~nickpapior/siesta/tddft-work

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Tests/Reference/sih_fire.out

  • Committer: Rafi Ullah
  • Date: 2017-08-30 14:09:10 UTC
  • mfrom: (611.1.19 trunk)
  • Revision ID: rraffiu@gmail.com-20170830140910-bhu0osuh4d59wn8e
Merged with trunk-630

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
10
10
reinit: -----------------------------------------------------------------------
11
11
reinit: System Label: sih_fire
12
12
reinit: -----------------------------------------------------------------------
13
 
Siesta Version: trunk-554
14
 
Architecture  : x86_64-linux-gcc
15
 
Compiler flags: mpif90 -m64 -fPIC -O3 -ftree-vectorize -fexpensive-optimizations -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fgraphite -fipa-icf -fipa-pure-const -march=native -fschedule-fusion -fselective-scheduling  -fipa-sra -fipa-cp -fno-second-underscore -I/opt/zlib/1.2.8/gnu-6.1.0/include -I/opt/hdf5/1.8.16/gnu-6.1.0/include -I/opt/pnetcdf/1.7.0/gnu-6.1.0/include -I/opt/netcdf/4.4.0/gnu-6.1.0/include -I/opt/openmpi/1.10.2/gnu-6.1.0/include -I/opt/mumps/5.0.1/gnu-6.1.0/include
16
 
PP flags      : -DSIESTA__FLOOK -DSIESTA__METIS -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DCDF -DGRID_DP -DMPI_TIMING -DTRANSIESTA_TIMING -DTBTRANS_TIMING -DSIESTA__MUMPS -DNCDF_PARALLEL -DNCDF -DNCDF_4 -DSCALAPACK_DEBUG
17
 
Libraries     : -lzmumps -lmumps_common -lpord -lparmetis -lmetis -L/opt/scalapack/204/gnu-6.1.0/lib -Wl,-rpath=/opt/scalapack/204/gnu-6.1.0/lib -lscalapack  -L/opt/openblas/0.2.17/gnu-6.1.0/lib -Wl,-rpath=/opt/openblas/0.2.17/gnu-6.1.0/lib -lopenblas -L/home/nicpa/phd/esl/flook -lflookall -ldl -lnetcdff -lnetcdf -lpnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -m64 -fPIC -O3 -ftree-vectorize -fexpensive-optimizations -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fgraphite -fipa-icf -fipa-pure-const -march=native -fschedule-fusion -fselective-scheduling  -fipa-sra -fipa-cp -fno-second-underscore -I/opt/zlib/1.2.8/gnu-6.1.0/include -I/opt/hdf5/1.8.16/gnu-6.1.0/include -I/opt/pnetcdf/1.7.0/gnu-6.1.0/include -I/opt/netcdf/4.4.0/gnu-6.1.0/include -I/opt/openmpi/1.10.2/gnu-6.1.0/include -I/opt/mumps/5.0.1/gnu-6.1.0/include
 
13
Siesta Version: siesta-4.1--731
 
14
Architecture  : x86_64-linux-n-62-18-14
 
15
Compiler flags: mpifort -m64 -fPIC -O3 -march=native -ftree-vectorize -fexpensive-optimizatioons -funroll-loops -fprefetch-loop-arrays -fno-second-underscore  -flto -fuse-linker-plugin
 
16
PP flags      : -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/build-tools/1.0/include -I/zdatta/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/gmp/6.1.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/mpfr/3.1.4/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/mpc/1.0.3/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/isl/0.16.1/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/gcc/6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/generic/numactl/2.0.11/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/zlib/1.2.8/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/libxml2/2.9.4/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/hwloc/1.11.4/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/openmpi/2.0.1/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/hdf5/1.8.17/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/pnetcdf/1.7.0/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/netcdf/4.4.1/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/flook/0.7.0/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/parmetis/4.0.3/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/scalapack/204/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/openblas/0.2.19/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/mumps/5.0.2/gnu-6.2.0/include -I/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/fftw/3.3.5/gnu-6.2.0/include -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DCDF -DCDF4 -DSIESTA__METIS -DSIESTA__MUMPS -DTS_NOCHECKS -DNCDF -DNCDF_4 -DNCDF_PARALLEL -DSIESTA__FLOOK
 
17
Libraries     : -lnetcdff -lnetcdf -lpnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz  -lzmumps -lmumps_common -llpord -lparmetis -lmetis -lscalapack -lopenblas  -lmetis -flto -fuse-linker-plugin  -L/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/flook/0.7.0/gnu-6.2.0/lib -Wl,-rpath=/zdata/groups/common/nicpa/2016-oct/XeonE5-2665/flook/0.7.0/gnu-6.2.0/lib -lflookall -ldl
18
18
PARALLEL version
19
19
NetCDF support
20
20
NetCDF-4 support
21
21
NetCDF-4 MPI-IO support
22
22
METIS ordering support
23
23
 
24
 
* Running on 4 nodes in parallel
25
 
>> Start of run:  18-AUG-2016   9:10:46
 
24
* Running on 8 nodes in parallel
 
25
>> Start of run:   2-JUL-2017  12:00:55
26
26
 
27
27
initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ----------
28
28
Species number:   1 Atomic number:   14 Label: Si
348
348
redata: Recompute H after scf cycle                 =   F
349
349
redata: Mix DM in first SCF step                    =   T
350
350
redata: Write Pulay info on disk                    =   F
351
 
redata: Discard 1st Pulay DM after kick             =   F
352
351
redata: New DM Mixing Weight                        =     0.3000
353
352
redata: New DM Occupancy tolerance                  = 0.000000000001
354
353
redata: No kicks to SCF
356
355
redata: Require Harris convergence for SCF          =   F
357
356
redata: Harris energy tolerance for SCF             =     0.000100 eV
358
357
redata: Require DM convergence for SCF              =   T
359
 
redata: DM tolerance for SCF                        =     0.001000
 
358
redata: DM tolerance for SCF                        =     0.0010
 
359
redata: Require EDM convergence for SCF             =   F
 
360
redata: EDM tolerance for SCF                       =     0.001000 eV
360
361
redata: Require H convergence for SCF               =   T
361
362
redata: Hamiltonian tolerance for SCF               =     0.001000 eV
362
363
redata: Require (free) Energy convergence for SCF   =   F
380
381
mix.SCF:    Linear mixing weight                 =     0.300000
381
382
mix.SCF:    Mixing weight                        =     0.300000
382
383
mix.SCF:    SVD condition                        = 0.1000E-07
383
 
redata: Save data in SIESTA.nc                      =   F
 
384
redata: Save all siesta data in one NC              =   F
384
385
redata: ***********************************************************************
385
386
 
386
387
%block SCF.Mixers
387
 
  Pulay                   
 
388
  Pulay
388
389
%endblock SCF.Mixers
389
390
 
390
391
%block SCF.Mixer.Pulay
396
397
  weight 0.3000
397
398
  weight.linear 0.3000
398
399
  history 3
399
 
  restart 0
400
 
  restart.save 1
401
 
 
402
 
  # Continuation options
403
400
%endblock SCF.Mixer.Pulay
404
401
 
405
402
DM_history_depth set to zero for 'Harris' run
410
407
* ProcessorY, Blocksize:    2  24
411
408
 
412
409
 
413
 
* Orbital distribution balance (max,min):    72    48
 
410
* Orbital distribution balance (max,min):    48    24
414
411
 
415
412
 Kpoints in:            1 . Kpoints trimmed:            1
416
413
 
436
433
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
437
434
<dSpData1D:S at geom step 1
438
435
  <sparsity:sparsity for geom step 1
439
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 7>
440
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8368, refcount: 1>
 
436
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 7>
 
437
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5584, refcount: 1>
441
438
refcount: 1>
442
 
New_DM. Step:     1
 
439
new_DM -- step:     1
443
440
Initializing Density Matrix...
444
 
DM after filling with atomic data:
445
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
441
DM filled with atomic data:
 
442
<dSpData2D:DM initialized from atoms
446
443
  <sparsity:sparsity for geom step 1
447
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 8>
448
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8368 m=1, refcount: 1>
 
444
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 8>
 
445
  <dData2D:DM n=5584 m=1, refcount: 1>
449
446
refcount: 1>
 
447
 
 
448
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
450
449
New grid distribution:   1
451
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
452
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
453
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
454
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
450
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
451
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
452
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
453
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
454
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
455
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
456
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
457
           8       1:   24   13:   24   19:   24
455
458
 
456
459
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
457
460
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
458
461
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
459
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
462
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
460
463
New grid distribution:   2
461
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
462
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
463
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
464
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
464
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
465
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
466
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
467
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
468
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
469
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
470
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
471
           8       1:   12   13:   24    1:   12
465
472
New grid distribution:   3
466
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
467
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
468
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
469
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
473
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
474
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
475
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
476
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
477
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
478
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
479
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
480
           8       1:   12   13:   24    1:   12
470
481
Setting up quadratic distribution...
471
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
472
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
473
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65244
474
 
rdiag-debug: Node=0, lwork=     39595>= lworkq=     39595, liwork=      1833>= liworkq=      1817
475
 
rdiag-debug: Node=1, lwork=     34937>= lworkq=     34937, liwork=      1833>= liworkq=      1817
476
 
rdiag-debug: Node=2, lwork=     34937>= lworkq=     34937, liwork=      1833>= liworkq=      1817
477
 
rdiag-debug: Node=3, lwork=     30857>= lworkq=     30857, liwork=      1833>= liworkq=      1817
 
482
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
483
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
484
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32731
478
485
 
479
486
stepf: Fermi-Dirac step function
480
487
 
481
488
siesta: Program's energy decomposition (eV):
482
 
siesta: Ebs     =     -1990.109940
 
489
siesta: Ebs     =     -1990.109942
483
490
siesta: Eions   =     12205.375272
484
491
siesta: Ena     =      3582.441728
485
492
siesta: Ekin    =      2865.981919
489
496
siesta: DEna    =        -0.000036
490
497
siesta: DUscf   =         0.000000
491
498
siesta: DUext   =         0.000000
492
 
siesta: Exc     =     -2114.517639
 
499
siesta: Exc     =     -2114.517630
493
500
siesta: eta*DQ  =         0.000000
494
501
siesta: Emadel  =         0.000000
495
502
siesta: Emeta   =         0.000000
496
503
siesta: Emolmec =         0.000000
497
504
siesta: Ekinion =         0.000000
498
 
siesta: Eharris =     -6826.425189
499
 
siesta: Etot    =     -6722.605308
500
 
siesta: FreeEng =     -6722.663515
501
 
 
502
 
siesta: Eharris(eV) =   -6826.425189
503
 
 
504
 
 
505
 
siesta: Eharris(eV) =   -6826.425189
506
 
 
507
 
timer: Routine,Calls,Time,% =    IterSCF     1       0.156  21.55
 
505
siesta: Eharris =     -6826.425202
 
506
siesta: Etot    =     -6722.605299
 
507
siesta: FreeEng =     -6722.663506
 
508
 
 
509
siesta: Eharris(eV) =   -6826.425202
 
510
 
 
511
 
 
512
siesta: Eharris(eV) =   -6826.425202
 
513
 
 
514
timer: Routine,Calls,Time,% = IterSCF        1       0.059  16.86
 
515
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
516
Geom step, scf iteration, dmax:   1  1    0.904056
508
517
 
509
518
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
519
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
510
520
 
511
521
siesta: E_KS - E_eggbox =     -6823.9186
512
522
 
513
523
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
514
524
----------------------------------------
515
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
525
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
516
526
----------------------------------------
517
 
   Max    9.204391
 
527
   Max    9.204390
518
528
   Res    1.616532    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
519
529
----------------------------------------
520
 
   Max    9.204391    constrained
 
530
   Max    9.204390    constrained
521
531
 
522
532
Stress-tensor-Voigt (kbar):      -50.72      -50.72      -50.72      -14.06      -14.06      -14.06
523
533
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6783.4329
528
538
        -0.008777   -0.031655   -0.008777
529
539
        -0.008777   -0.008777   -0.031655
530
540
 
531
 
siesta: Pressure (static):         50.71670963  kBar
 
541
siesta: Pressure (static):         50.71668068  kBar
532
542
 
533
543
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
534
544
        -0.031655   -0.008777   -0.008777
535
545
        -0.008777   -0.031655   -0.008777
536
546
        -0.008777   -0.008777   -0.031655
537
547
 
538
 
siesta: Pressure (total):         50.71670963  kBar
 
548
siesta: Pressure (total):         50.71668068  kBar
539
549
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
540
550
FIRE:      1    2.5000   0    0.1000      0.0000
541
551
 
555
565
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
556
566
<dSpData1D:S at geom step 2
557
567
  <sparsity:sparsity for geom step 2
558
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 7>
559
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8368, refcount: 1>
 
568
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 7>
 
569
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5584, refcount: 1>
560
570
refcount: 1>
561
 
New_DM. Step:     2
 
571
new_DM -- step:     2
562
572
Initializing Density Matrix...
563
 
DM after filling with atomic data:
564
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
573
DM filled with atomic data:
 
574
<dSpData2D:DM initialized from atoms
565
575
  <sparsity:sparsity for geom step 2
566
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 8>
567
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8368 m=1, refcount: 1>
 
576
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 8>
 
577
  <dData2D:DM n=5584 m=1, refcount: 1>
568
578
refcount: 1>
 
579
 
 
580
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
569
581
New grid distribution:   1
570
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
571
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
572
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
573
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
582
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
583
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
584
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
585
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
586
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
587
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
588
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
589
           8       1:   24   13:   24   19:   24
574
590
 
575
591
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
576
592
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
577
593
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
578
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
594
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
579
595
New grid distribution:   2
580
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
581
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
582
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
583
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
596
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
597
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
598
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
599
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
600
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
601
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
602
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
603
           8       1:   12   13:   24    1:   12
584
604
New grid distribution:   3
585
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
586
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
587
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
588
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
605
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
606
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
607
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
608
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
609
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
610
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
611
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
612
           8       1:   12   13:   24    1:   12
589
613
Setting up quadratic distribution...
590
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
591
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
592
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
593
 
 
594
 
siesta: Eharris(eV) =   -6828.956471
595
 
 
596
 
 
597
 
siesta: Eharris(eV) =   -6828.956471
598
 
 
 
614
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
615
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
616
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32691
 
617
 
 
618
siesta: Eharris(eV) =   -6828.956470
 
619
 
 
620
 
 
621
siesta: Eharris(eV) =   -6828.956470
 
622
 
 
623
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
624
Geom step, scf iteration, dmax:   2  1    0.865591
599
625
 
600
626
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
627
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
601
628
 
602
629
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
603
630
----------------------------------------
604
 
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
 
631
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
605
632
----------------------------------------
606
633
   Max    6.004315
607
634
   Res    1.054359    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
617
644
        -0.006514   -0.031542   -0.006514
618
645
        -0.006514   -0.006514   -0.031542
619
646
 
620
 
siesta: Pressure (static):         50.53622685  kBar
 
647
siesta: Pressure (static):         50.53622576  kBar
621
648
 
622
649
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
623
650
        -0.031542   -0.006514   -0.006514
624
651
        -0.006514   -0.031542   -0.006514
625
652
        -0.006514   -0.006514   -0.031542
626
653
 
627
 
siesta: Pressure (total):         50.53622685  kBar
 
654
siesta: Pressure (total):         50.53622576  kBar
628
655
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
629
656
FIRE:      2    2.5000   1    0.1000      0.0422
630
657
 
644
671
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
645
672
<dSpData1D:S at geom step 3
646
673
  <sparsity:sparsity for geom step 3
647
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 7>
648
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8368, refcount: 1>
 
674
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 7>
 
675
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5584, refcount: 1>
649
676
refcount: 1>
650
 
New_DM. Step:     3
 
677
new_DM -- step:     3
651
678
Initializing Density Matrix...
652
 
DM after filling with atomic data:
653
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
679
DM filled with atomic data:
 
680
<dSpData2D:DM initialized from atoms
654
681
  <sparsity:sparsity for geom step 3
655
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1267 nnzs=8368, refcount: 8>
656
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8368 m=1, refcount: 1>
 
682
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 8>
 
683
  <dData2D:DM n=5584 m=1, refcount: 1>
657
684
refcount: 1>
 
685
 
 
686
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
658
687
New grid distribution:   1
659
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
660
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
661
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
662
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
688
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
689
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
690
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
691
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
692
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
693
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
694
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
695
           8       1:   24   13:   24   19:   24
663
696
 
664
697
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
665
698
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
666
699
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
667
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
700
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
668
701
New grid distribution:   2
669
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
670
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
671
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
672
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
702
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
703
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
704
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
705
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
706
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
707
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
708
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
709
           8       1:   12   13:   24    1:   12
673
710
New grid distribution:   3
674
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
675
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
676
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
677
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
711
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
712
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
713
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
714
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
715
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
716
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
717
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
718
           8       1:   12   13:   24    1:   12
678
719
Setting up quadratic distribution...
679
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
680
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
681
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65296
682
 
 
683
 
siesta: Eharris(eV) =   -6829.957756
684
 
 
685
 
 
686
 
siesta: Eharris(eV) =   -6829.957756
687
 
 
 
720
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
721
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
722
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32663
 
723
 
 
724
siesta: Eharris(eV) =   -6829.957756
 
725
 
 
726
 
 
727
siesta: Eharris(eV) =   -6829.957756
 
728
 
 
729
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
730
Geom step, scf iteration, dmax:   3  1    0.867993
688
731
 
689
732
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
733
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      21
690
734
 
691
735
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
692
736
----------------------------------------
693
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
737
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
694
738
----------------------------------------
695
739
   Max    4.526075
696
740
   Res    0.795926    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
706
750
        -0.005330   -0.031323   -0.005330
707
751
        -0.005330   -0.005330   -0.031323
708
752
 
709
 
siesta: Pressure (static):         50.18596309  kBar
 
753
siesta: Pressure (static):         50.18596467  kBar
710
754
 
711
755
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
712
756
        -0.031592   -0.005599   -0.005599
713
757
        -0.005599   -0.031592   -0.005599
714
758
        -0.005599   -0.005599   -0.031592
715
759
 
716
 
siesta: Pressure (total):         50.61671309  kBar
 
760
siesta: Pressure (total):         50.61671465  kBar
717
761
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
718
762
FIRE:      3    2.5000   2    0.1000      0.0714
719
763
 
733
777
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
734
778
<dSpData1D:S at geom step 4
735
779
  <sparsity:sparsity for geom step 4
736
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1272 nnzs=8400, refcount: 7>
737
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8400, refcount: 1>
 
780
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 7>
 
781
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5584, refcount: 1>
738
782
refcount: 1>
739
 
New_DM. Step:     4
 
783
new_DM -- step:     4
740
784
Initializing Density Matrix...
741
 
DM after filling with atomic data:
742
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
785
DM filled with atomic data:
 
786
<dSpData2D:DM initialized from atoms
743
787
  <sparsity:sparsity for geom step 4
744
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1272 nnzs=8400, refcount: 8>
745
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8400 m=1, refcount: 1>
 
788
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0845 nnzs=5584, refcount: 8>
 
789
  <dData2D:DM n=5584 m=1, refcount: 1>
746
790
refcount: 1>
 
791
 
 
792
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
747
793
New grid distribution:   1
748
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
749
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
750
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
751
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
794
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
795
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
796
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
797
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
798
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
799
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
800
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
801
           8       1:   24   13:   24   19:   24
752
802
 
753
803
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
754
804
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
755
805
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
756
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
806
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
757
807
New grid distribution:   2
758
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
759
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
760
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
761
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
808
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
809
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
810
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
811
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
812
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
813
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
814
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
815
           8       1:   12   13:   24    1:   12
762
816
New grid distribution:   3
763
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
764
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
765
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
766
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
817
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
818
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
819
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
820
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
821
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
822
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
823
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
824
           8       1:   12   13:   24    1:   12
767
825
Setting up quadratic distribution...
768
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
769
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
770
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65340
771
 
 
772
 
siesta: Eharris(eV) =   -6830.950066
773
 
 
774
 
 
775
 
siesta: Eharris(eV) =   -6830.950066
776
 
 
 
826
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
827
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
828
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32635
 
829
 
 
830
siesta: Eharris(eV) =   -6830.950067
 
831
 
 
832
 
 
833
siesta: Eharris(eV) =   -6830.950067
 
834
 
 
835
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
836
Geom step, scf iteration, dmax:   4  1    0.875226
777
837
 
778
838
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
839
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
779
840
 
780
841
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
781
842
----------------------------------------
782
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
843
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
783
844
----------------------------------------
784
845
   Max    2.832778
785
 
   Res    0.506289    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
 
846
   Res    0.506290    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
786
847
----------------------------------------
787
848
   Max    2.832778    constrained
788
849
 
795
856
        -0.003780   -0.030883   -0.003780
796
857
        -0.003780   -0.003780   -0.030883
797
858
 
798
 
siesta: Pressure (static):         49.48109687  kBar
 
859
siesta: Pressure (static):         49.48110211  kBar
799
860
 
800
861
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
801
862
        -0.031653   -0.004548   -0.004548
802
863
        -0.004548   -0.031653   -0.004548
803
864
        -0.004548   -0.004548   -0.031653
804
865
 
