~ubuntu-branches/ubuntu/utopic/paml/utopic-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to examples/abglobin.aa

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Pjotr Prins
  • Date: 2010-09-11 23:01:37 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20100911230137-jjf5d0blx5p0m9ba
Tags: upstream-4.4c
ImportĀ upstreamĀ versionĀ 4.4c

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
  5 285  I
 
2
human
 
3
goat-cow
 
4
rabbit 
 
5
rat
 
6
marsupial
 
7
 
 
8
VLSPADKTNV KAAWGKVGAH AGEYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH GSAQVKGHGK 
 
9
VLSAADKSNV KAAWGKVGGN AGAYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH GSAQVKGHGE 
 
10
VLSPADKTNI KTAWEKIGSH GGEYGAEAVE RMFLGFPTTK TYFPHFDFTH GSEQIKAHGK 
 
11
VLSADDKTNI KNCWGKIGGH GGEYGEEALQ RMFAAFPTTK TYFSHIDVSP GSAQVKAHGK 
 
12
VLSDADKTHV KAIWGKVGGH AGAYAAEALA RTFLSFPTTK TYFPHFDLSP GSAQIQGHGK 
 
13
61      
 
14
KVADALTNAV AHVDDMPNAL SALSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA 
 
15
KVAAALTKAV GHLDDLPGTL SDLSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHSLLVTLA CHLPNDFTPA 
 
16
KVSEALTKAV GHLDDLPGAL STLSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHCLLVTLA NHHPSEFTPA 
 
17
KVADALAKAA DHVEDLPGAL STLSDLHAHK LRVDPVNFKF LSHCLLVTLA CHHPGDFTPA 
 
18
KVADALSQAV AHLDDLPGTM SKLSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHCLIVTLA AHLSKDLTPE 
 
19
121     
 
20
VHASLDKFLA SVSTVLTSKY RLTPEEKSAV TALWGKVNVD EVGGEALGRL LVVYPWTQRF 
 
21
VHASLDKFLA NVSTVLTSKY RLTAEEKAAV TAFWGKVKVD EVGGEALGRL LVVYPWTQRF 
 
22
VHASLDKFLA NVSTVLTSKY RLSSEEKSAV TALWGKVNVE EVGGEALGRL LVVYPWTQRF 
 
23
MHASLDKFLA SVSTVLTSKY RLTDAEKAAV NALWGKVNPD DVGGEALGRL LVVYPWTQRY 
 
24
VHASMDKFFA SVATVLTSKY RLTSEEKNCI TTIWSKVQVD QTGGEALGRM LVVYPWTTRF 
 
25
181     
 
26
FESFGDLSTP DAVMGNPKVK AHGKKVLGAF SDGLAHLDNL KGTFATLSEL HCDKLHVDPE 
 
27
FESFGDLSTA DAVMNNPKVK AHGKKVLDSF SNGMKHLDDL KGTFAALSEL HCDKLHVDPE 
 
28
FESFGDLSSA NAVMNNPKVK AHGKKVLAAF SEGLSHLDNL KGTFAKLSEL HCDKLHVDPE 
 
29
FDSFGDLSSA SAIMGNPKVK AHGKKVINAF NDGLKHLDNL KGTFAHLSEL HCDKLHVDPE 
 
30
FGSFGDLSSP GAVMSNSKVQ AHGAKVLTSF GEAVKHLDNL KGTYAKLSEL HCDKLHVDPE 
 
31
241     
 
32
NFRLLGNVLV CVLAHHFGKE FTPPVQAAYQ KVVAGVANAL AHKYH
 
33
NFKLLGNVLV VVLARNFGKE FTPVLQADFQ KVVAGVANAL AHRYH
 
34
NFRLLGNVLV IVLSHHFGKE FTPQVQAAYQ KVVAGVANAL AHKYH
 
35
NFRLLGNMIV IVLGHHLGKE FTPCAQAAFQ KVVAGVASAL AHKYH
 
36
NFKMLGNIIV ICLAEHFGKD FTPECQVAWQ KLVAGVAHAL AHKYH