~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/nco/trusty

<!-- $Header: /cvsroot/nco/nco/doc/index.shtml,v 1.870 2014/02/20 22:03:55 zender Exp $

http://nco.sf.net/index.shtml

/usr/bin/scp ~/nco/doc/index.shtml ~/nco/doc/logo_cog.png ~/nco/doc/logo_cog_nmr.png ~/nco/doc/logo_nco_stk.png ~/nco/doc/logo_pch.png ~/nco/doc/logo_srl.png ~/nco/doc/nasa.png ~/nco/doc/nco.png ~/nco/doc/nsf.png zender,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

scp -p ~/nco/doc/index.shtml ~/nco/doc/logo_cog.png ~/nco/doc/logo_cog_nmr.png ~/nco/doc/logo_nco_stk.png ~/nco/doc/logo_pch.png ~/nco/doc/logo_srl.png ~/nco/doc/nasa.png ~/nco/doc/nco.png ~/nco/doc/nsf.png dust.ess.uci.edu:/var/www/html/nco

<a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9831">Developer</a> /

<a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9829">Discussion</a> /

<a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9830">Help</a> /

[<a href="https://wiki.earthdata.nasa.gov/display/ESDSWG/Dataset+Interoperability+Working+Group">DIWG</a>] 

[<a href="http://www.gnu.org/software/gsl">GSL</a>]

<p><h2>

Current NCO version is 4.4.2 last updated on <!--#flastmod file="VERSION"-->

</h2>

<img src="logo_nco_stk.png" height=442 width=722 align=top>

<!--

-->

NCO manipulates data stored in

<a href="http://www.unidata.ucar.edu/packages/netcdf">netCDF</a>-accessible

formats, including 

<a href="http://hdfgroup.org/products/hdf4">HDF4</a> and 

<a href="http://hdfgroup.org/HDF5">HDF5</a>.

It also exploits the geophysical expressivity of many 

<a href="http://cf-pcmdi.llnl.gov/documents/cf-conventions/latest-cf-conventions-document-1">CF</a> 

(Climate &amp; Forecast) metadata conventions, 

the flexible description of physical dimensions translated by

<a href="http://www.unidata.ucar.edu/packages/udunits">UDUnits</a>,

the network transparency of

<a href="http://opendap.org">OPeNDAP</a>, 

the storage features (e.g., compression, chunking, groups) of

<a href="http://hdfgroup.org">HDF</a> (the Hierarchical Data Format),

and many powerful mathematical and statistical algorithms of 

<a href="http://www.gnu.org/software/gsl">GSL</a> (the GNU Scientific Library).

NCO is 

<a href="http://dust.ess.uci.edu/ppr/ppr_ZeM07.pdf">fast</a>, 

<a href="http://dust.ess.uci.edu/ppr/ppr_Zen08.pdf">powerful</a>,

and 

<a href="http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html">free</a>.

<li>2014 Mar&nbsp;25: (TBD) NCO <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/pst_nco_esds_201403.pdf">Poster</a> for NASA ESDSWG, Greenbelt, Maryland</li>

<li>2014 Feb&nbsp;??: NCO 4.4.3 (<i>In progress</i>)

<li>2014 Feb&nbsp;20: NCO 4.4.2 (Stability)

<li>2014 Jan&nbsp;29: NCO 4.4.1 (Stability)

<li>2014 Jan&nbsp;09: NCO 4.4.0 (Stability)

<li>2013 Dec&nbsp;13: NCO <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_nco_agu_201312.pdf">Talk</a> at Fall AGU, San Francisco, California</li>

<li>2013 Dec&nbsp;02: NCO 4.3.9 (new operator, <tt>nces</tt>)

<li>2013 Nov&nbsp;06: NCO 4.3.8 (<tt>ncatted</tt> groups)

<li>2013 Oct&nbsp;17: NCO 4.3.7 (HDF4, XML, <tt>ncrename</tt> groups)

<li>2013 Oct&nbsp;02: NCO <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/pst_nco_esds_201310.pdf">Poster</a> for NASA ESDSWG, Greenbelt, Maryland</li>

<li>2013 Sep&nbsp;27: NCO 4.3.6 (<tt>--dbl</tt> default, <tt>ncdismember</tt>)

<li>2013 Sep&nbsp;20: NCO 4.3.5 (<tt>nces</tt>, <tt>ncra</tt>, <tt>ncrcat</tt> groups)

<li>2013 Aug&nbsp;01: NCO 4.3.4 (<tt>ncpdq</tt> bugfix, HDF unpacking)

<li>2013 Jul&nbsp;24: NCO 4.3.3 (<tt>ncrename</tt>, <tt>ncwa</tt> groups, CDL, XML)

<li>2013 Jul&nbsp;05: NCO 4.3.2 (<tt>ncflint</tt>, <tt>ncpdq</tt> groups)</li>

<li>2013 Jun&nbsp;03: Submitted NASA ACCESS 2013 <a href="http://dust.ess.uci.edu/prp/prp_axs/prp_axs.pdf">proposal</a></li>

<li>2013 May&nbsp;01: NCO 4.3.1 (Group broadcasting)</li>

<li>2013 Mar&nbsp;28: NCO 4.3.0 (<tt>ncbo</tt> groups)</li>

<li>2013 Mar&nbsp;19: NCO 4.2.6</li>

<li>2013 Jan&nbsp;28: NCO 4.2.5</li>

<li>2013 Jan&nbsp;21: NCO 4.2.4</li>

<li>2012 Dec&nbsp;05: NCO <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_nco_agu_201212.pdf">Talk</a> at Fall AGU, San Francisco, California</li>

<li>2012 Nov&nbsp;28: NCO <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/pst_nco_esds_201211.pdf">Poster</a> at NASA ESDSWG, Annapolis, Maryland</li>

<li>2012 Nov&nbsp;13: NCO 4.2.3 (GPE)</li>

<li>2012 Oct&nbsp;29: NCO 4.2.2 (<tt>ncks, ncecat</tt> Groups)</li>

<li>2012 Aug&nbsp;02: NCO 4.2.1 (RAM disks)</li>

<li>2012 Jun&nbsp;12: NCO 4.2.0 (Windows support)</li>

<li>2012 Apr&nbsp;23: Received funding for NASA ACCESS 2011 <a href="#prp_access">project</a></li>

<li>2012 Mar&nbsp;29: NCO 4.1.0 (MD5 support, MM3)</li>

<li>2011 Jun&nbsp;03: Submitted NASA ACCESS 2011 <a href="http://dust.ess.uci.edu/prp/prp_access/prp_access.pdf">proposal</a></li>

<li>2008 Aug&nbsp;08: NCO <a href="http://nco.wiki.sf.net">Wiki</a>!</li>

<li>2007 Feb&nbsp;22: SWAMP <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_WZJ07_opendap_200702.pdf">Talk</a> at OPeNDAP Developer's Workshop, Boulder, Colorado</li>

<p>The netCDF Operators (NCO) comprise a dozen standalone,

command-line programs that take 

<a href="http://www.unidata.ucar.edu/packages/netcdf">netCDF</a> or

<a href="http://hdfgroup.org">HDF</a> 

files in text, binary, or netCDF formats.

