~ubuntu-branches/ubuntu/vivid/ncbi-tools6/vivid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/upstream/metadata

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Aaron M. Ucko, Aaron M. Ucko, James McCoy
  • Date: 2014-10-08 22:26:33 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20141008222633-ssjvhjcw31gyvig7
Tags: 6.1.20120620-8
[ Aaron M. Ucko ]
* corelib/ncbimisc.c (MergeStringArray): Ensure all return paths
  explicitly return a value, as Clang reasonably requires.
* debian/control: Formally update Standards-Version (3.9.6) and Vcs-Browser.

[ James McCoy ]
* Move debian/upstream to debian/upstream/metadata

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
Reference:
 
2
 - Author: Stephen F. Altschul and Warren Gish and Webb Miller and Eugene W. Myers and David J. Lipman
 
3
   Title: Basic local alignment search tool
 
4
   Journal: Journal of Molecular Biology
 
5
   Volume: 215
 
6
   Number: 3
 
7
   Pages: 403-410
 
8
   Year: 1990
 
9
   PMID: 2231712
 
10
   DOI: 10.1016/S0022-2836(05)80360-2
 
11
   URL: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283605803602
 
12
   Debian-Package: blast2
 
13
 - Author: Stephen F. Altschul and Thomas L. Madden and Alejandro A. Schäffer and Jinghui Zhang and Zheng Zhang and Webb Miller and David J. Lipman
 
14
   Title: "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs"
 
15
   Journal: Nucleic Acids Research
 
16
   Volume: 25
 
17
   Number: 17
 
18
   Pages: 3389-3402
 
19
   Year: 1997
 
20
   PMID: 9254694
 
21
   DOI: 10.1093/nar/25.17.3389
 
22
   URL: http://nar.oxfordjournals.org/content/25/17/3389.long
 
23
   Debian-Package: blast2
 
24
 - Author: Zheng Zhang and Alejandro A. Schäffer and Webb Miller and Thomas L. Madden and David J. Lipman and Eugene V. Koonin and Stephen F. Altschul
 
25
   Title: Protein sequence similarity searches using patterns as seeds.
 
26
   Journal: Nucleic Acids Research
 
27
   Volume: 26
 
28
   Number: 17
 
29
   Pages: 3986-3990
 
30
   Year: 1998
 
31
   PMID: 9705509
 
32
   DOI: 10.1093/nar/26.17.3986
 
33
   URL: http://nar.oxfordjournals.org/content/26/17/3986.long
 
34
   Debian-Package: blast2
 
35
 - Author: Zheng Zhang and Scott Schwartz and Lukas Wagner and Webb Miller
 
36
   Title: A Greedy Algorithm for Aligning DNA Sequences
 
37
   Journal: Journal of Computational Biology
 
38
   Volume: 7
 
39
   Number: 1-2
 
40
   Pages: 203-214
 
41
   Year: 2000
 
42
   PMID: 10890397
 
43
   DOI: 10.1089/10665270050081478
 
44
   URL: http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/10665270050081478
 
45
   Debian-Package: blast2
 
46
 - Author: Alejandro A. Schäffer and L. Aravind and Thomas L. Madden and Sergei Shavirin and John L. Spouge and Yuri I. Wolf and Eugene V. Koonin and Stephen F. Altschul
 
47
   Title: Improving the accuracy of PSI-BLAST protein database searches with composition-based statistics and other refinements
 
48
   Journal: Nucleic Acids Research
 
49
   Volume: 29
 
50
   Number: 14
 
51
   Pages: 2994-3005
 
52
   Year: 2001
 
53
   PMID: 11452024
 
54
   DOI: 10.1093/nar/29.14.2994
 
55
   URL: http://nar.oxfordjournals.org/content/29/14/2994.long
 
56
   Debian-Package: blast2
 
57
 - Author: Stephen F. Altschul and John C. Wootton and E. Michael Gertz and Richa Agarwala and Aleksandr Morgulis and Alejandro A. Schäffer and Yi-Kuo Yu
 
58
   Title: Protein database searches using compositionally adjusted substitution matrices
 
59
   Journal: FEBS Journal
 
60
   Volume: 272
 
61
   Number: 20
 
62
   Pages: 5101-5109
 
63
   Year: 2005
 
64
   PMID: 16218944
 
65
   DOI: 10.1111/j.1742-4658.2005.04945.x
 
66
   URL: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1742-4658.2005.04945.x/abstract
 
67
   Debian-Package: blast2