← Back to branch summary

~siesta-maint/siesta/rel-4.0

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Tests/Reference/pb_filter_tol.out

  • Committer: Nick Papior
  • Date: 2018-06-13 19:25:31 UTC
  • Revision ID: nickpapior@gmail.com-20180613192531-ywkvx48gw10hvtak
Reran all tests for 4.0

Since this 4.0 update implements new tabulated values
a lot of the tests changed values. I have gone through
all OUT.diffs and asserted that the values are agreeing
while they are not equal.

Secondly, many of the tests with HarrisFunctional have been
changed to use regular diagon to make them more predictable
and stable tests.

This commit only deals with Siesta tests.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Tests/Reference/pb_filter_tol.out
1
 
Siesta Version: siesta-4.0--527
2
 
Architecture  : x86_64-linux-n-62-18-14
3
 
Compiler flags: mpifort -m64 -fPIC -O3 -march=native -ftree-vectorize -fexpensive-optimizatioons -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fno-second-underscore 
4
 
PP flags      : -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/build-tools/1.0/include -I/zdatta/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/gmp/6.1.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/mpfr/3.1.4/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/mpc/1.0.3/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/isl/0.16.1/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/gcc/6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/numactl/2.0.11/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/zlib/1.2.8/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/libxml2/2.9.4/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/hwloc/1.11.4/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/openmpi/2.0.1/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/hdf5/1.8.17/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/pnetcdf/1.7.0/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/netcdf/4.4.1/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/flook/0.7.0/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/parmetis/4.0.3/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/scalapack/204/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/openblas/0.2.19/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/mumps/5.0.2/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/fftw/3.3.5/gnu-6.2.0/include -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DCDF  -DSIESTA__METIS -DSIESTA__MUMPS -DTS_NOCHECKS -DSIESTA__FLOOK  
 
1
Siesta Version  : siesta-4.0--578
 
2
Architecture    : x86_64-linux-n-62-25-35
 
3
Compiler version: GNU Fortran (GCC) 7.3.0
 
4
Compiler flags  : mpif90 -m64 -fPIC -O3 -march=native -ftree-vectorize -fexpensive-optimizationns -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fno-second-underscore
 
5
PP flags        : -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/build-tools/1.0/include -I/zdatta/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/gcc/7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/zlib/1.2.11/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/generic/numactl/2.0.11/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/libxml2/2.9.7/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hwloc/1.11.9/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openmpi/3.0.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/szip/2.1.1/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/hdf5-serial/1.8.18/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/netcdf-serial/4.6.0/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/scalapack/204/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/openblas/0.2.20/gnu-7.3.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2018-feb/XeonE5-2660v3/elpa/2017.05.003/gnu-7.3.0/include -DSIESTA__ELPA -DMPI -D1 -DFC_HAVE_ABORT -DCDF -DSIESTA__MRRR 
5
6
PARALLEL version
6
7
NetCDF support
7
8
 
8
9
* Running on    8 nodes in parallel
9
 
>> Start of run:   2-JUL-2017  11:58:06
 
10
>> Start of run:  10-JUN-2018  21:52:39
10
11
 
11
12
                           ***********************       
12
13
                           *  WELCOME TO SIESTA  *       
304
305
redata: Number of Atomic Species         =        1
305
306
redata: Charge density info will appear in .RHO file
306
307
redata: Write Mulliken Pop.              =     NO
307
 
redata: Mesh Cutoff                      =   200.0000  Ry
 
308
redata: Matel table size (NRTAB)         =     1024
 
309
redata: Mesh Cutoff                      =   200.0000 Ry
308
310
redata: Net charge of the system         =     0.0000 |e|
309
311
redata: Min. number of SCF Iter          =        0
310
312
redata: Max. number of SCF Iter          =       50
413
415
stepf: Fermi-Dirac step function
414
416
 
415
417
siesta: Program's energy decomposition (eV):
416
 
siesta: Ebs     =       -29.334463
 
418
siesta: Ebs     =       -29.334462
417
419
siesta: Eions   =       122.930792
418
420
siesta: Ena     =        18.410043
419
421
siesta: Ekin    =        36.117328
427
429
siesta: Emeta   =         0.000000
428
430
siesta: Emolmec =         0.000000
429
431
siesta: Ekinion =         0.000000
430
 
siesta: Eharris =      -349.054145
 
432
siesta: Eharris =      -349.054143
431
433
siesta: Etot    =      -345.048410
432
 
siesta: FreeEng =      -345.049687
 
434
siesta: FreeEng =      -345.049688
433
435
 
434
436
   scf: iscf   Eharris(eV)      E_KS(eV)   FreeEng(eV)    dDmax  Ef(eV)
435
437
   scf:    1     -349.0541     -345.0484     -345.0497  0.38965 -2.0066
436
 
