~ubuntu-branches/ubuntu/vivid/bioperl/vivid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/changelog_

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille, Luca Capello, Andreas Tille
  • Date: 2011-12-14 09:11:41 UTC
  • mfrom: (3.1.7 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111214091141-tkfghnafq92qjhy2
Tags: 1.6.901-2
[ Luca Capello ]
* debian/control:
  + add Recommends: to some libraries already in libbio-perl-perl's
    for binaries showing help output (Closes: #650412).
* debian/README.Debian:
  + new file with a more detailed explanation about the above.

[ Andreas Tille ]
* debian/source/format: 3.0 (quilt)
* Added myself to Uploaders

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
bioperl (1.6.901-2) unstable; urgency=low
 
2
 
 
3
  * debian/source/format: 3.0 (quilt)
 
4
  * 
 
5
 
 
6
 -- Andreas Tille <tille@debian.org>  Wed, 14 Dec 2011 09:04:08 +0100
 
7
 
 
8
bioperl (1.6.901-1) unstable; urgency=low
 
9
 
 
10
  * New upstream release.
 
11
  * Point debian/watch to search.cpan.org.
 
12
  * Build using dh and overrides:
 
13
    - Use Debhelper 8 (debian/rules, debian/control).
 
14
    - Simplified debian/rules.
 
15
  * Split into libbio-perl-perl, as discussed with the Debian Perl team.
 
16
    (debian/control, debian/bioperl.install, debian libbio-perl-perl.install)
 
17
  * debian/control:
 
18
    - Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2.
 
19
      No other changes needed.
 
20
    - Vcs-Browser URL made redirectable to viewvc.
 
21
    - Removed useless ‘svn’ in the Vcs-Svn URL.
 
22
 
 
23
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 17 Jun 2011 13:51:18 +0900
 
24
 
 
25
bioperl (1.6.1-2) unstable; urgency=low
 
26
 
 
27
  * Removed bibliographic information from the long description
 
28
    (debian/control).
 
29
  * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.4
 
30
    (debian/control, no changes needed).
 
31
  * Build-depends on libxml-sax-expatxs-perl to avoid downloading DTDs during
 
32
    the tests and therefore fail when network is not available
 
33
    (debian/control, Closes: #562442).
 
34
  * Depend on the ${misc:Depends} substvar (debian/control).
 
35
 
 
36
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 26 Feb 2010 23:52:23 +0900
 
37
 
 
38
bioperl (1.6.1-1) unstable; urgency=low
 
39
 
 
40
  * New upstream release with new features and many corrections in the
 
41
    test suite (Closes: #533976).
 
42
  * debian/rules: trigger network tests with DEB_MAINTAINER_MODE.
 
43
  * debian/control:
 
44
    - Build-depend on perl-modules >= 5.10.1 to have ExtUtils::Manifest 1.52 or
 
45
      higher, and on libtest-pod-perl.
 
46
    - Added liblist-moreutils-perl, libspreadsheet-writeexcel-perl,
 
47
      libsvg-perl, and libxml-simple-perl, libdbd-pg-perl, libdbd-mysql-perl,
 
48
      libdbd-sqlite3-perl to build and package dependencies (needed by some
 
49
      components of Bioperl, and therefore for the tests).
 
50
 
 
51
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 30 Sep 2009 18:56:42 +0900
 
52
 
 
53
bioperl (1.6.0-3) unstable; urgency=low
 
54
 
 
55
  [ David Paleino ]
 
56
  * Removed myself from Uploaders
 
57
 
 
58
  [ Charles Plessy ]
 
59
  * debian/control:
 
60
    - Added libdata-stag-perl in bioperl’s Depends field, since it is
 
61
      required in Build.PL.
 
62
    - Added libxml-simple-perl in bioperl’s Recommends and Build-Depends
 
63
      fields, since they are listed in DEPENDENCIES.
 
64
    - Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 
65
      (no changes needed).
 
66
  * Collected some informations in debian/upstream-metadata.yaml.
 
67
 
 
68
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 18 Sep 2009 20:23:51 +0900
 
69
 
 
70
bioperl (1.6.0-2) unstable; urgency=low
 
71
 
 
72
  * Removed patch system (not used):
 
73
    - removed instructions in debian/rules;
 
74
    - removed quilt from Build-Depends in debian/control.
 
75
  * Re-enabled tests:
 
76
    - uncommented test command in debian/rules;
 
77
    - uncommented previously missing build-dependencies in debian/control.
 
78
    - Re-enabled tests and uncommented build-dependencies accordingly.
 
79
  * Removed libmodule-build-perl and libtest-harness-perl from
 
80
    Build-Depends-Indep (provided by perl-modules).
 
81
  * Better cleaning of empty directories using find -type d -empty -delete
 
82
    instead of rmdir in debian/rules (LP: #324001).
 
