← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/quantal/genometools/quantal-backports

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/man/gt-splitfasta.1

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Sascha Steinbiss
  • Date: 2012-07-09 14:10:23 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20120709141023-7nomj0v4le7izeju
Tags: 1.4.1-1
http://bugs.debian.org/657923
* Initial release (Closes: #657923)
* the GFF3 parser now handles children which are defined before their parents
* many small improvements to the GFF3 parser

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
debian/man/gt-splitfasta.1
 
1
'\" t
 
2
.\"     Title: gt-splitfasta
 
3
.\"    Author: [see the "AUTHOR" section]
 
4
.\" Generator: DocBook XSL Stylesheets v1.76.1 <http://docbook.sf.net/>
 
5
.\"      Date: 07/11/2012
 
6
.\"    Manual: \ \&
 
7
.\"    Source: \ \&
 
8
.\"  Language: English
 
9
.\"
 
10
.TH "GT\-SPLITFASTA" "1" "07/11/2012" "\ \&" "\ \&"
 
11
.\" -----------------------------------------------------------------
 
12
.\" * Define some portability stuff
 
13
.\" -----------------------------------------------------------------
 
14
.\" ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
15
.\" http://bugs.debian.org/507673
 
16
.\" http://lists.gnu.org/archive/html/groff/2009-02/msg00013.html
 
17
.\" ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
18
.ie \n(.g .ds Aq \(aq
 
19
.el       .ds Aq '
 
20
.\" -----------------------------------------------------------------
 
21
.\" * set default formatting
 
22
.\" -----------------------------------------------------------------
 
23
.\" disable hyphenation
 
24
.nh
 
25
.\" disable justification (adjust text to left margin only)
 
26
.ad l
 
27
.\" -----------------------------------------------------------------
 
28
.\" * MAIN CONTENT STARTS HERE *
 
29
.\" -----------------------------------------------------------------
 
30
.SH "NAME"
 
31
gt-splitfasta \- Split the supplied fasta file\&.
 
32
.SH "SYNOPSIS"
 
33
.sp
 
34
gt splitfasta [option \&...] fastafile
 
35
.SH "OPTIONS"
 
36
.PP
 
37
\fB\-numfiles\fR
 
38
.RS 4
 
39
set the number of target files (default: 0)
 
40
.RE
 
41
.PP
 
42
\fB\-targetsize\fR
 
43
.RS 4
 
44
set the target file size in MB (default: 50)
 
45
.RE
 
46
.PP
 
47
\fB\-splitdesc\fR
 
48
.RS 4
 
49
put every fasta entry in a separate file named by its description in the given directory (default: undefined)
 
50
.RE
 
51
.PP
 
52
\fB\-width\fR
 
53
.RS 4
 
54
set output width for FASTA sequence printing (0 disables formatting) (default: 0)
 
55
.RE
 
56
.PP
 
57
\fB\-force\fR
 
58
.RS 4
 
59
force writing to output file (default: no)
 
60
.RE
 
61
.PP
 
62
\fB\-help\fR
 
63
.RS 4
 
64
display help and exit
 
65
.RE
 
66
.PP
 
67
\fB\-version\fR
 
68
.RS 4
 
69
display version information and exit
 
70
.RE
 
71
.SH "AUTHOR"
 
72
.sp
 
73
Report bugs to <gt\-users@genometools\&.org>\&.