← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/oneiric/mpqc/oneiric

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/bin/mpqc/validate/ref/basis1_nh3scfsto2gcs.out

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Michael Banck
  • Date: 2005-11-27 11:41:49 UTC
  • mfrom: (1.1.2 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20051127114149-zgz9r3gk50w8ww2q
Tags: 2.3.0-1
http://bugs.debian.org/339232
* New upstream release.
* debian/rules (SONAME): Activate awk snippet for automatic so-name
  detection again, resulting in a bump to `7' and making a `c2a' for
  the C++ allocator change unnecessary; closes: #339232.
* debian/patches/00list (08_gcc-4.0_fixes): Removed, no longer needed.
* debian/rules (test): Remove workarounds, do not abort build if tests
  fail.
* debian/ref: Removed.
* debian/control.in (libsc): Added Conflict against libsc6c2.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/bin/mpqc/validate/ref/basis1_nh3scfsto2gcs.out
 
1
 
 
2
                    MPQC: Massively Parallel Quantum Chemistry
 
3
                                Version 2.3.0-alpha
 
4
 
 
5
  Machine:    i686-pc-linux-gnu
 
6
  User:       cljanss@n118
 
7
  Start Time: Sun Jan  9 18:48:16 2005
 
8
 
 
9
  Using ProcMessageGrp for message passing (number of nodes = 1).
 
10
  Using PthreadThreadGrp for threading (number of threads = 1).
 
11
  Using ProcMemoryGrp for distributed shared memory.
 
12
  Total number of processors = 1
 
13
 
 
14
  Using IntegralV3 by default for molecular integrals evaluation
 
15
 
 
16
  Reading file /home/cljanss/src/SC/lib/atominfo.kv.
 
17
 
 
18
  IntCoorGen: generated 9 coordinates.
 
19
  Forming optimization coordinates:
 
20
    SymmMolecularCoor::form_variable_coordinates()
 
21
      expected 6 coordinates
 
22
      found 4 variable coordinates
 
23
      found 0 constant coordinates
 
24
  Reading file /home/cljanss/src/SC/lib/basis/sto-2g.kv.
 
25
      Reading file /home/cljanss/src/SC/lib/basis/sto-3g.kv.
 
26
 
 
27
      CLSCF::init: total charge = 0
 
28
 
 
29
      Starting from core Hamiltonian guess
 
30
 
 
31
      Using symmetric orthogonalization.
 
32
      n(basis):             6     2
 
33
      Maximum orthogonalization residual = 2.16204
 
34
      Minimum orthogonalization residual = 0.270539
 
35
      docc = [ 4 1 ]
 
36
      nbasis = 8
 
37
 
 
38
  CLSCF::init: total charge = 0
 
39
 
 
40
  Projecting guess wavefunction into the present basis set
 
41
 
 
42
      SCF::compute: energy accuracy = 1.0000000e-06
 
43
 
 
44
      integral intermediate storage = 20487 bytes
 
45
      integral cache = 31978937 bytes
 
46
      nuclear repulsion energy =   11.9274502439
 
47
 
 
48
                       802 integrals
 
49
      iter     1 energy =  -55.2019607415 delta = 5.97534e-01
 
50
                       802 integrals
 
51
      iter     2 energy =  -55.4392428450 delta = 1.84249e-01
 
52
                       802 integrals
 
53
      iter     3 energy =  -55.4516791940 delta = 4.62186e-02
 
54
                       802 integrals
 
55
      iter     4 energy =  -55.4526444791 delta = 1.64315e-02
 
56
                       802 integrals
 
57
      iter     5 energy =  -55.4526850309 delta = 3.57988e-03
 
58
                       802 integrals
 
59
      iter     6 energy =  -55.4526875619 delta = 9.97984e-04
 
60
                       802 integrals
 
61
      iter     7 energy =  -55.4526875628 delta = 1.81651e-05
 
62
 
 
63
      HOMO is     4  A' =  -0.343041
 
64
      LUMO is     5  A' =   0.628812
 
65
 
 
66
      total scf energy =  -55.4526875628
 
67
 
 
68
      Projecting the guess density.
 
69
 
 
70
        The number of electrons in the guess density = 10
 
71
        Using symmetric orthogonalization.
 
72
        n(basis):             6     2
 
73
        Maximum orthogonalization residual = 2.15416
 
74
        Minimum orthogonalization residual = 0.263731
 
75
        The number of electrons in the projected density = 9.97022
 
76
 
 
77
  docc = [ 4 1 ]
 