<li><a href="./nco.html#nces"><tt>nces</tt></a> netCDF Ensemble Statistics (<a href="./nco.html#xmp_nces">examples</a>)</li>

(<tt>ncra</tt> and <tt>ncwa</tt>) are misnamed because they perform

itself: there are no restrictions on the contents of input file(s).

<dt>Donations received between 20030624 and 20120301: US$144.55. Thank you, donors!</dt>

from 20120208&ndash;20140207 as part of the 

<a href="http://science.nasa.gov/earth-science/earth-science-data/access">Advancing Collaborative Connections for Earth System Science (ACCESS)</a> program.

We appreciate the proposal reviewers for and the staff of the 

<a href="http://science.nasa.gov/researchers/sara/division-corner/earth-science-division-corner">Earth Science Division (ESD) Research and Analysis (R\&A)</a>

<a href="http://science.nasa.gov/about-us/organization-and-leadership">Science Mission Directorate (SMD)</a>.

NCO development was completely voluntary and without

institutional support from August, 2008&ndash;February, 2012.

This NASA support dramatically changed the scale and pace of NCO development. 

<p>We recruited (i.e., these positions have been filled) two

personnel, a programmer (aka software engineer) 

and a graduate student (scientific specialist) both based at UCI for

at least two years, to accomplish our ACCESS objectives. 

is re-factoring the code-base to support groups, writing wrappers for

NCO, an improving the build system (e.g., now we have native Windows builds!).

is analyzing and intercomparing snow cover and snow albedo datasets

from NASA MODIS and MISR datasets (in HDF format) and CMIP5

simulations (in netCDF format).

Her analysis informs the development of NCO commands and wrappers for

HDF atasets so that we solve the most important problems real-world

researchers encounter in evaluating GCMs against NASA data.</p> 

 

<a href="xmp_cesm.html">Pre-ACCESS CMIP5/MODIS analysis scripts</a>

<!-- Copy files from http://glace.ess.uci.edu

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/index.shtml pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/xmp_cesm.html pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/cesm-eg.fig1.png pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/cesm-eg.fig2.png pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/cesm-eg.fig3.png pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

 

--> 

 

 

 

<li><!-- ZVW13 --> <a name="ZVW12"></a> <!--http://www.ess.uci.edu/~zender#ZVW13 -->

Zender, C.&nbsp;S., P.&nbsp;Vicente and W.&nbsp;Wang (2012): <i>Use Hierarchical Storage and Analysis to Exploit Intrinsic Parallelism</i>. Presented at the Fall Meeting of the American Geophysical Union, San Francisco,&nbsp;CA, December 9&ndash;13, 2013. <i>Eos Trans. AGU</i>, <b>93</b>(53), Fall Meet. Suppl., Abstract IN52A-06.

<a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_nco_agu_201312.pdf">PDF</a> (&copy;&nbsp;2013 by me)</a></li>

 

<li><!-- ZVW13 --> <a name="ZVW13"></a> <!--http://www.ess.uci.edu/~zender#ZVW13 -->

Zender, C.&nbsp;S., P.&nbsp;Vicente and W.&nbsp;Wang (2013): <i>The Future of Model Evaluation</i>. Presented to the Chapman University Symposium on Big Data and Analytics: 44th Symposium on the Interface of Computing Science and Statistics, Chapman University, Orange,&nbsp;CA, April 4&ndash;6, 2013. <a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_nco_chapman_201304.pdf">PDF</a> (&copy;&nbsp;2013 by me)</a></li>

 

<li><!-- ZVW12 --> <a name="ZVW12"></a> <!--http://www.ess.uci.edu/~zender#ZVW12 -->

Zender, C.&nbsp;S., P.&nbsp;Vicente and W.&nbsp;Wang (2012): <i>NCO: Simpler and faster model evaluation by NASA satellite data via unified file-level netCDF and HDF-EOS data post-processing tools.</i>. Presented at the Fall Meeting of the American Geophysical Union, San Francisco,&nbsp;CA, December 3&ndash;7, 2012. <i>Eos Trans. AGU</i>, <b>93</b>(53), Fall Meet. Suppl., Abstract IN34A-07.

<a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/smn_nco_agu_201212.pdf">PDF</a> (&copy;&nbsp;2012 by me)</a></li>

 

<li><!-- ZVW12 --> <a name="ZVW12"></a> <!--http://www.ess.uci.edu/~zender#ZVW12 -->

Zender, C.&nbsp;S., P.&nbsp;Vicente and W.&nbsp;Wang (2012): <i>Simplifying and accelerating model evaluation by NASA satellite data.</i>. Presented to the Earth Science Data Systems Working Group (ESDSWG) Meeting, Annapolis&nbsp;MD, November 13&ndash;15, 2012.

