~siesta-maint/siesta/rel-4.0

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Tests/Reference/h2o_bands_polarized.out

  • Committer: Nick Papior
  • Date: 2018-06-13 19:25:31 UTC
  • Revision ID: nickpapior@gmail.com-20180613192531-ywkvx48gw10hvtak
Reran all tests for 4.0

Since this 4.0 update implements new tabulated values
a lot of the tests changed values. I have gone through
all OUT.diffs and asserted that the values are agreeing
while they are not equal.

Secondly, many of the tests with HarrisFunctional have been
changed to use regular diagon to make them more predictable
and stable tests.

This commit only deals with Siesta tests.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
Siesta Version  : siesta-4.0--578
 
2
Architecture    : x86_64-linux-n-62-25-35
 
3
Compiler version: GNU Fortran (GCC) 7.3.0
 
4
Compiler flags  : mpif90 -m64 -fPIC -O3 -march=native -ftree-vectorize -fexpensive-optimizationns -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fno-second-underscore
 
5
PP flags        : -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/build-tools/1.0/include -I/zdatta/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/zlib/1.2.11/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/numactl/2.0.11/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/libxml2/2.9.7/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hwloc/1.11.9/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openmpi/3.0.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/szip/2.1.1/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hdf5-serial/1.8.18/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/netcdf-serial/4.6.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/scalapack/204/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openblas/0.2.20/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/elpa/2017.05.003/gnu-7.3.0/include -DSIESTA__ELPA -DMPI -D1 -DFC_HAVE_ABORT -DCDF -DSIESTA__MRRR 
 
6
PARALLEL version
 
7
NetCDF support
 
8
 
 
9
* Running on    8 nodes in parallel
 
10
>> Start of run:  10-JUN-2018  21:46:52
 
11
 
 
12
                           ***********************       
 
13
                           *  WELCOME TO SIESTA  *       
 
14
                           ***********************       
 
15
 
 
16
reinit: Reading from standard input
 
17
************************** Dump of input data file ****************************
 
18
SystemName          Water molecule (bands)
 
19
SystemLabel         h2o_bands_polarized
 
20
NumberOfAtoms       3
 
21
NumberOfSpecies     2
 
22
MeshCutoff  50 Ry
 
23
SpinPolarized True
 
24
%block ChemicalSpeciesLabel
 
25
 1  8  O      # Species index, atomic number, species label
 
26
 2  1  H
 
27
%endblock ChemicalSpeciesLabel
 
28
AtomicCoordinatesFormat  Ang
 
29
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
 
30
 0.000  0.000  0.000  1
 
31
 0.757  0.586  0.000  2
 
32
-0.757  0.586  0.000  2
 
33
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
 
34
LatticeConstant 1. Ang
 
35
%block LatticeVectors
 
36
  10.  0.  0.
 
37
   0. 10.  0.
 
38
   0.  0.  3.
 
39
%endblock
 
40
BandLinesScale ReciprocalLatticeVectors
 
41
%block BandLines
 
42
 1  0.000  0.000  0.000 \Gamma
 
43
20  0.000  0.000  0.500 K
 
44
%endblock BandLines
 
45
************************** End of input data file *****************************
 
46
 
 
47
reinit: -----------------------------------------------------------------------
 
48
reinit: System Name: Water molecule (bands
 
49
reinit: -----------------------------------------------------------------------
 
50
reinit: System Label: h2o_bands_polarized                                         
 
51
reinit: -----------------------------------------------------------------------
 
52
 
 
53
initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ----------
 
54
 Species number:            1  Label: O Atomic number:           8
 
55
 Species number:            2  Label: H Atomic number:           1
 
56
Ground state valence configuration:   2s02  2p04
 
57
Reading pseudopotential information in formatted form from O.psf
 
58
 
 
59
Valence configuration for pseudopotential generation:
 
60
2s( 2.00) rc: 1.14
 
61
2p( 4.00) rc: 1.14
 
62
3d( 0.00) rc: 1.14
 
63
4f( 0.00) rc: 1.14
 
64
Ground state valence configuration:   1s01
 
65
Reading pseudopotential information in formatted form from H.psf
 
66
 
 
67
Valence configuration for pseudopotential generation:
 
68
1s( 1.00) rc: 1.25
 
69
2p( 0.00) rc: 1.25
 
70
3d( 0.00) rc: 1.25
 
71
4f( 0.00) rc: 1.25
 
72
For O, standard SIESTA heuristics set lmxkb to 3
 
73
 (one more than the basis l, including polarization orbitals).
 