805
 
siesta: Pressure (total):         50.71442513  kBar
 
866
siesta: Pressure (total):         50.71443036  kBar
806
867
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
807
868
FIRE:      4    2.5000   3    0.1000      0.0918
808
869
 
822
883
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
823
884
<dSpData1D:S at geom step 5
824
885
  <sparsity:sparsity for geom step 5
825
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
826
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
886
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
887
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
827
888
refcount: 1>
828
 
New_DM. Step:     5
 
889
new_DM -- step:     5
829
890
Initializing Density Matrix...
830
 
DM after filling with atomic data:
831
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
891
DM filled with atomic data:
 
892
<dSpData2D:DM initialized from atoms
832
893
  <sparsity:sparsity for geom step 5
833
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
834
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
894
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
895
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
835
896
refcount: 1>
 
897
 
 
898
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
836
899
New grid distribution:   1
837
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
838
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
839
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
840
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
900
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
901
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
902
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
903
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
904
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
905
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
906
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
907
           8       1:   24   13:   24   19:   24
841
908
 
842
909
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
843
910
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
844
911
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
845
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
912
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
846
913
New grid distribution:   2
847
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
848
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
849
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
850
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
914
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
915
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
916
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
917
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
918
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
919
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
920
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
921
           8       1:   12   13:   24    1:   12
851
922
New grid distribution:   3
852
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
853
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
854
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
855
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
923
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
924
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
925
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
926
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
927
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
928
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
929
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
930
           8       1:   12   13:   24    1:   12
856
931
Setting up quadratic distribution...
857
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
858
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
859
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65276
860
 
 
861
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.617900
862
 
 
863
 
 
864
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.617900
865
 
 
 
932
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
933
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
934
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32555
 
935
 
 
936
siesta: Eharris(eV) =   -6831.617899
 
937
 
 
938
 
 
939
siesta: Eharris(eV) =   -6831.617899
 
940
 
 
941
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
942
Geom step, scf iteration, dmax:   5  1    0.885098
866
943
 
867
944
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
945
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
868
946
 
869
947
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
870
948
----------------------------------------
871
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
949
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
872
950
----------------------------------------
873
951
   Max    1.311439
874
952
   Res    0.269818    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
884
962
        -0.002180   -0.030646   -0.002180
885
963
        -0.002180   -0.002180   -0.030646
886
964
 
887
 
siesta: Pressure (static):         49.10052015  kBar
 
965
siesta: Pressure (static):         49.10052029  kBar
888
966
 
889
967
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
890
968
        -0.031917   -0.003446   -0.003446
891
969
        -0.003446   -0.031917   -0.003446
892
970
        -0.003446   -0.003446   -0.031917
893
971
 
894
 
siesta: Pressure (total):         51.13718254  kBar
 
972
siesta: Pressure (total):         51.13718269  kBar
895
973
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
896
974
FIRE:      5    2.5000   4    0.1000      0.1034
897
975
 
911
989
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
912
990
<dSpData1D:S at geom step 6
913
991
  <sparsity:sparsity for geom step 6
914
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
915
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
992
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
993
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
916
994
refcount: 1>
917
 
New_DM. Step:     6
 
995
new_DM -- step:     6
918
996
Initializing Density Matrix...
919
 
DM after filling with atomic data:
920
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
997
DM filled with atomic data:
 
998
<dSpData2D:DM initialized from atoms
921
999
  <sparsity:sparsity for geom step 6
922
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
923
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1000
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1001
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
924
1002
refcount: 1>
 
1003
 
 
1004
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
925
1005
New grid distribution:   1
926
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
927
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
928
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
929
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1006
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1007
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1008
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1009
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1010
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1011
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1012
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1013
           8       1:   24   13:   24   19:   24
930
1014
 
931
1015
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
932
1016
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
933
1017
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
934
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1018
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
935
1019
New grid distribution:   2
936
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
937
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
938
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
939
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1020
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1021
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1022
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1023
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1024
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1025
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1026
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1027
           8       1:   12   13:   24    1:   12
940
1028
New grid distribution:   3
941
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
942
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
943
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
944
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1029
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1030
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1031
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1032
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1033
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1034
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1035
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1036
           8       1:   12   13:   24    1:   12
945
1037
Setting up quadratic distribution...
946
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
947
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
948
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65324
949
 
 
950
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.908662
951
 
 
952
 
 
953
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.908662
954
 
 
 
1038
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1039
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1040
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32471
 
1041
 
 
1042
siesta: Eharris(eV) =   -6831.908661
 
1043
 
 
1044
 
 
1045
siesta: Eharris(eV) =   -6831.908661
 
1046
 
 
1047
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1048
Geom step, scf iteration, dmax:   6  1    0.886189
955
1049
 
956
1050
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1051
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
957
1052
 
958
1053
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
959
1054
----------------------------------------
960
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
1055
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
961
1056
----------------------------------------
962
1057
   Max    0.570688
963
1058
   Res    0.171253    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
973
1068
        -0.000928   -0.030614   -0.000928
974
1069
        -0.000928   -0.000928   -0.030614
975
1070
 
976
 
siesta: Pressure (static):         49.04910163  kBar
 
1071
siesta: Pressure (static):         49.04909939  kBar
977
1072
 
978
1073
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
979
1074
        -0.032198   -0.002483   -0.002483
980
1075
        -0.002483   -0.032198   -0.002483
981
1076
        -0.002483   -0.002483   -0.032198
982
1077
 
983
 
siesta: Pressure (total):         51.58765875  kBar
 
1078
siesta: Pressure (total):         51.58765654  kBar
984
1079
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
985
1080
FIRE:      6    2.5000   5    0.1000      0.1072
986
1081
 
1000
1095
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1001
1096
<dSpData1D:S at geom step 7
1002
1097
  <sparsity:sparsity for geom step 7
1003
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1004
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1098
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1099
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1005
1100
refcount: 1>
1006
 
New_DM. Step:     7
 
1101
new_DM -- step:     7
1007
1102
Initializing Density Matrix...
1008
 
DM after filling with atomic data:
1009
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1103
DM filled with atomic data:
 
1104
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1010
1105
  <sparsity:sparsity for geom step 7
1011
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1012
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1106
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1107
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1013
1108
refcount: 1>
 
1109
 
 
1110
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1014
1111
New grid distribution:   1
1015
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1016
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1017
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1018
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1112
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1113
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1114
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1115
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1116
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1117
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1118
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1119
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1019
1120
 
1020
1121
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1021
1122
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1022
1123
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1023
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1124
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1024
1125
New grid distribution:   2
1025
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1026
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1027
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1028
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1126
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1127
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1128
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1129
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1130
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1131
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1132
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1133
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1029
1134
New grid distribution:   3
1030
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1031
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1032
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1033
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1135
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1136
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1137
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1138
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1139
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1140
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1141
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1142
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1034
1143
Setting up quadratic distribution...
1035
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1036
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1037
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65344
1038
 
 
1039
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.933219
1040
 
 
1041
 
 
1042
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.933219
1043
 
 
 
1144
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1145
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1146
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
1147
 
 
1148
siesta: Eharris(eV) =   -6831.933218
 
1149
 
 
1150
 
 
1151
siesta: Eharris(eV) =   -6831.933218
 
1152
 
 
1153
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1154
Geom step, scf iteration, dmax:   7  1    0.873773
1044
1155
 
1045
1156
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1157
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1046
1158
 
1047
1159
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1048
1160
----------------------------------------
1049
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
1161
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
1050
1162
----------------------------------------
1051
1163
   Max    0.506810
1052
1164
   Res    0.175920    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1062
1174
        -0.000404   -0.030604   -0.000404
1063
1175
        -0.000404   -0.000404   -0.030604
1064
1176
 
1065
 
siesta: Pressure (static):         49.03288665  kBar
 
1177
siesta: Pressure (static):         49.03288713  kBar
1066
1178
 
1067
1179
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1068
1180
        -0.032140   -0.001815   -0.001815
1069
1181
        -0.001815   -0.032140   -0.001815
1070
1182
        -0.001815   -0.001815   -0.032140
1071
1183
 
1072
 
siesta: Pressure (total):         51.49406096  kBar
 
1184
siesta: Pressure (total):         51.49406150  kBar
1073
1185
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1074
1186
FIRE:      7    1.2500   0    0.1000      0.0000
1075
1187
 
1089
1201
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1090
1202
<dSpData1D:S at geom step 8
1091
1203
  <sparsity:sparsity for geom step 8
1092
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1093
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1204
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1205
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1094
1206
refcount: 1>
1095
 
New_DM. Step:     8
 
1207
new_DM -- step:     8
1096
1208
Initializing Density Matrix...
1097
 
DM after filling with atomic data:
1098
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1209
DM filled with atomic data:
 
1210
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1099
1211
  <sparsity:sparsity for geom step 8
1100
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1101
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1212
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1213
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1102
1214
refcount: 1>
 
1215
 
 
1216
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1103
1217
New grid distribution:   1
1104
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1105
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1106
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1107
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1218
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1219
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1220
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1221
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1222
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1223
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1224
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1225
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1108
1226
 
1109
1227
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1110
1228
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1111
1229
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1112
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1230
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1113
1231
New grid distribution:   2
1114
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1115
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1116
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1117
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1232
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1233
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1234
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1235
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1236
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1237
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1238
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1239
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1118
1240
New grid distribution:   3
1119
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1120
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1121
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1122
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1241
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1242
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1243
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1244
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1245
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1246
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1247
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1248
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1123
1249
Setting up quadratic distribution...
1124
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1125
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1126
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65344
1127
 
 
1128
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.942130
1129
 
 
1130
 
 
1131
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.942130
1132
 
 
 
1250
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1251
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1252
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
1253
 
 
1254
siesta: Eharris(eV) =   -6831.942130
 
1255
 
 
1256
 
 
1257
siesta: Eharris(eV) =   -6831.942130
 
1258
 
 
1259
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1260
Geom step, scf iteration, dmax:   8  1    0.872744
1133
1261
 
1134
1262
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1263
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1135
1264
 
1136
1265
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1137
1266
----------------------------------------
1138
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
1267
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1139
1268
----------------------------------------
1140
1269
   Max    0.493405
1141
1270
   Res    0.171222    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1151
1280
        -0.000447   -0.030597   -0.000447
1152
1281
        -0.000447   -0.000447   -0.030597
1153
1282
 
1154
 
siesta: Pressure (static):         49.02226462  kBar
 
1283
siesta: Pressure (static):         49.02226445  kBar
1155
1284
 
1156
1285
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1157
1286
        -0.030597   -0.000447   -0.000447
1158
1287
        -0.000447   -0.030597   -0.000447
1159
1288
        -0.000447   -0.000447   -0.030597
1160
1289
 
1161
 
siesta: Pressure (total):         49.02226462  kBar
 
1290
siesta: Pressure (total):         49.02226445  kBar
1162
1291
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1163
1292
FIRE:      8    1.2500   1    0.1000      0.0027
1164
1293
 
1178
1307
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1179
1308
<dSpData1D:S at geom step 9
1180
1309
  <sparsity:sparsity for geom step 9
1181
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1182
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1310
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1311
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1183
1312
refcount: 1>
1184
 
New_DM. Step:     9
 
1313
new_DM -- step:     9
1185
1314
Initializing Density Matrix...
1186
 
DM after filling with atomic data:
1187
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1315
DM filled with atomic data:
 
1316
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1188
1317
  <sparsity:sparsity for geom step 9
1189
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1190
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1318
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1319
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1191
1320
refcount: 1>
 
1321
 
 
1322
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1192
1323
New grid distribution:   1
1193
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1194
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1195
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1196
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1324
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1325
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1326
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1327
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1328
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1329
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1330
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1331
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1197
1332
 
1198
1333
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1199
1334
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1200
1335
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1201
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1336
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1202
1337
New grid distribution:   2
1203
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1204
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1205
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1206
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1338
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1339
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1340
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1341
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1342
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1343
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1344
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1345
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1207
1346
New grid distribution:   3
1208
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1209
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1210
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1211
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1347
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1348
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1349
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1350
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1351
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1352
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1353
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1354
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1212
1355
Setting up quadratic distribution...
1213
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1214
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1215
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65344
1216
 
 
1217
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.948527
1218
 
 
1219
 
 
1220
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.948527
1221
 
 
 
1356
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1357
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1358
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
1359
 
 
1360
siesta: Eharris(eV) =   -6831.948527
 
1361
 
 
1362
 
 
1363
siesta: Eharris(eV) =   -6831.948527
 
1364
 
 
1365
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1366
Geom step, scf iteration, dmax:   9  1    0.872656
1222
1367
 
1223
1368
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1369
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1224
1370
 
1225
1371
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1226
1372
----------------------------------------
1227
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
1373
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1228
1374
----------------------------------------
1229
1375
   Max    0.478950
1230
1376
   Res    0.167371    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1240
1386
        -0.000489   -0.030605   -0.000489
1241
1387
        -0.000489   -0.000489   -0.030605
1242
1388
 
1243
 
siesta: Pressure (static):         49.03491838  kBar
 
1389
siesta: Pressure (static):         49.03491705  kBar
1244
1390
 
1245
1391
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1246
1392
        -0.030606   -0.000489   -0.000489
1247
1393
        -0.000489   -0.030606   -0.000489
1248
1394
        -0.000489   -0.000489   -0.030606
1249
1395
 
1250
 
siesta: Pressure (total):         49.03673830  kBar
 
1396
siesta: Pressure (total):         49.03673697  kBar
1251
1397
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1252
1398
FIRE:      9    1.2500   2    0.1000      0.0054
1253
1399
 
1267
1413
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1268
1414
<dSpData1D:S at geom step 10
1269
1415
  <sparsity:sparsity for geom step 10
1270
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1271
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1416
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1417
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1272
1418
refcount: 1>
1273
 
New_DM. Step:    10
 
1419
new_DM -- step:    10
1274
1420
Initializing Density Matrix...
1275
 
DM after filling with atomic data:
1276
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1421
DM filled with atomic data:
 
1422
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1277
1423
  <sparsity:sparsity for geom step 10
1278
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1279
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1424
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1425
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1280
1426
refcount: 1>
 
1427
 
 
1428
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1281
1429
New grid distribution:   1
1282
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1283
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1284
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1285
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1430
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1431
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1432
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1433
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1434
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1435
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1436
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1437
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1286
1438
 
1287
1439
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1288
1440
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1289
1441
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1290
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1442
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1291
1443
New grid distribution:   2
1292
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1293
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1294
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1295
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1444
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1445
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1446
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1447
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1448
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1449
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1450
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1451
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1296
1452
New grid distribution:   3
1297
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1298
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1299
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1300
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1453
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1454
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1455
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1456
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1457
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1458
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1459
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1460
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1301
1461
Setting up quadratic distribution...
1302
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1303
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1304
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65344
1305
 
 
1306
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.958756
1307
 
 
1308
 
 
1309
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.958756
1310
 
 
 
1462
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1463
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1464
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
1465
 
 
1466
siesta: Eharris(eV) =   -6831.958755
 
1467
 
 
1468
 
 
1469
siesta: Eharris(eV) =   -6831.958755
 
1470
 
 
1471
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1472
Geom step, scf iteration, dmax:  10  1    0.872508
1311
1473
 
1312
1474
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1475
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1313
1476
 
1314
1477
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1315
1478
----------------------------------------
1316
 
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
 
1479
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1317
1480
----------------------------------------
1318
1481
   Max    0.462505
1319
1482
   Res    0.161034    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1329
1492
        -0.000616   -0.030679   -0.000616
1330
1493
        -0.000616   -0.000616   -0.030679
1331
1494
 
1332
 
siesta: Pressure (static):         49.15304471  kBar
 
1495
siesta: Pressure (static):         49.15304342  kBar
1333
1496
 
1334
1497
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1335
1498
        -0.030683   -0.000616   -0.000616
1336
1499
        -0.000616   -0.030683   -0.000616
1337
1500
        -0.000616   -0.000616   -0.030683
1338
1501
 
1339
 
siesta: Pressure (total):         49.16014604  kBar
 
1502
siesta: Pressure (total):         49.16014475  kBar
1340
1503
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1341
1504
FIRE:     10    1.2500   3    0.1000      0.0080
1342
1505
 
1356
1519
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1357
1520
<dSpData1D:S at geom step 11
1358
1521
  <sparsity:sparsity for geom step 11
1359
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1360
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1522
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1523
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1361
1524
refcount: 1>
1362
 
New_DM. Step:    11
 
1525
new_DM -- step:    11
1363
1526
Initializing Density Matrix...
1364
 
DM after filling with atomic data:
1365
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1527
DM filled with atomic data:
 
1528
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1366
1529
  <sparsity:sparsity for geom step 11
1367
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1368
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1530
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1531
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1369
1532
refcount: 1>
 
1533
 
 
1534
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1370
1535
New grid distribution:   1
1371
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1372
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1373
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1374
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1536
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1537
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1538
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1539
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1540
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1541
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1542
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1543
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1375
1544
 
1376
1545
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1377
1546
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1378
1547
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1379
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1548
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1380
1549
New grid distribution:   2
1381
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1382
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1383
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1384
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1550
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1551
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1552
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1553
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1554
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1555
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1556
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1557
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1385
1558
New grid distribution:   3
1386
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1387
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1388
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1389
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1559
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1560
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1561
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1562
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1563
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1564
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1565
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1566
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1390
1567
Setting up quadratic distribution...
1391
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1392
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1393
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65344
1394
 
 
1395
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.972083
1396
 
 
1397
 
 
1398
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.972083
1399
 
 
 
1568
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1569
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1570
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
1571
 
 
1572
siesta: Eharris(eV) =   -6831.972084
 
1573
 
 
1574
 
 
1575
siesta: Eharris(eV) =   -6831.972084
 
1576
 
 
1577
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1578
Geom step, scf iteration, dmax:  11  1    0.872301
1400
1579
 
1401
1580
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1581
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1402
1582
 
1403
1583
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1404
1584
----------------------------------------
1405
 
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
 
1585
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
1406
1586
----------------------------------------
1407
1587
   Max    0.436203
1408
1588
   Res    0.148851    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1418
1598
        -0.000684   -0.030620   -0.000684
1419
1599
        -0.000684   -0.000684   -0.030620
1420
1600
 
1421
 
siesta: Pressure (static):         49.05841655  kBar
 
1601
siesta: Pressure (static):         49.05841690  kBar
1422
1602
 
1423
1603
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1424
1604
        -0.030629   -0.000685   -0.000685
1425
1605
        -0.000685   -0.030629   -0.000685
1426
1606
        -0.000685   -0.000685   -0.030629
1427
1607
 
1428
 
siesta: Pressure (total):         49.07394711  kBar
 
1608
siesta: Pressure (total):         49.07394746  kBar
1429
1609
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1430
1610
FIRE:     11    1.2500   4    0.1000      0.0105
1431
1611
 
1445
1625
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1446
1626
<dSpData1D:S at geom step 12
1447
1627
  <sparsity:sparsity for geom step 12
1448
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1449
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1628
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1629
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1450
1630
refcount: 1>
1451
 
New_DM. Step:    12
 
1631
new_DM -- step:    12
1452
1632
Initializing Density Matrix...
1453
 
DM after filling with atomic data:
1454
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1633
DM filled with atomic data:
 
1634
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1455
1635
  <sparsity:sparsity for geom step 12
1456
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1457
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1636
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1637
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1458
1638
refcount: 1>
 
1639
 
 
1640
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1459
1641
New grid distribution:   1
1460
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1461
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1462
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1463
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1642
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1643
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1644
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1645
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1646
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1647
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1648
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1649
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1464
1650
 
1465
1651
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1466
1652
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1467
1653
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1468
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1654
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1469
1655
New grid distribution:   2
1470
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1471
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1472
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1473
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1656
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1657
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1658
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1659
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1660
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1661
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1662
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1663
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1474
1664
New grid distribution:   3
1475
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1476
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1477
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1478
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1665
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1666
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1667
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1668
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1669
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1670
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1671
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1672
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1479
1673
Setting up quadratic distribution...
1480
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1481
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1482
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65352
1483
 
 
1484
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.987540
1485
 
 
1486
 
 
1487
 
siesta: Eharris(eV) =   -6831.987540
1488
 
 
 
1674
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1675
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1676
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32459
 
1677
 
 
1678
siesta: Eharris(eV) =   -6831.987540
 
1679
 
 
1680
 
 
1681
siesta: Eharris(eV) =   -6831.987540
 
1682
 
 
1683
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1684
Geom step, scf iteration, dmax:  12  1    0.872031
1489
1685
 
1490
1686
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1687
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1491
1688
 
1492
1689
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1493
1690
----------------------------------------
1494
 
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
 
1691
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1495
1692
----------------------------------------
1496
1693
   Max    0.400658
1497
1694
   Res    0.138629    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1507
1704
        -0.000762   -0.030557   -0.000762
1508
1705
        -0.000762   -0.000762   -0.030557
1509
1706
 