<a href="http://dust.ess.uci.edu/smn/pst_nco_esds_201211.pdf">PDF</a> (&copy;&nbsp;2012 by me)</a></li>

 

<li><b>NCO 4.4.4</b>: (<i>Future</i>) 

extensive hashing?;

Optimize diskless files?;</li>

<li><b>NCO 4.4.3</b>: (<i>In Progress, features completed or being worked on include</i>)

<tt>cnk_map=rew</tt>;

<a href="http://nco.sf.net/nco.html#cnk">Chunking</a> bytes not elements, caching;</li>

<li><b>NCO 4.4.2</b>: (<i>Current Stable Release</i>)

Bugfixes for <tt>nces</tt>, LLVM/clang builds, <tt>-X</tt>;</li>

<li><b>NCO 4.4.1</b>: 

Group support for <tt>-X</tt> and <tt>--cnk_dmn</tt>;

Chunk and uncompress simultaneously;

<tt>ncra/ncea/ncrcat</tt> <a href="#bug_ncra_no_fl_close">bugfix</a></li>

<li><b>NCO 4.4.0</b>: 

Optimizations;

<tt>ncdismember</tt> awesomeness;

<tt>ncks --hdn</tt>;

<tt>ncks --fix_rec_dmn=all</tt>;

<tt>ncks</tt> <a href="http://nco.sf.net/nco.html#autoconv">autoconversion</a>;

<tt>ncrename</tt> output path;

<tt>ncra --mro</tt> <a href="#bug_ncra_mro_mss_val">bugfix</a>;

<tt>ncra/ncrcat</tt> stride bugfix;

Better <a href="http://nco.sf.net/nco.html#cnk">chunking</a>;

Group support for <tt>ncwa -w -m</tt>;</li>

<li><b>NCO 4.3.9</b>:

New operator <tt>nces</tt>;

Full XML/NcML compliance;

<tt>ncatted</tt> NaN bugfix;</li>

<li><b>NCO 4.3.8</b>:

<tt>ncatted</tt> group features;</li>

<li><b>NCO 4.3.7</b>:

HDF4 <a href="http://nco.sf.net/nco.html#hdf4">support</a>;

XML/NcML data <a href="http://nco.sf.net/nco.html#xml">support</a>;

Multiple record dimension <a href="http://nco.sf.net/nco.html#mrd">support</a> with <tt>ncpdq, ncecat --mrd</a></tt>;

<tt>ncrename</tt> group features;

<tt>ncap2</tt> file bugfix;

<tt>ncecat</tt> ID bugfix;

<tt>ncwa -b</tt> bugfix;</li>

<li><b>NCO 4.3.6</b>:

<tt>--flt</tt> default;

<tt>ncpdq/ncecat</tt> leave only one record dimension;

<tt>ncwa/nces</tt> bugfixes;

<tt>ncdismember</tt></li>

<li><b>NCO 4.3.5</b>: 

<tt>nces/ncra/ncrcat</tt> groups with <tt>-g -G --unn</tt>;</li>

<tt>nces/ncra/ncwa</tt> float&rightarrow;double coercion with <tt><a href="http://nco.sf.net/nco.html#dbl">--dbl</a></tt>;</li>

<tt>ncwa -d</tt> <a href="#bug_ncwa_lmt">bugfix</a>

<li><b>NCO 4.3.4</b>:

HDF unpacking <tt>--hdf_upk</tt>;

<tt>ncpdq</tt> unpacking <a href="#bug_ncpdq_upk">bugfix</a>;

CDL printing legibility;</li>

<li><b>NCO 4.3.3</b>:

CDL printing <tt>ncks --cdl</tt>;

<tt>ncrename -g</tt>;

<tt>ncwa</tt> groups with <tt>-g -G --unn</tt>;</li>

<li><b>NCO 4.3.2</b>:

<tt>ncflint/ncpdq</tt> groups with </tt>-g -G --unn</tt>;

<tt>ncks -X</tt> <a href="#bug_ncks_aux">bugfix</a>;</li>

<li><b>NCO 4.3.1</b>:

<tt>ncbo</tt> symmetry, group broadcasting;

<tt>ncbo -G --unn</tt>;

<tt>ncecat</tt> <a href="http://nco.sf.net/nco.html#rag">RAG</a>;

<tt>ncbo</tt> CF <a href="#bug_ncbo_ccm_ccsm_cf">bugfix</a>;

<tt>ncatted</tt> <a href="#bug_ncatted_strcmp">bugfix</a>;

Windows DAP;</li>

<li><b>NCO 4.3.0</b>: 

<tt>ncbo -g</tt> groups;

<tt>ncatted</tt> NULs;

<tt>ncap2</tt> rounding;

<tt>ncks</tt> metadata <a href="#bug_ncks_mtd">bugfix</a></li>

<li><b>NCO 4.2.6</b>: 

Record appending with <tt>ncra/ncrcat --rec_apn</tt>;

<tt>ncflint --fix_rec_crd</tt>;

RX's in full paths;

Correct dimension/coordinate scopes;

<tt>ncks</tt> MM3 bugfix;</li>

<li><b>NCO 4.2.5</b>: 

<tt>ncks --mk_rec_dmn</tt> <a href="#bug_ncks_mk_rec_dmn">bugfix</a>;

<tt>ncks</tt> subsetting <a href="#bug_ncks_sbs">bugfix</a></li>

<li><b>NCO 4.2.4</b>:

Group <a href="http://nco.sf.net/nco.html#rx">wildcards</a>;

Group <a href="http://nco.sf.net/nco.html#anchoring">anchoring and recursion</a>;

Intersection/union <a href="http://nco.sf.net/nco.html#unn">modes</a>;

<tt>ncrename</tt> global att. handling;

<tt>nces</tt> <a href="#bug_nces_rec_var">bugfix</a>;

<tt>ncra</tt> <a href="#bug_ncra_flg_bfr_nrm">bugfix</a></li>

<li><b>NCO 4.2.3</b>:

Group Path Editing (GPE);

<tt>ncecat</tt> <a href="#bug_ncecat_nintap">bugfix</a></li>

<li><b>NCO 4.2.2</b>: 

<tt>ncks</tt>, <tt>ncecat</tt> support groups;

<tt>--hdr_pad</tt> all operators;

<tt>ncks</tt> prints underscores;

fixes to <tt>--[mk/fix]_rec_dmn</tt>;

<tt>ncpdq</tt> fix;

<tt>ncwa</tt> on Windows;</li>

<li><b>NCO 4.2.1</b>: 

<tt>--ram_all</tt> for <a href="http://nco.sf.net/nco.html#diskless">diskless files</a>;

<tt>--no_tmp_fl</tt> to <a href="http://nco.sf.net/nco.html#no_tmp_fl">bypass</a> temporary files;

Negative indices for <a href="http://nco.sf.net/nco.html#hyp">hyperslabs</a>;

<tt>ncpdq</tt> unpacks coordinate variables;

<tt>ncra/ncrcat</tt> SSC/MRO <a href="http://nco.sf.net/nco.html#ssc">options</a>;

<tt>ncra/ncrcat</tt> rebase <a href="http://nco.sf.net/nco.html#rbs">bounds</a>;</li>

<li><b>NCO 4.2.0</b>: 

<tt>ncecat</tt> "fixes" auxiliary coordinates and bounds;

