprocessor"></span><span class="preprocessor">#define BMVMIN__H__INCLUDED__</span>
47
 
<a name="l00029"></a>00029 <span class="preprocessor"></span>
48
 
<a name="l00030"></a>00030 <span class="keyword">namespace </span>bm
49
 
<a name="l00031"></a>00031 {
50
 
<a name="l00032"></a>00032 
51
 
<a name="l00033"></a>00033 
52
 
<a name="l00034"></a><a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">00034</a> <span class="preprocessor">#define BM_MINISET_GAPLEN (bm::gap_len_table&lt;true&gt;::_len[0])</span>
53
 
<a name="l00035"></a><a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">00035</a> <span class="preprocessor"></span><span class="preprocessor">#define BM_MINISET_ARRSIZE(x) ((x / 32) + ( (x % 32) &amp;&amp; 1 ))</span>
54
 
<a name="l00036"></a>00036 <span class="preprocessor"></span><span class="comment"></span>
55
 
<a name="l00037"></a>00037 <span class="comment">/*! @defgroup mset Small sets functionality</span>
56
 
<a name="l00038"></a>00038 <span class="comment"> *  Templates in this group are used to keep block types in BM library.</span>
57
 
<a name="l00039"></a>00039 <span class="comment"> *  Classes of this group can tune bvector template (MS parameter)</span>
58
 
<a name="l00040"></a>00040 <span class="comment"> *  for best performance or minimal memory usage.</span>
59
 
<a name="l00041"></a>00041 <span class="comment"> *  @ingroup bmagic</span>
60
 
<a name="l00042"></a>00042 <span class="comment"> *  @{</span>
61
 
<a name="l00043"></a>00043 <span class="comment"> */</span>
62
 
<a name="l00044"></a>00044 
63
 
<a name="l00045"></a>00045 <span class="comment"></span>
64
 
<a name="l00046"></a>00046 <span class="comment">/*!</span>
65
 
<a name="l00047"></a>00047 <span class="comment">    @brief Template class implements memory saving set functionality</span>
66
 
<a name="l00048"></a>00048 <span class="comment">    </span>
67
 
<a name="l00049"></a>00049 <span class="comment">    Template can be used as template parameter for bvector if we </span>
68
 
<a name="l00050"></a>00050 <span class="comment">    want to tune bvector for minimal memory consumption.</span>
69
 
<a name="l00051"></a>00051 <span class="comment"></span>
70
 
<a name="l00052"></a>00052 <span class="comment">    @sa bvmini</span>
71
 
<a name="l00053"></a>00053 <span class="comment">*/</span>
72
 
<a name="l00054"></a><a class="code" href="a00074.html">00054</a> <span class="keyword">template</span> &lt;<span class="keyword">class</span> A, <span class="keywordtype">size_t</span> N&gt; <span class="keyword">class </span><a class="code" href="a00074.html" title="Template class implements memory saving set functionality.">miniset</a>
73
 
<a name="l00055"></a>00055 {
74
 
<a name="l00056"></a>00056 <span class="keyword">public</span>:
75
 
<a name="l00057"></a>00057 
76
 
<a name="l00058"></a><a class="code" href="a00074.html#22e5b5c7d702203c5fa5b0480cd85c25">00058</a>     <a class="code" href="a00074.html#22e5b5c7d702203c5fa5b0480cd85c25">miniset</a>() 
77
 
<a name="l00059"></a>00059         : m_buf(0),
78
 
<a name="l00060"></a>00060           m_type(1)
79
 
<a name="l00061"></a>00061     {}
80
 
<a name="l00062"></a>00062 
81
 
<a name="l00063"></a><a class="code" href="a00074.html#61e5961df48b9521392397a0863319ee">00063</a>     <a class="code" href="a00074.html#22e5b5c7d702203c5fa5b0480cd85c25">miniset</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00074.html" title="Template class implements memory saving set functionality.">miniset</a>&amp; mset)
82
 
<a name="l00064"></a>00064     {
83
 
<a name="l00065"></a>00065         <span class="keywordflow">if</span> (mset.<a class="code" href="a00074.html#614cb51c3008e9eb748cab9dacd1d3ba" title="Buffer pointer.">m_buf</a>)
84
 
<a name="l00066"></a>00066         {
85
 
<a name="l00067"></a>00067             <span class="keywordflow">if</span> (mset.<a class="code" href="a00074.html#aa42f2248193297b6f10058d8c607101" title="buffer type (0-bit, 1-gap)">m_type</a>)
86
 
<a name="l00068"></a>00068                 init_gapbuf(mset.<a class="code" href="a00074.html#614cb51c3008e9eb748cab9dacd1d3ba" title="Buffer pointer.">m_buf</a>);
87
 
<a name="l00069"></a>00069             <span class="keywordflow">else</span>
88
 
<a name="l00070"></a>00070                 init_bitbuf(mset.<a class="code" href="a00074.html#614cb51c3008e9eb748cab9dacd1d3ba" title="Buffer pointer.">m_buf</a>);
89
 
<a name="l00071"></a>00071         }
90
 
<a name="l00072"></a>00072         <span class="keywordflow">else</span>
91
 
<a name="l00073"></a>00073         {
92
 
<a name="l00074"></a>00074             m_type = mset.<a class="code" href="a00074.html#aa42f2248193297b6f10058d8c607101" title="buffer type (0-bit, 1-gap)">m_type</a>;
93
 
<a name="l00075"></a>00075             m_buf = 0;
94
 
<a name="l00076"></a>00076         }
95
 
<a name="l00077"></a>00077     }
96
 
<a name="l00078"></a>00078 
97
 
<a name="l00079"></a><a class="code" href="a00074.html#6e5569bf59dc0e96fd3637888f5e5fd1">00079</a>     <a class="code" href="a00074.html#6e5569bf59dc0e96fd3637888f5e5fd1">~miniset</a>()
98
 
<a name="l00080"></a>00080     {
99
 
<a name="l00081"></a>00081         <span class="keywordflow">if</span> (m_buf)
100
 
<a name="l00082"></a>00082         {
101
 
<a name="l00083"></a>00083             A::deallocate(m_buf, m_type ? 
102
 
<a name="l00084"></a>00084                 (<a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">BM_MINISET_GAPLEN</a> / (<span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>) / <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">bm::gap_word_t</a>)))
103
 
