← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/wily/dssp/wily

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/mkdssp.1

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Laszlo Kajan
  • Date: 2012-04-18 11:09:02 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20120418110902-0tiui82qd364yvxh
Tags: 2.0.4-1
http://bugs.debian.org/669259
* Initial release. (Closes: #669259)
* Added description to dssp; added upstream (reference); parallel building
  now enabled; fixed spelling error in man page; added debug package;
  fixed debian/watch; added get-orig-source target to rules.
* Changed libboost build dependency to version >= 1.42.0.1 to allow
  building on stable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
doc/mkdssp.1
13
13
Please note that \fImkdssp\fP \fBdoes not predict\fP secondary structure.
14
14
.SH OPTIONS
15
15
If you invoke \fImkdssp\fP with only one parameter, it will be
16
 
interpreted as the PDB file to process and output will be send to
 
16
interpreted as the PDB file to process and output will be sent to
17
17
stdout. If a second parameter is specified this is interpreted as
18
18
the name of the DSSP file to create. Both the input and the output
19
19
file names may have either \.gz or \.bz2 as extension resulting in
159
159
.SH TODO
160
160
The code desperately needs an update. The first thing that needs
161
161
implementing is the improved recognition of pi\-helices. A second
162
 
improvement would be to use angle dependant H\-bond energy calculation.
 
162
improvement would be to use angle dependent H\-bond energy calculation.
163
163
.SH BUGS
164
164
If you find any, please let me know.
165
165
.SH AUTHOR