1510
 
siesta: Pressure (static):         48.95865288  kBar
 
1707
siesta: Pressure (static):         48.95865270  kBar
1511
1708
 
1512
1709
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1513
1710
        -0.030574   -0.000763   -0.000763
1514
1711
        -0.000763   -0.030574   -0.000763
1515
1712
        -0.000763   -0.000763   -0.030574
1516
1713
 
1517
 
siesta: Pressure (total):         48.98511756  kBar
 
1714
siesta: Pressure (total):         48.98511738  kBar
1518
1715
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1519
1716
FIRE:     12    1.2500   5    0.1000      0.0127
1520
1717
 
1534
1731
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1535
1732
<dSpData1D:S at geom step 13
1536
1733
  <sparsity:sparsity for geom step 13
1537
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1538
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1734
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1735
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1539
1736
refcount: 1>
1540
 
New_DM. Step:    13
 
1737
new_DM -- step:    13
1541
1738
Initializing Density Matrix...
1542
 
DM after filling with atomic data:
1543
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1739
DM filled with atomic data:
 
1740
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1544
1741
  <sparsity:sparsity for geom step 13
1545
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1546
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1742
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1743
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1547
1744
refcount: 1>
 
1745
 
 
1746
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1548
1747
New grid distribution:   1
1549
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1550
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1551
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1552
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1748
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1749
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1750
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1751
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1752
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1753
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1754
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1755
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1553
1756
 
1554
1757
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1555
1758
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1556
1759
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1557
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1760
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1558
1761
New grid distribution:   2
1559
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1560
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1561
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1562
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1762
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1763
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1764
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1765
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1766
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1767
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1768
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1769
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1563
1770
New grid distribution:   3
1564
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1565
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1566
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1567
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1771
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1772
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1773
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1774
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1775
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1776
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1777
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1778
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1568
1779
Setting up quadratic distribution...
1569
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1570
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1571
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65340
1572
 
 
1573
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.004384
1574
 
 
1575
 
 
1576
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.004384
1577
 
 
 
1780
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1781
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1782
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32459
 
1783
 
 
1784
siesta: Eharris(eV) =   -6832.004384
 
1785
 
 
1786
 
 
1787
siesta: Eharris(eV) =   -6832.004384
 
1788
 
 
1789
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1790
Geom step, scf iteration, dmax:  13  1    0.871700
1578
1791
 
1579
1792
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1793
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1580
1794
 
1581
1795
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1582
1796
----------------------------------------
1583
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
1797
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
1584
1798
----------------------------------------
1585
1799
   Max    0.364911
1586
 
   Res    0.126785    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
 
1800
   Res    0.126786    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1587
1801
----------------------------------------
1588
1802
   Max    0.364911    constrained
1589
1803
 
1596
1810
        -0.000852   -0.030607   -0.000852
1597
1811
        -0.000852   -0.000852   -0.030607
1598
1812
 
1599
 
siesta: Pressure (static):         49.03780499  kBar
 
1813
siesta: Pressure (static):         49.03780580  kBar
1600
1814
 
1601
1815
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1602
1816
        -0.030631   -0.000854   -0.000854
1603
1817
        -0.000854   -0.030631   -0.000854
1604
1818
        -0.000854   -0.000854   -0.030631
1605
1819
 
1606
 
siesta: Pressure (total):         49.07698896  kBar
 
1820
siesta: Pressure (total):         49.07698976  kBar
1607
1821
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1608
1822
FIRE:     13    1.2500   6    0.1000      0.0148
1609
1823
 
1623
1837
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1624
1838
<dSpData1D:S at geom step 14
1625
1839
  <sparsity:sparsity for geom step 14
1626
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1627
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1840
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1841
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1628
1842
refcount: 1>
1629
 
New_DM. Step:    14
 
1843
new_DM -- step:    14
1630
1844
Initializing Density Matrix...
1631
 
DM after filling with atomic data:
1632
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1845
DM filled with atomic data:
 
1846
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1633
1847
  <sparsity:sparsity for geom step 14
1634
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1635
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1848
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1849
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1636
1850
refcount: 1>
 
1851
 
 
1852
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1637
1853
New grid distribution:   1
1638
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1639
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1640
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1641
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1854
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1855
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1856
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1857
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1858
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1859
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1860
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1861
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1642
1862
 
1643
1863
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1644
1864
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1645
1865
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1646
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1866
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1647
1867
New grid distribution:   2
1648
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1649
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1650
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1651
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1868
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1869
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1870
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1871
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1872
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1873
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1874
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1875
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1652
1876
New grid distribution:   3
1653
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1654
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1655
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1656
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1877
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1878
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1879
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1880
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1881
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1882
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1883
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1884
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1657
1885
Setting up quadratic distribution...
1658
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1659
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1660
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65340
1661
 
 
1662
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.021926
1663
 
 
1664
 
 
1665
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.021926
1666
 
 
 
1886
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1887
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1888
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32475
 
1889
 
 
1890
siesta: Eharris(eV) =   -6832.021925
 
1891
 
 
1892
 
 
1893
siesta: Eharris(eV) =   -6832.021925
 
1894
 
 
1895
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
1896
Geom step, scf iteration, dmax:  14  1    0.871301
1667
1897
 
1668
1898
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
1899
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1669
1900
 
1670
1901
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1671
1902
----------------------------------------
1672
 
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
 
1903
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1673
1904
----------------------------------------
1674
1905
   Max    0.327533
1675
1906
   Res    0.114561    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1685
1916
        -0.000953   -0.030611   -0.000953
1686
1917
        -0.000953   -0.000953   -0.030611
1687
1918
 
1688
 
siesta: Pressure (static):         49.04503502  kBar
 
1919
siesta: Pressure (static):         49.04503436  kBar
1689
1920
 
1690
1921
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1691
1922
        -0.030644   -0.000957   -0.000957
1692
1923
        -0.000957   -0.030644   -0.000957
1693
1924
        -0.000957   -0.000957   -0.030644
1694
1925
 
1695
 
siesta: Pressure (total):         49.09812247  kBar
 
1926
siesta: Pressure (total):         49.09812181  kBar
1696
1927
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1697
1928
FIRE:     14    1.3750   7    0.0990      0.0167
1698
1929
 
1712
1943
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1713
1944
<dSpData1D:S at geom step 15
1714
1945
  <sparsity:sparsity for geom step 15
1715
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1716
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
1946
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
1947
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1717
1948
refcount: 1>
1718
 
New_DM. Step:    15
 
1949
new_DM -- step:    15
1719
1950
Initializing Density Matrix...
1720
 
DM after filling with atomic data:
1721
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
1951
DM filled with atomic data:
 
1952
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1722
1953
  <sparsity:sparsity for geom step 15
1723
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1724
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
1954
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
1955
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1725
1956
refcount: 1>
 
1957
 
 
1958
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1726
1959
New grid distribution:   1
1727
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1728
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1729
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1730
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1960
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
1961
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
1962
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
1963
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
1964
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
1965
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
1966
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
1967
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1731
1968
 
1732
1969
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1733
1970
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1734
1971
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1735
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
1972
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1736
1973
New grid distribution:   2
1737
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1738
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1739
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1740
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1974
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1975
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1976
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1977
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1978
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1979
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1980
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1981
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1741
1982
New grid distribution:   3
1742
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1743
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1744
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1745
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
1983
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
1984
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
1985
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
1986
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
1987
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
1988
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
1989
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
1990
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1746
1991
Setting up quadratic distribution...
1747
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1748
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1749
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65300
1750
 
 
1751
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.040807
1752
 
 
1753
 
 
1754
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.040807
1755
 
 
 
1992
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
1993
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
1994
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32471
 
1995
 
 
1996
siesta: Eharris(eV) =   -6832.040807
 
1997
 
 
1998
 
 
1999
siesta: Eharris(eV) =   -6832.040807
 
2000
 
 
2001
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2002
Geom step, scf iteration, dmax:  15  1    0.870781
1756
2003
 
1757
2004
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2005
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1758
2006
 
1759
2007
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1760
2008
----------------------------------------
1761
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2009
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
1762
2010
----------------------------------------
1763
2011
   Max    0.278344
1764
2012
   Res    0.097670    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1766
2014
   Max    0.278344    constrained
1767
2015
 
1768
2016
Stress-tensor-Voigt (kbar):      -48.93      -48.93      -48.93       -1.83       -1.83       -1.83
1769
 
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6791.6445
 
2017
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6791.6446
1770
2018
Target enthalpy (eV/cell)    -6830.7579
1771
2019
 
1772
2020
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
1774
2022
        -0.001137   -0.030496   -0.001137
1775
2023
        -0.001137   -0.001137   -0.030496
1776
2024
 
1777
 
siesta: Pressure (static):         48.85980303  kBar
 
2025
siesta: Pressure (static):         48.85980092  kBar
1778
2026
 
1779
2027
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1780
2028
        -0.030538   -0.001142   -0.001142
1781
2029
        -0.001142   -0.030538   -0.001142
1782
2030
        -0.001142   -0.001142   -0.030538
1783
2031
 
1784
 
siesta: Pressure (total):         48.92727437  kBar
 
2032
siesta: Pressure (total):         48.92727226  kBar
1785
2033
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1786
2034
FIRE:     15    1.5125   8    0.0980      0.0185
1787
2035
 
1801
2049
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1802
2050
<dSpData1D:S at geom step 16
1803
2051
  <sparsity:sparsity for geom step 16
1804
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1805
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2052
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2053
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1806
2054
refcount: 1>
1807
 
New_DM. Step:    16
 
2055
new_DM -- step:    16
1808
2056
Initializing Density Matrix...
1809
 
DM after filling with atomic data:
1810
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2057
DM filled with atomic data:
 
2058
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1811
2059
  <sparsity:sparsity for geom step 16
1812
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1813
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2060
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2061
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1814
2062
refcount: 1>
 
2063
 
 
2064
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1815
2065
New grid distribution:   1
1816
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1817
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1818
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1819
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2066
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2067
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2068
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2069
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2070
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2071
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2072
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2073
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1820
2074
 
1821
2075
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1822
2076
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1823
2077
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1824
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2078
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1825
2079
New grid distribution:   2
1826
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1827
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1828
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1829
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2080
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2081
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2082
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2083
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2084
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2085
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2086
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2087
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1830
2088
New grid distribution:   3
1831
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1832
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1833
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1834
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2089
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2090
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2091
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2092
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2093
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2094
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2095
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2096
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1835
2097
Setting up quadratic distribution...
1836
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1837
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1838
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65316
1839
 
 
1840
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.059578
1841
 
 
1842
 
 
1843
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.059578
1844
 
 
 
2098
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2099
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2100
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32455
 
2101
 
 
2102
siesta: Eharris(eV) =   -6832.059579
 
2103
 
 
2104
 
 
2105
siesta: Eharris(eV) =   -6832.059579
 
2106
 
 
2107
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2108
Geom step, scf iteration, dmax:  16  1    0.870104
1845
2109
 
1846
2110
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2111
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1847
2112
 
1848
2113
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1849
2114
----------------------------------------
1850
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2115
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
1851
2116
----------------------------------------
1852
2117
   Max    0.230420
1853
2118
   Res    0.081368    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1863
2128
        -0.001297   -0.030474   -0.001297
1864
2129
        -0.001297   -0.001297   -0.030474
1865
2130
 
1866
 
siesta: Pressure (static):         48.82568602  kBar
 
2131
siesta: Pressure (static):         48.82568494  kBar
1867
2132
 
1868
2133
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1869
2134
        -0.030526   -0.001304   -0.001304
1870
2135
        -0.001304   -0.030526   -0.001304
1871
2136
        -0.001304   -0.001304   -0.030526
1872
2137
 
1873
 
siesta: Pressure (total):         48.90845920  kBar
 
2138
siesta: Pressure (total):         48.90845811  kBar
1874
2139
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1875
2140
FIRE:     16    1.6638   9    0.0970      0.0202
1876
2141
 
1890
2155
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1891
2156
<dSpData1D:S at geom step 17
1892
2157
  <sparsity:sparsity for geom step 17
1893
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1894
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2158
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2159
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1895
2160
refcount: 1>
1896
 
New_DM. Step:    17
 
2161
new_DM -- step:    17
1897
2162
Initializing Density Matrix...
1898
 
DM after filling with atomic data:
1899
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2163
DM filled with atomic data:
 
2164
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1900
2165
  <sparsity:sparsity for geom step 17
1901
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1902
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2166
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2167
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1903
2168
refcount: 1>
 
2169
 
 
2170
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1904
2171
New grid distribution:   1
1905
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1906
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1907
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1908
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2172
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2173
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2174
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2175
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2176
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2177
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2178
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2179
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1909
2180
 
1910
2181
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
1911
2182
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
1912
2183
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
1913
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2184
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
1914
2185
New grid distribution:   2
1915
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1916
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1917
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1918
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2186
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2187
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2188
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2189
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2190
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2191
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2192
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2193
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1919
2194
New grid distribution:   3
1920
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1921
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1922
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1923
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2195
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2196
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2197
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2198
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2199
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2200
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2201
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2202
           8       1:   12   13:   24    1:   12
1924
2203
Setting up quadratic distribution...
1925
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
1926
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
1927
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65340
1928
 
 
1929
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.077055
1930
 
 
1931
 
 
1932
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.077055
1933
 
 
 
2204
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2205
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2206
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32447
 
2207
 
 
2208
siesta: Eharris(eV) =   -6832.077054
 
2209
 
 
2210
 
 
2211
siesta: Eharris(eV) =   -6832.077054
 
2212
 
 
2213
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2214
Geom step, scf iteration, dmax:  17  1    0.869207
1934
2215
 
1935
2216
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2217
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1936
2218
 
1937
2219
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
1938
2220
----------------------------------------
1939
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2221
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
1940
2222
----------------------------------------
1941
2223
   Max    0.176095
1942
2224
   Res    0.064426    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
1952
2234
        -0.001456   -0.030554   -0.001456
1953
2235
        -0.001456   -0.001456   -0.030554
1954
2236
 
1955
 
siesta: Pressure (static):         48.95326150  kBar
 
2237
siesta: Pressure (static):         48.95326413  kBar
1956
2238
 
1957
2239
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
1958
2240
        -0.030615   -0.001465   -0.001465
1959
2241
        -0.001465   -0.030615   -0.001465
1960
2242
        -0.001465   -0.001465   -0.030615
1961
2243
 
1962
 
siesta: Pressure (total):         49.05104109  kBar
 
2244
siesta: Pressure (total):         49.05104371  kBar
1963
2245
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
1964
2246
FIRE:     17    1.8301  10    0.0961      0.0215
1965
2247
 
1979
2261
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
1980
2262
<dSpData1D:S at geom step 18
1981
2263
  <sparsity:sparsity for geom step 18
1982
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
1983
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2264
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2265
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
1984
2266
refcount: 1>
1985
 
New_DM. Step:    18
 
2267
new_DM -- step:    18
1986
2268
Initializing Density Matrix...
1987
 
DM after filling with atomic data:
1988
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2269
DM filled with atomic data:
 
2270
<dSpData2D:DM initialized from atoms
1989
2271
  <sparsity:sparsity for geom step 18
1990
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
1991
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2272
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2273
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
1992
2274
refcount: 1>
 
2275
 
 
2276
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
1993
2277
New grid distribution:   1
1994
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
1995
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
1996
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
1997
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2278
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2279
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2280
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2281
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2282
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2283
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2284
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2285
           8       1:   24   13:   24   19:   24
1998
2286
 
1999
2287
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2000
2288
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2001
2289
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2002
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2290
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2003
2291
New grid distribution:   2
2004
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2005
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2006
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2007
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2292
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2293
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2294
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2295
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2296
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2297
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2298
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2299
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2008
2300
New grid distribution:   3
2009
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2010
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2011
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2012
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2301
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2302
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2303
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2304
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2305
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2306
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2307
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2308
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2013
2309
Setting up quadratic distribution...
2014
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2015
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2016
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65340
2017
 
 
2018
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.090752
2019
 
 
2020
 
 
2021
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.090752
2022
 
 
 
2310
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2311
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2312
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32463
 
2313
 
 
2314
siesta: Eharris(eV) =   -6832.090751
 
2315
 
 
2316
 
 
2317
siesta: Eharris(eV) =   -6832.090751
 
2318
 
 
2319
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2320
Geom step, scf iteration, dmax:  18  1    0.868016
2023
2321
 
2024
2322
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2323
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2025
2324
 
2026
2325
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2027
2326
----------------------------------------
2041
2340
        -0.001706   -0.030893   -0.001706
2042
2341
        -0.001706   -0.001706   -0.030893
2043
2342
 
2044
 
siesta: Pressure (static):         49.49701912  kBar
 
2343
siesta: Pressure (static):         49.49701762  kBar
2045
2344
 
2046
2345
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2047
2346
        -0.030962   -0.001719   -0.001719
2048
2347
        -0.001719   -0.030962   -0.001719
2049
2348
        -0.001719   -0.001719   -0.030962
2050
2349
 
2051
 
siesta: Pressure (total):         49.60744633  kBar
 
2350
siesta: Pressure (total):         49.60744483  kBar
2052
2351
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2053
2352
FIRE:     18    2.0131  11    0.0951      0.0224
2054
2353
 
2068
2367
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2069
2368
<dSpData1D:S at geom step 19
2070
2369
  <sparsity:sparsity for geom step 19
2071
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2072
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2370
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2371
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2073
2372
refcount: 1>
2074
 
New_DM. Step:    19
 
2373
new_DM -- step:    19
2075
2374
Initializing Density Matrix...
2076
 
DM after filling with atomic data:
2077
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2375
DM filled with atomic data:
 
2376
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2078
2377
  <sparsity:sparsity for geom step 19
2079
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2080
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2378
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2379
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2081
2380
refcount: 1>
 
2381
 
 
2382
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2082
2383
New grid distribution:   1
2083
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2084
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2085
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2086
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2384
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2385
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2386
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2387
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2388
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2389
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2390
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2391
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2087
2392
 
2088
2393
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2089
2394
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2090
2395
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2091
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2396
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2092
2397
New grid distribution:   2
2093
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2094
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2095
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2096
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2398
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2399
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2400
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2401
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2402
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2403
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2404
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2405
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2097
2406
New grid distribution:   3
2098
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2099
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2100
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2101
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2407
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2408
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2409
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2410
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2411
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2412
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2413
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2414
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2102
2415
Setting up quadratic distribution...
2103
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2104
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2105
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65348
2106
 
 
2107
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.098568
2108
 
 
2109
 
 
2110
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.098568
2111
 
 
 
2416
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2417
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2418
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32459
 
2419
 
 
2420
siesta: Eharris(eV) =   -6832.098569
 
2421
 
 
2422
 
 
2423
siesta: Eharris(eV) =   -6832.098569
 
2424
 
 
2425
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2426
Geom step, scf iteration, dmax:  19  1    0.866429
2112
2427
 
2113
2428
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2429
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2114
2430
 
2115
2431
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2116
2432
----------------------------------------
2130
2446
        -0.002001   -0.030945   -0.002001
2131
2447
        -0.002001   -0.002001   -0.030945
2132
2448
 
2133
 
siesta: Pressure (static):         49.57921347  kBar
 
2449
siesta: Pressure (static):         49.57921117  kBar
2134
2450
 
2135
2451
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2136
2452
        -0.031017   -0.002018   -0.002018
2137
2453
        -0.002018   -0.031017   -0.002018
2138
2454
        -0.002018   -0.002018   -0.031017
2139
2455
 
2140
 
siesta: Pressure (total):         49.69489334  kBar
 
2456
siesta: Pressure (total):         49.69489103  kBar
2141
2457
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2142
2458
FIRE:     19    2.2145  12    0.0941      0.0225
2143
2459
 
2157
2473
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2158
2474
<dSpData1D:S at geom step 20
2159
2475
  <sparsity:sparsity for geom step 20
2160
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2161
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2476
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2477
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2162
2478
refcount: 1>
2163
 
New_DM. Step:    20
 
2479
new_DM -- step:    20
2164
2480
Initializing Density Matrix...
2165
 
DM after filling with atomic data:
2166
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2481
DM filled with atomic data:
 
2482
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2167
2483
  <sparsity:sparsity for geom step 20
2168
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2169
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2484
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2485
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2170
2486
refcount: 1>
 
2487
 
 
2488
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2171
2489
New grid distribution:   1
2172
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2173
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2174
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2175
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2490
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2491
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2492
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2493
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2494
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2495
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2496
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2497
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2176
2498
 
2177
2499
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2178
2500
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2179
2501
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2180
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2502
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2181
2503
New grid distribution:   2
2182
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2183
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2184
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2185
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2504
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2505
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2506
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2507
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2508
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2509
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2510
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2511
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2186
2512
New grid distribution:   3
2187
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2188
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2189
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2190
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2513
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2514
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2515
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2516
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2517
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2518
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2519
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2520
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2191
2521
Setting up quadratic distribution...
2192
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2193
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2194
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65320
2195
 
 
2196
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.100677
2197
 
 
2198
 
 
2199
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.100677
2200
 
 
 
2522
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2523
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2524
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32435
 