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       1.386  56.39
 
438
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       0.839  49.38
437
439
   scf:    2     -348.9997     -348.9951     -348.9965  0.06300 -2.1548
438
 
   scf:    3     -348.8467     -348.7400     -348.7413  0.03187 -2.1444
439
 
   scf:    4     -348.8465     -348.7459     -348.7473  0.03080 -2.1444
440
 
   scf:    5     -348.8448     -348.9242     -348.9256  0.00687 -2.1447
441
 
   scf:    6     -349.0015     -348.9794     -348.9808  0.03661 -2.1462
442
 
   scf:    7     -349.0018     -349.0515     -349.0529  0.03283 -2.1495
443
 
   scf:    8     -349.0018     -348.9889     -348.9902  0.03514 -2.1463
444
 
   scf:    9     -348.9998     -348.9173     -348.9187  0.04668 -2.1461
445
 
   scf:   10     -348.9996     -348.9082     -348.9096  0.04579 -2.1457
446
 
   scf:   11     -348.9994     -348.8875     -348.8889  0.01584 -2.1399
447
 
   scf:   12     -348.9994     -348.8937     -348.8951  0.01450 -2.1400
448
 
   scf:   13     -348.9994     -348.9964     -348.9978  0.00397 -2.1430
449
 
   scf:   14     -348.9994     -348.9979     -348.9993  0.00385 -2.1431
450
 
   scf:   15     -348.9993     -349.0027     -349.0041  0.00228 -2.1438
451
 
   scf:   16     -348.9993     -348.9994     -349.0008  0.00262 -2.1438
452
 
   scf:   17     -348.9993     -348.9929     -348.9943  0.00303 -2.1435
453
 
   scf:   18     -348.9993     -348.9914     -348.9928  0.00191 -2.1432
454
 
   scf:   19     -348.9993     -348.9920     -348.9934  0.00155 -2.1432
455
 
   scf:   20     -348.9993     -349.0038     -349.0052  0.00091 -2.1436
456
 
   scf:   21     -348.9993     -349.0039     -349.0053  0.00085 -2.1436
457
 
   scf:   22     -348.9993     -349.0012     -349.0026  0.00020 -2.1436
458
 
   scf:   23     -348.9993     -349.0010     -349.0024  0.00021 -2.1436
459
 
   scf:   24     -348.9993     -348.9987     -349.0001  0.00025 -2.1435
460
 
   scf:   25     -348.9993     -348.9987     -349.0001  0.00022 -2.1435
461
 
   scf:   26     -348.9993     -348.9991     -349.0005  0.00012 -2.1435
462
 
   scf:   27     -348.9993     -348.9996     -349.0009  0.00010 -2.1435
463
 
   scf:   28     -348.9993     -348.9997     -349.0011  0.00009 -2.1435
 
440
   scf:    3     -348.9994     -348.9010     -348.9024  0.06756 -2.1506
 
441
   scf:    4     -348.9993     -349.0012     -349.0026  0.00019 -2.1437
 
442
   scf:    5     -353.1796     -348.9988     -349.0001  0.33389 -2.7118
 
443
   scf:    6     -353.1796     -349.0021     -349.0033  0.33387 -2.7119
 
444
   scf:    7     -353.1796     -348.9981     -348.9993  0.33396 -2.7118
 
445
   scf:    8     -353.0936     -348.2022     -348.2034  0.31958 -2.6852
 
446
   scf:    9     -349.1089     -345.7759     -345.7770  0.19508 -2.0325
 
447
   scf:   10     -349.0130     -348.5938     -348.5951  0.12567 -2.1208
 
448
   scf:   11     -349.0067     -348.8798     -348.8812  0.11959 -2.1319
 
449
   scf:   12     -348.9999     -348.9742     -348.9756  0.00912 -2.1473
 
450
   scf:   13     -348.9998     -348.9743     -348.9757  0.00846 -2.1472
 
451
   scf:   14     -348.9993     -348.9675     -348.9689  0.00215 -2.1430
 
452
   scf:   15     -348.9993     -348.9691     -348.9705  0.00202 -2.1430
 
453
   scf:   16     -348.9993     -348.9939     -348.9952  0.00074 -2.1432
 
454
   scf:   17     -348.9993     -348.9945     -348.9958  0.00072 -2.1433
 
455
   scf:   18     -348.9993     -348.9960     -348.9974  0.00060 -2.1434
 
456
   scf:   19     -348.9993     -348.9948     -348.9962  0.00030 -2.1434
 
457
   scf:   20     -348.9993     -348.9949     -348.9963  0.00028 -2.1434
 
458
   scf:   21     -348.9993     -348.9986     -349.0000  0.00006 -2.1434
464
459
 
