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Viewing changes to util/tables/raw_scoremat.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2009-03-19 10:17:26 UTC
  • mfrom: (1.3.1 upstream) (5.1.1 experimental)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090319101726-wjuj7ajnq0w5a0mg
Tags: 6.1.20090301-1
* New upstream release; uploading to unstable now that lenny is out.
* debian/lib{ncbi6,vibrant6a}.symbols: update accordingly.
* doc/man/*.1: update accordingly as well.
* debian/control: place lib*-dbg in the new debug section, per the
  current override file.
* debian/control: declare compliance with Policy 3.8.1 (no changes needed).
* api/aliread.c: merge in fix (from 6.1.20080302-4) to undefined use of
  sprintf caught by Kees Cook's scan.
* debian/watch: belatedly update regex to recognize releases like the
  previous one ([6.1.]20081116a).

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Lines of Context:
util/tables/raw_scoremat.h
1
1
#ifndef UTIL_TABLES___SCOREMAT__H
2
2
#define UTIL_TABLES___SCOREMAT__H
3
3
 
4
 
/*  $Id: raw_scoremat.h,v 1.3 2006/09/25 19:29:05 madden Exp $
 
4
/*  $Id: raw_scoremat.h,v 1.4 2008/08/22 14:55:41 kazimird Exp $
5
5
 * ===========================================================================
6
6
 *
7
7
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
80
80
extern NCBI_TABLES_EXPORT const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Pam70;
81
81
extern NCBI_TABLES_EXPORT const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Pam250;
82
82
 
 
83
extern NCBI_TABLES_EXPORT
 
84
const SNCBIPackedScoreMatrix* NCBISM_GetStandardMatrix(const char* name);
 
85
 
83
86
#ifdef __cplusplus
84
87
}
85
88
#endif
86
89
 
87
 
/*
88
 
* ===========================================================================
89
 
*
90
 
* $Log: raw_scoremat.h,v $
91
 
* Revision 1.3  2006/09/25 19:29:05  madden
92
 
* Added the BLOSUM50 and BLOSUM90 matrices. [from Mike Gertz]
93
 
*
94
 
* Revision 1.2  2003/12/29 21:25:50  ucko
95
 
* +PAM250
96
 
*
97
 
* Revision 1.1  2003/08/21 19:48:19  ucko
98
 
* Add tables library (shared with C) for raw score matrices, etc.
99
 
*
100
 
*
101
 
* ===========================================================================
102
 
*/
103
 
 
104
90
#endif  /* UTIL_TABLES___SCOREMAT__H */