74
Use PS.lmax or PS.KBprojectors blocks to override.
 
75
For H, standard SIESTA heuristics set lmxkb to 2
 
76
 (one more than the basis l, including polarization orbitals).
 
77
Use PS.lmax or PS.KBprojectors blocks to override.
 
78
 
 
79
<basis_specs>
 
80
===============================================================================
 
81
O                    Z=   8    Mass=  16.000        Charge= 0.17977+309
 
82
Lmxo=1 Lmxkb= 3    BasisType=split      Semic=F
 
83
L=0  Nsemic=0  Cnfigmx=2
 
84
          n=1  nzeta=2  polorb=0
 
85
            splnorm:   0.15000    
 
86
               vcte:    0.0000    
 
87
               rinn:    0.0000    
 
88
               qcoe:    0.0000    
 
89
               qyuk:    0.0000    
 
90
               qwid:   0.10000E-01
 
91
                rcs:    0.0000      0.0000    
 
92
            lambdas:    1.0000      1.0000    
 
93
L=1  Nsemic=0  Cnfigmx=2
 
94
          n=1  nzeta=2  polorb=1
 
95
            splnorm:   0.15000    
 
96
               vcte:    0.0000    
 
97
               rinn:    0.0000    
 
98
               qcoe:    0.0000    
 
99
               qyuk:    0.0000    
 
100
               qwid:   0.10000E-01
 
101
                rcs:    0.0000      0.0000    
 
102
            lambdas:    1.0000      1.0000    
 
103
-------------------------------------------------------------------------------
 
104
L=0  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
105
L=1  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
106
L=2  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
107
L=3  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
108
===============================================================================
 
109
</basis_specs>
 
110
 
 
111
atom: Called for O                     (Z =   8)
 
112
 
 
113
read_vps: Pseudopotential generation method:
 
114
read_vps: ATM3      Troullier-Martins                       
 
115
Total valence charge:    6.00000
 
116
 
 
117
xc_check: Exchange-correlation functional:
 
118
xc_check: Ceperley-Alder
 
119
V l=0 = -2*Zval/r beyond r=  1.1278
 
120
V l=1 = -2*Zval/r beyond r=  1.1278
 
121
V l=2 = -2*Zval/r beyond r=  1.1278
 
122
V l=3 = -2*Zval/r beyond r=  1.1138
 
123
All V_l potentials equal beyond r=  1.1278
 
124
This should be close to max(r_c) in ps generation
 
125
All pots = -2*Zval/r beyond r=  1.1278
 
126
 
 
127
VLOCAL1: 99.0% of the norm of Vloc inside     34.126 Ry
 
128
VLOCAL1: 99.9% of the norm of Vloc inside     77.774 Ry
 
129
atom: Maximum radius for 4*pi*r*r*local-pseudopot. charge    1.37759
 
130
atom: Maximum radius for r*vlocal+2*Zval:    1.18566
 
131
GHOST: No ghost state for L =  0
 
132
GHOST: No ghost state for L =  1
 
133
GHOST: No ghost state for L =  2
 
134
GHOST: No ghost state for L =  3
 
135
 
 
136
KBgen: Kleinman-Bylander projectors: 
 
137
   l= 0   rc=  1.294105   el= -1.742414   Ekb=  9.135903   kbcos=  0.326910
 
138
   l= 1   rc=  1.294105   el= -0.676589   Ekb= -8.124878   kbcos= -0.395047
 
139
   l= 2   rc=  1.448233   el=  0.002386   Ekb= -2.039267   kbcos= -0.003484
 
140
   l= 3   rc=  1.561052   el=  0.003508   Ekb= -0.799141   kbcos= -0.000344
 
141
 
 
142
KBgen: Total number of  Kleinman-Bylander projectors:   16
 
143
atom: -------------------------------------------------------------------------
 
