← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/python-biopython/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Fasta/FastaAlign.py

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Philipp Benner
  • Date: 2009-08-24 09:29:27 UTC
  • mfrom: (1.3.3 upstream) (4.1.4 sid)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090824092927-2wwh36vwnfgn98kl
Tags: 1.51final-2
http://bugs.debian.org/543236
Merged patch from ubuntu to make the package ready for
python2.6 (Closes: #543236).

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/Fasta/FastaAlign.py
1
1
"""
2
 
Code to deal with alignments written in Fasta format (OBSOLETE).
 
2
Code to deal with alignments written in Fasta format (DEPRECATED).
3
3
 
4
 
This module is considered obsolete and likely to be deprecated.  Please use
5
 
Bio.AlignIO instead for reading and writing alignments in FASTA format.
 
4
This module is considered obsolete and has been deprecated. It will be
 
5
removed in a future release of Biopython. Please use Bio.AlignIO instead
 
6
for reading and writing alignments in FASTA format.
6
7
 
7
8
This mostly just uses the regular Fasta parsing stuff written by Jeff
8
9
to deal with all of the input and output formats.