83
 
 
84
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 10 Mar 2009 07:19:11 +0100
 
85
 
 
86
bioperl (1.6.0-1) experimental; urgency=low
 
87
 
 
88
  [ Charles Plessy ]
 
89
  * debian/control
 
90
    - Updated dependencies according to the new upstream release.
 
91
    - Added the CPAN dependencies of BioPerl to Build-Depends-Indep in order to
 
92
      run the tests at build time.
 
93
    - Added bioperl-run to the recommended packages.
 
94
    - Updated my email address.
 
95
    - Uses Debhelper 7 (debian/compat modified accordingly).
 
96
  * debian/patches: removed as not needed (no downloads by default).
 
97
  * debian/rules:
 
98
    - Uses Build.PL instead of Makefile.PL.
 
99
    - Tests disabled for the experimental upload: not all dependencies are
 
100
      available yet.
 
101
  * debian/README.{Debian,source}: removed as not needed anymore
 
102
  * debian/watch: BioPerl is now mixed case.
 
103
 
 
104
  [ David Paleino ]
 
105
  * New upstream stable release:
 
106
    - fixes Bio::AlignIO::next_aln bug (Closes: #266921).
 
107
    - New modules, deprecated modules,… please consult Upstream documents in
 
108
      /usr/share/doc/bioperl.
 
109
  * debian/control:
 
110
    - fields values rewrapped to easily spot diffs in commit mails
 
111
    - dropped B-D-I versioning on perl, since Etch already has a greater 
 
112
      version
 
113
    - Standards-Version bumped to 3.8.0 (no changes needed).
 
114
 
 
115
 -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 26 Jan 2009 12:58:28 +0900
 
116
 
 
117
bioperl (1.5.2.102-3) unstable; urgency=low
 
118
 
 
119
  * debian/control:
 
120
    - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
 
121
      Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
 
122
    - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
 
123
      according to the following discussion on Upstream's mail list.
 
124
      http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
 
125
      (Closes: #448890)
 
126
  * debian/copyright converted to machine-readable format.
 
127
 
 
128
 -- Charles Plessy <charles-debian-nospam@plessy.org>  Tue, 18 Mar 2008 14:44:57 +0900
 
129
 
 
130
bioperl (1.5.2.102-2) unstable; urgency=low
 
131
 
 
132
  [ Steffen Moeller ]
 
133
  * Added reference to libsvg-graph-perl (Closes: #342475).
 
134
 
 
135
  [ Nelson A. de Oliveira ]
 
136
  * debian/control:
 
137
    - Removed the XS- prefix from Vcs-Browser and Vcs-Svn
 
138
    - Moved debhelper and quilt from Build-Depends-Indep to Build-Depends
 
139
  * Updated debian/copyright
 
140
 
 
141
  [ David Paleino ]
 
142
  * debian/control:
 
143
    - updated Recommends (libpostscript-textblock-perl won't exist -
 
144
      the package will be named libpostscript-perl)
 
145
    - fields wrapped at around 80 columns
 
146
    - added myself to Uploaders
 
147
    - added libio-string-perl to Build-Depends-Indep (Closes: #453923)
 
148
    - fixed Vcs-* fields
 
149
    - removed XS- from DM-Upload-Allowed
 
150
  * debian/changelog:
 
151
    - fixing incorrect first line (leading tab)
 
152
  * debian/rules updated
 
153
  * debian/dirs removed (passing arguments to dh_installdirs directly)
 
154
 
 
155
 -- David Paleino <d.paleino@gmail.com>  Wed, 06 Feb 2008 12:01:15 +0100
 
156
 
 
157
bioperl (1.5.2.102-1) unstable; urgency=low
 
158
 
 
159
  * Developer release.
 
160
  * Upgraded source package to debhelper 5 and standards-version 3.7.2.
 
161
  * Added libmodule-build-perl and libtest-harness-perl to
 
162
    build-depends-indep.
 
163
  * Disabled automatic CPAN download.
 
164
  * Using quilt instead of .diff.gz to manage modifications.
 
165
  * Updated Recommends list for the binary package.
 
166
  * Moved the "production-quality" scripts to /usr/bin/.
 
167
  * New maintainer: Debian-Med packaging team mailing list.
 
168
  * New uploaders: Charles Plessy and Steffen Moeller.
 
169
  * Updated Depends, Recommends and Suggests.
 
170
  * Imported in Debian-Med's SVN repository on Alioth.
 
171
  * Executing the regression tests during package building.
 
172
  * Moved the Homepage: field out from the package's description.
 
173
  * Updated watch file.
 