2525
 
 
2526
siesta: Eharris(eV) =   -6832.100677
 
2527
 
 
2528
 
 
2529
siesta: Eharris(eV) =   -6832.100677
 
2530
 
 
2531
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2532
Geom step, scf iteration, dmax:  20  1    0.864438
2201
2533
 
2202
2534
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2535
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2203
2536
 
2204
2537
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2205
2538
----------------------------------------
2206
 
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
 
2539
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
2207
2540
----------------------------------------
2208
2541
   Max    0.141451
2209
2542
   Res    0.049462    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2219
2552
        -0.002230   -0.031229   -0.002230
2220
2553
        -0.002230   -0.002230   -0.031229
2221
2554
 
2222
 
siesta: Pressure (static):         50.03514620  kBar
 
2555
siesta: Pressure (static):         50.03514814  kBar
2223
2556
 
2224
2557
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2225
2558
        -0.031296   -0.002249   -0.002249
2226
2559
        -0.002249   -0.031296   -0.002249
2227
2560
        -0.002249   -0.002249   -0.031296
2228
2561
 
2229
 
siesta: Pressure (total):         50.14227923  kBar
 
2562
siesta: Pressure (total):         50.14228117  kBar
2230
2563
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2231
2564
FIRE:     20    1.1072   0    0.1000      0.0000
2232
2565
 
2246
2579
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2247
2580
<dSpData1D:S at geom step 21
2248
2581
  <sparsity:sparsity for geom step 21
2249
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2250
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2582
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2583
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2251
2584
refcount: 1>
2252
 
New_DM. Step:    21
 
2585
new_DM -- step:    21
2253
2586
Initializing Density Matrix...
2254
 
DM after filling with atomic data:
2255
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2587
DM filled with atomic data:
 
2588
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2256
2589
  <sparsity:sparsity for geom step 21
2257
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2258
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2590
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2591
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2259
2592
refcount: 1>
 
2593
 
 
2594
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2260
2595
New grid distribution:   1
2261
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2262
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2263
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2264
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2596
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2597
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2598
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2599
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2600
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2601
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2602
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2603
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2265
2604
 
2266
2605
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2267
2606
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2268
2607
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2269
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2608
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2270
2609
New grid distribution:   2
2271
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2272
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2273
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2274
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2610
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2611
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2612
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2613
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2614
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2615
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2616
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2617
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2275
2618
New grid distribution:   3
2276
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2277
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2278
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2279
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2619
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2620
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2621
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2622
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2623
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2624
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2625
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2626
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2280
2627
Setting up quadratic distribution...
2281
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2282
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2283
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65288
2284
 
 
2285
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101225
2286
 
 
2287
 
 
2288
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101225
2289
 
 
 
2628
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2629
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2630
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
2631
 
 
2632
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101225
 
2633
 
 
2634
 
 
2635
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101225
 
2636
 
 
2637
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2638
Geom step, scf iteration, dmax:  21  1    0.864390
2290
2639
 
2291
2640
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2641
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2292
2642
 
2293
2643
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2294
2644
----------------------------------------
2295
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2645
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
2296
2646
----------------------------------------
2297
2647
   Max    0.138641
2298
2648
   Res    0.045959    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2308
2658
        -0.002090   -0.031093   -0.002090
2309
2659
        -0.002090   -0.002090   -0.031093
2310
2660
 
2311
 
siesta: Pressure (static):         49.81757290  kBar
 
2661
siesta: Pressure (static):         49.81757201  kBar
2312
2662
 
2313
2663
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2314
2664
        -0.031093   -0.002090   -0.002090
2315
2665
        -0.002090   -0.031093   -0.002090
2316
2666
        -0.002090   -0.002090   -0.031093
2317
2667
 
2318
 
siesta: Pressure (total):         49.81757290  kBar
 
2668
siesta: Pressure (total):         49.81757201  kBar
2319
2669
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2320
2670
FIRE:     21    1.1072   1    0.1000      0.0007
2321
2671
 
2335
2685
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2336
2686
<dSpData1D:S at geom step 22
2337
2687
  <sparsity:sparsity for geom step 22
2338
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2339
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2688
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2689
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2340
2690
refcount: 1>
2341
 
New_DM. Step:    22
 
2691
new_DM -- step:    22
2342
2692
Initializing Density Matrix...
2343
 
DM after filling with atomic data:
2344
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2693
DM filled with atomic data:
 
2694
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2345
2695
  <sparsity:sparsity for geom step 22
2346
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2347
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2696
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2697
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2348
2698
refcount: 1>
 
2699
 
 
2700
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2349
2701
New grid distribution:   1
2350
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2351
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2352
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2353
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2702
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2703
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2704
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2705
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2706
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2707
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2708
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2709
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2354
2710
 
2355
2711
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2356
2712
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2357
2713
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2358
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2714
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2359
2715
New grid distribution:   2
2360
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2361
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2362
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2363
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2716
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2717
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2718
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2719
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2720
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2721
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2722
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2723
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2364
2724
New grid distribution:   3
2365
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2366
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2367
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2368
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2725
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2726
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2727
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2728
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2729
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2730
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2731
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2732
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2369
2733
Setting up quadratic distribution...
2370
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2371
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2372
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65288
2373
 
 
2374
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101592
2375
 
 
2376
 
 
2377
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101592
2378
 
 
 
2734
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2735
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2736
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
2737
 
 
2738
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101592
 
2739
 
 
2740
 
 
2741
siesta: Eharris(eV) =   -6832.101592
 
2742
 
 
2743
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2744
Geom step, scf iteration, dmax:  22  1    0.864359
2379
2745
 
2380
2746
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2747
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2381
2748
 
2382
2749
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2383
2750
----------------------------------------
2384
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2751
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
2385
2752
----------------------------------------
2386
2753
   Max    0.133072
2387
2754
   Res    0.045059    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2397
2764
        -0.002113   -0.031121   -0.002113
2398
2765
        -0.002113   -0.002113   -0.031121
2399
2766
 
2400
 
siesta: Pressure (static):         49.86141240  kBar
 
2767
siesta: Pressure (static):         49.86141218  kBar
2401
2768
 
2402
2769
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2403
2770
        -0.031121   -0.002113   -0.002113
2404
2771
        -0.002113   -0.031121   -0.002113
2405
2772
        -0.002113   -0.002113   -0.031121
2406
2773
 
2407
 
siesta: Pressure (total):         49.86151994  kBar
 
2774
siesta: Pressure (total):         49.86151971  kBar
2408
2775
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2409
2776
FIRE:     22    1.1072   2    0.1000      0.0013
2410
2777
 
2424
2791
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2425
2792
<dSpData1D:S at geom step 23
2426
2793
  <sparsity:sparsity for geom step 23
2427
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2428
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2794
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2795
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2429
2796
refcount: 1>
2430
 
New_DM. Step:    23
 
2797
new_DM -- step:    23
2431
2798
Initializing Density Matrix...
2432
 
DM after filling with atomic data:
2433
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2799
DM filled with atomic data:
 
2800
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2434
2801
  <sparsity:sparsity for geom step 23
2435
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2436
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2802
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2803
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2437
2804
refcount: 1>
 
2805
 
 
2806
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2438
2807
New grid distribution:   1
2439
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2440
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2441
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2442
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2808
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2809
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2810
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2811
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2812
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2813
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2814
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2815
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2443
2816
 
2444
2817
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2445
2818
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2446
2819
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2447
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2820
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2448
2821
New grid distribution:   2
2449
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2450
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2451
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2452
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2822
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2823
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2824
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2825
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2826
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2827
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2828
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2829
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2453
2830
New grid distribution:   3
2454
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2455
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2456
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2457
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2831
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2832
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2833
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2834
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2835
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2836
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2837
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2838
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2458
2839
Setting up quadratic distribution...
2459
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2460
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2461
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
2462
 
 
2463
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102181
2464
 
 
2465
 
 
2466
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102181
2467
 
 
 
2840
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2841
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2842
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
2843
 
 
2844
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102181
 
2845
 
 
2846
 
 
2847
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102181
 
2848
 
 
2849
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2850
Geom step, scf iteration, dmax:  23  1    0.864309
2468
2851
 
2469
2852
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2853
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2470
2854
 
2471
2855
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2472
2856
----------------------------------------
2473
 
   Tot    0.000000   -0.000000   -0.000000
 
2857
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
2474
2858
----------------------------------------
2475
2859
   Max    0.129395
2476
2860
   Res    0.043918    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2486
2870
        -0.002106   -0.031129   -0.002106
2487
2871
        -0.002106   -0.002106   -0.031129
2488
2872
 
2489
 
siesta: Pressure (static):         49.87445678  kBar
 
2873
siesta: Pressure (static):         49.87445708  kBar
2490
2874
 
2491
2875
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2492
2876
        -0.031129   -0.002106   -0.002106
2493
2877
        -0.002106   -0.031129   -0.002106
2494
2878
        -0.002106   -0.002106   -0.031129
2495
2879
 
2496
 
siesta: Pressure (total):         49.87486768  kBar
 
2880
siesta: Pressure (total):         49.87486798  kBar
2497
2881
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2498
2882
FIRE:     23    1.1072   3    0.1000      0.0019
2499
2883
 
2513
2897
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2514
2898
<dSpData1D:S at geom step 24
2515
2899
  <sparsity:sparsity for geom step 24
2516
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2517
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
2900
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
2901
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2518
2902
refcount: 1>
2519
 
New_DM. Step:    24
 
2903
new_DM -- step:    24
2520
2904
Initializing Density Matrix...
2521
 
DM after filling with atomic data:
2522
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
2905
DM filled with atomic data:
 
2906
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2523
2907
  <sparsity:sparsity for geom step 24
2524
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2525
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
2908
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
2909
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2526
2910
refcount: 1>
 
2911
 
 
2912
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2527
2913
New grid distribution:   1
2528
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2529
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2530
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2531
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2914
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
2915
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
2916
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
2917
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
2918
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
2919
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
2920
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
2921
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2532
2922
 
2533
2923
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2534
2924
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2535
2925
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2536
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
2926
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2537
2927
New grid distribution:   2
2538
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2539
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2540
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2541
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2928
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2929
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2930
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2931
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2932
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2933
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2934
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2935
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2542
2936
New grid distribution:   3
2543
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2544
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2545
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2546
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
2937
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
2938
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
2939
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
2940
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
2941
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
2942
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
2943
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
2944
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2547
2945
Setting up quadratic distribution...
2548
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2549
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2550
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
2551
 
 
2552
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102968
2553
 
 
2554
 
 
2555
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102968
2556
 
 
 
2946
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
2947
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
2948
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
2949
 
 
2950
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102969
 
2951
 
 
2952
 
 
2953
siesta: Eharris(eV) =   -6832.102969
 
2954
 
 
2955
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
2956
Geom step, scf iteration, dmax:  24  1    0.864241
2557
2957
 
2558
2958
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
2959
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2559
2960
 
2560
2961
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2561
2962
----------------------------------------
2562
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
2963
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
2563
2964
----------------------------------------
2564
2965
   Max    0.124331
2565
 
   Res    0.042245    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
 
2966
   Res    0.042246    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2566
2967
----------------------------------------
2567
2968
   Max    0.124331    constrained
2568
2969
 
2575
2976
        -0.002097   -0.031130   -0.002097
2576
2977
        -0.002097   -0.002097   -0.031130
2577
2978
 
2578
 
siesta: Pressure (static):         49.87601131  kBar
 
2979
siesta: Pressure (static):         49.87601477  kBar
2579
2980
 
2580
2981
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2581
2982
        -0.031130   -0.002097   -0.002097
2582
2983
        -0.002097   -0.031130   -0.002097
2583
2984
        -0.002097   -0.002097   -0.031130
2584
2985
 
2585
 
siesta: Pressure (total):         49.87690858  kBar
 
2986
siesta: Pressure (total):         49.87691204  kBar
2586
2987
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2587
2988
FIRE:     24    1.1072   4    0.1000      0.0025
2588
2989
 
2602
3003
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2603
3004
<dSpData1D:S at geom step 25
2604
3005
  <sparsity:sparsity for geom step 25
2605
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2606
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3006
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3007
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2607
3008
refcount: 1>
2608
 
New_DM. Step:    25
 
3009
new_DM -- step:    25
2609
3010
Initializing Density Matrix...
2610
 
DM after filling with atomic data:
2611
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3011
DM filled with atomic data:
 
3012
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2612
3013
  <sparsity:sparsity for geom step 25
2613
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2614
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3014
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3015
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2615
3016
refcount: 1>
 
3017
 
 
3018
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2616
3019
New grid distribution:   1
2617
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2618
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2619
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2620
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3020
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3021
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3022
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3023
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3024
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3025
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3026
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3027
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2621
3028
 
2622
3029
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2623
3030
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2624
3031
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2625
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3032
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2626
3033
New grid distribution:   2
2627
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2628
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2629
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2630
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3034
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3035
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3036
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3037
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3038
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3039
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3040
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3041
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2631
3042
New grid distribution:   3
2632
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2633
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2634
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2635
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3043
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3044
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3045
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3046
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3047
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3048
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3049
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3050
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2636
3051
Setting up quadratic distribution...
2637
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2638
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2639
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
2640
 
 
2641
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.103920
2642
 
 
2643
 
 
2644
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.103920
2645
 
 
 
3052
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3053
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3054
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32451
 
3055
 
 
3056
siesta: Eharris(eV) =   -6832.103918
 
3057
 
 
3058
 
 
3059
siesta: Eharris(eV) =   -6832.103918
 
3060
 
 
3061
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3062
Geom step, scf iteration, dmax:  25  1    0.864155
2646
3063
 
2647
3064
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3065
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2648
3066
 
2649
3067
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2650
3068
----------------------------------------
2651
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
3069
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
2652
3070
----------------------------------------
2653
3071
   Max    0.118140
2654
3072
   Res    0.040273    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2664
3082
        -0.002086   -0.031133   -0.002086
2665
3083
        -0.002086   -0.002086   -0.031133
2666
3084
 
2667
 
siesta: Pressure (static):         49.88083702  kBar
 
3085
siesta: Pressure (static):         49.88083640  kBar
2668
3086
 
2669
3087
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2670
3088
        -0.031134   -0.002086   -0.002086
2671
3089
        -0.002086   -0.031134   -0.002086
2672
3090
        -0.002086   -0.002086   -0.031134
2673
3091
 
2674
 
siesta: Pressure (total):         49.88238394  kBar
 
3092
siesta: Pressure (total):         49.88238332  kBar
2675
3093
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2676
3094
FIRE:     25    1.1072   5    0.1000      0.0031
2677
3095
 
2691
3109
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2692
3110
<dSpData1D:S at geom step 26
2693
3111
  <sparsity:sparsity for geom step 26
2694
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2695
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3112
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3113
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2696
3114
refcount: 1>
2697
 
New_DM. Step:    26
 
3115
new_DM -- step:    26
2698
3116
Initializing Density Matrix...
2699
 
DM after filling with atomic data:
2700
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3117
DM filled with atomic data:
 
3118
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2701
3119
  <sparsity:sparsity for geom step 26
2702
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2703
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3120
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3121
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2704
3122
refcount: 1>
 
3123
 
 
3124
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2705
3125
New grid distribution:   1
2706
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2707
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2708
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2709
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3126
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3127
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3128
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3129
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3130
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3131
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3132
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3133
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2710
3134
 
2711
3135
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2712
3136
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2713
3137
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2714
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3138
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2715
3139
New grid distribution:   2
2716
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2717
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2718
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2719
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3140
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3141
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3142
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3143
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3144
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3145
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3146
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3147
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2720
3148
New grid distribution:   3
2721
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2722
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2723
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2724
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3149
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3150
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3151
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3152
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3153
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3154
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3155
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3156
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2725
3157
Setting up quadratic distribution...
2726
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2727
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2728
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65264
2729
 
 
2730
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.104998
2731
 
 
2732
 
 
2733
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.104998
2734
 
 
 
3158
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3159
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3160
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
3161
 
 
3162
siesta: Eharris(eV) =   -6832.104998
 
3163
 
 
3164
 
 
3165
siesta: Eharris(eV) =   -6832.104998
 
3166
 
 
3167
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3168
Geom step, scf iteration, dmax:  26  1    0.864053
2735
3169
 
2736
3170
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3171
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2737
3172
 
2738
3173
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2739
3174
----------------------------------------
2740
 
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
 
3175
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
2741
3176
----------------------------------------
2742
3177
   Max    0.111626
2743
3178
   Res    0.037349    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2753
3188
        -0.002144   -0.030912   -0.002144
2754
3189
        -0.002144   -0.002144   -0.030912
2755
3190
 
2756
 
siesta: Pressure (static):         49.52726032  kBar
 
3191
siesta: Pressure (static):         49.52725987  kBar
2757
3192
 
2758
3193
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2759
3194
        -0.030914   -0.002144   -0.002144
2760
3195
        -0.002144   -0.030914   -0.002144
2761
3196
        -0.002144   -0.002144   -0.030914
2762
3197
 
2763
 
siesta: Pressure (total):         49.52959361  kBar
 
3198
siesta: Pressure (total):         49.52959316  kBar
2764
3199
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2765
3200
FIRE:     26    1.1072   6    0.1000      0.0036
2766
3201
 
2780
3215
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2781
3216
<dSpData1D:S at geom step 27
2782
3217
  <sparsity:sparsity for geom step 27
2783
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2784
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3218
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3219
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2785
3220
refcount: 1>
2786
 
New_DM. Step:    27
 
3221
new_DM -- step:    27
2787
3222
Initializing Density Matrix...
2788
 
DM after filling with atomic data:
2789
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3223
DM filled with atomic data:
 
3224
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2790
3225
  <sparsity:sparsity for geom step 27
2791
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2792
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3226
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3227
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2793
3228
refcount: 1>
 
3229
 
 
3230
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2794
3231
New grid distribution:   1
2795
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2796
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2797
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2798
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3232
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3233
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3234
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3235
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3236
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3237
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3238
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3239
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2799
3240
 
2800
3241
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2801
3242
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2802
3243
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2803
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3244
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2804
3245
New grid distribution:   2
2805
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2806
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2807
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2808
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3246
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3247
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3248
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3249
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3250
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3251
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3252
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3253
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2809
3254
New grid distribution:   3
2810
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2811
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2812
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2813
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3255
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3256
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3257
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3258
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3259
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3260
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3261
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3262
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2814
3263
Setting up quadratic distribution...
2815
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2816
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2817
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
2818
 
 
2819
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.106139
2820
 
 
2821
 
 
2822
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.106139
2823
 
 
 
3264
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3265
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3266
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32435
 
3267
 
 
3268
siesta: Eharris(eV) =   -6832.106139
 
3269
 
 
3270
 
 
3271
siesta: Eharris(eV) =   -6832.106139
 
3272
 
 
3273
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3274
Geom step, scf iteration, dmax:  27  1    0.863942
2824
3275
 
2825
3276
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3277
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2826
3278
 
2827
3279
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2828
3280
----------------------------------------
2829
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
3281
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
2830
3282
----------------------------------------
2831
3283
   Max    0.103697
2832
3284
   Res    0.034904    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2842
3294
        -0.002133   -0.030911   -0.002133
2843
3295
        -0.002133   -0.002133   -0.030911
2844
3296
 
2845
 
siesta: Pressure (static):         49.52578676  kBar
 
3297
siesta: Pressure (static):         49.52578719  kBar
2846
3298
 
2847
3299
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2848
3300
        -0.030913   -0.002133   -0.002133
2849
3301
        -0.002133   -0.030913   -0.002133
2850
3302
        -0.002133   -0.002133   -0.030913
2851
3303
 
2852
 
siesta: Pressure (total):         49.52899648  kBar
 
3304
siesta: Pressure (total):         49.52899691  kBar
2853
3305
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2854
3306
FIRE:     27    1.2179   7    0.0990      0.0041
2855
3307
 
2869
3321
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2870
3322
<dSpData1D:S at geom step 28
2871
3323
  <sparsity:sparsity for geom step 28
2872
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2873
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3324
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3325
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2874
3326
refcount: 1>
2875
 
New_DM. Step:    28
 
3327
new_DM -- step:    28
2876
3328
Initializing Density Matrix...
2877
 
DM after filling with atomic data:
2878
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3329
DM filled with atomic data:
 
3330
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2879
3331
  <sparsity:sparsity for geom step 28
2880
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2881
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3332
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3333
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2882
3334
refcount: 1>
 
3335
 
 
3336
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2883
3337
New grid distribution:   1
2884
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2885
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2886
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2887
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3338
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3339
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3340
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3341
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3342
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3343
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3344
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3345
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2888
3346
 
2889
3347
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2890
3348
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2891
3349
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2892
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3350
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2893
3351
New grid distribution:   2
2894
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2895
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2896
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2897
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3352
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3353
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3354
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3355
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3356
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3357
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3358
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3359
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2898
3360
New grid distribution:   3
2899
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2900
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2901
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2902
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3361
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3362
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3363
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3364
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3365
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3366
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3367
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3368
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2903
3369
Setting up quadratic distribution...
2904
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2905
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2906
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65272
2907
 
 
2908
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.107435
2909
 
 
2910
 
 
2911
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.107435
2912
 
 
 
3370
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3371
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3372
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32427
 