<tt>ncks</tt> uses <tt>nc__open</tt>, format <tt>NC_INT</tt> with <tt>%i</tt>;

<tt>ncra -y ttl</tt> fix;

<tt>ncrcat</tt> UDUnits fix;

<tt>ncwa</tt> and <tt>ncap2</tt> limited NaN support;

Microsoft Visual Studio support;</li>

<li><b>NCO 4.1.0</b>:

MD5 digests;

<tt>ncap2</tt> sorts &amp; maps;

<tt>ncks</tt> MM3 <a href="#bug_mm3">workaround</a>;

<tt>ncrename/ncatted</tt> chmods;

<tt>ncatted</tt> NaN support</li>

Fix <tt>nces -y ttl</tt>;

Warn when <tt>NC_MAX_ATTRS</tt> exceeded</li>

<li><b>NCO 4.0.8</b>: 

Fix <tt>NC_BYTE</tt> printing</li>

Fix degenerate hyperslab <a href="#bug_hyp_dgn">bug</a> (<i>upgrade recommended</i>)</li>

<tt>ncpdq</tt> warns when _FillValue outside packing range</li>

Fix <tt>ncra</tt> <a href="#bug_ncra_cf_crd_rec_crd">CF "coordinate" bug</a></li>

Do not pack coordinate variables</li>

Fix <tt>ncra</tt> <a href="#bug_ncra_date">bug</a> for some CF-compliant dates.</li>

<li><b>NCO 4.0.2</b>:

Fix <tt>ncatted</tt> appending <tt>NUL</tt>s.</li>

Easily create/remove record dimensions with <tt>ncks --mk_rec_dmn</tt>, <tt>--fix_rec_dmn</tt>;</li>

Better support CF <tt>calendar</tt> and <tt>coordinate</tt> attributes</li>

<li><b>NCO 3.9.9</b>:

<tt>ncrcat</tt> re-basing</li>

GSL distribution/RNG functions</li>

<tt>ncks --no_dmn_var_nm</tt> printing</li>

<a href="http://nco.sf.net/nco.html#gsl">GSL</a> math functions</li>

<li><b>NCO 3.9.5</b>:

<tt>ncap2</tt> builds on Solaris</li>

<tt>ncap2</tt>: masks, index arrays, print attributes, OpenMP, <tt>atan2()</tt>, <tt>pow()</tt></li>

<tt>ncap2</tt> OpenMP</li>

Change licenses to GPL3 and FDL1.2</li>

various and sundry build fixes</li>

Improve IRIX&nbsp;6.5 support</li>

<li><b>NCO 3.2.0</b>: More forgiving exclusion list (<tt>-x -v <i>var_nm</i></tt>) <a href="http://nco.sf.net/nco.html#xcl">handling</a>; Fix <tt>rmssdn</tt> normalization; Support Mac OS&nbsp;X on Intel; Documentation bugfixes</li>

<li><b>NCO 3.1.9</b>: <tt>ncap2</tt> in RPM packages; Quieter output; AIX <tt>configure</tt> supports <tt>ncap2</tt>; Update to DAP for netCDF 3.6.2; Fix <tt>nc[erw]a</tt> for coordinate min/max/ttl; <tt>ncecat</tt> allows files to differ in record dimension size</li>

<li><b>NCO 3.1.8</b>: Support <tt>_FillValue</tt> with compile-time switch; Debian package synchronized, includes <tt>ncap2</tt></li>

<li><b>NCO 3.1.7</b>: <tt>ncap2</tt> &ldquo;double-parsing&rdquo;, array initialization, supercedes <tt>ncap</tt></li>

<li><b>NCO 3.1.6</b>: Support <a href="http://nco.sf.net/nco.html#srd">stride</a> in all hyperslabbing operators; change more WARNINGs to INFOs</li>

<li><b>NCO 3.1.5</b>: New <tt>ncap2</tt> array and hyperslab features; change some WARNINGs to INFOs, add Pathscale and update PGI and Intel compiler support</li>

<li><b>NCO 3.1.4</b>: Fix <tt>ncbo</tt> memory problem; report timer results</li>

<li><b>NCO 3.1.3</b>: <tt>ncap2</tt> automatically <a href="http://nco.sf.net/nco.html#att_prp">propagates</a> attributes to new/derived variables; NCO handles record variables with zero records; <a href="http://nco.sf.net/nco.html#cnv_CF_crd">support</a> CF <tt>coordinates</tt> convention; <tt>ncwa -b</tt> <a href="http://nco.sf.net/nco.html#ncwa">retains</a> degenerate dimensions; build fixes for Cray T3E, Solaris, Cygwin.</li>

<li><b>NCO 3.1.2</b>: <tt>ncap2</tt> control structures (conditionals, loops, etc.); keep non-processed data <a href="bug_pack_fix">packed</a> in output file; binary operators <tt>ncbo</tt> and <tt>ncflint</tt> work when only one variable has <tt>missing_value</tt> attribute; change <tt>ncra</tt> and <tt>nces</tt> to always average coordinate variables</li>

<li><b>NCO 3.1.1</b>: NCO builds (again) with C++ compilers; ncap2 development code; server-side extensions</li>

<li><b>NCO 3.1.0</b>: MPI operators are bug-free; fix <t>./configure</t> for MPI and netCDF4; MRV algorithm speeds up <tt>ncwa</tt> 5&mdash;10 times; <tt>ncap</tt> random number generator <tt>rnd_nbr()</tt></li>

<li><b>NCO 3.0.3</b>: Eliminate all critical read regions (accelerates all SMP operators); builds with netCDF4 alpha; read <t>NETCDF4_CLASSIC</t> (i.e., HDF) files automatically; write <t>NETCDF4</t> files <a href="http://nco.sf.net/nco.html#netcdf4">on request</a>; <a href="http://nco.sf.net#BM">benchmark results</a> quantify parallelism.</li>

<li><b>NCO 3.0.2</b>: Fewer critical read regions; all known memory leaks plugged; better Intel compiler support; <tt>SFTP</tt> protocol support; FTP protocol supports <tt>.netrc</tt>-based passwords; better model grid-property-awareness (e.g., <tt>lat_bnds</tt>); <tt>ncatted</tt> <tt>ncks</tt>, <tt>ncrename</tt> support metadata header padding with <tt>--hdr</tt>; <tt>ncbo</tt> supports heterogeneous variable ordering; <tt>ncatted</tt> bugfix</li>