465
460
SCF Convergence by dMax criterion
466
 
max |DM_out - DM_in|:     0.00008954
467
 
SCF cycle converged after   28 iterations
 
461
max |DM_out - DM_in|:     0.00005665
 
462
SCF cycle converged after   21 iterations
468
463
 
469
464
Using DM_out to compute the final energy and forces
470
465
 
474
469
 
475
470
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
476
471
----------------------------------------
477
 
   Tot    0.000000   -0.000000   -0.000000
 
472
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
478
473
----------------------------------------
479
474
   Max    0.000000
480
475
   Res    0.000000    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
481
476
----------------------------------------
482
477
   Max    0.000000    constrained
483
478
 
484
 
Stress-tensor-Voigt (kbar):       31.55       31.55       31.55       -8.38       -8.38       -8.38
485
 
(Free)E + p*V (eV/cell)     -349.5763
 
479
Stress-tensor-Voigt (kbar):       31.54       31.54       31.54       -8.38       -8.38       -8.38
 
480
(Free)E + p*V (eV/cell)     -349.5762
486
481
Target enthalpy (eV/cell)     -349.0007
487
482
 
488
483
siesta: Program's energy decomposition (eV):
489
 
siesta: Ebs     =       -30.125727
 
484
siesta: Ebs     =       -30.125363
490
485
siesta: Eions   =       122.930792
491
486
siesta: Ena     =        18.410043
492
 
siesta: Ekin    =        30.736346
493
 
siesta: Enl     =        12.744037
494
 
siesta: DEna    =         2.140294
495
 
siesta: DUscf   =         0.095232
 
487
siesta: Ekin    =        30.736234
 
488
siesta: Enl     =        12.744002
 
489
siesta: DEna    =         2.140374
 
490
siesta: DUscf   =         0.095240
496
491
siesta: DUext   =         0.000000
497
 
siesta: Exc     =      -290.194484
 
492
siesta: Exc     =      -290.194422
498
493
siesta: eta*DQ  =         0.000000
499
494
siesta: Emadel  =         0.000000
500
495
siesta: Emeta   =         0.000000
501
496
siesta: Emolmec =         0.000000
502
497
siesta: Ekinion =         0.000000
503
 
siesta: Eharris =      -348.999323
504
 
siesta: Etot    =      -348.999323
505
 
siesta: FreeEng =      -349.000712
 
498
siesta: Eharris =      -348.999322
 
499
siesta: Etot    =      -348.999322
 
500
siesta: FreeEng =      -349.000710
506
501
 
507
502
siesta: Final energy (eV):
508
 
siesta:  Band Struct. =     -30.125727
509
 
siesta:       Kinetic =      30.736346
510
 
siesta:       Hartree =       1.179423
 
503
siesta:  Band Struct. =     -30.125363
 
504
siesta:       Kinetic =      30.736234
 
505
siesta:       Hartree =       1.179398
511
506
siesta:    Ext. field =       0.000000
512
 
siesta:   Exch.-corr. =    -290.194484
513
 
siesta:  Ion-electron =     -15.818242
 
507
siesta:   Exch.-corr. =    -290.194422
 
508
siesta:  Ion-electron =     -15.818165
514
509
siesta:       Ion-ion =     -74.902366
515
510
siesta:       Ekinion =       0.000000
516
 
siesta:         Total =    -348.999323
 
511
siesta:         Total =    -348.999322
517
512
 
518
513
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
519
 
siesta:     0.019690   -0.005228   -0.005229
520
 
siesta:    -0.005228    0.019690   -0.005230
521
 
siesta:    -0.005229   -0.005230    0.019689
 
514
siesta:     0.019687   -0.005228   -0.005227
 
515
siesta:    -0.005228    0.019687   -0.005228
 
516
siesta:    -0.005227   -0.005228    0.019687
522
517
 
523
518
siesta: Cell volume =         29.232542 Ang**3
524
519
 
525
520
siesta: Pressure (static):
526
521
siesta:                Solid            Molecule  Units
527
 
siesta:          -0.00021445         -0.00021445  Ry/Bohr**3
528
 
siesta:          -0.01968962         -0.01968962  eV/Ang**3
529
 
siesta:         -31.54658949        -31.54658949  kBar
530
 
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =        -348.350761
531
 
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =        -348.350761
532
 
>> End of run:   2-JUL-2017  11:58:46
 
522
siesta:          -0.00021442         -0.00021442  Ry/Bohr**3
 
523
siesta:          -0.01968721         -0.01968721  eV/Ang**3
 
524
siesta:         -31.54272751        -31.54272751  kBar
 
525
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =        -348.350760
 
526
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =        -348.350760
 
527
>> End of run:  10-JUN-2018  21:52:57
533
528
Job completed