<a name="l00085"></a>00085                 : 
104
 
<a name="l00086"></a>00086                 (<a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N)));
105
 
<a name="l00087"></a>00087         }
106
 
<a name="l00088"></a>00088     }
107
 
<a name="l00089"></a>00089 <span class="comment"></span>
108
 
<a name="l00090"></a>00090 <span class="comment">    /// Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.</span>
109
 
<a name="l00091"></a><a class="code" href="a00074.html#187012a7ef52ff62748c5b3937e4578c">00091</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00074.html#187012a7ef52ff62748c5b3937e4578c" title="Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.">test</a>(<a class="code" href="a00106.html#a3824d882a037396370b16f2f0a8bf37">bm::id_t</a> n)<span class="keyword"> const </span>
110
 
<a name="l00092"></a>00092 <span class="keyword">    </span>{ 
111
 
<a name="l00093"></a>00093         <span class="keywordflow">return</span>
112
 
<a name="l00094"></a>00094             !m_buf ? 0 
113
 
<a name="l00095"></a>00095             :
114
 
<a name="l00096"></a>00096             m_type ? 
115
 
<a name="l00097"></a>00097               <a class="code" href="a00110.html#g866352ef5986a7d2b709795d127b666b" title="Tests if bit = pos is true.">gap_test</a>((<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">gap_word_t</a>*)m_buf, n)
116
 
<a name="l00098"></a>00098               : 
117
 
<a name="l00099"></a>00099               m_buf[n&gt;&gt;<a class="code" href="a00106.html#83d76bccf6fe3770f32d5ba11d2a37ad">bm::set_word_shift</a>] &amp; (1&lt;&lt;(n &amp; <a class="code" href="a00106.html#ddbf345be3733d5e4575d71733ed1da8">bm::set_word_mask</a>));
118
 
<a name="l00100"></a>00100     }
119
 
<a name="l00101"></a>00101 
120
 
<a name="l00102"></a><a class="code" href="a00074.html#34d569e459720cb037a01d74bc6cccac">00102</a>     <span class="keywordtype">void</span> <span class="keyword">set</span>(<a class="code" href="a00106.html#a3824d882a037396370b16f2f0a8bf37">bm::id_t</a> n, <span class="keywordtype">bool</span> val=<span class="keyword">true</span>)
121
 
<a name="l00103"></a>00103     {
122
 
<a name="l00104"></a>00104         <span class="keywordflow">if</span> (m_type == 0)
123
 
<a name="l00105"></a>00105         {
124
 
<a name="l00106"></a>00106             <span class="keywordflow">if</span> (!m_buf)
125
 
<a name="l00107"></a>00107             {
126
 
<a name="l00108"></a>00108                 <span class="keywordflow">if</span> (!val) <span class="keywordflow">return</span>;
127
 
<a name="l00109"></a>00109                 init_bitbuf(0);
128
 
<a name="l00110"></a>00110             }
129
 
<a name="l00111"></a>00111 
130
 
<a name="l00112"></a>00112             <span class="keywordtype">unsigned</span> nword  = n &gt;&gt; <a class="code" href="a00106.html#83d76bccf6fe3770f32d5ba11d2a37ad">bm::set_word_shift</a>; 
131
 
<a name="l00113"></a>00113             <span class="keywordtype">unsigned</span> mask = unsigned(1) &lt;&lt; (n &amp; <a class="code" href="a00106.html#ddbf345be3733d5e4575d71733ed1da8">bm::set_word_mask</a>);
132
 
<a name="l00114"></a>00114 
133
 
<a name="l00115"></a>00115             val ? (m_buf[nword] |= mask) : (m_buf[nword] &amp;= ~mask);
134
 
<a name="l00116"></a>00116         }
135
 
<a name="l00117"></a>00117         <span class="keywordflow">else</span>
136
 
<a name="l00118"></a>00118         {
137
 
<a name="l00119"></a>00119             <span class="keywordflow">if</span> (!m_buf)
138
 
<a name="l00120"></a>00120             {
139
 
<a name="l00121"></a>00121                 <span class="keywordflow">if</span> (!val) <span class="keywordflow">return</span>;
140
 
<a name="l00122"></a>00122                 init_gapbuf(0);
141
 
<a name="l00123"></a>00123             }
142
 
<a name="l00124"></a>00124             
143
 
<a name="l00125"></a>00125             <span class="keywordtype">unsigned</span> is_set;
144
 
<a name="l00126"></a>00126             <span class="keywordtype">unsigned</span> new_block_len = 
145
 
<a name="l00127"></a>00127                 <a class="code" href="a00110.html#g69186bd13bda27e04b3e33683ff884c2" title="Abstract distance(similarity) operation for GAP buffers. Receives functor F as a...">gap_set_value</a>(val, (<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">gap_word_t</a>*)m_buf, n, &amp;is_set);
146
 
<a name="l00128"></a>00128 
147
 
<a name="l00129"></a>00129             <span class="keywordflow">if</span> (new_block_len &gt; <span class="keywordtype">unsigned</span>(<a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">BM_MINISET_GAPLEN</a>-4))
148
 
<a name="l00130"></a>00130             {
149
 
<a name="l00131"></a>00131                 convert_buf();
150
 
<a name="l00132"></a>00132             }
151
 
<a name="l00133"></a>00133         }
152
 
<a name="l00134"></a>00134     }
153
 
<a name="l00135"></a>00135 
154
 
<a name="l00136"></a><a class="code" href="a00074.html#2b74fe02080d4d515893e749624e7797">00136</a>     <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00074.html#2b74fe02080d4d515893e749624e7797">mem_used</a>()<span class="keyword"> const</span>
155
 
<a name="l00137"></a>00137 <span class="keyword">    </span>{
156
 
<a name="l00138"></a>00138         <span class="keywordflow">return</span> <span class="keyword">sizeof</span>(*this) +
157
 
<a name="l00139"></a>00139                m_buf ? 
158
 
<a name="l00140"></a>00140                  (m_type ? (<a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">BM_MINISET_GAPLEN</a> * <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">gap_word_t</a>))
159
 
<a name="l00141"></a>00141                         : (<a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N) * <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>)))
160
 
<a name="l00142"></a>00142                 : 0; 
161
 
<a name="l00143"></a>00143     }
162
 
<a name="l00144"></a>00144 
163
 
<a name="l00145"></a><a class="code" href="a00074.html#f94007643783b752eed263ac72ca8a5c">00145</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00074.html#f94007643783b752eed263ac72ca8a5c">swap</a>(<a class="code" href="a00074.html" title="Template class implements memory saving set functionality.">miniset</a>&amp; mset)
164
 