144
 
 
145
atom: SANKEY-TYPE ORBITALS:
 
146
atom: Selected multiple-zeta basis: split     
 
147
 
 
148
SPLIT: Orbitals with angular momentum L= 0
 
149
 
 
150
SPLIT: Basis orbitals for state 2s
 
151
 
 
152
SPLIT: PAO cut-off radius determined from an
 
153
SPLIT: energy shift=  0.020000 Ry
 
154
 
 
155
   izeta = 1
 
156
                 lambda =    1.000000
 
157
                     rc =    3.305093
 
158
                 energy =   -1.723766
 
159
                kinetic =    1.614911
 
160
    potential(screened) =   -3.338677
 
161
       potential(ionic) =  -11.304675
 
162
 
 
163
   izeta = 2
 
164
                 rmatch =    2.510382
 
165
              splitnorm =    0.150000
 
166
                 energy =   -1.471299
 
167
                kinetic =    2.446434
 
168
    potential(screened) =   -3.917732
 
169
       potential(ionic) =  -12.476133
 
170
 
 
171
SPLIT: Orbitals with angular momentum L= 1
 
172
 
 
173
SPLIT: Basis orbitals for state 2p
 
174
 
 
175
SPLIT: PAO cut-off radius determined from an
 
176
SPLIT: energy shift=  0.020000 Ry
 
177
 
 
178
   izeta = 1
 
179
                 lambda =    1.000000
 
180
                     rc =    3.937239
 
181
                 energy =   -0.658841
 
182
                kinetic =    5.005986
 
183
    potential(screened) =   -5.664827
 
184
       potential(ionic) =  -13.452360
 
185
 
 
186
   izeta = 2
 
187
                 rmatch =    2.541963
 
188
              splitnorm =    0.150000
 
189
                 energy =   -0.367441
 
190
                kinetic =    7.530509
 
191
    potential(screened) =   -7.897949
 
192
       potential(ionic) =  -16.611953
 
193
 
 
194
POLgen: Perturbative polarization orbital with L=  2
 
195
 
 
196
POLgen: Polarization orbital for state 2p
 
197
 
 
198
   izeta = 1
 
199
                     rc =    3.937239
 
200
                 energy =    2.398520
 
201
                kinetic =    4.716729
 
202
    potential(screened) =   -2.318209
 
203
       potential(ionic) =   -8.603170
 
204
atom: Total number of Sankey-type orbitals: 13
 
205
 
 
206
atm_pop: Valence configuration (for local Pseudopot. screening):
 
207
 2s( 2.00)                                                            
 
208
 2p( 4.00)                                                            
 
209
Vna: chval, zval:    6.00000   6.00000
 
210
 
 
211
Vna:  Cut-off radius for the neutral-atom potential:   3.937239
 
212
 
 
213
atom: _________________________________________________________________________
 
214
 
 
215
<basis_specs>
 
216
===============================================================================
 
217
H                    Z=   1    Mass=  1.0100        Charge= 0.17977+309
 
218
Lmxo=0 Lmxkb= 2    BasisType=split      Semic=F
 
219
L=0  Nsemic=0  Cnfigmx=1
 
220
          n=1  nzeta=2  polorb=1
 
221
            splnorm:   0.15000    
 
222
               vcte:    0.0000    
 
223
               rinn:    0.0000    
 
224
               qcoe:    0.0000    
 
225
               qyuk:    0.0000    
 
226
               qwid:   0.10000E-01
 
227
                rcs:    0.0000      0.0000    
 
228
            lambdas:    1.0000      1.0000    
 
229
-------------------------------------------------------------------------------
 
230
L=0  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
231
L=1  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
232
L=2  Nkbl=1  erefs: 0.17977+309
 
233
===============================================================================
 
234
</basis_specs>
 
235
 
 
236
atom: Called for H                     (Z =   1)
 
