~ubuntu-branches/ubuntu/saucy/paml/saucy

« back to all changes in this revision

Viewing changes to README.txt

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Pjotr Prins
  • Date: 2010-09-11 23:01:37 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20100911230137-jjf5d0blx5p0m9ba
Tags: upstream-4.4c
ImportĀ upstreamĀ versionĀ 4.4c

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
README.txt for PAML
 
2
 
 
3
PAML (for Phylogentic Analysis by Maximum Likelihood) contains a few
 
4
programs for model fitting and phylogenetic tree reconstruction using
 
5
nucleotide or amino-acid sequence data.  ANSI C source codes as well
 
6
as Win32 and MC OSX excutables are distributed.  Win32 executables are 
 
7
in the folder bin.  Type, say, 
 
8
        bin\codeml
 
9
to run the codeml program.  For UNIX and OS-X systems, go to the src/ 
 
10
folder to compile the programs: "cd src" and then "make".
 
11
 
 
12
The documentation is in doc/pamlDOC.pdf.  The program web page is the 
 
13
following, where the archive can be downloaded:
 
14
 
 
15
        http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html
 
16
 
 
17
PAML is distributed free of charge for academic use only.
 
18
 
 
19
Ziheng Yang
 
20
Department of Biology                   Phone: (+44) (0)20 7679 4379
 
21
University College London               Fax:   (+44) (0)20 7679 7096
 
22
Darwin Building                         Email: z.yang @ ucl.ac.uk
 
23
Gower Street
 
24
London WC1E 6BT
 
25
England