<a name="l00146"></a>00146     {
165
 
<a name="l00147"></a>00147         <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>* buftmp = m_buf;
166
 
<a name="l00148"></a>00148         m_buf = mset.<a class="code" href="a00074.html#614cb51c3008e9eb748cab9dacd1d3ba" title="Buffer pointer.">m_buf</a>;
167
 
<a name="l00149"></a>00149         mset.<a class="code" href="a00074.html#614cb51c3008e9eb748cab9dacd1d3ba" title="Buffer pointer.">m_buf</a> = buftmp;
168
 
<a name="l00150"></a>00150         <span class="keywordtype">unsigned</span> typetmp = m_type;
169
 
<a name="l00151"></a>00151         m_type = mset.<a class="code" href="a00074.html#aa42f2248193297b6f10058d8c607101" title="buffer type (0-bit, 1-gap)">m_type</a>;
170
 
<a name="l00152"></a>00152         mset.<a class="code" href="a00074.html#aa42f2248193297b6f10058d8c607101" title="buffer type (0-bit, 1-gap)">m_type</a> = typetmp;
171
 
<a name="l00153"></a>00153     }
172
 
<a name="l00154"></a>00154 
173
 
<a name="l00155"></a>00155 
174
 
<a name="l00156"></a>00156 <span class="keyword">private</span>:
175
 
<a name="l00157"></a>00157 
176
 
<a name="l00158"></a>00158     <span class="keywordtype">void</span> init_bitbuf(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>* buf)
177
 
<a name="l00159"></a>00159     {
178
 
<a name="l00160"></a>00160         <span class="keywordtype">unsigned</span> arr_size = <a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N);
179
 
<a name="l00161"></a>00161         m_buf = A::allocate(arr_size, 0);
180
 
<a name="l00162"></a>00162         <span class="keywordflow">if</span> (buf)
181
 
<a name="l00163"></a>00163         {
182
 
<a name="l00164"></a>00164             ::memcpy(m_buf, buf, arr_size * <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>));
183
 
<a name="l00165"></a>00165         }
184
 
<a name="l00166"></a>00166         <span class="keywordflow">else</span>
185
 
<a name="l00167"></a>00167         {
186
 
<a name="l00168"></a>00168             ::memset(m_buf, 0, arr_size * <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>));
187
 
<a name="l00169"></a>00169         }
188
 
<a name="l00170"></a>00170         m_type = 0;
189
 
<a name="l00171"></a>00171     }
190
 
<a name="l00172"></a>00172 
191
 
<a name="l00173"></a>00173     <span class="keywordtype">void</span> init_gapbuf(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>* buf)
192
 
<a name="l00174"></a>00174     {
193
 
<a name="l00175"></a>00175         <span class="keywordtype">unsigned</span> arr_size = 
194
 
<a name="l00176"></a>00176             <a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">BM_MINISET_GAPLEN</a> / (<span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>) / <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">bm::gap_word_t</a>));
195
 
<a name="l00177"></a>00177         m_buf = A::allocate(arr_size, 0);
196
 
<a name="l00178"></a>00178         <span class="keywordflow">if</span> (buf)
197
 
<a name="l00179"></a>00179         {
198
 
<a name="l00180"></a>00180             ::memcpy(m_buf, buf, arr_size * <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>));
199
 
<a name="l00181"></a>00181         }
200
 
<a name="l00182"></a>00182         <span class="keywordflow">else</span>
201
 
<a name="l00183"></a>00183         {
202
 
<a name="l00184"></a>00184             *m_buf = 0;
203
 
<a name="l00185"></a>00185             <a class="code" href="a00110.html#gef53b2877ff369badd7bb25b26bb9029" title="Sets all bits to 0 or 1 (GAP).">gap_set_all</a>((<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">gap_word_t</a>*)m_buf, <a class="code" href="a00106.html#d0b8714080144ac70197840ff96752b7">bm::gap_max_bits</a>, 0);
204
 
<a name="l00186"></a>00186         }
205
 
<a name="l00187"></a>00187         m_type = 1;
206
 
<a name="l00188"></a>00188     }
207
 
<a name="l00189"></a>00189 
208
 
<a name="l00190"></a>00190     <span class="keywordtype">void</span> convert_buf()
209
 
<a name="l00191"></a>00191     {
210
 
<a name="l00192"></a>00192         <span class="keywordtype">unsigned</span> arr_size = <a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N);
211
 
<a name="l00193"></a>00193         <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>* buf = A::allocate(arr_size, 0);
212
 
<a name="l00194"></a>00194 
213
 
<a name="l00195"></a>00195         <a class="code" href="a00110.html#g4862f4dcdcb7c0575e2e2db9e5f2a849" title="GAP block to bitblock conversion.">gap_convert_to_bitset</a>(buf, (<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">gap_word_t</a>*) m_buf, arr_size);
214
 
<a name="l00196"></a>00196         arr_size = 
215
 
<a name="l00197"></a>00197             <a class="code" href="a00095.html#e064a0440f9730f9661e51e6089dd853">BM_MINISET_GAPLEN</a> / (<span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>) / <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00106.html#c654d6319039a86546d235a236fc7cf6">bm::gap_word_t</a>));
216
 
<a name="l00198"></a>00198         A::deallocate(m_buf, arr_size);
217
 
<a name="l00199"></a>00199         m_buf = buf;
218
 
<a name="l00200"></a>00200         m_type = 0;
219
 
<a name="l00201"></a>00201     }
220
 
<a name="l00202"></a>00202 
221
 
<a name="l00203"></a>00203 <span class="keyword">private</span>:
222
 
<a name="l00204"></a>00204     <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>*   m_buf;      <span class="comment">//!&lt; Buffer pointer</span>
223
 
<a name="l00205"></a>00205 <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span>      m_type;     <span class="comment">//!&lt; buffer type (0-bit, 1-gap)</span>
224
 
<a name="l00206"></a>00206 <span class="comment"></span>};
225
 
<a name="l00207"></a>00207 
226
 
<a name="l00208"></a>00208 <span class="comment"></span>
227
 
<a name="l00209"></a>00209 <span class="comment">/*!</span>
228
 
<a name="l00210"></a>00210 <span class="comment">    @brief Mini bitvector used in bvector template to keep block type flags</span>
229
 