237
 
 
238
read_vps: Pseudopotential generation method:
 
239
read_vps: ATM3      Troullier-Martins                       
 
240
Total valence charge:    1.00000
 
241
 
 
242
xc_check: Exchange-correlation functional:
 
243
xc_check: Ceperley-Alder
 
244
V l=0 = -2*Zval/r beyond r=  1.2343
 
245
V l=1 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
 
246
V l=2 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
 
247
All V_l potentials equal beyond r=  1.2343
 
248
This should be close to max(r_c) in ps generation
 
249
All pots = -2*Zval/r beyond r=  1.2343
 
250
 
 
251
VLOCAL1: 99.0% of the norm of Vloc inside     28.493 Ry
 
252
VLOCAL1: 99.9% of the norm of Vloc inside     64.935 Ry
 
253
atom: Maximum radius for 4*pi*r*r*local-pseudopot. charge    1.45251
 
254
atom: Maximum radius for r*vlocal+2*Zval:    1.21892
 
255
GHOST: No ghost state for L =  0
 
256
GHOST: No ghost state for L =  1
 
257
GHOST: No ghost state for L =  2
 
258
 
 
259
KBgen: Kleinman-Bylander projectors: 
 
260
   l= 0   rc=  1.364359   el= -0.467325   Ekb= -2.005361   kbcos= -0.336422
 
261
   l= 1   rc=  1.434438   el=  0.001430   Ekb= -0.501708   kbcos= -0.021697
 
262
   l= 2   rc=  1.470814   el=  0.002365   Ekb= -0.190555   kbcos= -0.002281
 
263
 
 
264
KBgen: Total number of  Kleinman-Bylander projectors:    9
 
265
atom: -------------------------------------------------------------------------
 
266
 
 
267
atom: SANKEY-TYPE ORBITALS:
 
268
atom: Selected multiple-zeta basis: split     
 
269
 
 
270
SPLIT: Orbitals with angular momentum L= 0
 
271
 
 
272
SPLIT: Basis orbitals for state 1s
 
273
 
 
274
SPLIT: PAO cut-off radius determined from an
 
275
SPLIT: energy shift=  0.020000 Ry
 
276
 
 
277
   izeta = 1
 
278
                 lambda =    1.000000
 
279
                     rc =    4.828263
 
280
                 energy =   -0.449375
 
281
                kinetic =    0.929372
 
282
    potential(screened) =   -1.378747
 
283
       potential(ionic) =   -1.915047
 
284
 
 
285
   izeta = 2
 
286
                 rmatch =    3.854947
 
287
              splitnorm =    0.150000
 
288
                 energy =   -0.336153
 
289
                kinetic =    1.505294
 
290
    potential(screened) =   -1.841447
 
291
       potential(ionic) =   -2.413582
 
292
 
 
293
POLgen: Perturbative polarization orbital with L=  1
 
294
 
 
295
POLgen: Polarization orbital for state 1s
 
296
 
 
297
   izeta = 1
 
298
                     rc =    4.828263
 
299
                 energy =    0.706972
 
300
                kinetic =    1.396397
 
301
    potential(screened) =   -0.689424
 
302
       potential(ionic) =   -1.169792
 
303
atom: Total number of Sankey-type orbitals:  5
 
304
 
 
305
atm_pop: Valence configuration (for local Pseudopot. screening):
 
306
 1s( 1.00)                                                            
 
307
Vna: chval, zval:    1.00000   1.00000
 
308
 
 
309
Vna:  Cut-off radius for the neutral-atom potential:   4.828263
 
310
 
 
311
atom: _________________________________________________________________________
 
312
 
 
313
prinput: Basis input ----------------------------------------------------------
 
314
 
 
315
PAO.BasisType split     
 
316
 
 
317
%block ChemicalSpeciesLabel
 
318
    1    8 O                       # Species index, atomic number, species label
 
319
    2    1 H                       # Species index, atomic number, species label
 