78
  nbasis = 8
 
79
 
 
80
  Molecular formula H3N
 
81
 
 
82
  MPQC options:
 
83
    matrixkit     = <ReplSCMatrixKit>
 
84
    filename      = basis1_nh3scfsto2gcs
 
85
    restart_file  = basis1_nh3scfsto2gcs.ckpt
 
86
    restart       = no
 
87
    checkpoint    = no
 
88
    savestate     = no
 
89
    do_energy     = yes
 
90
    do_gradient   = yes
 
91
    optimize      = no
 
92
    write_pdb     = no
 
93
    print_mole    = yes
 
94
    print_timings = yes
 
95
 
 
96
  
 
97
  SCF::compute: energy accuracy = 1.0000000e-08
 
98
 
 
99
  integral intermediate storage = 13487 bytes
 
100
  integral cache = 31985937 bytes
 
101
  nuclear repulsion energy =   11.9274502439
 
102
 
 
103
                   802 integrals
 
104
  iter     1 energy =  -53.8257252144 delta = 6.00860e-01
 
105
                   802 integrals
 
106
  iter     2 energy =  -53.8295016554 delta = 2.05186e-02
 
107
                   802 integrals
 
108
  iter     3 energy =  -53.8295703072 delta = 3.58779e-03
 
109
                   802 integrals
 
110
  iter     4 energy =  -53.8295763331 delta = 1.21928e-03
 
111
                   802 integrals
 
112
  iter     5 energy =  -53.8295771990 delta = 6.68806e-04
 
113
                   802 integrals
 
114
  iter     6 energy =  -53.8295771995 delta = 1.20820e-05
 
115
                   802 integrals
 
116
  iter     7 energy =  -53.8295771995 delta = 4.88308e-07
 
117
                   802 integrals
 
118
  iter     8 energy =  -53.8295771995 delta = 3.06781e-08
 
119
 
 
120
  HOMO is     4  A' =  -0.318850
 
121
  LUMO is     5  A' =   0.642486
 
122
 
 
123
  total scf energy =  -53.8295771995
 
124
 
 
125
  SCF::compute: gradient accuracy = 1.0000000e-06
 
126
 
 
127
  Total Gradient:
 
128
       1   N   0.0084740056  -0.0584723194  -0.0000000000
 
129
       2   H   0.0065744521   0.0183641394  -0.0151628706
 
130
       3   H   0.0065744521   0.0183641394   0.0151628706
 
131
       4   H  -0.0216229098   0.0217440406   0.0000000000
 
132
Value of the MolecularEnergy:  -53.8295771995
 
133
 
 
134
 
 
135
  Gradient of the MolecularEnergy:
 
136
      1   -0.0233847140
 
137
      2   -0.0056651521
 
138
      3   -0.0368303199
 
139
      4    0.0000223025
 
140
 
 
141
  Function Parameters:
 
142
    value_accuracy    = 2.678290e-09 (1.000000e-08) (computed)
 
143
    gradient_accuracy = 2.678290e-07 (1.000000e-06) (computed)
 
144
    hessian_accuracy  = 0.000000e+00 (1.000000e-04)
 
145
 
 
146
  Molecular Coordinates:
 
147
    IntMolecularCoor Parameters:
 
148
      update_bmat = no
 
149
      scale_bonds = 1.0000000000
 
150
      scale_bends = 1.0000000000
 
151
      scale_tors = 1.0000000000
 
152
      scale_outs = 1.0000000000
 
153
      symmetry_tolerance = 1.000000e-05
 
154
      simple_tolerance = 1.000000e-03
 
155
      coordinate_tolerance = 1.000000e-07
 
156
      have_fixed_values = 0
 
157
      max_update_steps = 100
 
158
      max_update_disp = 0.500000
 
159
      have_fixed_values = 0
 
160
 
 
161
    Molecular formula: H3N
 
162
    molecule<Molecule>: (
 
163
      symmetry = cs
 
164
      unit = "angstrom"
 
165
      {  n atoms                        geometry                     }={
 
166
         1     N [    0.0000000000     0.2523658570     0.0000000000]
 
167
         2     H [   -0.4861505130    -0.0841219570     0.8247168660]
 