<a name="l00211"></a>00211 <span class="comment">    </span>
230
 
<a name="l00212"></a>00212 <span class="comment">    Template is used as a default template parameter MS for bvector  </span>
231
 
<a name="l00213"></a>00213 <span class="comment">    Offers maximum performance comparing to miniset.</span>
232
 
<a name="l00214"></a>00214 <span class="comment"></span>
233
 
<a name="l00215"></a>00215 <span class="comment">    @sa miniset</span>
234
 
<a name="l00216"></a>00216 <span class="comment">*/</span>
235
 
<a name="l00217"></a><a class="code" href="a00051.html">00217</a> <span class="keyword">template</span>&lt;<span class="keywordtype">size_t</span> N&gt; <span class="keyword">class </span><a class="code" href="a00051.html" title="Mini bitvector used in bvector template to keep block type flags.">bvmini</a>
236
 
<a name="l00218"></a>00218 {
237
 
<a name="l00219"></a>00219 <span class="keyword">public</span>:
238
 
<a name="l00220"></a>00220 
239
 
<a name="l00221"></a><a class="code" href="a00051.html#06c2a8c6253e47e107acf75f3f9dfb38">00221</a>     <a class="code" href="a00051.html#06c2a8c6253e47e107acf75f3f9dfb38">bvmini</a>(<span class="keywordtype">int</span> start_strategy = 0) 
240
 
<a name="l00222"></a>00222     {
241
 
<a name="l00223"></a>00223         ::memset(m_buf, 0, <span class="keyword">sizeof</span>(m_buf));
242
 
<a name="l00224"></a>00224     }
243
 
<a name="l00225"></a>00225 
244
 
<a name="l00226"></a><a class="code" href="a00051.html#aca8fc1df0be6bf5e0dbb78f399c793d">00226</a>     <a class="code" href="a00051.html#06c2a8c6253e47e107acf75f3f9dfb38">bvmini</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00051.html" title="Mini bitvector used in bvector template to keep block type flags.">bvmini</a>&amp; mset)
245
 
<a name="l00227"></a>00227     {
246
 
<a name="l00228"></a>00228         ::memcpy(m_buf, mset.<a class="code" href="a00051.html#3ada8fd46ce7f178bed01545db5ac889">m_buf</a>, <span class="keyword">sizeof</span>(m_buf));
247
 
<a name="l00229"></a>00229     }
248
 
<a name="l00230"></a>00230 
249
 
<a name="l00231"></a>00231 <span class="comment"></span>
250
 
<a name="l00232"></a>00232 <span class="comment">    /// Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.</span>
251
 
<a name="l00233"></a><a class="code" href="a00051.html#6c5950cd2043fe1de37aa7eeba2ad208">00233</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00051.html#6c5950cd2043fe1de37aa7eeba2ad208" title="Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.">test</a>(<a class="code" href="a00106.html#a3824d882a037396370b16f2f0a8bf37">bm::id_t</a> n)<span class="keyword"> const </span>
252
 
<a name="l00234"></a>00234 <span class="keyword">    </span>{ 
253
 
<a name="l00235"></a>00235         <span class="keywordflow">return</span> m_buf[n&gt;&gt;<a class="code" href="a00106.html#83d76bccf6fe3770f32d5ba11d2a37ad">bm::set_word_shift</a>] &amp; (1&lt;&lt;(n &amp; <a class="code" href="a00106.html#ddbf345be3733d5e4575d71733ed1da8">bm::set_word_mask</a>));
254
 
<a name="l00236"></a>00236     }
255
 
<a name="l00237"></a>00237 
256
 
<a name="l00238"></a><a class="code" href="a00051.html#74c7834f34f41e6042243cdbe2b7b93e">00238</a>     <span class="keywordtype">void</span> <span class="keyword">set</span>(<a class="code" href="a00106.html#a3824d882a037396370b16f2f0a8bf37">bm::id_t</a> n, <span class="keywordtype">bool</span> val=<span class="keyword">true</span>)
257
 
<a name="l00239"></a>00239     {
258
 
<a name="l00240"></a>00240         <span class="keywordtype">unsigned</span> nword  = n &gt;&gt; <a class="code" href="a00106.html#83d76bccf6fe3770f32d5ba11d2a37ad">bm::set_word_shift</a>; 
259
 
<a name="l00241"></a>00241         <span class="keywordtype">unsigned</span> mask = unsigned(1) &lt;&lt; (n &amp; <a class="code" href="a00106.html#ddbf345be3733d5e4575d71733ed1da8">bm::set_word_mask</a>);
260
 
<a name="l00242"></a>00242 
261
 
<a name="l00243"></a>00243         val ? (m_buf[nword] |= mask) : (m_buf[nword] &amp;= ~mask);
262
 
<a name="l00244"></a>00244     }
263
 
<a name="l00245"></a>00245 
264
 
<a name="l00246"></a><a class="code" href="a00051.html#3253569551b1ce6fb6b1e1d21f318f70">00246</a>     <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00051.html#3253569551b1ce6fb6b1e1d21f318f70">mem_used</a>()<span class="keyword"> const</span>
265
 
<a name="l00247"></a>00247 <span class="keyword">    </span>{
266
 
<a name="l00248"></a>00248         <span class="keywordflow">return</span> <span class="keyword">sizeof</span>(*this);
267
 
<a name="l00249"></a>00249     }
268
 
<a name="l00250"></a>00250 
269
 
<a name="l00251"></a><a class="code" href="a00051.html#f5f33b8936925bec92522af3c44dd677">00251</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00051.html#f5f33b8936925bec92522af3c44dd677">swap</a>(<a class="code" href="a00051.html" title="Mini bitvector used in bvector template to keep block type flags.">bvmini</a>&amp; mset)
270
 
<a name="l00252"></a>00252     {
271
 
<a name="l00253"></a>00253         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span> i = 0; i &lt; <a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N); ++i)
272
 
<a name="l00254"></a>00254         {
273
 
<a name="l00255"></a>00255             <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a> tmp = m_buf[i];
274
 
<a name="l00256"></a>00256             m_buf[i] = mset.<a class="code" href="a00051.html#3ada8fd46ce7f178bed01545db5ac889">m_buf</a>[i];
275
 