320
%endblock ChemicalSpeciesLabel
 
321
 
 
322
%block PAO.Basis                 # Define Basis set
 
323
O                     2                    # Species label, number of l-shells
 
324
 n=2   0   2                         # n, l, Nzeta 
 
325
   3.305      2.510   
 
326
   1.000      1.000   
 
327
 n=2   1   2 P   1                   # n, l, Nzeta, Polarization, NzetaPol
 
328
   3.937      2.542   
 
329
   1.000      1.000   
 
330
H                     1                    # Species label, number of l-shells
 
331
 n=1   0   2 P   1                   # n, l, Nzeta, Polarization, NzetaPol
 
332
   4.828      3.855   
 
333
   1.000      1.000   
 
334
%endblock PAO.Basis
 
335
 
 
336
prinput: ----------------------------------------------------------------------
 
337
 
 
338
Dumping basis to NetCDF file O.ion.nc
 
339
Dumping basis to NetCDF file H.ion.nc
 
340
coor:   Atomic-coordinates input format  =     Cartesian coordinates
 
341
coor:                                          (in Angstroms)
 
342
 
 
343
siesta: Atomic coordinates (Bohr) and species
 
344
siesta:      0.00000   0.00000   0.00000  1        1
 
345
siesta:      1.43052   1.10738   0.00000  2        2
 
346
siesta:     -1.43052   1.10738   0.00000  2        3
 
347
 
 
348
siesta: System type = chain     
 
349
 
 
350
initatomlists: Number of atoms, orbitals, and projectors:      3    23    34
 
351
 
 
352
siesta: ******************** Simulation parameters ****************************
 
353
siesta:
 
354
siesta: The following are some of the parameters of the simulation.
 
355
siesta: A complete list of the parameters used, including default values,
 
356
siesta: can be found in file out.fdf
 
357
siesta:
 
358
redata: Non-Collinear-spin run           =     F
 
359
redata: SpinPolarized (Up/Down) run      =     T
 
360
redata: Number of spin components        =     2
 
361
redata: Long output                      =     F
 
362
redata: Number of Atomic Species         =        2
 
363
redata: Charge density info will appear in .RHO file
 
364
redata: Write Mulliken Pop.              =     NO
 
365
redata: Matel table size (NRTAB)         =     1024
 
366
redata: Mesh Cutoff                      =    50.0000 Ry
 
367
redata: Net charge of the system         =     0.0000 |e|
 
368
redata: Min. number of SCF Iter          =        0
 
369
redata: Max. number of SCF Iter          =       50
 
370
redata: Mix DM or H after convergence    =     F
 
371
redata: Recompute H after scf cycle      =     F
 
372
redata: Mixing is linear
 
373
redata: Mix DM in first SCF step ?       =     F
 
374
redata: Write Pulay info on disk?        =     F
 
375
redata: Discard 1st Pulay DM after  kick =     F
 
376
redata: New DM Mixing Weight             =     0.2500
 
377
redata: New DM Occupancy tolerance       = 0.000000000001
 
378
redata: No kicks to SCF
 
379
redata: DM Mixing Weight for Kicks       =     0.5000
 
380
redata: DM Tolerance for SCF             =     0.000100
 
381
redata: Require (free) Energy convergence in SCF =     F
 
382
redata: DM (free)Energy tolerance for SCF =     0.000010 eV
 
383
redata: Require Harris convergence for SCF =     F
 
384
redata: DM Harris energy tolerance for SCF =     0.000010 eV
 
385
redata: Antiferro initial spin density   =     F
 
386
redata: Using Saved Data (generic)   =     F
 
387
redata: Use continuation files for DM    =     F
 
388
redata: Neglect nonoverlap interactions  =     F
 
389
redata: Method of Calculation            =     Diagonalization
 
390
redata: Divide and Conquer               =     T
 
391
redata: Electronic Temperature           =     0.0019  Ry
 
392
redata: Fix the spin of the system       =     F
 
393
redata: Dynamics option                  =     Single-point calculation
 
394
redata: ***********************************************************************
 