  <li><b>NCO 3.0.1</b>: benchmarks; <tt>ncks</tt> printing tweaks; memory cleanup; <tt>ncap</tt> double-parse speedup and <a href="bug_ncap_cmt">exponentiation bugfix</a>; thread operators by default</li>

  <li><b>NCO 3.0.0</b>: New <tt>ncks -P</tt> print switch; <tt>ncap</tt> optimizations; <tt>-Z</tt> option supports 64-bit offsets (requires netCDF&nbsp;3.6); NEC&nbsp;SX build improvements; support GCC&nbsp;3.4.X; <tt>nco_put_vara()</tt> overloads in <tt>libnco_c++</tt></li>

<li><b>NCO 2.9.9</b>: <tt>ncpdq</tt> packs/unpacks entire files; <tt>ncbo</tt> is threaded</li>

<li><b>NCO 2.9.8</b>: <a href="./nco.html#ncpdq"><tt>ncpdq</tt></a> released; <tt>ncwa --msk_sng</tt> consolidated mask switch; C99 compiler required</li>

<li><b>NCO 2.9.7</b>: Read input file lists from <tt>stdin</tt>; write <tt>nco_input_file_list</tt> attributes; add <tt>nco_put_att&lt;int,short,long&gt;</tt> functions to libnco_c++; large file support (LFS); write <tt>nco_openmp_thread_number</tt> attribute</li>

<li><b>NCO 2.9.6</b>: Support <tt>-o fl_out</tt> syntax; 64-bit ABI for x86_64; <a href="http://www.debian.org">Debian</a> builds libnco_c++</li>

<li><b>NCO 2.9.5</b>: <tt>ncflint</tt> handles <tt>missing_value</tt> data better, is commutative when weights are equal</li>

<li><b>NCO 2.9.4</b>: <tt>ncecat</tt> works on pure scalar files; change to <tt>cvs.sf.net</tt>; AIX GCC builds</li>

<li><b>NCO 2.9.3</b>: <tt>ncra</tt> and <tt>nces</tt> now <a name="bug_mss_val_zro_ncra">work correctly</a> when <tt>missing_value</tt> equals zero or any intermediate sums</li>

<li><b>NCO 2.9.2</b>: <tt>ncap</tt> <tt>S/V</tt>, <tt>S%V</tt>, and <tt>S^V</tt> <a href="#bug_ncap_cmt">operations fixed</a> (<tt>S</tt> = scalar, <tt>V</tt> = variable)</li>

<li><b>NCO 2.9.1</b>: <tt>ncwa</tt> works again on packed <tt>NC_FLOAT</tt> data (<a href="#bug_pck_ncwa">broke when?</a>)</li>

<li><b>NCO 2.9.0</b>: Complete <tt>ncap</tt> modulo operator (<tt>V%S</tt>) and generic exponentiation (<tt>V^S</tt>), scalar divided by variable (<tt>S/V</tt>); workaround stack memory problem with GCC extensions; fix <tt>make check</tt></li>

<li><b>NCO 2.8.8</b>: <tt>--enable-[optimize/debug]-custom</tt> options for GCC work again (broke in 2.8.6)</li>

<li><b>NCO 2.8.7</b>: <tt>ncap</tt> packing works again (<a href="#bug_pck">broke in 2.8.4</a>); Cygwin builds work again</li>

<li><b>NCO 2.8.6</b>: AIX and IRIX builds work again; custom GCC builds with <tt>-Werror</tt></li>

<li><b>NCO 2.8.5</b>: Solaris <tt>make install</tt> works; <tt>ncap</tt> changes attribute values correctly; <a href="#bld_DODS">Support DODS 3.4+, deprecate 3.3-</a>; add <tt>--enable-[optimize/debug]-custom</tt> options to <tt>./configure</tt></li>

<li><b>NCO 2.8.4</b>: Index-based hyperslabs work again (<a href="#bug_idx_hyp">broke in 2.7.3</a>, <i>upgrade highly recommended</i>); <tt>ncap</tt> peak memory usage reduced still more; support for AMD Opteron x86_64 architecture</li>

<li><b>NCO 2.6.0</b>: All arithmetic operators (<tt>ncap</tt>, <tt>ncdiff</tt>, <tt>nces</tt>, <tt>ncflint</tt>, <tt>ncra</tt>) support unpacking</li>

<li><b>NCO 2.0.1</b>: Add user-configurable multi-threaded capability to arithmetic-intensive operators <tt>ncwa</tt>, <tt>nces</tt>, and <tt>ncra</tt></li>

<li><b>NCO 2.0.0</b>: (RPM available) <a href="./nco_news.shtml#20010507">20010507</a>: Switched all internal calls to netCDF&nbsp;3.x API</li>

<li><b>NCO 1.2</b>: <a href="./nco_news.shtml#20000730">20000730</a>: Added non-linear operations to <tt>ncra/nces</tt> and <tt>ncwa</tt>: min,max,total,rms,rmssdn,sqrt. Added <a href="http://opendap.org">DODS</a> compliance.</li>

<!-- http://nco.sf.net#binaries -->

<ul> <!-- http://nco.sf.net/src/nco-4.2.5.aix53.tar.gz -->

<li><a href="src/nco-4.2.5.aix53.tar.gz">nco-4.2.5.aix53.tar.gz</a> (<!--#fsize file="src/nco-4.2.5.aix53.tar.gz"-->): Executables AIX 5.3-compatible (last updated <!--#flastmod file="src/nco-4.2.5.aix53.tar.gz"-->). Maintained by NCO Project.</li>

<li><a href="http://www.debian.org">Debian</a> and <a href="http://www.ubuntu.com">Ubuntu</a> GNU/Linux-compatible Intel systems, prebuilt binary executable <a href="http://www.debian.org">deb</a>: <a href="http://packages.debian.org/testing/math/nco.html">nco-4.4.2</a></li>

NCO packages in the Debian/Ubuntu repositories (i.e., Sid and Raring) generally lag the packages distributed here by 6&ndash;12 months.