<a name="l00257"></a>00257             mset.<a class="code" href="a00051.html#3ada8fd46ce7f178bed01545db5ac889">m_buf</a>[i] = tmp;
276
 
<a name="l00258"></a>00258         }
277
 
<a name="l00259"></a>00259     }
278
 
<a name="l00260"></a>00260 
279
 
<a name="l00261"></a>00261 <span class="keyword">private</span>:
280
 
<a name="l00262"></a>00262     <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>   m_buf[<a class="code" href="a00095.html#4c52fe8ea11bf34fcaafb71253846fea">BM_MINISET_ARRSIZE</a>(N)];
281
 
<a name="l00263"></a>00263 };
282
 
<a name="l00264"></a>00264 
283
 
<a name="l00265"></a>00265 <span class="comment"></span>
284
 
<a name="l00266"></a>00266 <span class="comment">/*!@} */</span>
285
 
<a name="l00267"></a>00267 <span class="comment"></span>
286
 
<a name="l00268"></a>00268 <span class="comment">/*!</span>
287
 
<a name="l00269"></a>00269 <span class="comment">    @brief Bitvector class with very limited functionality.</span>
288
 
<a name="l00270"></a>00270 <span class="comment"></span>
289
 
<a name="l00271"></a>00271 <span class="comment">    Class implements simple bitset and used for internal </span>
290
 
<a name="l00272"></a>00272 <span class="comment">    and testing purposes. </span>
291
 
<a name="l00273"></a>00273 <span class="comment">*/</span>
292
 
<a name="l00274"></a><a class="code" href="a00050.html">00274</a> <span class="keyword">template</span>&lt;<span class="keyword">class</span> A&gt; <span class="keyword">class </span><a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>
293
 
<a name="l00275"></a>00275 {
294
 
<a name="l00276"></a>00276 <span class="keyword">public</span>:
295
 
<a name="l00277"></a><a class="code" href="a00050.html#6a19b7eb95001b59818314ab36af98f8">00277</a>     <a class="code" href="a00050.html#6a19b7eb95001b59818314ab36af98f8">bvector_mini</a>(<span class="keywordtype">unsigned</span> size) 
296
 
<a name="l00278"></a>00278       : m_buf(0),
297
 
<a name="l00279"></a>00279         m_size(size)
298
 
<a name="l00280"></a>00280     {
299
 
<a name="l00281"></a>00281         <span class="keywordtype">unsigned</span> arr_size = (size / 32) + 1; 
300
 
<a name="l00282"></a>00282         m_buf = A::allocate(arr_size, 0);
301
 
<a name="l00283"></a>00283         ::memset(m_buf, 0, arr_size * <span class="keyword">sizeof</span>(unsigned));
302
 
<a name="l00284"></a>00284     }
303
 
<a name="l00285"></a><a class="code" href="a00050.html#df04b08db38bfd6445c26cdbbf9dc296">00285</a>     <a class="code" href="a00050.html#6a19b7eb95001b59818314ab36af98f8">bvector_mini</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
304
 
<a name="l00286"></a>00286        : m_size(bvect.m_size)
305
 
<a name="l00287"></a>00287     {
306
 
<a name="l00288"></a>00288         <span class="keywordtype">unsigned</span> arr_size = (m_size / 32) + 1;
307
 
<a name="l00289"></a>00289         m_buf = A::allocate(arr_size, 0);
308
 
<a name="l00290"></a>00290         ::memcpy(m_buf, bvect.<a class="code" href="a00050.html#cf9cb2e578072a15c2a04ce2afce72b1">m_buf</a>, arr_size * <span class="keyword">sizeof</span>(unsigned));        
309
 
<a name="l00291"></a>00291     }
310
 
<a name="l00292"></a>00292 
311
 
<a name="l00293"></a><a class="code" href="a00050.html#d8ab729a8aafd44e623bd251b9f9c1fa">00293</a>     <a class="code" href="a00050.html#d8ab729a8aafd44e623bd251b9f9c1fa">~bvector_mini</a>()
312
 
<a name="l00294"></a>00294     {
313
 
<a name="l00295"></a>00295         A::deallocate(m_buf, (m_size / 32) + 1); 
314
 
<a name="l00296"></a>00296     }
315
 
<a name="l00297"></a>00297 <span class="comment"></span>
316
 
<a name="l00298"></a>00298 <span class="comment">    /// Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.</span>
317
 
<a name="l00299"></a><a class="code" href="a00050.html#6cfcb4606f6fbb52ae78943fcb85b97e">00299</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">int</span> <a class="code" href="a00050.html#6cfcb4606f6fbb52ae78943fcb85b97e" title="Checks if bit pos 1 or 0. Returns 0 if 0 and non zero otherwise.">is_bit_true</a>(<span class="keywordtype">unsigned</span> pos)<span class="keyword"> const</span>
318
 
<a name="l00300"></a>00300 <span class="keyword">    </span>{
319
 
<a name="l00301"></a>00301         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>  mask = (<span class="keywordtype">unsigned</span> char)((<span class="keywordtype">char</span>)0x1 &lt;&lt; (pos &amp; 7));
320
 
<a name="l00302"></a>00302         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>* offs = (<span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>*)m_buf + (pos &gt;&gt; 3); <span class="comment">// m_buf + (pos/8)</span>
321
 
<a name="l00303"></a>00303 
322
 
<a name="l00304"></a>00304         <span class="keywordflow">return</span> (*offs) &amp; mask;
323
 
<a name="l00305"></a>00305     }
324
 
<a name="l00306"></a>00306 <span class="comment"></span>
325
 
<a name="l00307"></a>00307 <span class="comment">    /// Sets bit number pos to 1</span>
326
 
<a name="l00308"></a><a class="code" href="a00050.html#e28f350dc925a9c8bef673fcffce9c8e">00308</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#e28f350dc925a9c8bef673fcffce9c8e" title="Sets bit number pos to 1.">set_bit</a>(<span class="keywordtype">unsigned</span> pos)
327
 
<a name="l00309"></a>00309     {
328
 
<a name="l00310"></a>00310         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>  mask = (<span class="keywordtype">unsigned</span> char)(0x1 &lt;&lt; (pos &amp; 7));
329
 
<a name="l00311"></a>00311         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>* offs = (<span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>*)m_buf + (pos &gt;&gt; 3); 
330
 
