← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/karmic/bioperl/karmic

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/ay149291.gb

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2007-09-21 22:52:22 UTC
  • mfrom: (1.2.2 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20070921225222-tt20m2yy6ycuy2d8
Tags: 1.5.2.102-1
* Developer release.
* Upgraded source package to debhelper 5 and standards-version 3.7.2.
* Added libmodule-build-perl and libtest-harness-perl to
  build-depends-indep.
* Disabled automatic CRAN download.
* Using quilt instead of .diff.gz to manage modifications.
* Updated Recommends list for the binary package.
* Moved the "production-quality" scripts to /usr/bin/.
* New maintainer: Debian-Med packaging team mailing list.
* New uploaders: Charles Plessy and Steffen Moeller.
* Updated Depends, Recommends and Suggests.
* Imported in Debian-Med's SVN repository on Alioth.
* Executing the regression tests during package building.
* Moved the Homepage: field out from the package's description.
* Updated watch file.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/ay149291.gb
 
1
LOCUS       AY149291                 357 bp    DNA     linear   PRI 25-FEB-2003
 
2
DEFINITION  Homo sapiens neanderthalsensis mitochondrial D-loop hypervariable
 
3
            region I, partial sequence.
 
4
ACCESSION   AY149291
 
5
VERSION     AY149291.1  GI:28557455
 
6
KEYWORDS    .
 
7
SOURCE      mitochondrion Homo sapiens neanderthalensis
 
8
  ORGANISM  Homo sapiens neanderthalensis
 
9
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
 
10
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
 
11
            Catarrhini; Hominidae; Homo.
 
12
REFERENCE   1  (bases 1 to 357)
 
13
  AUTHORS   Schmitz,R.W., Serre,D., Bonani,G., Feine,S., Hillgruber,F.,
 
14
            Krainitzki,H., Paabo,S. and Smith,F.H.
 
15
  TITLE     The Neandertal type site revisited: interdisciplinary
 
16
            investigations of skeletal remains from the Neander Valley, Germany
 
17
  JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (20), 13342-13347 (2002)
 
18
   PUBMED   12232049
 
19
REFERENCE   2  (bases 1 to 357)
 
20
  AUTHORS   Serre,D. and Paabo,S.
 
21
  TITLE     Direct Submission
 
22
  JOURNAL   Submitted (05-SEP-2002) Department of Evolutionary Genetics, Max
 
23
            Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Inselstrasse,
 
24
            Leipzig D-04103, Germany
 
25
FEATURES             Location/Qualifiers
 
26
     source          1..357
 
27
                     /organism="Homo sapiens neanderthalensis"
 
28
                     /organelle="mitochondrion"
 
29
                     /mol_type="genomic DNA"
 
30
                     /isolate="Neandertal 2"
 
31
                     /sub_species="neanderthalensis"
 
32
                     /db_xref="taxon:63221"
 
33
                     /country="Germany: Neandertal"
 
34
     D-loop          <1..>357
 
35
                     /note="hypervariable region I"
 
36
ORIGIN      
 
37
        1 gttctttcat gggggagcag atttgggtac cacccaagta ttgactcacc catcagcaac
 
38
       61 cgctatgtat ttcgtacatt actgccagcc accatgaata ttgtacagta ccataattac
 
39
      121 ttgactacct gcagtacata aaaacctaat ccacatcaac cccccccccc catgcttaca
 
40
      181 agcaagcaca gcaatcaacc ttcaactgtc atacatcaac tacaactcca aagacaccct
 
41
      241 tacacccact aggatatcaa caaacctacc cacccttgac agtacatagc acataaagtc
 
42
      301 atttaccgta catagcacat tacagtcaaa tcccttctcg cccccatgga tgacccc
 
43
//
 
44