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Viewing changes to debian/patches/news-file

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Filippo Rusconi
  • Date: 2013-06-07 19:31:15 UTC
  • mfrom: (1.1.1)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130607193115-brdv42x1dpwh8kew
Tags: 1:2013.02.01.1-1
* Packaging of X!Tandem (CYCLONE 2013.02.01.1, from
  http://www.thegpm.org/TANDEM/) for Debian GNU/Linux
  (Olivier Langella <olivier.langella@laposte.net>, with the
  great help of Filippo Rusconi <lopippo@debian.org>);
* Added and tested debian/watch file (Filippo Rusconi);
* Added debian/upstream file (Olivier Langella);

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
debian/patches/news-file
1
 
--- /dev/null
2
 
+++ b/debian/NEWS
3
 
@@ -0,0 +1,11 @@
4
 
+This release contains several bug fixes as well as some new features associated with peptide cleavage patterns.
5
 
+
6
 
+    The parameters " protein, cleavage semi" and "refine, cleavage semi" now have four possible values:
7
 
+        "amino" - simulates cleavage by an aminopeptidase
8
 
+        "carboxy" - simulates cleavage by a carboxypeptidase
9
 
+        "yes" - simulates cleavage by both amino- and carboxy-peptidase
10
 
+        "no" - semi-type cleavage not used (default)
11
 
+    A bug that could produce negative values for "missed_cleavage" has been corrected.
12
 
+    The RTINSECONDS parameter in MGF files is now handled correctly.
13
 
+    A mechanism for specifying protein-specific modifications that are to be applied in all rounds of analysis has been added.
14
 
+