1
#Type Base Number Mass vdWR covR Red Green Blue
2
# X is a fall-back element type that should always exist
3
X X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
5
H H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
6
He He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
7
Li Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
8
Be Be 4 9.0122 1.3725 0.90 34 139 34
9
B B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
10
C C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
11
N N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
12
O O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
13
F F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
14
Ne Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
15
Na Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
16
Mg Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
17
Al Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
18
Si Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
19
P P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
20
S S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
21
Cl Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
22
Ar Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
23
K K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
24
Ca Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
25
Sc Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
26
Ti Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
27
V V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
28
Cr Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
29
Mn Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
30
Fe Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
31
Co Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
32
Ni Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
33
Cu Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
34
Zn Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
35
Ga Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
36
Ge Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
37
As As 33 74.9216 1.85 1.20 253 245 230
38
Se Se 34 78.96 1.90 1.16 152 251 152
39
Br Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
40
Kr Kr 36 83.80 2.02 1.12 50 205 50
41
Rb Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
42
Sr Sr 38 87.62 2.151 1.91 190 190 190
43
Y Y 39 88.9059 1.801 1.62 190 190 190
44
Zr Zr 40 91.224 1.602 1.45 190 190 190
45
Nb Nb 41 92.9064 1.468 1.34 190 190 190
46
Mo Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
47
Tc Tc 43 98.0 1.360 1.27 190 190 190
48
Ru Ru 44 101.07 1.339 1.25 190 190 190
49
Rh Rh 45 102.906 1.345 1.25 190 190 190
50
Pd Pd 46 106.42 1.376 1.28 190 190 190
51
Ag Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
52
Cd Cd 48 112.41 1.424 1.48 255 140 0
53
In In 49 114.82 1.663 1.44 190 190 190
54
Sn Sn 50 118.71 2.10 1.41 190 190 190
55
Sb Sb 51 121.75 2.05 1.40 190 190 190
56
Te Te 52 127.60 2.06 1.36 190 190 190
57
I I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
58
Xe Xe 54 131.29 2.00 1.31 255 105 180
59
Cs Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
60
Ba Ba 56 137.33 2.243 1.98 190 190 190
61
La La 57 138.906 1.877 1.69 190 190 190
62
Lu Lu 71 174.967 2.17 1.60 190 190 190
63
Hf Hf 72 178.49 1.580 1.44 190 190 190
64
Ta Ta 73 180.948 1.467 1.34 190 190 190
65
W W 74 183.85 1.534 1.30 64 224 208
66
Re Re 75 186.207 1.375 1.28 190 190 190
67
Os Os 76 190.2 1.353 1.26 190 190 190
68
Ir Ir 77 192.22 1.357 1.27 190 190 190
69
Pt Pt 78 195.08 1.75 1.30 190 190 190
70
Au Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
71
Hg Hg 80 200.59 1.55 1.49 190 190 190
72
Tl Tl 81 204.383 1.96 1.48 190 190 190
73
Pb Pb 82 207.2 2.02 1.47 190 190 190
74
Bi Bi 83 208.98 2.15 1.46 255 181 197
76
LP X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
77
PD X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
78
DM X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
79
1 H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
80
H3 H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
81
HALI H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
82
HARO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
83
HC H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
84
HHBN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
85
HN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
86
HO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
87
HS H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
88
HE He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
89
3 Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
90
LI Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
91
5 B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
92
6 C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
93
C1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
94
C2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
95
C3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
96
CA C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
97
CAR C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
98
CARO C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
99
CB C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
100
CD C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
101
CD1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
102
CD2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
103
CE C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
104
CE1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
105
CE2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
106
CG C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
107
CG1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
108
CG2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
109
CZ C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
110
CH2AL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
111
CH2OL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
112
CH3AL C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
113
CHAL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
114
CHAR C 6 13.019 1.58 0.77 112 128 144
115
CHOL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
116
CSP C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
117
CSP2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
118
CSP3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
119
CT C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
120
7 N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
121
NE N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
122
ND2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
123
NH1 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
124
NH2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
125
N1 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
126
N2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
127
N3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
128
N3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
129
NAM N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
130
NAR N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
131
NARO N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
132
NPL3 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
133
NSP N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
134
NSP2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
135
NSP3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
136
NSP3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
137
8 O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
138
O2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
139
O3 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
140
OH O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
141
OD1 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
142
OE1 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
143
OE2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
144
OG O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
145
OG1 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
146
OXT O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
147
OSP2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
148
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149
OSP3- O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
150
9 F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
151
NE Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
152
11 Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
153
NA Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
154
12 Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
155
MG Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
156
13 Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
157
AL Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
158
14 Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
159
SI Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
160
15 P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
161
P(C) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
162
P(N) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
163
P(O) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
164
P(S) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
165
16 S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
166
S2 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
167
S3 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
168
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169
SDIV S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
170
STET S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
171
STRI S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
172
Sh S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
173
17 Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
174
CL Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
175
AR Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
176
HV Ar 18 399.48 1.91 0.0 255 192 203
177
LT Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
178
DZ Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
179
19 K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
180
20 Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
181
21 Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
182
SC Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
183
22 Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
184
TI Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
185
23 V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
186
24 Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
187
CR Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
188
25 Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
189
MN Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
190
26 Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
191
FE Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
192
27 Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
193
CO Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
194
28 Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
195
NI Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
196
29 Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
197
CU Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
198
30 Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
199
ZN Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
200
31 Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
201
GA Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
202
GE Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
203
35 Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
204
BR Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
205
37 Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
206
RB Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
207
MO Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
208
47 Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
209
AG Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
210
53 I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
211
55 Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
212
CS Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
213
79 Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
214
AU Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
215
# Some oddball types derived from X:
216
XX X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
217
+ X 0 0.0 1.0 1.38 255 20 147
218
++ X 0 0.0 1.0 0.9 255 20 147
219
- X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
220
-- X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
221
DUMMY X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
222
RESERV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
223
BOGUS X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
224
DU X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
225
Tv X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
226
TV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
227
BQ X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
228
GB X 0 760.09 1.0 0.0 255 20 147
229
GBDP X 0 760.09 10.0 0.0 255 20 147
added
removed
src/org/openscience/cdk/config/data/jmol_atomtypes.txt