<dt>Debian package for most recent NCO release (install with, e.g., &lsquo;<tt>dpkg --install nco_4.4.2-1_i386.deb</tt>&rsquo;):</dt>

<li><a href="src/nco_4.4.2-1_amd64.deb">nco_4.4.2-1_amd64.deb</a> (<!--#fsize file="src/nco_4.4.2-1_amd64.deb"-->): Executables AMD64-compatible (last updated <!--#flastmod file="src/nco_4.4.2-1_amd64.deb"-->)</li>

<li><a href="src/nco_4.4.2-1.dsc">nco_4.4.2-1.dsc</a> (<!--#fsize file="src/nco_4.4.2-1.dsc"-->): Description (last updated <!--#flastmod file="src/nco_4.4.2-1.dsc"-->)</li>

<li><a href="src/nco_4.4.2-1_amd64.changes">nco_4.4.2-1_amd64.changes</a> (<!--#fsize file="src/nco_4.4.2-1_amd64.changes"-->): Changes since last deb package (last updated <!--#flastmod file="src/nco_4.4.2-1_amd64.changes"-->)</li>

<li><a href="src/nco_4.4.2.orig.tar.gz">nco_4.4.2.orig.tar.gz</a> (<!--#fsize file="src/nco_4.4.2.orig.tar.gz"-->): Upstream Source (last updated <!--#flastmod file="src/nco_4.4.2.orig.tar.gz"-->)</li>

<li><a href="src/nco_4.4.2-1.diff.gz">nco_4.4.2-1.diff.gz</a> (<!--#fsize file="src/nco_4.4.2-1_amd64.changes"-->): Debian patch to upstream source (last updated <!--#flastmod file="src/nco_4.4.2-1_amd64.changes"-->)</li>

<dt>The <a href="https://admin.fedoraproject.org/pkgdb/packages/name/nco">Fedora NCO</a> RPMs are usually up-to-date so that &lsquo;<tt>yum install nco</tt>&rsquo; will install a recent version. 

A comprehensive list of pre-built RPMs for many OS's is <a href="http://rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=nco">here</a>.

<li><a href="ftp://rpmfind.net/linux/fedora/linux/development/rawhide/x86_64/os/Packages/n/nco-4.3.2-1.fc20.x86_64.rpm">nco-4.3.2-1.fc20.x86_64.rpm</a>: Executables for x86_64/Fedora Core&nbsp;20-compatible environments</li></dt>

<dt>If not, try our own most recent (we stopped building RPMs many years ago and are looking for a volunteer to do this instead) self-built NCO RPMs (install with, e.g., &lsquo;<tt>yum install nco-3.9.5-1.fc7.i386.rpm</tt>&rsquo;):

<!-- 

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/index.shtml pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/windows_setup/nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs/src

The most up-to-date binaries are probably those in the tarball below. Those unfamiliar with installing executables from tarballs may try the (older) <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Apple_Disk_Image">DMG</a> files (you may need to add <tt>/opt/local/bin</tt> to your executable path to access those operators).

<li><a href="src/nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz">nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz</a> (<!--#fsize file="src/nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz"-->): Executables MacOSX 10.9-compatible (last updated <!--#flastmod file="src/nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz"-->). 

(NB: These executables require the <a href="http://trac.macosforge.org/projects/macports/wiki">MacPorts</a> dependencies for <a href="http://svn.macports.org/repository/macports/trunk/dports/science/nco">NCO</a>). Maintained by NCO Project.</li>

<li><a href="http://trac.macosforge.org/projects/macports/wiki">MacPorts</a> infrastructure for <a href="http://svn.macports.org/repository/macports/trunk/dports/science/nco">NCO</a>: <a href="http://svn.macports.org/repository/macports/trunk/dports/science/nco">Portfile</a> for NCO 3.9.9. Maintained by Takeshi Enomoto.</li>

</ul>

 

<a name="visual"></a> <!-- http://nco.sf.net#visual -->

<a name="mvs"></a> <!-- http://nco.sf.net#mvs -->

<a name="windows"></a> <!-- http://nco.sf.net#windows -->

<h3><a href="http://www.microsoft.com">Microsoft</a> Windows</a>

(native build, compiled with <a href="http://www.microsoft.com/visualstudio/en-us/products/2010-editions/express">Visual Studio 2010</a>, use this if unsure)</h3>

These native Windows executables should be stand-alone, i.e., not

require users to have any additional software. 

This is a new feature as of 20120615, please send us feedback. 

To build NCO from source yourself using MSVC or Qt, please see the <a href="nco_qt_msvc.shtml">NCO Qt/MSVC build</a> page.

<ul>

<!-- Copy files from http://glace.ess.uci.edu

/usr/bin/scp /home/pvicente/nco/doc/index.shtml pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs

/usr/bin/scp /home/pvicente/windows_setup/nco-4.4.1.windows.mvs.exe pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs/src

/usr/bin/scp /home/pvicente/windows_setup/nco-4.4.1.win32.cygwin.tar.gz pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs/src

/usr/bin/scp /home/pvicente/windows_setup/nco-4.4.1.macosx.10.9.tar.gz pvicente,nco@web.sf.net:/home/project-web/nco/htdocs/src

-->

<li><a href="src/nco-4.4.1.windows.mvs.exe">nco-4.4.1.windows.mvs.exe</a> (<!--#fsize file="src/nco-4.4.1.windows.mvs.exe"-->) : Windows Self-Extracting Installer (last updated <!--#flastmod file="src/nco-4.4.1.windows.mvs.exe"-->). Maintained by NCO Project.</li>

</ul>

 

<a name="cygwin"></a> <!-- http://nco.sf.net#cygwin -->

<h3><a href="http://www.microsoft.com">Microsoft</a> Windows</a> (running <a href="http://www.cygwin.org">Cygwin</a> environment, compiled with GNU-toolchain)</h3>

<ul>

<li><a href="src/nco-4.4.1.win32.cygwin.tar.gz">nco-4.4.1.win32.cygwin.tar.gz</a> (<!--#fsize file="src/nco-4.4.1.win32.cygwin.tar.gz"-->): Executables Cygwin-compatible (last updated <!--#flastmod file="src/nco-4.4.1.win32.cygwin.tar.gz"-->). Maintained by NCO Project.</li>

Thanks to Mark Hadfield for creating Cygwin tarballs.

<dt><a name="rtfm"></a></dt>

contain all the mathematical formulae (typeset with TeX) missing from

the screen-oriented formats. 

<!--

<li>NCO had a <a href="http://nco.wiki.sf.net">Wiki</a> for a few

  years beginning in August, 2008. 

  The Wiki contained a <a href="http://nco.wiki.sf.net/Cookbook">Cookbook</a> 

  of NCO examples not found in the manual. 