174
 
 
175
 -- Charles Plessy <charles-debian-nospam@plessy.org>  Fri, 21 Sep 2007 22:52:22 +0900
 
176
 
 
177
bioperl (1.4-1) unstable; urgency=low
 
178
 
 
179
  * New upstream release
 
180
  * Examples and working code are installed by default to usr/bin,
 
181
    this has been moved to usr/share/doc/bioperl/bin
 
182
 
 
183
 -- Matt Hope <matth@bioinformatics.unsw.edu.au>  Sun, 18 Apr 2004 14:24:11 +1000
 
184
 
 
185
bioperl (1.2.1-2) unstable; urgency=low
 
186
 
 
187
  * Updated dependencies to libgd-gd2-perl
 
188
    (Closes: Bug#192210)
 
189
  * Same maintainer, different email address
 
190
 
 
191
 -- Matt Hope <matth@bioinformatics.unsw.edu.au>  Mon, 30 Jun 2003 23:40:59 +1000
 
192
 
 
193
bioperl (1.2.1-1) unstable; urgency=low
 
194
 
 
195
  * New upstream release
 
196
  * Added more Depends/Recommends.
 
197
  * Added Depend: libio-string-perl
 
198
    (Closes: Bug#188395)
 
199
 
 
200
 -- Matt Hope <dopey@debian.org>  Sat,  3 May 2003 01:21:54 +1000
 
201
 
 
202
bioperl (1.2-1) unstable; urgency=low
 
203
 
 
204
  * New upstream release
 
205
 
 
206
 -- Matt Hope <dopey@debian.org>  Fri, 25 Apr 2003 12:30:10 +1000
 
207
 
 
208
bioperl (1.0.2-1) unstable; urgency=low
 
209
 
 
210
  * *Another* new upstream release.
 
211
 
 
212
 -- Matt Hope <dopey@debian.org>  Wed, 17 Jul 2002 09:58:09 +1000
 
213
 
 
214
bioperl (1.0.1-1) unstable; urgency=low
 
215
 
 
216
  * New upstream release
 
217
 
 
218
 -- Matt Hope <dopey@debian.org>  Sat, 29 Jun 2002 22:35:08 +1000
 
219
 
 
220
bioperl (1.0-1) unstable; urgency=low
 
221
 
 
222
  * New upstream release
 
223
 
 
224
 -- Matt Hope <dopey@debian.org>  Wed, 20 Mar 2002 01:16:30 +1100
 
225
 
 
226
bioperl (0.7.2-1) unstable; urgency=low
 
227
 
 
228
  * New upstream release.
 
229
  * Adopted by new maintainer; closes: #100208
 
230
  * Fixed lintian errors.
 
231
 
 
232
 -- Matt Hope <dopey@quickstix.com.au>  Thu, 22 Nov 2001 19:31:26 +1100
 
233
 
 
234
bioperl (0.7.1-1) unstable; urgency=low
 
235
 
 
236
  * Maintainer set to Debian QA Group <packages@qa.debian.org>.
 
237
  * New upstream release.
 
238
 
 
239
 -- Adrian Bunk <bunk@fs.tum.de>  Fri, 24 Aug 2001 20:47:57 +0200
 
240
 
 
241
bioperl (0.7.0-1) unstable; urgency=low
 
242
 
 
243
  * New upstream release; closes: #44245
 
244
 
 
245
 -- Dr. Guenter Bechly <gbechly@debian.org>  Sat,  5 May 2001 18:35:44 +0200
 
246
 
 
247
bioperl (0.05.1-3) unstable; urgency=low
 
248
 
 
249
  * Fixed compliance with perl policy; closes: #95880, #95418 
 
250
 
 
251
 -- Dr. Guenter Bechly <gbechly@debian.org>  Tue,  1 May 2001 08:13:09 +0200
 
252
 
 
253
bioperl (0.05.1-2) unstable; urgency=low
 
254
 
 
255
  * Adopted by new maintainer; closes: #92806
 
256
  * Updated to latest standards version and added Build-Depends (changed
 
257
    control, copyright, dirs, docs, and rules);
 
258
    closes: #70154, #91121, #91397
 
259
  * Fixed some lintian errors in rules.
 
260
  * Moved package to section non-free/science, because it is a tool that
 
261
    is exclusively useful for molecular biologists.
 
262
 
 
263
 -- Dr. Guenter Bechly <gbechly@debian.org>  Fri, 20 Apr 2001 19:48:05 +0200
 
264
 
 
265
bioperl (0.05.1-1) unstable; urgency=low
 
266
 
 
267
  * Complies with the new Perl policy. Closes #40564
 
268
  * New upstream release
 
269
 
 
270
 -- Stephane Bortzmeyer <bortzmeyer@debian.org>  Wed,  7 Jul 1999 14:49:16 +0200
 
271
 
 
272
bioperl (0.05-1) unstable; urgency=low
 
273
 
 
274
  * Initial Release.
 
275
 
 
276
 -- Stephane Bortzmeyer <bortzmeyer@debian.org>  Wed, 19 May 1999 11:35:30 +0200