395
Total number of electrons:     8.000000
 
396
Total ionic charge:     8.000000
 
397
 
 
398
* ProcessorY, Blocksize:    2   3
 
399
 
 
400
 
 
401
* Orbital distribution balance (max,min):     3     2
 
402
 
 
403
 Kpoints in:            1 . Kpoints trimmed:            1
 
404
 
 
405
siesta: k-grid: Number of k-points =     1
 
406
siesta: k-grid: Cutoff (effective) =     1.500 Ang
 
407
siesta: k-grid: Supercell and displacements
 
408
siesta: k-grid:    1   0   0      0.000
 
409
siesta: k-grid:    0   1   0      0.000
 
410
siesta: k-grid:    0   0   1      0.000
 
411
Using current reciprocal lattice vectors for BandLinesScale
 
412
Beware any cell changes by the end of the run
 
413
Using current reciprocal lattice vectors for BandLinesScale
 
414
Beware any cell changes by the end of the run
 
415
Naive supercell factors:     2    2    5
 
416
 
 
417
superc: Internal auxiliary supercell:     2 x     2 x     5  =      20
 
418
superc: Number of atoms, orbitals, and projectors:     60    460    680
 
419
 
 
420
                     ====================================
 
421
                        Single-point calculation
 
422
                     ====================================
 
423
 
 
424
superc: Internal auxiliary supercell:     2 x     2 x     5  =      20
 
425
superc: Number of atoms, orbitals, and projectors:     60    460    680
 
426
 
 
427
outcell: Unit cell vectors (Ang):
 
428
       10.000000    0.000000    0.000000
 
429
        0.000000   10.000000    0.000000
 
430
        0.000000    0.000000    3.000000
 
431
 
 
432
outcell: Cell vector modules (Ang)   :   10.000000   10.000000    3.000000
 
433
outcell: Cell angles (23,13,12) (deg):     90.0000     90.0000     90.0000
 
434
outcell: Cell volume (Ang**3)        :    300.0000
 
435
New_DM. Step:     1
 
436
Initializing Density Matrix...
 
437
     spin moment: S , {S} =    4.00000       0.0       0.0   4.00000
 
438
New grid distribution:   1
 
439
           1       1:   24    1:   12    1:    2
 
440
           2       1:   24    1:   12    3:    4
 
441
           3       1:   24    1:   12    5:    6
 
442
           4       1:   24    1:   12    7:    8
 
443
           5       1:   24   13:   24    1:    2
 
444
           6       1:   24   13:   24    3:    4
 
445
           7       1:   24   13:   24    5:    6
 
446
           8       1:   24   13:   24    7:    8
 
447
 
 
448
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    16 =       36864
 
449
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x     8 =        4608
 
450
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    50.000    63.677 Ry
 
451
ExtMesh (bp) on 0 =    52 x    40 x    30 =       62400
 
452
New grid distribution:   2
 
453
           1       1:    4    5:   22    1:    8
 
454
           2       6:   24    3:    4    1:    8
 
455
           3       6:   24    1:    2    1:    8
 
456
           4       1:    5    1:    2    1:    8
 
457
           5       5:   24    5:   22    1:    8
 
458
           6       5:   24   23:   24    1:    8
 
459
           7       1:    5    3:    4    1:    8
 
460
           8       1:    4   23:   24    1:    8
 
461
New grid distribution:   3
 
462
           1       1:    7    6:   21    1:    8
 
463
           2       9:   24    3:    5    1:    8
 
464
           3       9:   24    1:    2    1:    8
 
465
           4       1:    8    1:    2    1:    8
 
466
           5       8:   24    6:   21    1:    8
 
467
           6       8:   24   22:   24    1:    8
 
468
           7       1:    8    3:    5    1:    8
 
469
           8       1:    7   22:   24    1:    8
 
470
Setting up quadratic distribution...
 
471
ExtMesh (bp) on 0 =    32 x    46 x    36 =       52992
 
472
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                  576
 
473
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                 2541
 
474
 
 
475
stepf: Fermi-Dirac step function
 
476
 
 
477
siesta: Program's energy decomposition (eV):
 