168
         3     H [   -0.4861505130    -0.0841219570    -0.8247168660]
 
169
         4     H [    0.9523010250    -0.0841219570     0.0000000000]
 
170
      }
 
171
    )
 
172
    Atomic Masses:
 
173
       14.00307    1.00783    1.00783    1.00783
 
174
 
 
175
    Bonds:
 
176
      STRE       s1     1.01475    1    2         N-H
 
177
      STRE       s2     1.01475    1    3         N-H
 
178
      STRE       s3     1.01000    1    4         N-H
 
179
    Bends:
 
180
      BEND       b1   108.72635    2    1    3      H-N-H
 
181
      BEND       b2   109.95245    2    1    4      H-N-H
 
182
      BEND       b3   109.95245    3    1    4      H-N-H
 
183
    Out of Plane:
 
184
      OUT        o1    54.75160    2    1    3    4   H-N-H-H
 
185
      OUT        o2   -54.75160    3    1    2    4   H-N-H-H
 
186
      OUT        o3    54.14939    4    1    2    3   H-N-H-H
 
187
 
 
188
    SymmMolecularCoor Parameters:
 
189
      change_coordinates = no
 
190
      transform_hessian = yes
 
191
      max_kappa2 = 10.000000
 
192
 
 
193
  GaussianBasisSet:
 
194
    nbasis = 8
 
195
    nshell = 5
 
196
    nprim  = 10
 
197
    name = "STO-2G"
 
198
  Natural Population Analysis:
 
199
     n   atom    charge     ne(S)     ne(P) 
 
200
      1    N   -0.358666  3.412219  3.946447
 
201
      2    H    0.119136  0.880864
 
202
      3    H    0.119136  0.880864
 
203
      4    H    0.120394  0.879606
 
204
 
 
205
  SCF Parameters:
 
206
    maxiter = 40
 
207
    density_reset_frequency = 10
 
208
    level_shift = 0.000000
 
209
 
 
210
  CLSCF Parameters:
 
211
    charge = 0.0000000000
 
212
    ndocc = 5
 
213
    docc = [ 4 1 ]
 
214
 
 
215
  The following keywords in "basis1_nh3scfsto2gcs.in" were ignored:
 
216
    mpqc:mole:guess_wavefunction:multiplicity
 
217
    mpqc:mole:multiplicity
 
218
 
 
219
                               CPU Wall
 
220
mpqc:                         0.10 0.11
 
221
  NAO:                        0.00 0.00
 
222
  calc:                       0.03 0.02
 
223
    compute gradient:         0.01 0.01
 
224
      nuc rep:                0.00 0.00
 
225
      one electron gradient:  0.00 0.00
 
226
      overlap gradient:       0.00 0.00
 
227
      two electron gradient:  0.01 0.00
 
228
        contribution:         0.00 0.00
 
229
          start thread:       0.00 0.00
 
230
          stop thread:        0.00 0.00
 
231
        setup:                0.01 0.00
 
232
    vector:                   0.02 0.02
 
233
      density:                0.00 0.00
 
234
      evals:                  0.00 0.00
 
235
      extrap:                 0.01 0.00
 
236
      fock:                   0.00 0.01
 
237
        accum:                0.00 0.00
 
238
        ao_gmat:              0.00 0.00
 
239
          start thread:       0.00 0.00
 
240
          stop thread:        0.00 0.00
 
241
        init pmax:            0.00 0.00
 
242
        local data:           0.00 0.00
 
243
        setup:                0.00 0.00
 
244
        sum:                  0.00 0.00
 
245
        symm:                 0.00 0.00
 
246
  input:                      0.07 0.08
 
247
    vector:                   0.02 0.02
 
248
      density:                0.00 0.00
 
249
      evals:                  0.00 0.00
 
250
      extrap:                 0.00 0.00
 
251
      fock:                   0.02 0.01
 
252
        accum:                0.00 0.00
 
253
        ao_gmat:              0.02 0.00
 
254
          start thread:       0.02 0.00
 
255
          stop thread:        0.00 0.00
 
256
        init pmax:            0.00 0.00
 
257
        local data:           0.00 0.00
 
258
        setup:                0.00 0.00
 
259
        sum:                  0.00 0.00
 
260
        symm:                 0.00 0.00
 
261
 
 
262
  End Time: Sun Jan  9 18:48:16 2005
 
263