<a name="l00312"></a>00312         *offs |= mask;
331
 
<a name="l00313"></a>00313     }
332
 
<a name="l00314"></a>00314 
333
 
<a name="l00315"></a>00315 <span class="comment"></span>
334
 
<a name="l00316"></a>00316 <span class="comment">    /// Sets bit number pos to 0</span>
335
 
<a name="l00317"></a><a class="code" href="a00050.html#852767299516dacb6b27296d71ea60c0">00317</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#852767299516dacb6b27296d71ea60c0" title="Sets bit number pos to 0.">clear_bit</a>(<span class="keywordtype">unsigned</span> pos)
336
 
<a name="l00318"></a>00318     {
337
 
<a name="l00319"></a>00319         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>  mask = (<span class="keywordtype">unsigned</span> char)(0x1 &lt;&lt; (pos &amp; 7));
338
 
<a name="l00320"></a>00320         <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>* offs = (<span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>*)m_buf + (pos &gt;&gt; 3); 
339
 
<a name="l00321"></a>00321 
340
 
<a name="l00322"></a>00322         *offs &amp;= ~mask;
341
 
<a name="l00323"></a>00323     }
342
 
<a name="l00324"></a>00324 <span class="comment"></span>
343
 
<a name="l00325"></a>00325 <span class="comment">    /// Counts number of bits ON </span>
344
 
<a name="l00326"></a><a class="code" href="a00050.html#1becbe1fa1d767f6ea17801bd64b4bd5">00326</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00050.html#1becbe1fa1d767f6ea17801bd64b4bd5" title="Counts number of bits ON.">bit_count</a>()<span class="keyword"> const</span>
345
 
<a name="l00327"></a>00327 <span class="keyword">    </span>{
346
 
<a name="l00328"></a>00328         <span class="keyword">register</span> <span class="keywordtype">unsigned</span> count = 0;
347
 
<a name="l00329"></a>00329         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* end = m_buf + (m_size / 32)+1;    
348
 
<a name="l00330"></a>00330 
349
 
<a name="l00331"></a>00331         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span>* start = m_buf; start &lt; end; ++start)
350
 
<a name="l00332"></a>00332         {
351
 
<a name="l00333"></a>00333             <span class="keyword">register</span> <span class="keywordtype">unsigned</span> value = *start;
352
 
<a name="l00334"></a>00334             <span class="keywordflow">for</span> (count += (value!=0); value &amp;= value - 1; ++count);
353
 
<a name="l00335"></a>00335         }
354
 
<a name="l00336"></a>00336         <span class="keywordflow">return</span> count;
355
 
<a name="l00337"></a>00337     }
356
 
<a name="l00338"></a>00338 <span class="comment"></span>
357
 
<a name="l00339"></a>00339 <span class="comment">    /// Comparison.</span>
358
 
<a name="l00340"></a><a class="code" href="a00050.html#c3b022f81e3eaafab851a23232053a93">00340</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">int</span> <a class="code" href="a00050.html#c3b022f81e3eaafab851a23232053a93" title="Comparison.">compare</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
359
 
<a name="l00341"></a>00341     {
360
 
<a name="l00342"></a>00342         <span class="keywordtype">unsigned</span> cnt1 = <a class="code" href="a00050.html#1becbe1fa1d767f6ea17801bd64b4bd5" title="Counts number of bits ON.">bit_count</a>();
361
 
<a name="l00343"></a>00343         <span class="keywordtype">unsigned</span> cnt2 = bvect.<a class="code" href="a00050.html#1becbe1fa1d767f6ea17801bd64b4bd5" title="Counts number of bits ON.">bit_count</a>();
362
 
<a name="l00344"></a>00344 
363
 
<a name="l00345"></a>00345         <span class="keywordflow">if</span> (!cnt1 &amp;&amp; !cnt2) <span class="keywordflow">return</span> 0;
364
 
<a name="l00346"></a>00346 
365
 
<a name="l00347"></a>00347         <span class="keywordtype">unsigned</span> cnt_min = cnt1 &lt; cnt2 ? cnt1 : cnt2;
366
 
<a name="l00348"></a>00348 
367
 
<a name="l00349"></a>00349         <span class="keywordflow">if</span> (!cnt_min) <span class="keywordflow">return</span> cnt1 ? 1 : -1;
368
 
<a name="l00350"></a>00350 
369
 
<a name="l00351"></a>00351         <span class="keywordtype">unsigned</span> idx1 = <a class="code" href="a00050.html#69391ac769601c2386ca87cfce255c6b" title="Returns index of the first ON bit.">get_first</a>();
370
 
<a name="l00352"></a>00352         <span class="keywordtype">unsigned</span> idx2 = bvect.<a class="code" href="a00050.html#69391ac769601c2386ca87cfce255c6b" title="Returns index of the first ON bit.">get_first</a>();
371
 
<a name="l00353"></a>00353 
372
 
<a name="l00354"></a>00354         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span> i = 0; i &lt; cnt_min; ++i)
373
 
<a name="l00355"></a>00355         {
374
 
<a name="l00356"></a>00356             <span class="keywordflow">if</span> (idx1 != idx2)
375
 
<a name="l00357"></a>00357             {
376
 
<a name="l00358"></a>00358                 <span class="keywordflow">return</span> idx1 &lt; idx2 ? 1 : -1;
377
 
<a name="l00359"></a>00359             }
378
 
<a name="l00360"></a>00360             idx1 = <a class="code" href="a00050.html#b43a59f4e322f5a270a7c9bb920b17a3" title="Returns index of next bit, which is ON.">get_next</a>(idx1);
379
 
<a name="l00361"></a>00361             idx2 = bvect.<a class="code" href="a00050.html#b43a59f4e322f5a270a7c9bb920b17a3" title="Returns index of next bit, which is ON.">get_next</a>(idx2);
380
 
<a name="l00362"></a>00362         }
381
 
<a name="l00363"></a>00363 
382
 
<a name="l00364"></a>00364         <a class="code" href="a00087.html#a44515fab0ace8928d1cb82009a95bf8">BM_ASSERT</a>(idx1==0 || idx2==0);
383
 
<a name="l00365"></a>00365 
384
 
<a name="l00366"></a>00366         <span class="keywordflow">if</span> (idx1 != idx2)
385
 
<a name="l00367"></a>00367         {
386
 
<a name="l00368"></a>00368             <span class="keywordflow">if</span> (!idx1) <span class="keywordflow">return</span> -1;
387
 
