← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/maverick/ncbi-tools6/maverick

« back to all changes in this revision

Viewing changes to demo/asn2asn.mk

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2002-04-04 22:13:09 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20020404221309-vfze028rfnlrldct
Tags: upstream-6.1.20011220a
Import upstream version 6.1.20011220a

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
demo/asn2asn.mk
 
1
########################################################################
 
2
#       demo makefile for NCBI applications
 
3
#
 
4
#   This assumes the following variables are set in a file called "ncbi.mk"
 
5
#     which is included by this one. In this case it resides in a directory
 
6
#     set by the environment variable "NCBI"
 
7
#
 
8
#    NCBI_CC = default compiler to use
 
9
#    NCBI_CFLAGS1 = default compiler switches (not optimization)
 
10
#    NCBI_LDFLAGS1 = default compiler switches when linking (not optimization)
 
11
#    NCBI_OPTFLAG = default optimization (-O)
 
12
#    NCBI_INCDIR =      default toolkit include paths
 
13
#    NCBI_LIBDIR = default toolkit library paths
 
14
#    NCBI_ALTLIB  = debugging toolkit library paths
 
15
#    NCBI_VIBFLAG = additional include paths/defines for Vibrant apps
 
16
#    NCBI_VIBLIBS  = additional libraries needed to link Vibrant apps
 
17
#    NCBI_OTHERLIBS = additional libraries needed to link the system
 
18
#
 
19
#   This enables platform independent makefiles for ncbi toolkit apps. You
 
20
#   can change any default behavior by setting the variable on the command
 
21
#   line.
 
22
#
 
23
#   Use gcc complier.   "make NCBI_CC=gcc" or "make CC=gcc"
 
24
#   Change optimization to debug
 
25
#                "make NCBI_OPTFLAG="-g" NCBI_LIBPATH=$NCBI_ALTLIB"
 
26
#                or
 
27
#                "make OPTFLAG="-g" LIBPATH=$NCBI_ALTLIB"
 
28
#
 
29
#   You can also change the behavior permanently in the makefile by changing
 
30
#    the assignment of the internal variable to the one from the include
 
31
#    file:
 
32
#
 
33
#   Use gcc compiler.
 
34
#    Change   CC=$(NCBI_CC)
 
35
#    To       CC=gcc
 
36
#    in the makefile itself
 
37
#
 
38
#   Make debugging version
 
39
#    OPTFLAG=-g
 
40
#    LIBPATH=$(NCBI_ALTDIR)
 
41
#
 
42
#   Current settings are:
 
43
#   Sun OS:
 
44
#    NCBI_CC = acc
 
45
#    NCBI_CFLAGS1 = "-c"
 
46
#    NCBI_LDFLAGS1 = ""
 
47
#    NCBI_OPTFLAG = "-O"
 
48
#    NCBI_INCPATH = "/usr/ncbi/include/NCBI"
 
49
#    NCBI_LIBPATH = "/usr/ncbi/lib"
 
50
#    NCBI_ALTLIB  = "/am/ncbi/altlib"
 
51
#    NCBI_VIBFLAG = "-I/am/Motif/include -L/am/Motif/lib -DWIN_MOTIF"
 
52
#    NCBI_VIBLIBS  = "-lXm -lXmu -lXt -lX11"
 
53
#    NCBI_OTHERLIBS = "-lm"
 
54
#
 
55
#   Silicon Graphics:
 
56
#    NCBI_CC = cc
 
57
#    NCBI_CFLAGS1 = "-c"
 
58
#    NCBI_LDFLAGS1 = ""
 
59
#    NCBI_OPTFLAG = "-O"
 
60
#    NCBI_INCPATH = "/usr/ncbi/include/NCBI"
 
61
#    NCBI_LIBPATH = "/usr/ncbi/lib"
 
62
#    NCBI_ALTLIB  = "/am/ncbi/altlib"
 
63
#    NCBI_VIBFLAG = "-I/am/Motif/include -L/am/Motif/lib -DWIN_MOTIF"
 
64
#    NCBI_VIBLIBS  = "-lXm -lXmu -lXt -lX11"
 
65
#    NCBI_OTHERLIBS = "-lm -lPW -lsun"
 
66
#
 
67
#   Solaris:
 
68
#    NCBI_CC = cc
 
69
#    NCBI_CFLAGS1 = "-c -Xa"
 