  Volunteers are encouraged to add their own &ldquo;NCO Hacks&rdquo; to this cookbook!</li>

-->

<!-- This documentation went MIA sometime in 2010:

-->

<a href="http://www.ncl.ucar.edu/Training/Workshops/PPTS/nco.ppt">Slideshow</a> and

Otherwise, you may be on your own.</li>

The NCAR CISL-suported executables are made available through

&ldquo;modules&rdquo; so try <tt>module add nco</tt>.

If you notice problems with the NCO installation on CISL machines,

<a href="src/nco-4.4.2.tar.gz">nco-4.4.2.tar.gz</a> 

(<!--#fsize file="src/nco-4.4.2.tar.gz"--> compressed tar-file)<br>

<!--#exec cmd="openssl dgst -md5 src/nco-4.4.2.tar.gz"--><br>

<!--#exec cmd="openssl dgst -sha1 src/nco-4.4.2.tar.gz"--> 

<!-- Equivalent source browsing in Unidata's netCDF SVN repository:

     http://svn.unidata.ucar.edu/repos/netcdf/trunk/ncdump/nccopy.c -->

This command retrieves and places NCO version <tt>4.4.2</tt> (which is

tagged as <tt>nco-4_4_2</tt> due to CVS rules) into local directory

<tt>nco-4.4.2</tt>:   

<p><tt>cvs -z3 -d:pserver:anonymous@nco.cvs.sf.net:/cvsroot/nco co -r nco-4_4_2 -d nco-4.4.2 nco</tt></p>

(e.g., <tt>nco-4_4_2</tt>) and the development version is that the

<tt>4.4.2</tt>) when asked to do so with the <tt>-r</tt> flag

 <a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9829">forums</a>.

<li>Although building NCO yourself can be easy, sexy, and lucrative,

we recommend that you first try the pre-built binaries for your

system, e.g.,  

<dt>sudo aptitude install nco # Debian-based systems like Debian, Mint, Ubuntu</dt>

<dt>sudo yum-install nco      # RPM-based systems like CentOS, Fedora, RHEL</dt>

If the pre-built executables do not satisfy you, or are out-of-date

and you want the latest, greatest NCO features, then the recommended

first steps to build (i.e., compile, for the most part) NCO from

source code are to install 

<a href="http://www.antlr.org">ANTLR 2.7.x</a> (not version 3.x or 4.x!) (required for <tt>ncap2</tt>), 

If possible, install this software stack from pre-built binaries 

(commands to do so on Debian and RPM systems are given just below).

Failing that (e.g., you lack root access or are on a non-package

system such as AIX), build these all with the same compiler (and switches).

Recent versions of netCDF automatically build OPeNDAP and UDUnits.

ANTLR&nbsp;3.x and 4.x C++ interfaces are incomplete.

<dt><a name="apt"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#apt -->

<dt><a name="aptitude"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#aptitude -->

<dt><a name="bld_apt"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#bld_apt -->

For the reasons explained above (compiler compatibility) install as

much pre-requisite and optional software as possible from pre-compiled

packages. 

This is easy on modern package-oriented OSs. 

For Debian-based systems:

<dt>sudo aptitude install libcurl4-gnutls-dev libexpat1-dev libxml2-dev # DAP-prereqs (curl, expat XML parser) </dt>

<dt>sudo aptitude install libhdf5-serial-dev # HDF5</dt>

</tt>

 

<dt><a name="yum"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#yum -->

<dt><a name="bld_yum"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#bld_yum -->

For RPM-based systems:

<tt>

<dt>sudo yum install antlr antlr-C++ -y # ANTLR</dt>

<dt>sudo yum install curl-devel libxml2-devel -y # DAP-prereqs</dt>

<dt>sudo yum install expat expat-devel -y # expat XML parser, a UDUnits-prereq (RHEL only?)</dt>

<dt>sudo yum install libdap libdap-devel -y # DAP</dt>

<dt>sudo yum install bison flex gcc gcc-c++ -y # GNU toolchain</dt>

<dt>sudo yum install gsl gsl-devel -y # GSL</dt>

<dt>sudo yum install netcdf netcdf-devel -y # netCDF</dt>

<dt>sudo yum install librx librx-devel -y # RX</dt>

<dt>sudo yum install udunits2 udunits2-devel -y # UDUnits</dt>

</tt>

 

<dt><a name="port"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#port -->

<dt><a name="bld_macports"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#bld_macports -->

For Mac OS X with MacPorts:

<tt>

<dt>sudo port install libdap # DAP</dt>

<dt>sudo port install gsl # GSL</dt>

<dt>sudo port install netcdf # netCDF</dt>

<dt>sudo port install udunits2 # UDUnits</dt>

<li>Once you have installed the pre-requisites as shown above, you may

  then build the latest stable NCO and install it in,

  e.g., <tt>/usr/local</tt> with: 

<tt>

<dt>wget http://dust.ess.uci.edu/nco/nco.tar.gz</dt>

<dt>tar xvzf nco.tar.gz</dt>

<dt>cd nco-4.4.2</dt>

<dt>./configure --prefix=/usr/local</dt>

<dt>make</dt>

<dt>sudo make install</dt>

<dt>export PATH=/usr/local/bin\:${PATH}</dt>

<dt>export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib\:${LD_LIBRARY_PATH}</dt>

</tt>

<dt><a name="bonobo"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#bonobo -->

<dt><a name="bnb"></a></dt> <!-- http://nco.sf.net#bnb -->

Please post questions about building or installing NCO to the 

<a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9830">list</a>

only after reading and attempting to follow these instructions.

To indicate you have done this, include the word &ldquo;bonobo&rdquo;

in the first sentence of your post. 

Yes, &ldquo;bonobo&rdquo;.

Otherwise we will likely redirect you here.

For more sophisticated build/install options, see the next section.

If the simple <tt>configure</tt> recipe above does not work, savvy

on their machines.

Plaform-specific build hints (CentOS, Mac OS&nbsp;X, RHEL, Solaris)

are listed <a href="#bld_plt_spc">below</a>.

<!-- http://nco.sf.net#bld_plt_spc -->

<a name="bld_plt_spc"></a>

The most common problem with building on SGI IRIX is an out-of-date toolchain.

