← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/oneiric/mpqc/oneiric

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/bin/mpqc/validate/ref/uscf_h2oub3lypsto3gc2v.out

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Michael Banck
  • Date: 2005-11-27 11:41:49 UTC
  • mfrom: (1.1.2 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20051127114149-zgz9r3gk50w8ww2q
Tags: 2.3.0-1
http://bugs.debian.org/339232
* New upstream release.
* debian/rules (SONAME): Activate awk snippet for automatic so-name
  detection again, resulting in a bump to `7' and making a `c2a' for
  the C++ allocator change unnecessary; closes: #339232.
* debian/patches/00list (08_gcc-4.0_fixes): Removed, no longer needed.
* debian/rules (test): Remove workarounds, do not abort build if tests
  fail.
* debian/ref: Removed.
* debian/control.in (libsc): Added Conflict against libsc6c2.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/bin/mpqc/validate/ref/uscf_h2oub3lypsto3gc2v.out
 
1
 
 
2
                    MPQC: Massively Parallel Quantum Chemistry
 
3
                             Version 2.1.0-alpha-gcc3
 
4
 
 
5
  Machine:    i686-pc-linux-gnu
 
6
  User:       cljanss@aros.ca.sandia.gov
 
7
  Start Time: Sun Apr  7 06:27:11 2002
 
8
 
 
9
  Using ProcMessageGrp for message passing (number of nodes = 1).
 
10
  Using PthreadThreadGrp for threading (number of threads = 2).
 
11
  Using ProcMemoryGrp for distributed shared memory.
 
12
  Total number of processors = 2
 
13
  Reading file /usr/local/mpqc/2.1.0-alpha-gcc3/share/atominfo.kv.
 
14
 
 
15
  IntCoorGen: generated 3 coordinates.
 
16
  Forming optimization coordinates:
 
17
    SymmMolecularCoor::form_variable_coordinates()
 
18
      expected 3 coordinates
 
19
      found 2 variable coordinates
 
20
      found 0 constant coordinates
 
21
  Reading file /usr/local/mpqc/2.1.0-alpha-gcc3/share/basis/sto-3g.kv.
 
22
      Reading file /usr/local/mpqc/2.1.0-alpha-gcc3/share/basis/sto-3g.kv.
 
23
 
 
24
      USCF::init: total charge = 0
 
25
 
 
26
      Starting from core Hamiltonian guess
 
27
 
 
28
      Using symmetric orthogonalization.
 
29
      n(SO):             4     0     2     1
 
30
      Maximum orthogonalization residual = 1.9104
 
31
      Minimum orthogonalization residual = 0.344888
 
32
      alpha = [ 3 0 1 1 ]
 
33
      beta  = [ 3 0 1 1 ]
 
34
 
 
35
  USCF::init: total charge = 0
 
36
 
 
37
  Using guess wavefunction as starting vector
 
38
 
 
39
      SCF::compute: energy accuracy = 1.0000000e-06
 
40
 
 
41
      nuclear repulsion energy =    9.1571164588
 
42
 
 
43
      iter     1 energy =  -74.6468200575 delta = 7.47315e-01
 
44
      iter     2 energy =  -74.9176265779 delta = 1.87087e-01
 
45
      iter     3 energy =  -74.9557846376 delta = 8.27062e-02
 
46
      iter     4 energy =  -74.9602947172 delta = 3.46353e-02
 
47
      iter     5 energy =  -74.9606660586 delta = 1.05354e-02
 
48
      iter     6 energy =  -74.9607011362 delta = 3.50014e-03
 
49
      iter     7 energy =  -74.9607024386 delta = 6.78915e-04
 
50
      iter     8 energy =  -74.9607024810 delta = 1.19965e-04
 
51
      iter     9 energy =  -74.9607024826 delta = 2.31818e-05
 
52
      iter    10 energy =  -74.9607024827 delta = 4.51906e-06
 
53
 
 
54
      <S^2>exact = 0.000000
 
55
      <S^2>      = 0.000000
 
56
 
 
57
      total scf energy =  -74.9607024827
 
58
 
 
59
  Using symmetric orthogonalization.
 
60
  n(SO):             4     0     2     1
 
61
  Maximum orthogonalization residual = 1.9104
 
62
  Minimum orthogonalization residual = 0.344888
 
63
  alpha = [ 3 0 1 1 ]
 
64
  beta  = [ 3 0 1 1 ]
 