70
#    NCBI_LDFLAGS1 = "-Xa"
 
71
#    NCBI_OPTFLAG = "-O"
 
72
#    NCBI_INCPATH = "/netopt/ncbi_tools/ver0.0/ncbi/include/NCBI"
 
73
#    NCBI_LIBPATH = "/netopt/ncbi_tools/ver0.0/ncbi/lib"
 
74
#    NCBI_ALTLIB  = "/netopt/ncbi_tools/ver0.0/ncbi/altlib"
 
75
#    NCBI_VIBFLAG = "-I/netopt/X11R5/include -I/netopt/Motif1.2.2/include -L/netopt/X11R5/lib -L/netopt/Motif1.2.2/lib -DWIN_MOTIF"
 
76
#    NCBI_VIBLIBS  = "-lXm -lXmu -lXt -lX11"
 
77
#    NCBI_OTHERLIBS = "-lm -lsocket -lnsl"
 
78
#
 
79
#######################################################################
 
80
#
 
81
# default flags for compiling and loading
 
82
#
 
83
#######################################################################
 
84
 
 
85
include $(NCBI)/ncbi.mk
 
86
 
 
87
CC = $(NCBI_CC)
 
88
CFLAGS1 = $(NCBI_CFLAGS1)
 
89
LDFLAGS1 = $(NCBI_LDFLAGS1)
 
90
OPTFLAG = $(NCBI_OPTFLAG)
 
91
OTHERLIBS = $(NCBI_OTHERLIBS)
 
92
VIBLIBS= $(NCBI_VIBLIBS)
 
93
VIBFLAG= $(NCBI_VIBFLAG)
 
94
INCPATH = $(NCBI_INCDIR)
 
95
LIBPATH = $(NCBI_LIBDIR)
 
96
 
 
97
CFLAGS = $(CFLAGS1) $(OPTFLAG) -I$(INCPATH) $(VIBFLAG)
 
98
LDFLAGS = -I$(INCPATH) $(OPTFLAG) -L$(LIBPATH) $(VIBFLAG)
 
99
 
 
100
# all NCBI libraries aliased for easy access here
 
101
 
 
102
LIB1 = -lncbi
 
103
LIB2 = -lncbiobj
 
104
LIB3 = -lncbicdr
 
105
LIB4 = -lvibrant
 
106
LIB5 = -lncbiacc
 
107
LIB6 = -lnetcli
 
108
LIB7 = -lnetentr
 
109
LIB8 = -lncbiNacc
 
110
LIB9 = -lncbiCacc
 
111
# LIB10 is reserved for NCSA socket library
 
112
LIB10 =
 
113
LIB11 = -lncbimla
 
114
LIB12 = -lncbitax
 
115
LIB13 = -lncbiid0
 
116
LIB14 = -lncbibls1
 
117
LIB15 = -lncbispel
 
118
 
 
119
## To clean out the directory without removing make
 
120
##
 
121
 
 
122
## Implicit actions
 
123
##
 
124
## if need a .o, compile the .c
 
125
##
 
126
 
 
127
.c.o :
 
128
        $(CC) $(CFLAGS) $<
 
129
 
 
130
#####################################################################
 
131
##
 
132
## Here is where you set up your own things to make
 
133
##
 
134
#####################################################################
 
135
 
 
136
## Default thing to make will be "all", in this case it checks that the
 
137
## source files exist, then tries to make "testcds"
 
138
##
 
139
 
 
140
 
 
141
all : asn2asn
 
142
 
 
143
 
 
144
## make individual applications and components
 
145
##
 
146
 
 
147
## These are non-vibrant versions
 
148
 
 
149
asn2asn : asn2asn.c
 
150
        $(CC) -o asn2asn $(LDFLAGS) asn2asn.c $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
 
151
 
 
152
asn2asn.pure : asn2asn.c
 
153
        purify3 $(CC) -o asn2asn.pure $(LDFLAGS) asn2asn.c $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
 
154
 
 
155
## these are vibrant versions
 
156
##
 
157
 
 
158
asn2asnv : asn2asn.c
 
159
        $(CC) -o asn2asn $(LDFLAGS) asn2asn.c $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
 
160
 
 
161
asn2asnv.pure : asn2asn.c
 
162
        purify3 $(CC) -o asn2asn.pure $(LDFLAGS) asn2asn.c $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
 
163