478
siesta: Ebs     =      -120.740017
 
479
siesta: Eions   =       815.854478
 
480
siesta: Ena     =       175.151731
 
481
siesta: Ekin    =       341.667406
 
482
siesta: Enl     =       -52.736859
 
483
siesta: DEna    =        -0.000003
 
484
siesta: DUscf   =         0.000000
 
485
siesta: DUext   =         0.000000
 
486
siesta: Exc     =      -113.714162
 
487
siesta: eta*DQ  =         0.000000
 
488
siesta: Emadel  =         0.000000
 
489
siesta: Emeta   =         0.000000
 
490
siesta: Emolmec =         0.000000
 
491
siesta: Ekinion =         0.000000
 
492
siesta: Eharris =      -461.990598
 
493
siesta: Etot    =      -465.486366
 
494
siesta: FreeEng =      -465.486366
 
495
 
 
496
   scf: iscf   Eharris(eV)      E_KS(eV)   FreeEng(eV)    dDmax  Ef(eV)
 
497
   scf:    1     -461.9906     -465.4864     -465.4864  0.92833 -4.8445
 
498
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
499
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       0.027   2.18
 
500
   scf:    2     -467.3691     -463.6608     -463.6608  0.17543 -0.2596
 
501
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
502
   scf:    3     -465.1981     -464.1542     -464.1542  0.06888 -0.4937
 
503
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
504
   scf:    4     -465.0490     -464.3862     -464.3862  0.04052 -1.0396
 
505
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
506
   scf:    5     -465.0369     -464.5496     -464.5496  0.03557 -1.1838
 
507
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
508
   scf:    6     -465.0362     -464.6712     -464.6712  0.02904 -1.2168
 
509
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
510
   scf:    7     -465.0364     -464.7625     -464.7625  0.02277 -1.2197
 
511
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
512
   scf:    8     -465.0365     -464.8310     -464.8310  0.01762 -1.2156
 
513
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
514
   scf:    9     -465.0366     -464.8824     -464.8824  0.01357 -1.2109
 
515
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
516
   scf:   10     -465.0367     -464.9210     -464.9210  0.01045 -1.2069
 
517
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
518
   scf:   11     -465.0367     -464.9499     -464.9499  0.00805 -1.2038
 
519
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
520
   scf:   12     -465.0368     -464.9716     -464.9716  0.00620 -1.2016
 
521
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
522
   scf:   13     -465.0368     -464.9879     -464.9879  0.00479 -1.1999
 
523
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
524
   scf:   14     -465.0368     -465.0001     -465.0001  0.00370 -1.1986
 
525
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
526
   scf:   15     -465.0368     -465.0093     -465.0093  0.00286 -1.1977
 
527
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
528
   scf:   16     -465.0368     -465.0162     -465.0162  0.00221 -1.1970
 
529
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
530
   scf:   17     -465.0368     -465.0213     -465.0213  0.00172 -1.1965
 
531
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
532
   scf:   18     -465.0368     -465.0252     -465.0252  0.00133 -1.1961
 
533
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
534
   scf:   19     -465.0368     -465.0281     -465.0281  0.00103 -1.1959
 
535
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
536
   scf:   20     -465.0368     -465.0303     -465.0303  0.00080 -1.1956
 
537
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
538
   scf:   21     -465.0368     -465.0319     -465.0319  0.00062 -1.1955
 
539
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
540
   scf:   22     -465.0368     -465.0331     -465.0331  0.00048 -1.1954
 
541
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
542
   scf:   23     -465.0368     -465.0341     -465.0341  0.00038 -1.1953
 
543
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
544
   scf:   24     -465.0368     -465.0347     -465.0347  0.00029 -1.1952
 
545
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
546
   scf:   25     -465.0368     -465.0353     -465.0353  0.00023 -1.1951
 
547
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
548
   scf:   26     -465.0368     -465.0357     -465.0357  0.00018 -1.1951
 
549
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
550
   scf:   27     -465.0368     -465.0359     -465.0359  0.00014 -1.1951
 
551
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
552
   scf:   28     -465.0368     -465.0362     -465.0362  0.00011 -1.1950
 
