← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/wily/openms/wily

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/libopenms.3

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Filippo Rusconi
  • Date: 2012-11-12 15:58:12 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20121112155812-e6mvctvil4ko9npv
Tags: 1.9.0-1
http://bugs.debian.org/691129
1.9.0 First Debian package release (Closes: #691129).

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
debian/libopenms.3
 
1
.TH "LIBOPENMS" "3" "October 2012"
 
2
 
 
3
.SH "NAME"
 
4
libopenms \- library for LC/MS data management and analysis
 
5
 
 
6
.SH "DESCRIPTION"
 
7
This manual page documents briefly the \fBlibopenms\fR package that
 
8
brings a library for LC/MS data management and analysis. OpenMS offers
 
9
an infrastructure for the development of mass spectrometry-related
 
10
software and powerful 2D and 3D visualization solutions. OpenMS offers
 
11
analyses for various quantitation protocols, including label-free
 
12
quantitation, SILAC, iTRAQ, SRM, SWATH… It provides build-in
 
13
algorithms for de-novo identification and database search, as well as
 
14
adapters to other state-of-the art tools like X!Tandem, Mascot, OMSSA…
 
15
OpenMS supports the Proteomics Standard Initiative (PSI) formats for
 
16
MS data and supports easy integration of tools into workflow engines
 
17
like Knime, Galaxy, WS-Pgrade, and TOPPAS via the TOPPtools concept
 
18
and a unified parameter handling.
 
19
 
 
20
.SH "BIBLIOGRAPHICAL REFERENCE TO BE CITED"
 
21
Marc Sturm, Andreas Bertsch, Clemens Gröpl, Andreas Hildebrandt, Rene
 
22
Hussong, Eva Lange, Nico Pfeifer, Ole Schulz-Trieglaff, Alexandra
 
23
Zerck, Knut Reinert, and Oliver Kohlbacher (2008)  OpenMS – an
 
24
Open-Source Software Framework for Mass Spectrometry. \fI BMC
 
25
Bioinformatics\fP, 9:163. doi:10.1186/1471-2105-9-163.
 
26
 
 
27
.SH "SEE ALSO" 
 
28
.BR topp (1),
 
29
.BR openms-common (7),
 
30
.BR openms (7),
 
31
.BR openms\-doc (7).
 
32
.PP 
 
33
The program is documented fully in the \fITutorials\fP,
 
34
that are packaged in openms\-doc.
 
35
 
 
36
.SH "AUTHOR" 
 
37
This manual page was written by Filippo Rusconi
 
38
<\&lopippo@debian.org\&>. Permission is granted to copy,
 
39
distribute and/or modify this document under the terms of the GNU
 
40
General Public License, Version 3, published by the Free Software
 
41
Foundation.
 
42
.PP 
 
43
 On a Debian system the complete text of the GNU General Public
 
44
License version 3 can be found in the file
 
45
`\fI\%/usr/share/common-licenses/GPL\-3\fP'.