3373
 
 
3374
siesta: Eharris(eV) =   -6832.107434
 
3375
 
 
3376
 
 
3377
siesta: Eharris(eV) =   -6832.107434
 
3378
 
 
3379
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3380
Geom step, scf iteration, dmax:  28  1    0.863813
2913
3381
 
2914
3382
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3383
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2915
3384
 
2916
3385
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
2917
3386
----------------------------------------
2918
 
   Tot    0.000000   -0.000000   -0.000000
 
3387
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
2919
3388
----------------------------------------
2920
3389
   Max    0.093977
2921
3390
   Res    0.032079    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
2931
3400
        -0.002113   -0.030921   -0.002113
2932
3401
        -0.002113   -0.002113   -0.030921
2933
3402
 
2934
 
siesta: Pressure (static):         49.54121572  kBar
 
3403
siesta: Pressure (static):         49.54121460  kBar
2935
3404
 
2936
3405
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
2937
3406
        -0.030923   -0.002114   -0.002114
2938
3407
        -0.002114   -0.030923   -0.002114
2939
3408
        -0.002114   -0.002114   -0.030923
2940
3409
 
2941
 
siesta: Pressure (total):         49.54535949  kBar
 
3410
siesta: Pressure (total):         49.54535838  kBar
2942
3411
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
2943
3412
FIRE:     28    1.3397   8    0.0980      0.0046
2944
3413
 
2958
3427
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
2959
3428
<dSpData1D:S at geom step 29
2960
3429
  <sparsity:sparsity for geom step 29
2961
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
2962
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3430
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3431
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
2963
3432
refcount: 1>
2964
 
New_DM. Step:    29
 
3433
new_DM -- step:    29
2965
3434
Initializing Density Matrix...
2966
 
DM after filling with atomic data:
2967
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3435
DM filled with atomic data:
 
3436
<dSpData2D:DM initialized from atoms
2968
3437
  <sparsity:sparsity for geom step 29
2969
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
2970
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3438
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3439
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
2971
3440
refcount: 1>
 
3441
 
 
3442
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
2972
3443
New grid distribution:   1
2973
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2974
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2975
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2976
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3444
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3445
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3446
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3447
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3448
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3449
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3450
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3451
           8       1:   24   13:   24   19:   24
2977
3452
 
2978
3453
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
2979
3454
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
2980
3455
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
2981
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3456
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
2982
3457
New grid distribution:   2
2983
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2984
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2985
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2986
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3458
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3459
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3460
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3461
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3462
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3463
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3464
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3465
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2987
3466
New grid distribution:   3
2988
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
2989
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
2990
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
2991
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3467
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3468
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3469
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3470
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3471
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3472
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3473
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3474
           8       1:   12   13:   24    1:   12
2992
3475
Setting up quadratic distribution...
2993
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
2994
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
2995
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65268
2996
 
 
2997
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.108841
2998
 
 
2999
 
 
3000
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.108841
3001
 
 
 
3476
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3477
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3478
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32427
 
3479
 
 
3480
siesta: Eharris(eV) =   -6832.108841
 
3481
 
 
3482
 
 
3483
siesta: Eharris(eV) =   -6832.108841
 
3484
 
 
3485
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3486
Geom step, scf iteration, dmax:  29  1    0.863663
3002
3487
 
3003
3488
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3489
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3004
3490
 
3005
3491
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3006
3492
----------------------------------------
3007
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
3493
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
3008
3494
----------------------------------------
3009
3495
   Max    0.083104
3010
3496
   Res    0.027150    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3020
3506
        -0.002015   -0.030858   -0.002015
3021
3507
        -0.002015   -0.002015   -0.030858
3022
3508
 
3023
 
siesta: Pressure (static):         49.44064687  kBar
 
3509
siesta: Pressure (static):         49.44064554  kBar
3024
3510
 
3025
3511
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3026
3512
        -0.030861   -0.002016   -0.002016
3027
3513
        -0.002016   -0.030861   -0.002016
3028
3514
        -0.002016   -0.002016   -0.030861
3029
3515
 
3030
 
siesta: Pressure (total):         49.44585593  kBar
 
3516
siesta: Pressure (total):         49.44585460  kBar
3031
3517
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3032
3518
FIRE:     29    1.4737   9    0.0970      0.0051
3033
3519
 
3047
3533
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3048
3534
<dSpData1D:S at geom step 30
3049
3535
  <sparsity:sparsity for geom step 30
3050
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3051
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3536
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3537
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3052
3538
refcount: 1>
3053
 
New_DM. Step:    30
 
3539
new_DM -- step:    30
3054
3540
Initializing Density Matrix...
3055
 
DM after filling with atomic data:
3056
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3541
DM filled with atomic data:
 
3542
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3057
3543
  <sparsity:sparsity for geom step 30
3058
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3059
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3544
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3545
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3060
3546
refcount: 1>
 
3547
 
 
3548
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3061
3549
New grid distribution:   1
3062
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3063
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3064
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3065
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3550
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3551
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3552
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3553
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3554
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3555
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3556
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3557
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3066
3558
 
3067
3559
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3068
3560
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3069
3561
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3070
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3562
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3071
3563
New grid distribution:   2
3072
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3073
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3074
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3075
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3564
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3565
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3566
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3567
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3568
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3569
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3570
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3571
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3076
3572
New grid distribution:   3
3077
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3078
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3079
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3080
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3573
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3574
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3575
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3576
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3577
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3578
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3579
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3580
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3081
3581
Setting up quadratic distribution...
3082
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3083
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3084
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65300
3085
 
 
3086
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.110218
3087
 
 
3088
 
 
3089
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.110218
3090
 
 
 
3582
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3583
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3584
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32419
 
3585
 
 
3586
siesta: Eharris(eV) =   -6832.110218
 
3587
 
 
3588
 
 
3589
siesta: Eharris(eV) =   -6832.110218
 
3590
 
 
3591
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3592
Geom step, scf iteration, dmax:  30  1    0.863499
3091
3593
 
3092
3594
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3595
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3093
3596
 
3094
3597
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3095
3598
----------------------------------------
3096
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
3599
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
3097
3600
----------------------------------------
3098
3601
   Max    0.065018
3099
3602
   Res    0.023279    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3109
3612
        -0.002040   -0.030716   -0.002040
3110
3613
        -0.002040   -0.002040   -0.030716
3111
3614
 
3112
 
siesta: Pressure (static):         49.21267416  kBar
 
3615
siesta: Pressure (static):         49.21267360  kBar
3113
3616
 
3114
3617
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3115
3618
        -0.030720   -0.002041   -0.002041
3116
3619
        -0.002041   -0.030720   -0.002041
3117
3620
        -0.002041   -0.002041   -0.030720
3118
3621
 
3119
 
siesta: Pressure (total):         49.21901037  kBar
 
3622
siesta: Pressure (total):         49.21900982  kBar
3120
3623
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3121
3624
FIRE:     30    1.6211  10    0.0961      0.0056
3122
3625
 
3136
3639
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3137
3640
<dSpData1D:S at geom step 31
3138
3641
  <sparsity:sparsity for geom step 31
3139
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3140
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3642
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3643
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3141
3644
refcount: 1>
3142
 
New_DM. Step:    31
 
3645
new_DM -- step:    31
3143
3646
Initializing Density Matrix...
3144
 
DM after filling with atomic data:
3145
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3647
DM filled with atomic data:
 
3648
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3146
3649
  <sparsity:sparsity for geom step 31
3147
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3148
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3650
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3651
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3149
3652
refcount: 1>
 
3653
 
 
3654
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3150
3655
New grid distribution:   1
3151
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3152
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3153
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3154
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3656
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3657
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3658
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3659
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3660
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3661
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3662
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3663
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3155
3664
 
3156
3665
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3157
3666
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3158
3667
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3159
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3668
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3160
3669
New grid distribution:   2
3161
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3162
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3163
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3164
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3670
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3671
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3672
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3673
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3674
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3675
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3676
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3677
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3165
3678
New grid distribution:   3
3166
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3167
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3168
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3169
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3679
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3680
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3681
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3682
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3683
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3684
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3685
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3686
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3170
3687
Setting up quadratic distribution...
3171
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3172
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3173
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65324
3174
 
 
3175
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.111538
3176
 
 
3177
 
 
3178
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.111538
3179
 
 
 
3688
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3689
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3690
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32403
 
3691
 
 
3692
siesta: Eharris(eV) =   -6832.111537
 
3693
 
 
3694
 
 
3695
siesta: Eharris(eV) =   -6832.111537
 
3696
 
 
3697
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3698
Geom step, scf iteration, dmax:  31  1    0.863331
3180
3699
 
3181
3700
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3701
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3182
3702
 
3183
3703
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3184
3704
----------------------------------------
3185
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
3705
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
3186
3706
----------------------------------------
3187
3707
   Max    0.048660
3188
3708
   Res    0.020769    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3198
3718
        -0.001933   -0.030655   -0.001933
3199
3719
        -0.001933   -0.001933   -0.030655
3200
3720
 
3201
 
siesta: Pressure (static):         49.11523524  kBar
 
3721
siesta: Pressure (static):         49.11523480  kBar
3202
3722
 
3203
3723
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3204
3724
        -0.030660   -0.001935   -0.001935
3205
3725
        -0.001935   -0.030660   -0.001935
3206
3726
        -0.001935   -0.001935   -0.030660
3207
3727
 
3208
 
siesta: Pressure (total):         49.12261443  kBar
 
3728
siesta: Pressure (total):         49.12261398  kBar
3209
3729
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3210
3730
FIRE:     31    1.7832  11    0.0951      0.0059
3211
3731
 
3225
3745
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3226
3746
<dSpData1D:S at geom step 32
3227
3747
  <sparsity:sparsity for geom step 32
3228
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3229
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3748
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3749
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3230
3750
refcount: 1>
3231
 
New_DM. Step:    32
 
3751
new_DM -- step:    32
3232
3752
Initializing Density Matrix...
3233
 
DM after filling with atomic data:
3234
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3753
DM filled with atomic data:
 
3754
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3235
3755
  <sparsity:sparsity for geom step 32
3236
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3237
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3756
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3757
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3238
3758
refcount: 1>
 
3759
 
 
3760
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3239
3761
New grid distribution:   1
3240
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3241
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3242
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3243
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3762
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3763
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3764
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3765
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3766
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3767
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3768
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3769
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3244
3770
 
3245
3771
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3246
3772
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3247
3773
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3248
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3774
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3249
3775
New grid distribution:   2
3250
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3251
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3252
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3253
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3776
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3777
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3778
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3779
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3780
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3781
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3782
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3783
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3254
3784
New grid distribution:   3
3255
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3256
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3257
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3258
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3785
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3786
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3787
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3788
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3789
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3790
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3791
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3792
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3259
3793
Setting up quadratic distribution...
3260
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3261
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3262
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65364
3263
 
 
3264
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.112764
3265
 
 
3266
 
 
3267
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.112764
3268
 
 
 
3794
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3795
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3796
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32399
 
3797
 
 
3798
siesta: Eharris(eV) =   -6832.112764
 
3799
 
 
3800
 
 
3801
siesta: Eharris(eV) =   -6832.112764
 
3802
 
 
3803
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3804
Geom step, scf iteration, dmax:  32  1    0.863169
3269
3805
 
3270
3806
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3807
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3271
3808
 
3272
3809
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3273
3810
----------------------------------------
3274
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
3811
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
3275
3812
----------------------------------------
3276
3813
   Max    0.043509
3277
3814
   Res    0.019379    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3287
3824
        -0.001899   -0.030660   -0.001899
3288
3825
        -0.001899   -0.001899   -0.030660
3289
3826
 
3290
 
siesta: Pressure (static):         49.12278268  kBar
 
3827
siesta: Pressure (static):         49.12278317  kBar
3291
3828
 
3292
3829
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3293
3830
        -0.030665   -0.001901   -0.001901
3294
3831
        -0.001901   -0.030665   -0.001901
3295
3832
        -0.001901   -0.001901   -0.030665
3296
3833
 
3297
 
siesta: Pressure (total):         49.13099578  kBar
 
3834
siesta: Pressure (total):         49.13099627  kBar
3298
3835
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3299
3836
FIRE:     32    1.9615  12    0.0941      0.0062
3300
3837
 
3314
3851
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3315
3852
<dSpData1D:S at geom step 33
3316
3853
  <sparsity:sparsity for geom step 33
3317
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3318
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3854
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3855
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3319
3856
refcount: 1>
3320
 
New_DM. Step:    33
 
3857
new_DM -- step:    33
3321
3858
Initializing Density Matrix...
3322
 
DM after filling with atomic data:
3323
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3859
DM filled with atomic data:
 
3860
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3324
3861
  <sparsity:sparsity for geom step 33
3325
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3326
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3862
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3863
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3327
3864
refcount: 1>
 
3865
 
 
3866
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3328
3867
New grid distribution:   1
3329
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3330
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3331
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3332
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3868
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3869
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3870
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3871
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3872
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3873
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3874
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3875
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3333
3876
 
3334
3877
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3335
3878
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3336
3879
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3337
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3880
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3338
3881
New grid distribution:   2
3339
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3340
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3341
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3342
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3882
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3883
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3884
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3885
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3886
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3887
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3888
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3889
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3343
3890
New grid distribution:   3
3344
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3345
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3346
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3347
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3891
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3892
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3893
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3894
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3895
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3896
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3897
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3898
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3348
3899
Setting up quadratic distribution...
3349
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3350
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3351
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65348
3352
 
 
3353
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.113888
3354
 
 
3355
 
 
3356
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.113888
3357
 
 
 
3900
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
3901
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
3902
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32391
 
3903
 
 
3904
siesta: Eharris(eV) =   -6832.113889
 
3905
 
 
3906
 
 
3907
siesta: Eharris(eV) =   -6832.113889
 
3908
 
 
3909
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
3910
Geom step, scf iteration, dmax:  33  1    0.863021
3358
3911
 
3359
3912
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
3913
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3360
3914
 
3361
3915
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3362
3916
----------------------------------------
3376
3930
        -0.001866   -0.030666   -0.001866
3377
3931
        -0.001866   -0.001866   -0.030666
3378
3932
 
3379
 
siesta: Pressure (static):         49.13337132  kBar
 
3933
siesta: Pressure (static):         49.13337371  kBar
3380
3934
 
3381
3935
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3382
3936
        -0.030672   -0.001869   -0.001869
3383
3937
        -0.001869   -0.030672   -0.001869
3384
3938
        -0.001869   -0.001869   -0.030672
3385
3939
 
3386
 
siesta: Pressure (total):         49.14213598  kBar
 
3940
siesta: Pressure (total):         49.14213837  kBar
3387
3941
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3388
3942
FIRE:     33    2.1577  13    0.0932      0.0063
3389
3943
 
3403
3957
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3404
3958
<dSpData1D:S at geom step 34
3405
3959
  <sparsity:sparsity for geom step 34
3406
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3407
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
3960
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
3961
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3408
3962
refcount: 1>
3409
 
New_DM. Step:    34
 
3963
new_DM -- step:    34
3410
3964
Initializing Density Matrix...
3411
 
DM after filling with atomic data:
3412
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
3965
DM filled with atomic data:
 
3966
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3413
3967
  <sparsity:sparsity for geom step 34
3414
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3415
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
3968
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
3969
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3416
3970
refcount: 1>
 
3971
 
 
3972
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3417
3973
New grid distribution:   1
3418
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3419
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3420
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3421
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3974
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
3975
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
3976
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
3977
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
3978
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
3979
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
3980
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
3981
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3422
3982
 
3423
3983
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3424
3984
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3425
3985
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3426
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
3986
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3427
3987
New grid distribution:   2
3428
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3429
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3430
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3431
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3988
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3989
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3990
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
3991
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
3992
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
3993
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
3994
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
3995
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3432
3996
New grid distribution:   3
3433
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3434
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3435
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3436
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
3997
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
3998
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
3999
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4000
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4001
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4002
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4003
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4004
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3437
4005
Setting up quadratic distribution...
3438
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3439
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3440
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65332
3441
 
 
3442
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.114924
3443
 
 
3444
 
 
3445
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.114924
3446
 
 
 
4006
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4007
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4008
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32391
 
4009
 
 
4010
siesta: Eharris(eV) =   -6832.114924
 
4011
 
 
4012
 
 
4013
siesta: Eharris(eV) =   -6832.114924
 
4014
 
 
4015
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4016
Geom step, scf iteration, dmax:  34  1    0.862893
3447
4017
 
3448
4018
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4019
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3449
4020
 
3450
4021
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3451
4022
----------------------------------------
3452
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4023
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
3453
4024
----------------------------------------
3454
4025
   Max    0.049098
3455
4026
   Res    0.019523    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3465
4036
        -0.001810   -0.030691   -0.001810
3466
4037
        -0.001810   -0.001810   -0.030691
3467
4038
 
3468
 
siesta: Pressure (static):         49.17282697  kBar
 
4039
siesta: Pressure (static):         49.17282934  kBar
3469
4040
 
3470
4041
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3471
4042
        -0.030697   -0.001814   -0.001814
3472
4043
        -0.001814   -0.030697   -0.001814
3473
4044
        -0.001814   -0.001814   -0.030697
3474
4045
 
3475
 
siesta: Pressure (total):         49.18181312  kBar
 
4046
siesta: Pressure (total):         49.18181549  kBar
3476
4047
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3477
4048
FIRE:     34    2.3734  14    0.0923      0.0064
3478
4049
 
3492
4063
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3493
4064
<dSpData1D:S at geom step 35
3494
4065
  <sparsity:sparsity for geom step 35
3495
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3496
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4066
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4067
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3497
4068
refcount: 1>
3498
 
New_DM. Step:    35
 
4069
new_DM -- step:    35
3499
4070
Initializing Density Matrix...
3500
 
DM after filling with atomic data:
3501
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4071
DM filled with atomic data:
 
4072
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3502
4073
  <sparsity:sparsity for geom step 35
3503
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3504
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4074
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4075
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3505
4076
refcount: 1>
 
4077
 
 
4078
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3506
4079
New grid distribution:   1
3507
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3508
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3509
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3510
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4080
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4081
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4082
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4083
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4084
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4085
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4086
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4087
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3511
4088
 
3512
4089
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3513
4090
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3514
4091
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3515
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4092
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3516
4093
New grid distribution:   2
3517
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3518
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3519
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3520
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4094
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4095
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4096
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4097
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4098
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4099
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4100
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4101
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3521
4102
New grid distribution:   3
3522
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3523
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3524
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3525
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4103
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4104
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4105
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4106
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4107
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4108
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4109
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4110
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3526
4111
Setting up quadratic distribution...
3527
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3528
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3529
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65332
3530
 
 
3531
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.115767
3532
 
 
3533
 
 
3534
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.115767
3535
 
 
 
4112
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4113
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4114
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32383
 
4115
 
 
4116
siesta: Eharris(eV) =   -6832.115767
 
4117
 
 
4118
 
 
4119
siesta: Eharris(eV) =   -6832.115767
 
4120
 
 
4121
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4122
Geom step, scf iteration, dmax:  35  1    0.862769
3536
4123
 
3537
4124
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4125
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3538
4126
 
3539
4127
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3540
4128
----------------------------------------
3541
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
4129
   Tot    0.000000   -0.000000   -0.000000
3542
4130
----------------------------------------
3543
4131
   Max    0.055807
3544
4132
   Res    0.020904    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3554
4142
        -0.001787   -0.030897   -0.001787
3555
4143
        -0.001787   -0.001787   -0.030897
3556
4144
 
3557
 
siesta: Pressure (static):         49.50253366  kBar
 
4145
siesta: Pressure (static):         49.50253214  kBar
3558
4146
 
3559
4147
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3560
4148
        -0.030902   -0.001791   -0.001791
3561
4149
        -0.001791   -0.030902   -0.001791
3562
4150
        -0.001791   -0.001791   -0.030902
3563
4151
 
3564
 
siesta: Pressure (total):         49.51140082  kBar
 
4152
siesta: Pressure (total):         49.51139930  kBar
3565
4153
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3566
4154
FIRE:     35    2.6108  15    0.0914      0.0063
3567
4155
 
3581
4169
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3582
4170
<dSpData1D:S at geom step 36
3583
4171
  <sparsity:sparsity for geom step 36
3584
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3585
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4172
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4173
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3586
4174
refcount: 1>
3587
 
New_DM. Step:    36
 
4175
new_DM -- step:    36
3588
4176
Initializing Density Matrix...
3589
 
DM after filling with atomic data:
3590
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4177
DM filled with atomic data:
 
4178
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3591
4179
  <sparsity:sparsity for geom step 36
3592
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3593
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4180
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4181
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3594
4182
refcount: 1>
 
4183
 
 
4184
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3595
4185
New grid distribution:   1
3596
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3597
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3598
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3599
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4186
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4187
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4188
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4189
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4190
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4191
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4192
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4193
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3600
4194
 