<a name="l00369"></a>00369             <span class="keywordflow">if</span> (!idx2) <span class="keywordflow">return</span>  1;
388
 
<a name="l00370"></a>00370             <span class="keywordflow">return</span> idx1 &lt; idx2 ? 1 : -1;
389
 
<a name="l00371"></a>00371         }
390
 
<a name="l00372"></a>00372 
391
 
<a name="l00373"></a>00373         <span class="keywordflow">return</span> 0;
392
 
<a name="l00374"></a>00374     }
393
 
<a name="l00375"></a>00375 
394
 
<a name="l00376"></a>00376 <span class="comment"></span>
395
 
<a name="l00377"></a>00377 <span class="comment">    /// Returns index of the first ON bit</span>
396
 
<a name="l00378"></a><a class="code" href="a00050.html#69391ac769601c2386ca87cfce255c6b">00378</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00050.html#69391ac769601c2386ca87cfce255c6b" title="Returns index of the first ON bit.">get_first</a>()<span class="keyword"> const</span>
397
 
<a name="l00379"></a>00379 <span class="keyword">    </span>{
398
 
<a name="l00380"></a>00380         <span class="keywordtype">unsigned</span> pos = 0;
399
 
<a name="l00381"></a>00381         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>* ptr = (<span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>*) m_buf;
400
 
<a name="l00382"></a>00382 
401
 
<a name="l00383"></a>00383         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span> i = 0; i &lt; (m_size/8)+1; ++i)
402
 
<a name="l00384"></a>00384         {
403
 
<a name="l00385"></a>00385             <span class="keyword">register</span> <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span> w = ptr[i];
404
 
<a name="l00386"></a>00386 
405
 
<a name="l00387"></a>00387 
406
 
<a name="l00388"></a>00388             <span class="keywordflow">if</span> (w != 0)
407
 
<a name="l00389"></a>00389             {
408
 
<a name="l00390"></a>00390                 <span class="keywordflow">while</span> ((w &amp; 1) == 0)
409
 
<a name="l00391"></a>00391                 {
410
 
<a name="l00392"></a>00392                     w &gt;&gt;= 1;
411
 
<a name="l00393"></a>00393                     ++pos;
412
 
<a name="l00394"></a>00394                 }
413
 
<a name="l00395"></a>00395                 <span class="keywordflow">return</span> pos;
414
 
<a name="l00396"></a>00396             }
415
 
<a name="l00397"></a>00397             pos += <span class="keyword">sizeof</span>(<span class="keywordtype">unsigned</span> char) * 8;
416
 
<a name="l00398"></a>00398         }
417
 
<a name="l00399"></a>00399         <span class="keywordflow">return</span> 0;
418
 
<a name="l00400"></a>00400     }
419
 
<a name="l00401"></a>00401 
420
 
<a name="l00402"></a>00402 <span class="comment"></span>
421
 
<a name="l00403"></a>00403 <span class="comment">    /// Returns index of next bit, which is ON</span>
422
 
<a name="l00404"></a><a class="code" href="a00050.html#b43a59f4e322f5a270a7c9bb920b17a3">00404</a> <span class="comment"></span>    <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00050.html#b43a59f4e322f5a270a7c9bb920b17a3" title="Returns index of next bit, which is ON.">get_next</a>(<span class="keywordtype">unsigned</span> idx)<span class="keyword"> const</span>
423
 
<a name="l00405"></a>00405 <span class="keyword">    </span>{
424
 
<a name="l00406"></a>00406         <span class="keyword">register</span> <span class="keywordtype">unsigned</span> i;
425
 
<a name="l00407"></a>00407 
426
 
<a name="l00408"></a>00408         <span class="keywordflow">for</span> (i = idx+1; i &lt; m_size; ++i)
427
 
<a name="l00409"></a>00409         {
428
 
<a name="l00410"></a>00410             <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>* offs = (<span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span>*)m_buf + (i &gt;&gt; 3); 
429
 
<a name="l00411"></a>00411             <span class="keywordflow">if</span> (*offs)
430
 
<a name="l00412"></a>00412             {
431
 
<a name="l00413"></a>00413                 <span class="keywordtype">unsigned</span> <span class="keywordtype">char</span> mask = (<span class="keywordtype">unsigned</span> char)((<span class="keywordtype">char</span>)0x1 &lt;&lt; (i &amp; 7));
432
 
<a name="l00414"></a>00414 
433
 
<a name="l00415"></a>00415                 <span class="keywordflow">if</span> (*offs &amp; mask)
434
 
<a name="l00416"></a>00416                 {
435
 
<a name="l00417"></a>00417                     <span class="keywordflow">return</span> i;
436
 
<a name="l00418"></a>00418                 }
437
 
<a name="l00419"></a>00419             }
438
 
<a name="l00420"></a>00420             <span class="keywordflow">else</span>
439
 
<a name="l00421"></a>00421             {
440
 
<a name="l00422"></a>00422                 i += 7;
441
 
<a name="l00423"></a>00423             }
442
 
<a name="l00424"></a>00424         }
443
 
<a name="l00425"></a>00425         <span class="keywordflow">return</span> 0;
444
 
<a name="l00426"></a>00426     }
445
 
<a name="l00427"></a>00427 
446
 
<a name="l00428"></a>00428 
447
 
<a name="l00429"></a><a class="code" href="a00050.html#8a95d88b371e57e7f9f2636f535fde97">00429</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#8a95d88b371e57e7f9f2636f535fde97">combine_and</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
448
 
<a name="l00430"></a>00430     {
449
 
<a name="l00431"></a>00431         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* end = m_buf + (m_size / 32)+1;
450
 
<a name="l00432"></a>00432     
451
 
<a name="l00433"></a>00433         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* src = bvect.<a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">get_buf</a>();
452
 
<a name="l00434"></a>00434 
453
 
<a name="l00435"></a>00435         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span>* start = m_buf; start &lt; end; ++start)
454
 
<a name="l00436"></a>00436         {
455
 
<a name="l00437"></a>00437             *start &amp;= *src++;
456
 
<a name="l00438"></a>00438         }
457
 
<a name="l00439"></a>00439     }
458
 
<a name="l00440"></a>00440 
459
 
<a name="l00441"></a><a class="code" href="a00050.html#b53f530e6be242a26491141a05d09982">00441</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#b53f530e6be242a26491141a05d09982">combine_xor</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
460
 