65
 
 
66
  Molecular formula H2O
 
67
 
 
68
  MPQC options:
 
69
    matrixkit     = <ReplSCMatrixKit>
 
70
    filename      = uscf_h2oub3lypsto3gc2v
 
71
    restart_file  = uscf_h2oub3lypsto3gc2v.ckpt
 
72
    restart       = no
 
73
    checkpoint    = no
 
74
    savestate     = no
 
75
    do_energy     = yes
 
76
    do_gradient   = yes
 
77
    optimize      = no
 
78
    write_pdb     = no
 
79
    print_mole    = yes
 
80
    print_timings = yes
 
81
 
 
82
  SCF::compute: energy accuracy = 1.0000000e-08
 
83
 
 
84
  Initializing ShellExtent
 
85
    nshell = 4
 
86
    ncell = 26912
 
87
    ave nsh/cell = 1.20363
 
88
    max nsh/cell = 4
 
89
  nuclear repulsion energy =    9.1571164588
 
90
 
 
91
  Total integration points = 4049
 
92
  Integrated electron density error = 0.000133056311
 
93
  iter     1 energy =  -75.3096746058 delta = 7.73012e-01
 
94
  Total integration points = 11317
 
95
  Integrated electron density error = 0.000020388731
 
96
  iter     2 energy =  -75.3099932435 delta = 8.09075e-03
 
97
  Total integration points = 11317
 
98
  Integrated electron density error = 0.000020326367
 
99
  iter     3 energy =  -75.3100167763 delta = 2.67251e-03
 
100
  Total integration points = 11317
 
101
  Integrated electron density error = 0.000020306057
 
102
  iter     4 energy =  -75.3100199147 delta = 1.03884e-03
 
103
  Total integration points = 24639
 
104
  Integrated electron density error = -0.000000617474
 
105
  iter     5 energy =  -75.3100131250 delta = 3.17214e-04
 
106
  Total integration points = 46071
 
107
  Integrated electron density error = 0.000001554376
 
108
  iter     6 energy =  -75.3100149005 delta = 9.62645e-05
 
109
  Total integration points = 46071
 
110
  Integrated electron density error = 0.000001554250
 
111
  iter     7 energy =  -75.3100149025 delta = 2.57875e-05
 
112
  Total integration points = 46071
 
113
  Integrated electron density error = 0.000001554229
 
114
  iter     8 energy =  -75.3100149027 delta = 7.10471e-06
 
115
  Total integration points = 46071
 
116
  Integrated electron density error = 0.000001554226
 
117
  iter     9 energy =  -75.3100149027 delta = 2.49637e-06
 
118
  Total integration points = 46071
 
119
  Integrated electron density error = 0.000001554225
 
120
  iter    10 energy =  -75.3100149027 delta = 9.79768e-07
 
121
  Total integration points = 46071
 
122
  Integrated electron density error = 0.000001554223
 
123
  iter    11 energy =  -75.3100149027 delta = 2.92122e-07
 
124
  Total integration points = 46071
 
125
  Integrated electron density error = 0.000001554223
 
126
  iter    12 energy =  -75.3100149027 delta = 8.81509e-08
 
127
  Total integration points = 46071
 
128
  Integrated electron density error = 0.000001554223
 
129
  iter    13 energy =  -75.3100149027 delta = 2.68702e-08
 
130
 
 
131
  <S^2>exact = 0.000000
 
132
  <S^2>      = 0.000000
 
133
 
 
134
  total scf energy =  -75.3100149027
 
135
 
 
136
  SCF::compute: gradient accuracy = 1.0000000e-06
 
137
 
 
138
  Initializing ShellExtent
 
139
    nshell = 4
 
140
    ncell = 26912
 
141
    ave nsh/cell = 1.20363
 
142
    max nsh/cell = 4
 
143
  Total integration points = 46071
 
144
  Integrated electron density error = 0.000001554378
 
145
  Total Gradient:
 
146
       1   O  -0.0000000000  -0.0000000000  -0.1148740087
 
147
       2   H  -0.0376621749   0.0000000000   0.0574370043
 
148
       3   H   0.0376621749   0.0000000000   0.0574370043
 
149
 
 
150
  Value of the MolecularEnergy:  -75.3100149027
 
151
 
 
152
 
 
153
  Gradient of the MolecularEnergy:
 
154
      1    0.0984958964
 
155
      2   -0.0234804049
 
156
 
 
157
  Unrestricted Kohn-Sham (UKS) Parameters:
 
158
    Function Parameters:
 
159
      value_accuracy    = 8.220945e-09 (1.000000e-08) (computed)
 
160
      gradient_accuracy = 8.220945e-07 (1.000000e-06) (computed)
 
161
      hessian_accuracy  = 0.000000e+00 (1.000000e-04)
 
