← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/psicode/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/bin/nonbonded/nonbonded.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Michael Banck, Michael Banck, Daniel Leidert
  • Date: 2009-02-23 00:12:02 UTC
  • mfrom: (1.1.2 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090223001202-rutldoy3dimfpesc
Tags: 3.4.0-1
* New upstream release.

[ Michael Banck ]
* debian/patches/01_DESTDIR.dpatch: Refreshed.
* debian/patches/02_FHS.dpatch: Removed, applied upstream.
* debian/patches/03_debian_docdir: Likewise.
* debian/patches/04_man.dpatch: Likewise.
* debian/patches/06_466828_fix_gcc_43_ftbfs.dpatch: Likewise.
* debian/patches/07_464867_move_executables: Fixed and refreshed.
* debian/patches/00list: Adjusted.
* debian/control: Improved description.
* debian/patches-held: Removed.
* debian/rules (install/psi3): Do not ship the ruby bindings for now.

[ Daniel Leidert ]
* debian/rules: Fix txtdir via DEB_MAKE_INSTALL_TARGET.
* debian/patches/01_DESTDIR.dpatch: Refreshed.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/bin/nonbonded/nonbonded.h
 
1
/*
 
2
 * nonbonded.h
 
3
 *
 
4
 * Contains empirical parameters relevant for nonbonded interactions
 
5
 *
 
6
 * C. David Sherrill
 
7
 * January 2008
 
8
 */
 
9
 
 
10
#ifndef _psi_include_masses_h
 
11
#define _psi_include_masses_h
 
12
 
 
13
#define LAST_VDW_RADII_GRIMME_INDEX (54)
 
14
 
 
15
/*
 
16
 * van der Waals radii (Angstrom) from atomic ROHF/TZV computations
 
17
 * used in the revised DFT-D method, B97-D
 
18
 * S. Grimme, J. Comput. Chem. 27, 1787-1799 (2006)
 
19
 */
 
20
double vdw_radii_grimme[] =
 
21
{
 
22
  2.000, /* Default element or ghost */
 
23
  1.001, /* H  */
 
24
  1.012, /* He */
 
25
  0.825, /* Li */
 
26
  1.408, /* Be */
 
27
  1.485, /* B  */
 
28
  1.452, /* C  */
 
29
  1.397, /* N  */
 
30
  1.342, /* O  */
 
31
  1.287, /* F  */
 
32
  1.243, /* Ne */
 
33
  1.144, /* Na */
 
34
  1.364, /* Mg */
 
35
  1.639, /* Al */
 
36
  1.716, /* Si */
 
37
  1.705, /* P  */
 
38
  1.683, /* S  */
 
39
  1.639, /* Cl */
 
40
  1.595, /* Ar */
 
41
  1.485, /* K  */
 
42
  1.474, /* Ca */
 
43
  1.562, /* Sc */
 
44
  1.562, /* Ti */
 
45
  1.562, /* V  */
 
46
  1.562, /* Cr */
 
47
  1.562, /* Mn */
 
48
  1.562, /* Fe */
 
49
  1.562, /* Co */
 
50
  1.562, /* Ni */
 
51
  1.562, /* Cu */
 
52
  1.562, /* Zn */
 
53
  1.650, /* Ga */
 
54
  1.727, /* Ge */
 
55
  1.760, /* As */
 
56
  1.771, /* Se */
 
57
  1.749, /* Br */
 
58
  1.727, /* Kr */
 
59
  1.628, /* Rb */
 
60
  1.606, /* Sr */
 
61
  1.639, /* Y  */
 
62
  1.639, /* Zr */
 
63
  1.639, /* Nb */
 
64
  1.639, /* Mo */
 
65
  1.639, /* Tc */
 
66
  1.639, /* Ru */
 
67
  1.639, /* Rh */
 
68
  1.639, /* Pd */
 
69
  1.639, /* Ag */
 
70
  1.639, /* Cd */
 
71
  1.672, /* In */
 
72
  1.804, /* Sn */
 
73
  1.881, /* Sb */
 
74
  1.892, /* Te */
 
75
  1.892, /* I  */
 
76
  1.881  /* Xe */
 
77
};
 
78
 
 
79
 
 
80
#define LAST_VDW_C6_GRIMME_INDEX (54)
 
81
/*
 
82
 * van der Waals C_6 parameters (in J nm^6 mol^-1) 
 
83
 * obtained for the revised DFT-D method, B97-D
 
84
 * S. Grimme, J. Comput. Chem. 27, 1787-1799 (2006)
 
85
 */
 
86
double vdw_C6_grimme[] =
 
87
{
 
88
  0.00, /* Default element or ghost */
 
89
  0.14, /* H  */
 
90
  0.08, /* He */
 
91
  1.61, /* Li */
 
92
  1.61, /* Be */
 
93
  3.13, /* B  */
 
94
  1.75, /* C  */
 
95
  1.23, /* N  */
 
96
  0.70, /* O  */
 
97
  0.75, /* F  */
 
98
  0.63, /* Ne */
 
99
  5.71, /* Na */
 
100
  5.71, /* Mg */
 
101
 10.79, /* Al */
 
102
  9.23, /* Si */
 
103
  7.84, /* P  */
 
104
  5.57, /* S  */
 
105
  5.07, /* Cl */
 
106
  4.61, /* Ar */
 
107
 10.80, /* K  */
 
108
 10.80, /* Ca */
 
109
 10.80, /* Sc */
 
110
 10.80, /* Ti */
 
111
 10.80, /* V  */
 
112
 10.80, /* Cr */
 
113
 10.80, /* Mn */
 
114
 10.80, /* Fe */
 
115
 10.80, /* Co */
 
116
 10.80, /* Ni */
 
117
 10.80, /* Cu */
 
118
 10.80, /* Zn */
 
119
 16.99, /* Ga */
 
120
 17.10, /* Ge */
 
121
 16.37, /* As */
 
122
 12.64, /* Se */
 
123
 12.47, /* Br */
 
124
 12.01, /* Kr */
 
125
 24.67, /* Rb */
 
126
 24.67, /* Sr */
 
127
 24.67, /* Y  */
 
128
 24.67, /* Zr */
 
129
 24.67, /* Nb */
 
130
 24.67, /* Mo */
 
131
 24.67, /* Tc */
 
132
 24.67, /* Ru */
 
133
 24.67, /* Rh */
 
134
 24.67, /* Pd */
 
135
 24.67, /* Ag */
 
136
 24.67, /* Cd */
 
137
 37.32, /* In */
 
138
 38.71, /* Sn */
 
139
 38.44, /* Sb */
 
140
 31.74, /* Te */
 
141
 31.50, /* I  */
 
142
 29.99  /* Xe */
 
143
};
 
144
 
 
145
 
 
146
#endif /* header guard */
 
147