<a name="l00442"></a>00442     {
461
 
<a name="l00443"></a>00443         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* end = m_buf + (m_size / 32)+1;
462
 
<a name="l00444"></a>00444     
463
 
<a name="l00445"></a>00445         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* src = bvect.<a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">get_buf</a>();
464
 
<a name="l00446"></a>00446 
465
 
<a name="l00447"></a>00447         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span>* start = m_buf; start &lt; end; ++start)
466
 
<a name="l00448"></a>00448         {
467
 
<a name="l00449"></a>00449             *start ^= *src++;
468
 
<a name="l00450"></a>00450         }
469
 
<a name="l00451"></a>00451     }
470
 
<a name="l00452"></a>00452 
471
 
<a name="l00453"></a>00453 
472
 
<a name="l00454"></a><a class="code" href="a00050.html#9b977e253866aafed72df9ae6be18965">00454</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#9b977e253866aafed72df9ae6be18965">combine_or</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
473
 
<a name="l00455"></a>00455     {
474
 
<a name="l00456"></a>00456         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* end = m_buf + (m_size / 32)+1;
475
 
<a name="l00457"></a>00457     
476
 
<a name="l00458"></a>00458         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* src = bvect.<a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">get_buf</a>();
477
 
<a name="l00459"></a>00459 
478
 
<a name="l00460"></a>00460         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span>* start = m_buf; start &lt; end; ++start)
479
 
<a name="l00461"></a>00461         {
480
 
<a name="l00462"></a>00462             *start |= *src++;
481
 
<a name="l00463"></a>00463         }
482
 
<a name="l00464"></a>00464     }
483
 
<a name="l00465"></a>00465 
484
 
<a name="l00466"></a><a class="code" href="a00050.html#606b3a5570dd2d1016c60d00118bf8d5">00466</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#606b3a5570dd2d1016c60d00118bf8d5">combine_sub</a>(<span class="keyword">const</span> <a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; <a class="code" href="a00040.html" title="bitvector with runtime compression of bits.">bvect</a>)
485
 
<a name="l00467"></a>00467     {
486
 
<a name="l00468"></a>00468         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* end = m_buf + (m_size / 32)+1;
487
 
<a name="l00469"></a>00469     
488
 
<a name="l00470"></a>00470         <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* src = bvect.<a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">get_buf</a>();
489
 
<a name="l00471"></a>00471 
490
 
<a name="l00472"></a>00472         <span class="keywordflow">for</span> (<span class="keywordtype">unsigned</span>* start = m_buf; start &lt; end; ++start)
491
 
<a name="l00473"></a>00473         {
492
 
<a name="l00474"></a>00474             *start &amp;= ~(*src++);
493
 
<a name="l00475"></a>00475         }
494
 
<a name="l00476"></a>00476     }
495
 
<a name="l00477"></a>00477 
496
 
<a name="l00478"></a><a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">00478</a>     <span class="keyword">const</span> <span class="keywordtype">unsigned</span>* <a class="code" href="a00050.html#44873b590c47bf1b52ea62a3384aea1a">get_buf</a>()<span class="keyword"> const </span>{ <span class="keywordflow">return</span> m_buf; }
497
 
<a name="l00479"></a><a class="code" href="a00050.html#b94ed32db48e192c6bd6da15bfa9c486">00479</a>     <span class="keywordtype">unsigned</span> <a class="code" href="a00050.html#b94ed32db48e192c6bd6da15bfa9c486">mem_used</a>()<span class="keyword"> const</span>
498
 
<a name="l00480"></a>00480 <span class="keyword">    </span>{
499
 
<a name="l00481"></a>00481         <span class="keywordflow">return</span> <span class="keyword">sizeof</span>(<a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>) + (m_size / 32) + 1;
500
 
<a name="l00482"></a>00482     }
501
 
<a name="l00483"></a>00483 
502
 
<a name="l00484"></a><a class="code" href="a00050.html#6e51947affb26ce925b3a71c81105802">00484</a>     <span class="keywordtype">void</span> <a class="code" href="a00050.html#6e51947affb26ce925b3a71c81105802">swap</a>(<a class="code" href="a00050.html" title="Bitvector class with very limited functionality.">bvector_mini</a>&amp; bvm)
503
 
<a name="l00485"></a>00485     {
504
 
<a name="l00486"></a>00486         <a class="code" href="a00087.html#a44515fab0ace8928d1cb82009a95bf8">BM_ASSERT</a>(m_size == bvm.<a class="code" href="a00050.html#5c3e48cbeb4f79b66b7b2d4f279e119d">m_size</a>);
505
 
<a name="l00487"></a>00487         <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>* buftmp = m_buf;
506
 
<a name="l00488"></a>00488         m_buf = bvm.<a class="code" href="a00050.html#cf9cb2e578072a15c2a04ce2afce72b1">m_buf</a>;
507
 
<a name="l00489"></a>00489         bvm.<a class="code" href="a00050.html#cf9cb2e578072a15c2a04ce2afce72b1">m_buf</a> = buftmp;
508
 
<a name="l00490"></a>00490     }
509
 
<a name="l00491"></a>00491 
510
 
<a name="l00492"></a>00492 <span class="keyword">private</span>:
511
 
<a name="l00493"></a>00493     <a class="code" href="a00106.html#17fd5ba52db3ddda05e6f8dd5000a1a4">bm::word_t</a>*   m_buf;
512
 
<a name="l00494"></a>00494     <span class="keywordtype">unsigned</span>      m_size;
513
 
<a name="l00495"></a>00495 };
514
 
<a name="l00496"></a>00496 
515
 
<a name="l00497"></a>00497 
516
 
<a name="l00498"></a>00498 
517
 
<a name="l00499"></a>00499 } <span class="comment">// namespace bm</span>
518
 
<a name="l00500"></a>00500 
519
 
<a name="l00501"></a>00501 <span class="preprocessor">#endif</span>
520
 
</pre></div></div>
521
 
<hr size="1"><address style="text-align: right;"><small>Generated on Mon Oct 12 12:16:39 2009 for BitMagic by&nbsp;
522
 
<a href="http://www.doxygen.org/index.html">
523
 
<img src="doxygen.png" alt="doxygen" align="middle" border="0"></a> 1.5.5 </small></address>
524
 
</body>
525
 
</html>