← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/wily/ncbi-tools6/wily

« back to all changes in this revision

Viewing changes to api/tofasta.h

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Aaron M. Ucko, Andreas Tille
  • Date: 2012-06-24 22:54:29 UTC
  • mfrom: (1.1.12)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20120624225429-y81u0gzrppi3fhyf
Tags: 6.1.20120620-2
[ Andreas Tille ]
debian/upstream: Strings containing ': ' need to be quoted.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
api/tofasta.h
29
29
*   
30
30
* Version Creation Date: 7/12/91
31
31
*
32
 
* $Revision: 6.41 $
 
32
* $Revision: 6.43 $
33
33
*
34
34
* File Description:  various sequence objects to fasta output
35
35
*
219
219
  CharPtr idSuffix
220
220
);
221
221
 
 
222
NLM_EXTERN Int4 CdRegionFastaStreamEx (
 
223
  SeqFeatPtr sfp,
 
224
  FILE *fp,
 
225
  StreamFlgType flags,
 
226
  Int2 linelen,
 
227
  Int2 blocklen,
 
228
  Int2 grouplen,
 
229
  Boolean do_defline,
 
230
  CharPtr idSuffix,
 
231
  SeqLocPtr mappedloc,
 
232
  BioseqPtr parentbsp
 
233
);
 
234
 
222
235
NLM_EXTERN Int4 TranslationFastaStream (
223
236
  SeqFeatPtr sfp,
224
237
  FILE *fp,
230
243
  CharPtr idSuffix
231
244
);
232
245
 
 
246
NLM_EXTERN Int4 TranslationFastaStreamEx (
 
247
  SeqFeatPtr sfp,
 
248
  FILE *fp,
 
249
  StreamFlgType flags,
 
250
  Int2 linelen,
 
251
  Int2 blocklen,
 
252
  Int2 grouplen,
 
253
  Boolean do_defline,
 
254
  CharPtr idSuffix,
 
255
  SeqLocPtr mappedloc,
 
256
  BioseqPtr parentbsp
 
257
);
 
258
 
233
259
NLM_EXTERN Int4 GeneFastaStream (
234
260
  SeqFeatPtr sfp,
235
261
  FILE *fp,
241
267
  CharPtr idSuffix
242
268
);
243
269
 
 
270
NLM_EXTERN Int4 GeneFastaStreamEx (
 
271
  SeqFeatPtr sfp,
 
272
  FILE *fp,
 
273
  StreamFlgType flags,
 
274
  Int2 linelen,
 
275
  Int2 blocklen,
 
276
  Int2 grouplen,
 
277
  Boolean do_defline,
 
278
  CharPtr idSuffix,
 
279
  SeqLocPtr mappedloc,
 
280
  BioseqPtr parentbsp
 
281
);
 
282
 
244
283
NLM_EXTERN Int4 SeqEntryFastaStream (
245
284
  SeqEntryPtr sep,
246
285
  FILE *fp,