<!-- http://nco.sf.net#bld_rhel -->

<a name="bld_rhel"></a>

<a name="bld_centos"></a> <!-- http://nco.sf.net#bld_centos -->

<li><i>RHEL build hints:</i>

Scripts for generating executables for recent (4.0.x, ~2011) versions of NCO for RedHat Enterprise Linux&nbsp;5 (RHEL5) and CentOS5 platforms are described <a href="http://sf.net/projects/nco/forums/forum/9830/topic/4089501">here</a>.

Older information on building x86_64 RPMs is available <a href="http://dust.ess.uci.edu/wangd/s9y">here</a>.

</li>

 

 

<!--Qt/MSVC -->

<li><i>Windows build with Qt/MSVC:</i>

As of NCO 4.2.0, you may build NCO from source using MSVC and Qt, please see the <a href="nco_qt_msvc.shtml">NCO Qt/MSVC build</a> page.

</li>

 

Users at NCAR/NWSC should first try the CISL-<i>supported</i>

executables with <tt>module load nco</tt>. 

The unsatisfied or adventurous may try my personal executables which

are built from the &ldquo;main trunk&rdquo; of NCO, not a tagged

version, and therefore may behave slightly differently.

<li>UCI ESS <tt>greenplanet.ps.uci.edu</tt> (Linux 2.6.x): <tt>~zender/bin/LINUX</tt></li>

<li>UCI ESS <tt>dust.ess.uci.edu</tt> (Linux 3.2.x): <tt>~zender/bin/LINUXAMD64</tt></li>

<li>NCAR CISL <tt>yellowstone.ucar.edu</tt> (Linux 2.6.x): <tt>~zender/bin/LINUXAMD64</tt></li>

<li>NCAR CISL <tt>mirage0.ucar.edu</tt> (Linux 2.6.x): <tt>~zender/bin/LINUXAMD64</tt></li>

<!-- http://nco.sf.net#bug_mm3 -->

<a name="bug_mm3"></a>

<li><i><tt>MM3</tt> slowdown:</i>

A longstanding &ldquo;feature&rdquo; of netCDF3 was identified in

March, 2012, and is now known by the tag MM3.

The MM3 issue can lead to unusually slow performance. 

The problem is triggered by an aggregate pattern of file access so the

workaround must be implemented in the application software (e.g., NCO)

rather than in the netCDF library itself.   

The name MM3 fits because the problem is normally encountered on

Multi-record Multi-variable netCDF3 files.

And we call our &ldquo;solution&rdquo; the MM3-workaround.  

If you encounter unusually slow NCO performance while using NCO to

analyze MM3 files on a large blocksize filesystem, 

chances are you are encountering an MM3-induced slowdown. 

NCO release 4.1.0 implements the MM3-workaround for <tt>ncks</tt>.  

It speeds-up common ncks sub-setting on NCAR's GLADE by 10-50x.  

MM3-induced slowdowns are present in other NCO operators and we are 

prioritizing our MM3-patches to those encountered most often.  

Thanks to Gary Strand for reporting this problem, and to Russ Rew for 

creating the workaround algorithm, which is also now in <tt>nccopy</tt>.

</li>

 

 

<!-- http://nco.sf.net#bug_ncra_no_fl_close -->

<a name="bug_ncra_no_fl_close"></a>

<li><i><tt>ncra</tt>, <tt>ncea</tt>, and <tt>ncrcat</tt> file close bug:</i>

Versions 4.3.9&mdash;4.4.0 of <tt>ncra</tt>, <tt>ncea</tt>,

and <tt>ncrcat</tt> failed to correctly close and optionally remove

input files. 

This could cause NCO to exceed system limits on the maximum number of

open files when hundreds-to-thousands of input files were specified

per NCO invocation. 

The exact failure point is OS-dependent (NCO commands on Mac OS X 10.9

would fail when processing more than 256 files at a time). 

This is embarassing because NCO has always been designed to work with

arbitrary numbers of input files and we want power users to be

comfortable running it on hundreds of thousands of input files.

The solution is to avoid versions 4.3.9&mdash;4.4.0 or to upgrade to

NCO&nbsp;4.4.1.

</li>

</ul>

 

<!-- http://nco.sf.net#bug_ncra_mro_mss_val -->

<a name="bug_ncra_mro_mss_val"></a>

<li><i><tt>ncra</tt> MRO missing value bug:</i>

Versions 4.3.6&mdash;4.3.9 of <tt>ncra</tt> could treat missing values

incorrectly during double-precision arithmetic. 

A symptom was that missing values could be replaced by strange numbers

like, well, infinity or zero. 

This mainly affects <tt>ncra</tt> in MRO (multi-record output) mode,

and the symptoms should be noticeable. 

The workaround is to run the affected versions of ncra using the 

<tt>--flt</tt> switch, so that single-precision floating point numbers

are not promoted prior to arithmetic.

The solution is to upgrade to NCO 4.4.0.

</li>

</ul>

 

<!-- http://nco.sf.net#bug_ncwa_lmt -->

<a name="bug_ncwa_lmt"></a>

<li><i><tt>ncwa</tt> hyperslabbing while averaging bug:</i>

Versions 4.3.3&mdash;4.3.5 of <tt>ncwa</tt> could return incorrect

answers when user-specified hyperslabs were simultaneously extracted. 

In such cases, hyperslab limits were not consistently applied.

This could produce incorrect answers that look correct.

This bug only affected hyperslabbed statistics (those produced

by simultaneously invoking <tt>-a</tt> and <tt>-d</tt> switches);

&ldquo;global averages&rdquo; were unaffected.

We urge all <tt>ncwa</tt> users to upgrade to NCO 4.3.6.

</li>

</ul>

 

<!-- http://nco.sf.net#bug_ncpdq_upk -->

<a name="bug_ncpdq_upk"></a>

<li><i><tt>ncpdq</tt> unpacking bug with auxiliary coordinates:</i>

Versions 4.3.2&ndash;4.3.3 of <tt>ncpdq</tt> did not correctly 

store unpacked variables.

These versions unpacked (when specified with <tt>-U</tt> or <tt>-P

upk</tt>) the values, but inadvertently stored their original packing

attributes with the unpacked values. 

This would lead further operators to assume that the values were still

packed. 

Hence consecutive operations could lead to incorrect values.

Fixed in version 4.3.4.

All <tt>ncpdq</tt> users are encouraged to upgrade.

NB: this bug did not affect the other arithmetic operators which

unpack data prior to arithmetic.

</li>

 

operators, e.g., <tt>nces</tt> to produce incorrect results under some

<a href="http://sf.net/forum/message.php?msg_id=6217274">here</a>.