← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/bioperl/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Structure/Entry.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2011-06-17 13:51:18 UTC
  • mfrom: (1.2.5 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20110617135118-xgpxhaanue57cwqs
Tags: 1.6.901-1
* New upstream release.
* Point debian/watch to search.cpan.org.
* Build using dh and overrides:
  - Use Debhelper 8 (debian/rules, debian/control).
  - Simplified debian/rules.
* Split into libbio-perl-perl, as discussed with the Debian Perl team.
  (debian/control, debian/bioperl.install, debian libbio-perl-perl.install)
* debian/control:
  - Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2.
    No other changes needed.
  - Vcs-Browser URL made redirectable to viewvc.
  - Removed useless ‘svn’ in the Vcs-Svn URL.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/Structure/Entry.pm
1
 
# $Id: Entry.pm 16123 2009-09-17 12:57:27Z cjfields $
2
1
#
3
2
# bioperl module for Bio::Structure::Entry
4
3
#
56
55
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
57
56
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the web:
58
57
 
59
 
  http://bugzilla.open-bio.org/
 
58
  https://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
60
59
 
61
60
=head1 AUTHOR - Kris Boulez
62
61
 
708
707
 Usage   : $seqobj = $structure->seqres("A");
709
708
 Function: Gets a sequence object containing the sequence from the SEQRES record.
710
709
                if a chain-ID is given, the sequence for this chain is given, if none
711
 
                is provided the first chain is choosen
 
710
                is provided the first chain is chosen
712
711
 Returns : A Bio::PrimarySeq
713
712
 Args    : The chain-ID of the chain you want the sequence from
714
713