← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/embassy-domsearch/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/seqsearch.c

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2012-06-22 10:03:24 UTC
  • mfrom: (1.1.3)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20120622100324-v9e98arr9zjtmitl
Tags: 1:0.1.0+20110714-1
* New upstream version
* debian/control:
   - Standards-Version: 3.9.3 (no changes needed)
   - debhelper version 9
   - Adapted versioned (build-)depends to latest emboss version
* added debian/compat: 9
* debian/source/format: 3.0 (quilt)
* debian/rules: short dh
* debian/copyright: DEP5 fixes

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/seqsearch.c
42
42
 
43
43
 
44
44
 
 
45
#include <config.h>
45
46
#include "emboss.h"
46
47
 
47
48
 
703
704
    ajint   fragend    = 0;     /* End of sequence fragment. */
704
705
    ajint   hitn       = 0;     /* The number of the hit we are on. */
705
706
    ajint   nhits      = 0;     /* No. of hits in alignment file. */
706
 
    ajint   fseekr     = 0;
707
707
 
708
708
    float   offset     = 0;
709
709
    float   eval       = 0;
723
723
    while(ajReadlineTrim(psif,&line))
724
724
        if(ajStrFindCaseC(line,"score = ")>=0)
725
725
            nhits++;
726
 
    fseekr = ajFileSeek(psif,offset,SEEK_SET);
 
726
 
 
727
    ajFileSeek(psif,offset,SEEK_SET);
727
728
    
728
729
    
729
730
    /* Allocate memory for Hitlist object. */