3601
4195
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3602
4196
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3603
4197
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3604
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4198
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3605
4199
New grid distribution:   2
3606
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3607
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3608
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3609
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4200
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4201
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4202
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4203
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4204
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4205
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4206
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4207
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3610
4208
New grid distribution:   3
3611
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3612
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3613
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3614
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4209
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4210
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4211
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4212
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4213
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4214
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4215
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4216
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3615
4217
Setting up quadratic distribution...
3616
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3617
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3618
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65324
3619
 
 
3620
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.116634
3621
 
 
3622
 
 
3623
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.116634
3624
 
 
 
4218
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4219
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4220
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32391
 
4221
 
 
4222
siesta: Eharris(eV) =   -6832.116634
 
4223
 
 
4224
 
 
4225
siesta: Eharris(eV) =   -6832.116634
 
4226
 
 
4227
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4228
Geom step, scf iteration, dmax:  36  1    0.862593
3625
4229
 
3626
4230
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4231
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3627
4232
 
3628
4233
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3629
4234
----------------------------------------
3630
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4235
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
3631
4236
----------------------------------------
3632
4237
   Max    0.053511
3633
4238
   Res    0.021349    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3643
4248
        -0.001808   -0.030943   -0.001808
3644
4249
        -0.001808   -0.001808   -0.030943
3645
4250
 
3646
 
siesta: Pressure (static):         49.57667797  kBar
 
4251
siesta: Pressure (static):         49.57667813  kBar
3647
4252
 
3648
4253
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3649
4254
        -0.030948   -0.001812   -0.001812
3650
4255
        -0.001812   -0.030948   -0.001812
3651
4256
        -0.001812   -0.001812   -0.030948
3652
4257
 
3653
 
siesta: Pressure (total):         49.58514790  kBar
 
4258
siesta: Pressure (total):         49.58514806  kBar
3654
4259
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3655
4260
FIRE:     36    2.8719  16    0.0904      0.0062
3656
4261
 
3670
4275
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3671
4276
<dSpData1D:S at geom step 37
3672
4277
  <sparsity:sparsity for geom step 37
3673
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3674
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4278
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4279
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3675
4280
refcount: 1>
3676
 
New_DM. Step:    37
 
4281
new_DM -- step:    37
3677
4282
Initializing Density Matrix...
3678
 
DM after filling with atomic data:
3679
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4283
DM filled with atomic data:
 
4284
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3680
4285
  <sparsity:sparsity for geom step 37
3681
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3682
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4286
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4287
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3683
4288
refcount: 1>
 
4289
 
 
4290
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3684
4291
New grid distribution:   1
3685
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3686
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3687
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3688
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4292
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4293
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4294
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4295
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4296
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4297
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4298
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4299
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3689
4300
 
3690
4301
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3691
4302
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3692
4303
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3693
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4304
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3694
4305
New grid distribution:   2
3695
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3696
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3697
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3698
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4306
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4307
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4308
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4309
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4310
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4311
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4312
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4313
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3699
4314
New grid distribution:   3
3700
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3701
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3702
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3703
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4315
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4316
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4317
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4318
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4319
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4320
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4321
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4322
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3704
4323
Setting up quadratic distribution...
3705
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3706
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3707
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
3708
 
 
3709
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.117820
3710
 
 
3711
 
 
3712
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.117820
3713
 
 
 
4324
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4325
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4326
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32375
 
4327
 
 
4328
siesta: Eharris(eV) =   -6832.117820
 
4329
 
 
4330
 
 
4331
siesta: Eharris(eV) =   -6832.117820
 
4332
 
 
4333
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4334
Geom step, scf iteration, dmax:  37  1    0.862350
3714
4335
 
3715
4336
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4337
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3716
4338
 
3717
4339
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3718
4340
----------------------------------------
3719
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
4341
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
3720
4342
----------------------------------------
3721
4343
   Max    0.059306
3722
4344
   Res    0.021118    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3732
4354
        -0.001831   -0.030961   -0.001831
3733
4355
        -0.001831   -0.001831   -0.030961
3734
4356
 
3735
 
siesta: Pressure (static):         49.60551123  kBar
 
4357
siesta: Pressure (static):         49.60550973  kBar
3736
4358
 
3737
4359
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3738
4360
        -0.030966   -0.001835   -0.001835
3739
4361
        -0.001835   -0.030966   -0.001835
3740
4362
        -0.001835   -0.001835   -0.030966
3741
4363
 
3742
 
siesta: Pressure (total):         49.61374894  kBar
 
4364
siesta: Pressure (total):         49.61374744  kBar
3743
4365
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3744
4366
FIRE:     37    3.1590  17    0.0895      0.0062
3745
4367
 
3759
4381
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3760
4382
<dSpData1D:S at geom step 38
3761
4383
  <sparsity:sparsity for geom step 38
3762
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3763
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4384
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4385
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3764
4386
refcount: 1>
3765
 
New_DM. Step:    38
 
4387
new_DM -- step:    38
3766
4388
Initializing Density Matrix...
3767
 
DM after filling with atomic data:
3768
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4389
DM filled with atomic data:
 
4390
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3769
4391
  <sparsity:sparsity for geom step 38
3770
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3771
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4392
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4393
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3772
4394
refcount: 1>
 
4395
 
 
4396
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3773
4397
New grid distribution:   1
3774
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3775
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3776
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3777
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4398
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4399
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4400
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4401
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4402
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4403
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4404
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4405
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3778
4406
 
3779
4407
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3780
4408
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3781
4409
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3782
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4410
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3783
4411
New grid distribution:   2
3784
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3785
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3786
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3787
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4412
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4413
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4414
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4415
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4416
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4417
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4418
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4419
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3788
4420
New grid distribution:   3
3789
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3790
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3791
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3792
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4421
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4422
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4423
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4424
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4425
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4426
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4427
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4428
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3793
4429
Setting up quadratic distribution...
3794
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3795
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3796
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
3797
 
 
3798
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.119320
3799
 
 
3800
 
 
3801
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.119320
3802
 
 
 
4430
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4431
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4432
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32383
 
4433
 
 
4434
siesta: Eharris(eV) =   -6832.119320
 
4435
 
 
4436
 
 
4437
siesta: Eharris(eV) =   -6832.119320
 
4438
 
 
4439
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4440
Geom step, scf iteration, dmax:  38  1    0.862027
3803
4441
 
3804
4442
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4443
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3805
4444
 
3806
4445
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3807
4446
----------------------------------------
3808
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
4447
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
3809
4448
----------------------------------------
3810
4449
   Max    0.055203
3811
4450
   Res    0.019316    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3821
4460
        -0.001895   -0.030825   -0.001895
3822
4461
        -0.001895   -0.001895   -0.030825
3823
4462
 
3824
 
siesta: Pressure (static):         49.38815000  kBar
 
4463
siesta: Pressure (static):         49.38814808  kBar
3825
4464
 
3826
4465
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3827
4466
        -0.030831   -0.001899   -0.001899
3828
4467
        -0.001899   -0.030831   -0.001899
3829
4468
        -0.001899   -0.001899   -0.030831
3830
4469
 
3831
 
siesta: Pressure (total):         49.39657380  kBar
 
4470
siesta: Pressure (total):         49.39657189  kBar
3832
4471
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3833
4472
FIRE:     38    3.4749  18    0.0886      0.0063
3834
4473
 
3848
4487
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3849
4488
<dSpData1D:S at geom step 39
3850
4489
  <sparsity:sparsity for geom step 39
3851
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3852
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4490
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4491
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3853
4492
refcount: 1>
3854
 
New_DM. Step:    39
 
4493
new_DM -- step:    39
3855
4494
Initializing Density Matrix...
3856
 
DM after filling with atomic data:
3857
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4495
DM filled with atomic data:
 
4496
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3858
4497
  <sparsity:sparsity for geom step 39
3859
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3860
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4498
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4499
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3861
4500
refcount: 1>
 
4501
 
 
4502
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3862
4503
New grid distribution:   1
3863
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3864
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3865
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3866
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4504
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4505
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4506
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4507
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4508
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4509
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4510
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4511
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3867
4512
 
3868
4513
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3869
4514
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3870
4515
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3871
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4516
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3872
4517
New grid distribution:   2
3873
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3874
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3875
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3876
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4518
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4519
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4520
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4521
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4522
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4523
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4524
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4525
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3877
4526
New grid distribution:   3
3878
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3879
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3880
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3881
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4527
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4528
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4529
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4530
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4531
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4532
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4533
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4534
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3882
4535
Setting up quadratic distribution...
3883
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3884
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3885
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65348
3886
 
 
3887
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.120717
3888
 
 
3889
 
 
3890
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.120717
3891
 
 
 
4536
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4537
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4538
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32367
 
4539
 
 
4540
siesta: Eharris(eV) =   -6832.120716
 
4541
 
 
4542
 
 
4543
siesta: Eharris(eV) =   -6832.120716
 
4544
 
 
4545
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4546
Geom step, scf iteration, dmax:  39  1    0.861619
3892
4547
 
3893
4548
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4549
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3894
4550
 
3895
4551
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3896
4552
----------------------------------------
3897
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4553
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
3898
4554
----------------------------------------
3899
4555
   Max    0.043027
3900
4556
   Res    0.014524    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3910
4566
        -0.001814   -0.030795   -0.001814
3911
4567
        -0.001814   -0.001814   -0.030795
3912
4568
 
3913
 
siesta: Pressure (static):         49.34008391  kBar
 
4569
siesta: Pressure (static):         49.34008376  kBar
3914
4570
 
3915
4571
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
3916
4572
        -0.030801   -0.001818   -0.001818
3917
4573
        -0.001818   -0.030801   -0.001818
3918
4574
        -0.001818   -0.001818   -0.030801
3919
4575
 
3920
 
siesta: Pressure (total):         49.34899497  kBar
 
4576
siesta: Pressure (total):         49.34899483  kBar
3921
4577
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
3922
4578
FIRE:     39    3.8224  19    0.0878      0.0064
3923
4579
 
3937
4593
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
3938
4594
<dSpData1D:S at geom step 40
3939
4595
  <sparsity:sparsity for geom step 40
3940
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
3941
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4596
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4597
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
3942
4598
refcount: 1>
3943
 
New_DM. Step:    40
 
4599
new_DM -- step:    40
3944
4600
Initializing Density Matrix...
3945
 
DM after filling with atomic data:
3946
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4601
DM filled with atomic data:
 
4602
<dSpData2D:DM initialized from atoms
3947
4603
  <sparsity:sparsity for geom step 40
3948
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
3949
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4604
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4605
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
3950
4606
refcount: 1>
 
4607
 
 
4608
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3951
4609
New grid distribution:   1
3952
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3953
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3954
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3955
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4610
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4611
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4612
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4613
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4614
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4615
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4616
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4617
           8       1:   24   13:   24   19:   24
3956
4618
 
3957
4619
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
3958
4620
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
3959
4621
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
3960
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4622
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
3961
4623
New grid distribution:   2
3962
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3963
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3964
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3965
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4624
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4625
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4626
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4627
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4628
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4629
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4630
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4631
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3966
4632
New grid distribution:   3
3967
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
3968
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
3969
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
3970
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4633
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4634
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4635
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4636
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4637
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4638
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4639
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4640
           8       1:   12   13:   24    1:   12
3971
4641
Setting up quadratic distribution...
3972
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
3973
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
3974
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65348
3975
 
 
3976
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121054
3977
 
 
3978
 
 
3979
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121054
3980
 
 
 
4642
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4643
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4644
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32399
 
4645
 
 
4646
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121055
 
4647
 
 
4648
 
 
4649
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121055
 
4650
 
 
4651
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4652
Geom step, scf iteration, dmax:  40  1    0.861227
3981
4653
 
3982
4654
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4655
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
3983
4656
 
3984
4657
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
3985
4658
----------------------------------------
3986
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4659
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
3987
4660
----------------------------------------
3988
4661
   Max    0.037697
3989
4662
   Res    0.015130    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
3999
4672
        -0.001700   -0.030542   -0.001700
4000
4673
        -0.001700   -0.001700   -0.030542
4001
4674
 
4002
 
siesta: Pressure (static):         48.93362983  kBar
 
4675
siesta: Pressure (static):         48.93363066  kBar
4003
4676
 
4004
4677
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4005
4678
        -0.030547   -0.001704   -0.001704
4006
4679
        -0.001704   -0.030547   -0.001704
4007
4680
        -0.001704   -0.001704   -0.030547
4008
4681
 
4009
 
siesta: Pressure (total):         48.94256113  kBar
 
4682
siesta: Pressure (total):         48.94256197  kBar
4010
4683
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4011
4684
FIRE:     40    1.9112   0    0.1000      0.0000
4012
4685
 
4026
4699
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4027
4700
<dSpData1D:S at geom step 41
4028
4701
  <sparsity:sparsity for geom step 41
4029
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4030
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4702
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4703
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4031
4704
refcount: 1>
4032
 
New_DM. Step:    41
 
4705
new_DM -- step:    41
4033
4706
Initializing Density Matrix...
4034
 
DM after filling with atomic data:
4035
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4707
DM filled with atomic data:
 
4708
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4036
4709
  <sparsity:sparsity for geom step 41
4037
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4038
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4710
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4711
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4039
4712
refcount: 1>
 
4713
 
 
4714
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4040
4715
New grid distribution:   1
4041
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4042
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4043
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4044
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4716
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4717
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4718
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4719
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4720
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4721
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4722
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4723
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4045
4724
 
4046
4725
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4047
4726
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4048
4727
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4049
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4728
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4050
4729
New grid distribution:   2
4051
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4052
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4053
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4054
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4730
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4731
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4732
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4733
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4734
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4735
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4736
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4737
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4055
4738
New grid distribution:   3
4056
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4057
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4058
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4059
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4739
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4740
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4741
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4742
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4743
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4744
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4745
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4746
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4060
4747
Setting up quadratic distribution...
4061
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4062
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4063
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65348
4064
 
 
4065
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121205
4066
 
 
4067
 
 
4068
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121205
4069
 
 
 
4748
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4749
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4750
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32407
 
4751
 
 
4752
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121205
 
4753
 
 
4754
 
 
4755
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121205
 
4756
 
 
4757
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4758
Geom step, scf iteration, dmax:  41  1    0.861274
4070
4759
 
4071
4760
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4761
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4072
4762
 
4073
4763
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4074
4764
----------------------------------------
4075
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4765
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
4076
4766
----------------------------------------
4077
4767
   Max    0.035131
4078
4768
   Res    0.014224    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4088
4778
        -0.001709   -0.030537   -0.001709
4089
4779
        -0.001709   -0.001709   -0.030537
4090
4780
 
4091
 
siesta: Pressure (static):         48.92688165  kBar
 
4781
siesta: Pressure (static):         48.92688111  kBar
4092
4782
 
4093
4783
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4094
4784
        -0.030537   -0.001709   -0.001709
4095
4785
        -0.001709   -0.030537   -0.001709
4096
4786
        -0.001709   -0.001709   -0.030537
4097
4787
 
4098
 
siesta: Pressure (total):         48.92688165  kBar
 
4788
siesta: Pressure (total):         48.92688111  kBar
4099
4789
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4100
4790
FIRE:     41    1.9112   1    0.1000      0.0004
4101
4791
 
4115
4805
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4116
4806
<dSpData1D:S at geom step 42
4117
4807
  <sparsity:sparsity for geom step 42
4118
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4119
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4808
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4809
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4120
4810
refcount: 1>
4121
 
New_DM. Step:    42
 
4811
new_DM -- step:    42
4122
4812
Initializing Density Matrix...
4123
 
DM after filling with atomic data:
4124
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4813
DM filled with atomic data:
 
4814
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4125
4815
  <sparsity:sparsity for geom step 42
4126
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4127
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4816
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4817
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4128
4818
refcount: 1>
 
4819
 
 
4820
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4129
4821
New grid distribution:   1
4130
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4131
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4132
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4133
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4822
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4823
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4824
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4825
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4826
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4827
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4828
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4829
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4134
4830
 
4135
4831
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4136
4832
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4137
4833
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4138
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4834
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4139
4835
New grid distribution:   2
4140
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4141
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4142
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4143
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4836
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4837
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4838
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4839
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4840
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4841
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4842
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4843
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4144
4844
New grid distribution:   3
4145
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4146
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4147
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4148
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4845
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4846
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4847
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4848
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4849
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4850
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4851
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4852
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4149
4853
Setting up quadratic distribution...
4150
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4151
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4152
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
4153
 
 
4154
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121308
4155
 
 
4156
 
 
4157
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121308
4158
 
 
 
4854
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4855
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4856
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32407
 
4857
 
 
4858
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121309
 
4859
 
 
4860
 
 
4861
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121309
 
4862
 
 
4863
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4864
Geom step, scf iteration, dmax:  42  1    0.861308
4159
4865
 
4160
4866
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4867
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4161
4868
 
4162
4869
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4163
4870
----------------------------------------
4164
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
4871
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
4165
4872
----------------------------------------
4166
4873
   Max    0.033467
4167
4874
   Res    0.013609    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4177
4884
        -0.001715   -0.030532   -0.001715
4178
4885
        -0.001715   -0.001715   -0.030532
4179
4886
 
4180
 
siesta: Pressure (static):         48.91846892  kBar
 
4887
siesta: Pressure (static):         48.91846994  kBar
4181
4888
 
4182
4889
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4183
4890
        -0.030532   -0.001715   -0.001715
4184
4891
        -0.001715   -0.030532   -0.001715
4185
4892
        -0.001715   -0.001715   -0.030532
4186
4893
 
4187
 
siesta: Pressure (total):         48.91849933  kBar
 
4894
siesta: Pressure (total):         48.91850035  kBar
4188
4895
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4189
4896
FIRE:     42    1.9112   2    0.1000      0.0007
4190
4897
 
4204
4911
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4205
4912
<dSpData1D:S at geom step 43
4206
4913
  <sparsity:sparsity for geom step 43
4207
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4208
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
4914
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
4915
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4209
4916
refcount: 1>
4210
 
New_DM. Step:    43
 
4917
new_DM -- step:    43
4211
4918
Initializing Density Matrix...
4212
 
DM after filling with atomic data:
4213
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
4919
DM filled with atomic data:
 
4920
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4214
4921
  <sparsity:sparsity for geom step 43
4215
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4216
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
4922
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
4923
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4217
4924
refcount: 1>
 
4925
 
 
4926
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4218
4927
New grid distribution:   1
4219
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4220
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4221
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4222
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4928
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
4929
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
4930
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
4931
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
4932
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
4933
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
4934
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
4935
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4223
4936
 
4224
4937
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4225
4938
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4226
4939
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4227
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
4940
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4228
4941
New grid distribution:   2
4229
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4230
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4231
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4232
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4942
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4943
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4944
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4945
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4946
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4947
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4948
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4949
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4233
4950
New grid distribution:   3
4234
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4235
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4236
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4237
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
4951
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
4952
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
4953
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
4954
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
4955
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
4956
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
4957
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
4958
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4238
4959
Setting up quadratic distribution...
4239
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4240
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4241
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
4242
 
 
4243
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121466
4244
 
 
4245
 
 
4246
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121466
4247
 
 
 
4960
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
4961
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
4962
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32407
 
4963
 
 
4964
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121467
 
4965
 
 
4966
 
 
4967
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121467
 
4968
 
 
4969
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
4970
Geom step, scf iteration, dmax:  43  1    0.861364
4248
4971
 
4249
4972
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
4973
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4250
4974
 
4251
4975
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4252
4976
----------------------------------------
4253
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
4977
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
4254
4978
----------------------------------------
4255
4979
   Max    0.030601
4256
4980
   Res    0.012599    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4266
4990
        -0.001727   -0.030531   -0.001727
4267
4991
        -0.001727   -0.001727   -0.030531
4268
4992
 
4269
 
siesta: Pressure (static):         48.91604002  kBar
 
4993
siesta: Pressure (static):         48.91604254  kBar
4270
4994
 
4271
4995
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4272
4996
        -0.030531   -0.001727   -0.001727
4273
4997
        -0.001727   -0.030531   -0.001727
4274
4998
        -0.001727   -0.001727   -0.030531
4275
4999
 
4276
 
siesta: Pressure (total):         48.91615538  kBar
 
5000
siesta: Pressure (total):         48.91615790  kBar
4277
5001
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4278
5002
FIRE:     43    1.9112   3    0.1000      0.0010
4279
5003
 
4293
5017
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4294
5018
<dSpData1D:S at geom step 44
4295
5019
  <sparsity:sparsity for geom step 44
4296
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4297
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5020
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5021
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4298
5022
refcount: 1>
4299
 
New_DM. Step:    44
 
5023
new_DM -- step:    44
4300
5024
Initializing Density Matrix...
4301
 
DM after filling with atomic data:
4302
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5025
DM filled with atomic data:
 
5026
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4303
5027
  <sparsity:sparsity for geom step 44
4304
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4305
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5028
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5029
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4306
5030
refcount: 1>
 
5031
 
 
5032
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4307
5033
New grid distribution:   1
4308
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4309
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4310
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4311
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5034
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5035
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5036
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5037
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5038
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5039
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5040
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5041
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4312
5042
 