553
     spin moment: S , {S} =   -0.00000       0.0       0.0  -0.00000
 
554
   scf:   29     -465.0368     -465.0363     -465.0363  0.00008 -1.1950
 
555
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
556
 
 
557
SCF Convergence by dMax criterion
 
558
max |DM_out - DM_in|:     0.00008408
 
559
SCF cycle converged after   29 iterations
 
560
 
 
561
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
562
 
 
563
siesta: E_KS(eV) =             -465.0368
 
564
 
 
565
siesta: E_KS - E_eggbox =      -465.0368
 
566
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
567
 
 
568
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
 
569
----------------------------------------
 
570
   Tot    0.000000    0.123858   -0.000000
 
571
----------------------------------------
 
572
   Max    1.104369
 
573
   Res    0.660458    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
 
574
----------------------------------------
 
575
   Max    1.104369    constrained
 
576
 
 
577
Stress-tensor-Voigt (kbar):      -13.11       -5.08      -21.39       -0.00        0.00        0.00
 
578
(Free)E + p*V (eV/cell)     -462.5661
 
579
Target enthalpy (eV/cell)     -465.0368
 
580
Computing bands...
 
581
 
 
582
siesta: Program's energy decomposition (eV):
 
583
siesta: Ebs     =       -99.542239
 
584
siesta: Eions   =       815.854478
 
585
siesta: Ena     =       175.151731
 
586
siesta: Ekin    =       358.123990
 
587
siesta: Enl     =       -64.814832
 
588
siesta: DEna    =        -4.796111
 
589
siesta: DUscf   =         0.894126
 
590
siesta: DUext   =         0.000000
 
591
siesta: Exc     =      -113.741241
 
592
siesta: eta*DQ  =         0.000000
 
593
siesta: Emadel  =         0.000000
 
594
siesta: Emeta   =         0.000000
 
595
siesta: Emolmec =         0.000000
 
596
siesta: Ekinion =         0.000000
 
597
siesta: Eharris =      -465.036815
 
598
siesta: Etot    =      -465.036815
 
599
siesta: FreeEng =      -465.036815
 
600
 
 
601
siesta: Final energy (eV):
 
602
siesta:  Band Struct. =     -99.542239
 
603
siesta:       Kinetic =     358.123990
 
604
siesta:       Hartree =     519.804030
 
605
siesta:    Ext. field =       0.000000
 
606
siesta:   Exch.-corr. =    -113.741241
 
607
siesta:  Ion-electron =   -1348.238873
 
608
siesta:       Ion-ion =     119.015279
 
609
siesta:       Ekinion =       0.000000
 
610
siesta:         Total =    -465.036815
 
611
 
 
612
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
 
613
siesta:      1   -0.000000   -1.104369    0.000000
 
614
siesta:      2    0.987912    0.614113   -0.000000
 
615
siesta:      3   -0.987912    0.614113   -0.000000
 
616
siesta: ----------------------------------------
 
617
siesta:    Tot    0.000000    0.123858   -0.000000
 
618
 
 
619
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
 
620
siesta:    -0.008184   -0.000000   -0.000000
 
621
siesta:    -0.000000   -0.003172   -0.000000
 
622
siesta:     0.000000    0.000000   -0.013351
 
623
 
 
624
siesta: Cell volume =        300.000000 Ang**3
 
625
 
 
626
siesta: Pressure (static):
 
627
siesta:                Solid            Molecule  Units
 
628
siesta:           0.00008970          0.00006347  Ry/Bohr**3
 
629
siesta:           0.00823580          0.00582796  eV/Ang**3
 
630
siesta:          13.19534804          9.33752808  kBar
 
631
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =        -464.451648
 
632
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =        -464.451648
 
633
     spin moment: S , {S} =    0.00000       0.0       0.0   0.00000
 
634
 
 
635
siesta: Electric dipole (a.u.)  =    0.000000    0.492675   -0.000000
 
636
siesta: Electric dipole (Debye) =    0.000000    1.252256   -0.000000
 
637
>> End of run:  10-JUN-2018  21:46:54
 
638
Job completed