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Viewing changes to src/org/openscience/cdk/isomorphism/matchers/smarts/ImplicitHCountAtom.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Paul Cager
  • Date: 2008-04-09 21:17:53 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080409211753-46lmjw5z8mx5pd8d
Tags: upstream-1.0.2
Import upstream version 1.0.2

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Lines of Context:
src/org/openscience/cdk/isomorphism/matchers/smarts/ImplicitHCountAtom.java
 
1
/* $RCSfile$
 
2
 * $Author: sushil_ronghe $
 
3
 * $Date: 2007-04-17 20:49:16 +0200 (Tue, 17 Apr 2007) $
 
4
 * $Revision: 8208 $
 
5
 * 
 
6
 * Copyright (C) 2004-2007  The Chemistry Development Kit (CDK) project
 
7
 *
 
8
 * Contact: cdk-devel@lists.sourceforge.net
 
9
 * 
 
10
 * This program is free software; you can redistribute it and/or
 
11
 * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
 
12
 * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
 
13
 * of the License, or (at your option) any later version.
 
14
 * 
 
15
 * This program is distributed in the hope that it will be useful,
 
16
 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
 
17
 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
 
18
 * GNU Lesser General Public License for more details.
 
19
 * 
 
20
 * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
 
21
 * along with this program; if not, write to the Free Software
 
22
 * Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301 USA.
 
23
 */
 
24
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts;
 
25
 
 
26
import org.openscience.cdk.interfaces.IAtom;
 
27
 
 
28
/**
 
29
 * This matcher checks the number of implicit hydrogens of the Atom.
 
30
 *
 
31
 * @cdk.module extra
 
32
 */
 
33
public class ImplicitHCountAtom extends SMARTSAtom {
 
34
    
 
35
    private static final long serialVersionUID = 6752937431492584928L;
 
36
    
 
37
    private int hCount;
 
38
    
 
39
    public ImplicitHCountAtom(int hCount) {
 
40
        this.hCount = hCount;
 
41
    }
 
42
    public ImplicitHCountAtom(){
 
43
        this.hCount = Default;
 
44
    }
 
45
   
 
46
    public int getOperator(){
 
47
        if(ID!=null && this.hCount==Default)
 
48
            return 1;
 
49
        else if(ID!=null && this.hCount!=Default)
 
50
            return 2;
 
51
        else if(this.hCount==Default)
 
52
            return 3;
 
53
        else if(this.hCount!=Default)
 
54
            return 4;
 
55
        return 5;
 
56
    }
 
57
    private int getIMPH(IAtom atom){
 
58
        return atom.getHydrogenCount();
 
59
    }
 
60
    public boolean matches(IAtom atom) {
 
61
        switch(getOperator()){
 
62
            case 1:return defaultOperatorCheck(atom);
 
63
            case 2:return nonDefaultOperatorCheck(atom);
 
64
            case 3:return defaultCheck(atom);
 
65
            case 4:return nonDefaultCheck(atom);
 
66
            default:return false;
 
67
        }
 
68
    };
 
69
    private boolean defaultCheck(IAtom atom){
 
70
        if(getIMPH(atom)!=0)return true;
 
71
        return false;
 
72
    }
 
73
    private boolean nonDefaultCheck(IAtom atom){
 
74
        if(getIMPH(atom)!=0 && getIMPH(atom)==this.hCount) return true;
 
75
        return false;
 
76
    }
 
77
    private boolean defaultOperatorCheck(IAtom atom){
 
78
        if(getIMPH(atom)==0)return true;
 
79
        return false;
 
80
    }
 
81
    private boolean nonDefaultOperatorCheck(IAtom atom){
 
82
        if(getIMPH(atom)!=0 && getIMPH(atom)!=this.hCount) return false;
 
83
        return false;
 
84
    }
 
85
    public String toString() {
 
86
                StringBuffer s = new StringBuffer();
 
87
                s.append("ImplicitHCountAtom(");
 
88
        s.append(this.hashCode() + ", ");
 
89
                s.append("IH:" + hCount);
 
90
                s.append(")");
 
91
                return s.toString();
 
92
    }
 
93
}
 
94