4313
5043
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4314
5044
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4315
5045
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4316
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5046
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4317
5047
New grid distribution:   2
4318
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4319
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4320
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4321
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5048
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5049
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5050
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5051
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5052
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5053
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5054
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5055
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4322
5056
New grid distribution:   3
4323
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4324
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4325
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4326
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5057
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5058
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5059
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5060
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5061
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5062
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5063
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5064
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4327
5065
Setting up quadratic distribution...
4328
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4329
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4330
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
4331
 
 
4332
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121662
4333
 
 
4334
 
 
4335
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121662
4336
 
 
 
5066
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5067
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5068
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32415
 
5069
 
 
5070
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121662
 
5071
 
 
5072
 
 
5073
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121662
 
5074
 
 
5075
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5076
Geom step, scf iteration, dmax:  44  1    0.861442
4337
5077
 
4338
5078
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5079
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4339
5080
 
4340
5081
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4341
5082
----------------------------------------
4342
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
5083
   Tot    0.000000    0.000000   -0.000000
4343
5084
----------------------------------------
4344
5085
   Max    0.027480
4345
5086
   Res    0.011488    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4355
5096
        -0.001742   -0.030519   -0.001742
4356
5097
        -0.001742   -0.001742   -0.030519
4357
5098
 
4358
 
siesta: Pressure (static):         48.89756087  kBar
 
5099
siesta: Pressure (static):         48.89756221  kBar
4359
5100
 
4360
5101
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4361
5102
        -0.030519   -0.001742   -0.001742
4362
5103
        -0.001742   -0.030519   -0.001742
4363
5104
        -0.001742   -0.001742   -0.030519
4364
5105
 
4365
 
siesta: Pressure (total):         48.89780590  kBar
 
5106
siesta: Pressure (total):         48.89780724  kBar
4366
5107
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4367
5108
FIRE:     44    1.9112   4    0.1000      0.0013
4368
5109
 
4382
5123
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4383
5124
<dSpData1D:S at geom step 45
4384
5125
  <sparsity:sparsity for geom step 45
4385
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4386
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5126
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5127
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4387
5128
refcount: 1>
4388
 
New_DM. Step:    45
 
5129
new_DM -- step:    45
4389
5130
Initializing Density Matrix...
4390
 
DM after filling with atomic data:
4391
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5131
DM filled with atomic data:
 
5132
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4392
5133
  <sparsity:sparsity for geom step 45
4393
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4394
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5134
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5135
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4395
5136
refcount: 1>
 
5137
 
 
5138
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4396
5139
New grid distribution:   1
4397
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4398
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4399
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4400
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5140
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5141
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5142
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5143
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5144
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5145
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5146
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5147
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4401
5148
 
4402
5149
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4403
5150
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4404
5151
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4405
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5152
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4406
5153
New grid distribution:   2
4407
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4408
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4409
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4410
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5154
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5155
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5156
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5157
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5158
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5159
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5160
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5161
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4411
5162
New grid distribution:   3
4412
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4413
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4414
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4415
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5163
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5164
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5165
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5166
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5167
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5168
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5169
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5170
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4416
5171
Setting up quadratic distribution...
4417
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4418
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4419
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65356
4420
 
 
4421
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121877
4422
 
 
4423
 
 
4424
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121877
4425
 
 
 
5172
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5173
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5174
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32423
 
5175
 
 
5176
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121876
 
5177
 
 
5178
 
 
5179
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121876
 
5180
 
 
5181
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5182
Geom step, scf iteration, dmax:  45  1    0.861539
4426
5183
 
4427
5184
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5185
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4428
5186
 
4429
5187
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4430
5188
----------------------------------------
4431
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
5189
   Tot   -0.000000   -0.000000    0.000000
4432
5190
----------------------------------------
4433
5191
   Max    0.022975
4434
5192
   Res    0.010132    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4444
5202
        -0.001756   -0.030513   -0.001756
4445
5203
        -0.001756   -0.001756   -0.030513
4446
5204
 
4447
 
siesta: Pressure (static):         48.88731256  kBar
 
5205
siesta: Pressure (static):         48.88731342  kBar
4448
5206
 
4449
5207
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4450
5208
        -0.030513   -0.001756   -0.001756
4451
5209
        -0.001756   -0.030513   -0.001756
4452
5210
        -0.001756   -0.001756   -0.030513
4453
5211
 
4454
 
siesta: Pressure (total):         48.88771824  kBar
 
5212
siesta: Pressure (total):         48.88771910  kBar
4455
5213
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4456
5214
FIRE:     45    1.9112   5    0.1000      0.0016
4457
5215
 
4471
5229
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4472
5230
<dSpData1D:S at geom step 46
4473
5231
  <sparsity:sparsity for geom step 46
4474
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4475
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5232
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5233
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4476
5234
refcount: 1>
4477
 
New_DM. Step:    46
 
5235
new_DM -- step:    46
4478
5236
Initializing Density Matrix...
4479
 
DM after filling with atomic data:
4480
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5237
DM filled with atomic data:
 
5238
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4481
5239
  <sparsity:sparsity for geom step 46
4482
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4483
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5240
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5241
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4484
5242
refcount: 1>
 
5243
 
 
5244
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4485
5245
New grid distribution:   1
4486
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4487
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4488
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4489
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5246
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5247
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5248
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5249
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5250
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5251
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5252
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5253
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4490
5254
 
4491
5255
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4492
5256
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4493
5257
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4494
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5258
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4495
5259
New grid distribution:   2
4496
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4497
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4498
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4499
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5260
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5261
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5262
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5263
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5264
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5265
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5266
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5267
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4500
5268
New grid distribution:   3
4501
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4502
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4503
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4504
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5269
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5270
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5271
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5272
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5273
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5274
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5275
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5276
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4505
5277
Setting up quadratic distribution...
4506
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4507
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4508
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65388
4509
 
 
4510
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121973
4511
 
 
4512
 
 
4513
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121973
4514
 
 
 
5278
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5279
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5280
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32415
 
5281
 
 
5282
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121972
 
5283
 
 
5284
 
 
5285
siesta: Eharris(eV) =   -6832.121972
 
5286
 
 
5287
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5288
Geom step, scf iteration, dmax:  46  1    0.861658
4515
5289
 
4516
5290
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5291
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4517
5292
 
4518
5293
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4519
5294
----------------------------------------
4520
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
5295
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
4521
5296
----------------------------------------
4522
5297
   Max    0.018810
4523
5298
   Res    0.008465    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4533
5308
        -0.001983   -0.030716   -0.001983
4534
5309
        -0.001983   -0.001983   -0.030716
4535
5310
 
4536
 
siesta: Pressure (static):         49.21266930  kBar
 
5311
siesta: Pressure (static):         49.21266799  kBar
4537
5312
 
4538
5313
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4539
5314
        -0.030716   -0.001983   -0.001983
4540
5315
        -0.001983   -0.030716   -0.001983
4541
5316
        -0.001983   -0.001983   -0.030716
4542
5317
 
4543
 
siesta: Pressure (total):         49.21324973  kBar
 
5318
siesta: Pressure (total):         49.21324843  kBar
4544
5319
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4545
5320
FIRE:     46    1.9112   6    0.1000      0.0017
4546
5321
 
4560
5335
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4561
5336
<dSpData1D:S at geom step 47
4562
5337
  <sparsity:sparsity for geom step 47
4563
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4564
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5338
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5339
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4565
5340
refcount: 1>
4566
 
New_DM. Step:    47
 
5341
new_DM -- step:    47
4567
5342
Initializing Density Matrix...
4568
 
DM after filling with atomic data:
4569
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5343
DM filled with atomic data:
 
5344
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4570
5345
  <sparsity:sparsity for geom step 47
4571
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4572
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5346
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5347
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4573
5348
refcount: 1>
 
5349
 
 
5350
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4574
5351
New grid distribution:   1
4575
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4576
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4577
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4578
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5352
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5353
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5354
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5355
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5356
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5357
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5358
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5359
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4579
5360
 
4580
5361
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4581
5362
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4582
5363
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4583
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5364
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4584
5365
New grid distribution:   2
4585
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4586
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4587
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4588
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5366
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5367
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5368
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5369
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5370
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5371
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5372
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5373
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4589
5374
New grid distribution:   3
4590
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4591
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4592
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4593
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5375
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5376
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5377
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5378
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5379
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5380
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5381
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5382
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4594
5383
Setting up quadratic distribution...
4595
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4596
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4597
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65396
4598
 
 
4599
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122048
4600
 
 
4601
 
 
4602
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122048
4603
 
 
 
5384
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5385
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5386
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32415
 
5387
 
 
5388
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122049
 
5389
 
 
5390
 
 
5391
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122049
 
5392
 
 
5393
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5394
Geom step, scf iteration, dmax:  47  1    0.861760
4604
5395
 
4605
5396
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5397
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4606
5398
 
4607
5399
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4608
5400
----------------------------------------
4609
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
5401
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
4610
5402
----------------------------------------
4611
5403
   Max    0.020910
4612
5404
   Res    0.008795    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4622
5414
        -0.001919   -0.030637   -0.001919
4623
5415
        -0.001919   -0.001919   -0.030637
4624
5416
 
4625
 
siesta: Pressure (static):         49.08688088  kBar
 
5417
siesta: Pressure (static):         49.08687907  kBar
4626
5418
 
4627
5419
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4628
5420
        -0.030638   -0.001919   -0.001919
4629
5421
        -0.001919   -0.030638   -0.001919
4630
5422
        -0.001919   -0.001919   -0.030638
4631
5423
 
4632
 
siesta: Pressure (total):         49.08749882  kBar
 
5424
siesta: Pressure (total):         49.08749701  kBar
4633
5425
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4634
5426
FIRE:     47    2.1023   7    0.0990      0.0017
4635
5427
 
4649
5441
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4650
5442
<dSpData1D:S at geom step 48
4651
5443
  <sparsity:sparsity for geom step 48
4652
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4653
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5444
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5445
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4654
5446
refcount: 1>
4655
 
New_DM. Step:    48
 
5447
new_DM -- step:    48
4656
5448
Initializing Density Matrix...
4657
 
DM after filling with atomic data:
4658
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5449
DM filled with atomic data:
 
5450
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4659
5451
  <sparsity:sparsity for geom step 48
4660
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4661
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5452
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5453
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4662
5454
refcount: 1>
 
5455
 
 
5456
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4663
5457
New grid distribution:   1
4664
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4665
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4666
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4667
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5458
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5459
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5460
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5461
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5462
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5463
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5464
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5465
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4668
5466
 
4669
5467
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4670
5468
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4671
5469
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4672
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5470
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4673
5471
New grid distribution:   2
4674
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4675
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4676
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4677
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5472
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5473
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5474
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5475
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5476
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5477
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5478
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5479
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4678
5480
New grid distribution:   3
4679
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4680
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4681
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4682
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5481
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5482
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5483
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5484
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5485
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5486
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5487
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5488
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4683
5489
Setting up quadratic distribution...
4684
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4685
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4686
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65404
4687
 
 
4688
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122141
4689
 
 
4690
 
 
4691
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122141
4692
 
 
 
5490
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5491
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5492
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32415
 
5493
 
 
5494
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122140
 
5495
 
 
5496
 
 
5497
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122140
 
5498
 
 
5499
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5500
Geom step, scf iteration, dmax:  48  1    0.861853
4693
5501
 
4694
5502
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5503
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4695
5504
 
4696
5505
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4697
5506
----------------------------------------
4698
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
5507
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
4699
5508
----------------------------------------
4700
5509
   Max    0.022244
4701
5510
   Res    0.008840    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4711
5520
        -0.001929   -0.030622   -0.001929
4712
5521
        -0.001929   -0.001929   -0.030622
4713
5522
 
4714
 
siesta: Pressure (static):         49.06218756  kBar
 
5523
siesta: Pressure (static):         49.06218401  kBar
4715
5524
 
4716
5525
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4717
5526
        -0.030622   -0.001929   -0.001929
4718
5527
        -0.001929   -0.030622   -0.001929
4719
5528
        -0.001929   -0.001929   -0.030622
4720
5529
 
4721
 
siesta: Pressure (total):         49.06278768  kBar
 
5530
siesta: Pressure (total):         49.06278413  kBar
4722
5531
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4723
5532
FIRE:     48    2.3126   8    0.0980      0.0017
4724
5533
 
4738
5547
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4739
5548
<dSpData1D:S at geom step 49
4740
5549
  <sparsity:sparsity for geom step 49
4741
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4742
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5550
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5551
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4743
5552
refcount: 1>
4744
 
New_DM. Step:    49
 
5553
new_DM -- step:    49
4745
5554
Initializing Density Matrix...
4746
 
DM after filling with atomic data:
4747
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5555
DM filled with atomic data:
 
5556
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4748
5557
  <sparsity:sparsity for geom step 49
4749
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4750
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5558
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5559
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4751
5560
refcount: 1>
 
5561
 
 
5562
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4752
5563
New grid distribution:   1
4753
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4754
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4755
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4756
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5564
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5565
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5566
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5567
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5568
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5569
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5570
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5571
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4757
5572
 
4758
5573
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4759
5574
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4760
5575
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4761
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5576
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4762
5577
New grid distribution:   2
4763
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4764
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4765
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4766
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5578
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5579
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5580
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5581
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5582
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5583
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5584
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5585
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4767
5586
New grid distribution:   3
4768
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4769
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4770
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4771
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5587
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5588
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5589
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5590
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5591
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5592
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5593
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5594
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4772
5595
Setting up quadratic distribution...
4773
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4774
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4775
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65416
4776
 
 
4777
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122260
4778
 
 
4779
 
 
4780
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122260
4781
 
 
 
5596
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5597
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5598
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32431
 
5599
 
 
5600
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122262
 
5601
 
 
5602
 
 
5603
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122262
 
5604
 
 
5605
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5606
Geom step, scf iteration, dmax:  49  1    0.861935
4782
5607
 
4783
5608
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5609
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4784
5610
 
4785
5611
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4786
5612
----------------------------------------
4787
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
5613
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
4788
5614
----------------------------------------
4789
5615
   Max    0.021977
4790
5616
   Res    0.008532    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4800
5626
        -0.001931   -0.030607   -0.001931
4801
5627
        -0.001931   -0.001931   -0.030607
4802
5628
 
4803
 
siesta: Pressure (static):         49.03891069  kBar
 
5629
siesta: Pressure (static):         49.03891478  kBar
4804
5630
 
4805
5631
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4806
5632
        -0.030608   -0.001931   -0.001931
4807
5633
        -0.001931   -0.030608   -0.001931
4808
5634
        -0.001931   -0.001931   -0.030608
4809
5635
 
4810
 
siesta: Pressure (total):         49.03951851  kBar
 
5636
siesta: Pressure (total):         49.03952259  kBar
4811
5637
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4812
5638
FIRE:     49    2.5438   9    0.0970      0.0017
4813
5639
 
4827
5653
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4828
5654
<dSpData1D:S at geom step 50
4829
5655
  <sparsity:sparsity for geom step 50
4830
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4831
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5656
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5657
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4832
5658
refcount: 1>
4833
 
New_DM. Step:    50
 
5659
new_DM -- step:    50
4834
5660
Initializing Density Matrix...
4835
 
DM after filling with atomic data:
4836
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5661
DM filled with atomic data:
 
5662
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4837
5663
  <sparsity:sparsity for geom step 50
4838
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4839
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5664
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5665
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4840
5666
refcount: 1>
 
5667
 
 
5668
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4841
5669
New grid distribution:   1
4842
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4843
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4844
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4845
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5670
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5671
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5672
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5673
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5674
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5675
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5676
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5677
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4846
5678
 
4847
5679
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4848
5680
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4849
5681
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4850
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5682
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4851
5683
New grid distribution:   2
4852
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4853
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4854
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4855
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5684
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5685
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5686
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5687
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5688
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5689
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5690
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5691
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4856
5692
New grid distribution:   3
4857
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4858
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4859
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4860
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5693
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5694
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5695
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5696
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5697
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5698
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5699
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5700
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4861
5701
Setting up quadratic distribution...
4862
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4863
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4864
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65448
4865
 
 
4866
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122395
4867
 
 
4868
 
 
4869
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122395
4870
 
 
 
5702
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5703
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5704
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32423
 
5705
 
 
5706
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122396
 
5707
 
 
5708
 
 
5709
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122396
 
5710
 
 
5711
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5712
Geom step, scf iteration, dmax:  50  1    0.862004
4871
5713
 
4872
5714
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5715
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4873
5716
 
4874
5717
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4875
5718
----------------------------------------
4889
5732
        -0.002036   -0.030708   -0.002036
4890
5733
        -0.002036   -0.002036   -0.030708
4891
5734
 
4892
 
siesta: Pressure (static):         49.20053473  kBar
 
5735
siesta: Pressure (static):         49.20053569  kBar
4893
5736
 
4894
5737
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4895
5738
        -0.030709   -0.002036   -0.002036
4896
5739
        -0.002036   -0.030709   -0.002036
4897
5740
        -0.002036   -0.002036   -0.030709
4898
5741
 
4899
 
siesta: Pressure (total):         49.20118238  kBar
 
5742
siesta: Pressure (total):         49.20118334  kBar
4900
5743
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4901
5744
FIRE:     50    2.7982  10    0.0961      0.0018
4902
5745
 
4916
5759
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
4917
5760
<dSpData1D:S at geom step 51
4918
5761
  <sparsity:sparsity for geom step 51
4919
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
4920
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5762
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5763
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
4921
5764
refcount: 1>
4922
 
New_DM. Step:    51
 
5765
new_DM -- step:    51
4923
5766
Initializing Density Matrix...
4924
 
DM after filling with atomic data:
4925
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5767
DM filled with atomic data:
 
5768
<dSpData2D:DM initialized from atoms
4926
5769
  <sparsity:sparsity for geom step 51
4927
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
4928
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5770
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5771
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
4929
5772
refcount: 1>
 
5773
 
 
5774
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4930
5775
New grid distribution:   1
4931
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4932
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4933
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4934
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5776
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5777
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5778
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5779
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5780
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5781
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5782
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5783
           8       1:   24   13:   24   19:   24
4935
5784
 
4936
5785
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
4937
5786
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
4938
5787
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
4939
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5788
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
4940
5789
New grid distribution:   2
4941
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4942
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4943
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4944
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5790
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5791
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5792
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5793
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5794
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5795
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5796
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5797
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4945
5798
New grid distribution:   3
4946
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
4947
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
4948
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
4949
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5799
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5800
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5801
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5802
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5803
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5804
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5805
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5806
           8       1:   12   13:   24    1:   12
4950
5807
Setting up quadratic distribution...
4951
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
4952
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
4953
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65472
4954
 
 
4955
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122540
4956
 
 
4957
 
 
4958
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122540
4959
 
 
 
5808
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5809
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5810
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32423
 
5811
 
 
5812
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122541
 
5813
 
 
5814
 
 
5815
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122541
 
5816
 
 
5817
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5818
Geom step, scf iteration, dmax:  51  1    0.862060
4960
5819
 
4961
5820
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5821
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
4962
5822
 
4963
5823
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
4964
5824
----------------------------------------
4965
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
5825
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
4966
5826
----------------------------------------
4967
5827
   Max    0.018142
4968
5828
   Res    0.007885    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
4978
5838
        -0.002015   -0.030690   -0.002015
4979
5839
        -0.002015   -0.002015   -0.030690
4980
5840
 
4981
 
siesta: Pressure (static):         49.17096706  kBar
 
5841
siesta: Pressure (static):         49.17097055  kBar
4982
5842
 
4983
5843
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
4984
5844
        -0.030690   -0.002015   -0.002015
4985
5845
        -0.002015   -0.030690   -0.002015
4986
5846
        -0.002015   -0.002015   -0.030690
4987
5847
 
4988
 
siesta: Pressure (total):         49.17164985  kBar
 
5848
siesta: Pressure (total):         49.17165335  kBar
4989
5849
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
4990
5850
FIRE:     51    3.0780  11    0.0951      0.0018
4991
5851
 
5005
5865
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5006
5866
<dSpData1D:S at geom step 52
5007
5867
  <sparsity:sparsity for geom step 52
5008
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5009
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5868
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5869
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5010
5870
refcount: 1>
5011
 
New_DM. Step:    52
 
5871
new_DM -- step:    52
5012
5872
Initializing Density Matrix...
5013
 
DM after filling with atomic data:
5014
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5873
DM filled with atomic data:
 
5874
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5015
5875
  <sparsity:sparsity for geom step 52
5016
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5017
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5876
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5877
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5018
5878
refcount: 1>
 
5879
 
 
5880
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5019
5881
New grid distribution:   1
5020
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5021
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5022
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5023
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5882
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5883
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5884
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5885
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5886
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5887
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5888
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5889
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5024
5890
 
5025
5891
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5026
5892
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5027
5893
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5028
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
5894
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5029
5895
New grid distribution:   2
5030
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5031
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5032
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5033
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5896
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5897
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5898
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5899
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5900
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5901
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5902
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5903
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5034
5904
New grid distribution:   3
5035
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5036
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5037
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5038
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5905
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
5906
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
5907
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
5908
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
5909
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
5910
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
5911
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
5912
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5039
5913
Setting up quadratic distribution...
5040
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5041
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5042
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65472
5043
 
