~mok0/clipper/trunk

« back to all changes in this revision

Viewing changes to dox/installation.dox

  • Committer: Morten Kjeldgaard
  • Date: 2011-02-09 21:25:56 UTC
  • Revision ID: mok@bioxray.dk-20110209212556-3zbon5ukh4zf3x00
Tags: 2.0.3
versionĀ 2.0.3

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
/*! \page p_installation Installation
 
2
 
 
3
\section s_install_dep Installing Clipper and dependencies
 
4
 
 
5
On Linux systems you will need at least gcc 2.96. On SGI and alpha,
 
6
any resonably recent compiler (i.e. last 2 years) should do.
 
7
 
 
8
Clipper has the following dependencies:
 
9
 - The 'fftw' FFT library: http://www.fftw.org/
 
10
 - (Alternatively, a kiss-fft overlay is available).
 
11
 
 
12
It may optionally be used with:
 
13
 - The CCP4v5.0 and mmdb libraries: ftp://ftp.ccp4.ac.uk/prerelease/ccp4-onlylibs-dev.tar.gz
 
14
 - The 'cctbx' Crystallographic toolbox: http://cctbx.sourceforge.net/
 
15
 
 
16
The following instructions should download and install Clipper and all
 
17
its dependencies on a properly configured Linux machine.
 
18
 
 
19
\include install.csh
 
20
 
 
21
This file is available as a shell script from the Clipper homepage.
 
22
 
 
23
\subsection ss_install_dep_problems Problems
 
24
 
 
25
Likely problems may include:
 
26
 - Failure to agree to CCP4 v6 license agreement. If you have not installed CCP4 v6 before, you should read the agreement at http://www.ccp4.ac.uk/ and then use the following before attempting the install:
 
27
\code
 
28
echo $user `date` "V5.0" > ${HOME}/.agree2ccp4v6
 
29
\endcode
 
30
 - Non-Linux platforms: Change the CCP4 configure line to have the name of your platform, instead of 'linux', on the end. The fortran example will fail.
 
31
 - 'wget' fails: Your firewall may block wget. In which case, fetch the tar files by hand and then run the rest of the script.
 
32
 - If you haven't installed cctbx, the cctbx example will fail.
 
33
 
 
34
*/