162
 
 
163
    Molecular Coordinates:
 
164
      IntMolecularCoor Parameters:
 
165
        update_bmat = no
 
166
        scale_bonds = 1.0000000000
 
167
        scale_bends = 1.0000000000
 
168
        scale_tors = 1.0000000000
 
169
        scale_outs = 1.0000000000
 
170
        symmetry_tolerance = 1.000000e-05
 
171
        simple_tolerance = 1.000000e-03
 
172
        coordinate_tolerance = 1.000000e-07
 
173
        have_fixed_values = 0
 
174
        max_update_steps = 100
 
175
        max_update_disp = 0.500000
 
176
        have_fixed_values = 0
 
177
 
 
178
      Molecular formula: H2O
 
179
      molecule<Molecule>: (
 
180
        symmetry = c2v
 
181
        unit = "angstrom"
 
182
        {  n atoms                        geometry                     }={
 
183
           1     O [    0.0000000000     0.0000000000     0.3693729440]
 
184
           2     H [    0.7839758990     0.0000000000    -0.1846864720]
 
185
           3     H [   -0.7839758990    -0.0000000000    -0.1846864720]
 
186
        }
 
187
      )
 
188
      Atomic Masses:
 
189
         15.99491    1.00783    1.00783
 
190
 
 
191
      Bonds:
 
192
        STRE       s1     0.96000    1    2         O-H
 
193
        STRE       s2     0.96000    1    3         O-H
 
194
      Bends:
 
195
        BEND       b1   109.50000    2    1    3      H-O-H
 
196
 
 
197
      SymmMolecularCoor Parameters:
 
198
        change_coordinates = no
 
199
        transform_hessian = yes
 
200
        max_kappa2 = 10.000000
 
201
 
 
202
    GaussianBasisSet:
 
203
      nbasis = 7
 
204
      nshell = 4
 
205
      nprim  = 12
 
206
      name = "STO-3G"
 
207
    Natural Population Analysis:
 
208
       n   atom    charge     ne(S)     ne(P) 
 
209
        1    O   -0.403101  3.748038  4.655064
 
210
        2    H    0.201551  0.798449
 
211
        3    H    0.201551  0.798449
 
212
 
 
213
    SCF Parameters:
 
214
      maxiter = 100
 
215
      density_reset_frequency = 10
 
216
      level_shift = 0.250000
 
217
 
 
218
    UnrestrictedSCF Parameters:
 
219
      charge = 0.0000000000
 
220
      nalpha = 5
 
221
      nbeta = 5
 
222
      alpha = [ 3 0 1 1 ]
 
223
      beta  = [ 3 0 1 1 ]
 
224
 
 
225
    Functional:
 
226
      Standard Density Functional: B3LYP
 
227
      Sum of Functionals:
 
228
        +0.8000000000000000
 
229
          Object of type SlaterXFunctional
 
230
        +0.7200000000000000
 
231
          Object of type Becke88XFunctional
 
232
        +0.1900000000000000
 
233
          Object of type VWN1LCFunctional
 
234
        +0.8100000000000001
 
235
          Object of type LYPCFunctional
 
236
    Integrator:
 
237
      RadialAngularIntegrator:
 
238
        Pruned fine grid employed
 
239
                               CPU Wall
 
240
mpqc:                         7.39 9.18
 
241
  NAO:                        0.00 0.01
 
242
  calc:                       7.14 8.94
 
243
    compute gradient:         1.57 1.86
 
244
      nuc rep:                0.00 0.00
 
245
      one electron gradient:  0.01 0.01
 
246
      overlap gradient:       0.00 0.00
 
247
      two electron gradient:  1.56 1.85
 
248
        grad:                 1.56 1.85
 
249
          integrate:          1.41 1.69
 
250
          two-body:           0.02 0.03
 
251
    vector:                   5.57 7.08
 
252
      density:                0.01 0.01
 
253
      evals:                  0.02 0.01
 
254
      extrap:                 0.01 0.02
 
255
      fock:                   5.39 6.89
 
256
        integrate:            5.26 6.76
 
257
        start thread:         0.01 0.00
 
258
        stop thread:          0.00 0.00
 
259
  input:                      0.24 0.24
 
260
    vector:                   0.09 0.09
 
261
      density:                0.00 0.01
 
262
      evals:                  0.01 0.01
 
263
      extrap:                 0.01 0.02
 
264
      fock:                   0.07 0.06
 
265
        start thread:         0.00 0.00
 
266
        stop thread:          0.00 0.00
 
267
 
 
268
  End Time: Sun Apr  7 06:27:20 2002
 
269