 
5044
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122714
5045
 
 
5046
 
 
5047
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122714
5048
 
 
 
5914
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
5915
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
5916
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32427
 
5917
 
 
5918
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122713
 
5919
 
 
5920
 
 
5921
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122713
 
5922
 
 
5923
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
5924
Geom step, scf iteration, dmax:  52  1    0.862106
5049
5925
 
5050
5926
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
5927
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5051
5928
 
5052
5929
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5053
5930
----------------------------------------
5054
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
5931
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5055
5932
----------------------------------------
5056
5933
   Max    0.017616
5057
5934
   Res    0.007375    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5067
5944
        -0.001980   -0.030683   -0.001980
5068
5945
        -0.001980   -0.001980   -0.030683
5069
5946
 
5070
 
siesta: Pressure (static):         49.15949117  kBar
 
5947
siesta: Pressure (static):         49.15949217  kBar
5071
5948
 
5072
5949
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5073
5950
        -0.030683   -0.001980   -0.001980
5074
5951
        -0.001980   -0.030683   -0.001980
5075
5952
        -0.001980   -0.001980   -0.030683
5076
5953
 
5077
 
siesta: Pressure (total):         49.16022793  kBar
 
5954
siesta: Pressure (total):         49.16022892  kBar
5078
5955
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5079
5956
FIRE:     52    3.3858  12    0.0941      0.0019
5080
5957
 
5094
5971
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5095
5972
<dSpData1D:S at geom step 53
5096
5973
  <sparsity:sparsity for geom step 53
5097
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5098
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
5974
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
5975
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5099
5976
refcount: 1>
5100
 
New_DM. Step:    53
 
5977
new_DM -- step:    53
5101
5978
Initializing Density Matrix...
5102
 
DM after filling with atomic data:
5103
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
5979
DM filled with atomic data:
 
5980
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5104
5981
  <sparsity:sparsity for geom step 53
5105
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5106
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
5982
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
5983
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5107
5984
refcount: 1>
 
5985
 
 
5986
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5108
5987
New grid distribution:   1
5109
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5110
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5111
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5112
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
5988
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
5989
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
5990
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
5991
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
5992
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
5993
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
5994
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
5995
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5113
5996
 
5114
5997
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5115
5998
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5116
5999
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5117
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6000
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5118
6001
New grid distribution:   2
5119
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5120
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5121
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5122
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6002
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6003
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6004
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6005
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6006
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6007
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6008
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6009
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5123
6010
New grid distribution:   3
5124
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5125
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5126
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5127
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6011
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6012
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6013
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6014
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6015
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6016
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6017
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6018
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5128
6019
Setting up quadratic distribution...
5129
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5130
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5131
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65456
5132
 
 
5133
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122899
5134
 
 
5135
 
 
5136
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122899
5137
 
 
 
6020
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6021
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6022
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32435
 
6023
 
 
6024
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122898
 
6025
 
 
6026
 
 
6027
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122898
 
6028
 
 
6029
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6030
Geom step, scf iteration, dmax:  53  1    0.862153
5138
6031
 
5139
6032
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6033
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5140
6034
 
5141
6035
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5142
6036
----------------------------------------
5143
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6037
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5144
6038
----------------------------------------
5145
6039
   Max    0.018835
5146
6040
   Res    0.007853    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5156
6050
        -0.001975   -0.030598   -0.001975
5157
6051
        -0.001975   -0.001975   -0.030598
5158
6052
 
5159
 
siesta: Pressure (static):         49.02349979  kBar
 
6053
siesta: Pressure (static):         49.02350081  kBar
5160
6054
 
5161
6055
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5162
6056
        -0.030598   -0.001975   -0.001975
5163
6057
        -0.001975   -0.030598   -0.001975
5164
6058
        -0.001975   -0.001975   -0.030598
5165
6059
 
5166
 
siesta: Pressure (total):         49.02431040  kBar
 
6060
siesta: Pressure (total):         49.02431143  kBar
5167
6061
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5168
6062
FIRE:     53    3.7244  13    0.0932      0.0020
5169
6063
 
5183
6077
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5184
6078
<dSpData1D:S at geom step 54
5185
6079
  <sparsity:sparsity for geom step 54
5186
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5187
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6080
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6081
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5188
6082
refcount: 1>
5189
 
New_DM. Step:    54
 
6083
new_DM -- step:    54
5190
6084
Initializing Density Matrix...
5191
 
DM after filling with atomic data:
5192
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6085
DM filled with atomic data:
 
6086
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5193
6087
  <sparsity:sparsity for geom step 54
5194
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5195
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6088
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6089
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5196
6090
refcount: 1>
 
6091
 
 
6092
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5197
6093
New grid distribution:   1
5198
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5199
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5200
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5201
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6094
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6095
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6096
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6097
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6098
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6099
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6100
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6101
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5202
6102
 
5203
6103
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5204
6104
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5205
6105
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5206
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6106
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5207
6107
New grid distribution:   2
5208
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5209
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5210
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5211
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6108
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6109
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6110
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6111
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6112
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6113
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6114
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6115
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5212
6116
New grid distribution:   3
5213
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5214
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5215
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5216
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6117
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6118
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6119
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6120
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6121
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6122
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6123
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6124
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5217
6125
Setting up quadratic distribution...
5218
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5219
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5220
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65448
5221
 
 
5222
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122915
5223
 
 
5224
 
 
5225
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122915
5226
 
 
 
6126
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6127
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6128
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32435
 
6129
 
 
6130
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122914
 
6131
 
 
6132
 
 
6133
siesta: Eharris(eV) =   -6832.122914
 
6134
 
 
6135
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6136
Geom step, scf iteration, dmax:  54  1    0.862190
5227
6137
 
5228
6138
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6139
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5229
6140
 
5230
6141
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5231
6142
----------------------------------------
5232
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6143
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5233
6144
----------------------------------------
5234
6145
   Max    0.029426
5235
 
   Res    0.012417    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
 
6146
   Res    0.012418    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5236
6147
----------------------------------------
5237
6148
   Max    0.029426    constrained
5238
6149
 
5245
6156
        -0.001614   -0.030441   -0.001614
5246
6157
        -0.001614   -0.001614   -0.030441
5247
6158
 
5248
 
siesta: Pressure (static):         48.77306588  kBar
 
6159
siesta: Pressure (static):         48.77306421  kBar
5249
6160
 
5250
6161
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5251
6162
        -0.030442   -0.001615   -0.001615
5252
6163
        -0.001615   -0.030442   -0.001615
5253
6164
        -0.001615   -0.001615   -0.030442
5254
6165
 
5255
 
siesta: Pressure (total):         48.77394760  kBar
 
6166
siesta: Pressure (total):         48.77394593  kBar
5256
6167
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5257
6168
FIRE:     54    4.0969  14    0.0923      0.0020
5258
6169
 
5272
6183
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5273
6184
<dSpData1D:S at geom step 55
5274
6185
  <sparsity:sparsity for geom step 55
5275
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5276
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6186
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6187
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5277
6188
refcount: 1>
5278
 
New_DM. Step:    55
 
6189
new_DM -- step:    55
5279
6190
Initializing Density Matrix...
5280
 
DM after filling with atomic data:
5281
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6191
DM filled with atomic data:
 
6192
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5282
6193
  <sparsity:sparsity for geom step 55
5283
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5284
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6194
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6195
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5285
6196
refcount: 1>
 
6197
 
 
6198
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5286
6199
New grid distribution:   1
5287
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5288
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5289
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5290
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6200
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6201
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6202
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6203
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6204
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6205
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6206
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6207
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5291
6208
 
5292
6209
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5293
6210
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5294
6211
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5295
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6212
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5296
6213
New grid distribution:   2
5297
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5298
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5299
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5300
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6214
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6215
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6216
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6217
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6218
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6219
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6220
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6221
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5301
6222
New grid distribution:   3
5302
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5303
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5304
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5305
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6223
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6224
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6225
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6226
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6227
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6228
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6229
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6230
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5306
6231
Setting up quadratic distribution...
5307
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5308
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5309
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65452
5310
 
 
5311
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123113
5312
 
 
5313
 
 
5314
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123113
5315
 
 
 
6232
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6233
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6234
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
6235
 
 
6236
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123113
 
6237
 
 
6238
 
 
6239
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123113
 
6240
 
 
6241
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6242
Geom step, scf iteration, dmax:  55  1    0.862346
5316
6243
 
5317
6244
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6245
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5318
6246
 
5319
6247
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5320
6248
----------------------------------------
5321
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6249
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5322
6250
----------------------------------------
5323
6251
   Max    0.026824
5324
6252
   Res    0.011675    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5334
6262
        -0.001587   -0.030409   -0.001587
5335
6263
        -0.001587   -0.001587   -0.030409
5336
6264
 
5337
 
siesta: Pressure (static):         48.72080340  kBar
 
6265
siesta: Pressure (static):         48.72080573  kBar
5338
6266
 
5339
6267
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5340
6268
        -0.030409   -0.001587   -0.001587
5341
6269
        -0.001587   -0.030409   -0.001587
5342
6270
        -0.001587   -0.001587   -0.030409
5343
6271
 
5344
 
siesta: Pressure (total):         48.72164547  kBar
 
6272
siesta: Pressure (total):         48.72164780  kBar
5345
6273
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5346
6274
FIRE:     55    4.5066  15    0.0914      0.0021
5347
6275
 
5361
6289
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5362
6290
<dSpData1D:S at geom step 56
5363
6291
  <sparsity:sparsity for geom step 56
5364
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5365
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6292
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6293
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5366
6294
refcount: 1>
5367
 
New_DM. Step:    56
 
6295
new_DM -- step:    56
5368
6296
Initializing Density Matrix...
5369
 
DM after filling with atomic data:
5370
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6297
DM filled with atomic data:
 
6298
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5371
6299
  <sparsity:sparsity for geom step 56
5372
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5373
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6300
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6301
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5374
6302
refcount: 1>
 
6303
 
 
6304
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5375
6305
New grid distribution:   1
5376
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5377
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5378
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5379
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6306
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6307
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6308
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6309
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6310
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6311
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6312
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6313
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5380
6314
 
5381
6315
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5382
6316
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5383
6317
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5384
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6318
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5385
6319
New grid distribution:   2
5386
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5387
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5388
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5389
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6320
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6321
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6322
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6323
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6324
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6325
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6326
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6327
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5390
6328
New grid distribution:   3
5391
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5392
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5393
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5394
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6329
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6330
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6331
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6332
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6333
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6334
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6335
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6336
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5395
6337
Setting up quadratic distribution...
5396
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5397
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5398
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65384
5399
 
 
5400
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123498
5401
 
 
5402
 
 
5403
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123498
5404
 
 
 
6338
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6339
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6340
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
6341
 
 
6342
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123496
 
6343
 
 
6344
 
 
6345
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123496
 
6346
 
 
6347
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6348
Geom step, scf iteration, dmax:  56  1    0.862642
5405
6349
 
5406
6350
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6351
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5407
6352
 
5408
6353
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5409
6354
----------------------------------------
5410
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
6355
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
5411
6356
----------------------------------------
5412
6357
   Max    0.017112
5413
6358
   Res    0.008158    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5415
6360
   Max    0.017112    constrained
5416
6361
 
5417
6362
Stress-tensor-Voigt (kbar):      -48.67      -48.67      -48.67       -2.68       -2.68       -2.68
5418
 
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6791.9609
 
6363
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6791.9608
5419
6364
Target enthalpy (eV/cell)    -6830.8686
5420
6365
 
5421
6366
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
5423
6368
        -0.001675   -0.030377   -0.001675
5424
6369
        -0.001675   -0.001675   -0.030377
5425
6370
 
5426
 
siesta: Pressure (static):         48.66917693  kBar
 
6371
siesta: Pressure (static):         48.66918034  kBar
5427
6372
 
5428
6373
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5429
6374
        -0.030377   -0.001675   -0.001675
5430
6375
        -0.001675   -0.030377   -0.001675
5431
6376
        -0.001675   -0.001675   -0.030377
5432
6377
 
5433
 
siesta: Pressure (total):         48.67009268  kBar
 
6378
siesta: Pressure (total):         48.67009609  kBar
5434
6379
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5435
6380
FIRE:     56    4.9572  16    0.0904      0.0023
5436
6381
 
5450
6395
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5451
6396
<dSpData1D:S at geom step 57
5452
6397
  <sparsity:sparsity for geom step 57
5453
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5454
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6398
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6399
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5455
6400
refcount: 1>
5456
 
New_DM. Step:    57
 
6401
new_DM -- step:    57
5457
6402
Initializing Density Matrix...
5458
 
DM after filling with atomic data:
5459
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6403
DM filled with atomic data:
 
6404
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5460
6405
  <sparsity:sparsity for geom step 57
5461
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5462
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6406
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6407
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5463
6408
refcount: 1>
 
6409
 
 
6410
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5464
6411
New grid distribution:   1
5465
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5466
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5467
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5468
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6412
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6413
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6414
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6415
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6416
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6417
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6418
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6419
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5469
6420
 
5470
6421
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5471
6422
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5472
6423
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5473
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6424
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5474
6425
New grid distribution:   2
5475
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5476
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5477
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5478
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6426
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6427
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6428
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6429
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6430
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6431
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6432
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6433
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5479
6434
New grid distribution:   3
5480
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5481
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5482
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5483
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6435
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6436
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6437
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6438
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6439
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6440
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6441
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6442
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5484
6443
Setting up quadratic distribution...
5485
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5486
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5487
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65304
5488
 
 
5489
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123690
5490
 
 
5491
 
 
5492
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123690
5493
 
 
 
6444
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6445
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6446
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32443
 
6447
 
 
6448
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123689
 
6449
 
 
6450
 
 
6451
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123689
 
6452
 
 
6453
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6454
Geom step, scf iteration, dmax:  57  1    0.863072
5494
6455
 
5495
6456
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6457
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5496
6458
 
5497
6459
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5498
6460
----------------------------------------
5499
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6461
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
5500
6462
----------------------------------------
5501
6463
   Max    0.031394
5502
6464
   Res    0.011772    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5512
6474
        -0.002010   -0.030795   -0.002010
5513
6475
        -0.002010   -0.002010   -0.030795
5514
6476
 
5515
 
siesta: Pressure (static):         49.34034753  kBar
 
6477
siesta: Pressure (static):         49.34034538  kBar
5516
6478
 
5517
6479
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5518
6480
        -0.030796   -0.002010   -0.002010
5519
6481
        -0.002010   -0.030796   -0.002010
5520
6482
        -0.002010   -0.002010   -0.030796
5521
6483
 
5522
 
siesta: Pressure (total):         49.34150615  kBar
 
6484
siesta: Pressure (total):         49.34150400  kBar
5523
6485
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5524
6486
FIRE:     57    5.4529  17    0.0895      0.0024
5525
6487
 
5539
6501
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5540
6502
<dSpData1D:S at geom step 58
5541
6503
  <sparsity:sparsity for geom step 58
5542
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5543
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6504
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6505
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5544
6506
refcount: 1>
5545
 
New_DM. Step:    58
 
6507
new_DM -- step:    58
5546
6508
Initializing Density Matrix...
5547
 
DM after filling with atomic data:
5548
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6509
DM filled with atomic data:
 
6510
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5549
6511
  <sparsity:sparsity for geom step 58
5550
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5551
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6512
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6513
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5552
6514
refcount: 1>
 
6515
 
 
6516
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5553
6517
New grid distribution:   1
5554
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5555
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5556
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5557
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6518
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6519
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6520
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6521
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6522
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6523
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6524
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6525
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5558
6526
 
5559
6527
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5560
6528
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5561
6529
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5562
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6530
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5563
6531
New grid distribution:   2
5564
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5565
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5566
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5567
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6532
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6533
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6534
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6535
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6536
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6537
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6538
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6539
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5568
6540
New grid distribution:   3
5569
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5570
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5571
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5572
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6541
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6542
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6543
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6544
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6545
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6546
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6547
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6548
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5573
6549
Setting up quadratic distribution...
5574
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5575
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5576
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65296
5577
 
 
5578
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123920
5579
 
 
5580
 
 
5581
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123920
5582
 
 
 
6550
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6551
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6552
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32419
 
6553
 
 
6554
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123921
 
6555
 
 
6556
 
 
6557
siesta: Eharris(eV) =   -6832.123921
 
6558
 
 
6559
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6560
Geom step, scf iteration, dmax:  58  1    0.863403
5583
6561
 
5584
6562
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6563
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5585
6564
 
5586
6565
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5587
6566
----------------------------------------
5588
 
   Tot   -0.000000    0.000000    0.000000
 
6567
   Tot    0.000000   -0.000000   -0.000000
5589
6568
----------------------------------------
5590
6569
   Max    0.042014
5591
6570
   Res    0.013859    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5601
6580
        -0.002073   -0.030757   -0.002073
5602
6581
        -0.002073   -0.002073   -0.030757
5603
6582
 
5604
 
siesta: Pressure (static):         49.27907109  kBar
 
6583
siesta: Pressure (static):         49.27907397  kBar
5605
6584
 
5606
6585
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5607
6586
        -0.030758   -0.002073   -0.002073
5608
6587
        -0.002073   -0.030758   -0.002073
5609
6588
        -0.002073   -0.002073   -0.030758
5610
6589
 
5611
 
siesta: Pressure (total):         49.28020318  kBar
 
6590
siesta: Pressure (total):         49.28020606  kBar
5612
6591
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5613
6592
FIRE:     58    5.9982  18    0.0886      0.0024
5614
6593
 
5628
6607
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5629
6608
<dSpData1D:S at geom step 59
5630
6609
  <sparsity:sparsity for geom step 59
5631
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5632
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6610
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6611
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5633
6612
refcount: 1>
5634
 
New_DM. Step:    59
 
6613
new_DM -- step:    59
5635
6614
Initializing Density Matrix...
5636
 
DM after filling with atomic data:
5637
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6615
DM filled with atomic data:
 
6616
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5638
6617
  <sparsity:sparsity for geom step 59
5639
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5640
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6618
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6619
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5641
6620
refcount: 1>
 
6621
 
 
6622
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5642
6623
New grid distribution:   1
5643
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5644
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5645
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5646
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6624
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6625
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6626
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6627
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6628
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6629
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6630
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6631
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5647
6632
 
5648
6633
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5649
6634
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5650
6635
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5651
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6636
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5652
6637
New grid distribution:   2
5653
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5654
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5655
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5656
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6638
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6639
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6640
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6641
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6642
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6643
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6644
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6645
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5657
6646
New grid distribution:   3
5658
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5659
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5660
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5661
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6647
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6648
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6649
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6650
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6651
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6652
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6653
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6654
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5662
6655
Setting up quadratic distribution...
5663
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5664
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5665
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65260
5666
 
 
5667
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124303
5668
 
 
5669
 
 
5670
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124303
5671
 
 
 
6656
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6657
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6658
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32427
 
6659
 
 
6660
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124301
 
6661
 
 
6662
 
 
6663
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124301
 
6664
 
 
6665
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6666
Geom step, scf iteration, dmax:  59  1    0.863467
5672
6667
 
5673
6668
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6669
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5674
6670
 
5675
6671
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5676
6672
----------------------------------------
5677
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
6673
   Tot    0.000000   -0.000000    0.000000
5678
6674
----------------------------------------
5679
6675
   Max    0.011894
5680
6676
   Res    0.005340    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5690
6686
        -0.001735   -0.030693   -0.001735
5691
6687
        -0.001735   -0.001735   -0.030693
5692
6688
 
5693
 
siesta: Pressure (static):         49.17686298  kBar
 
6689
siesta: Pressure (static):         49.17686194  kBar
5694
6690
 
5695
6691
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5696
6692
        -0.030694   -0.001735   -0.001735
5697
6693
        -0.001735   -0.030694   -0.001735
5698
6694
        -0.001735   -0.001735   -0.030694
5699
6695
 
5700
 
siesta: Pressure (total):         49.17807755  kBar
 
6696
siesta: Pressure (total):         49.17807651  kBar
5701
6697
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5702
6698
FIRE:     59    6.5981  19    0.0878      0.0025
5703
6699
 
5717
6713
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5718
6714
<dSpData1D:S at geom step 60
5719
6715
  <sparsity:sparsity for geom step 60
5720
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5721
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6716
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6717
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5722
6718
refcount: 1>
5723
 
New_DM. Step:    60
 
6719
new_DM -- step:    60
5724
6720
Initializing Density Matrix...
5725
 
DM after filling with atomic data:
5726
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6721
DM filled with atomic data:
 
6722
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5727
6723
  <sparsity:sparsity for geom step 60
5728
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5729
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6724
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6725
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5730
6726
refcount: 1>
 
6727
 
 
6728
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5731
6729
New grid distribution:   1
5732
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5733
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5734
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5735
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6730
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6731
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6732
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6733
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6734
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6735
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6736
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6737
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5736
6738
 
5737
6739
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5738
6740
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5739
6741
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5740
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6742
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5741
6743
New grid distribution:   2
5742
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5743
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5744
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5745
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6744
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6745
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6746
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6747
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6748
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6749
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6750
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6751
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5746
6752
New grid distribution:   3
5747
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5748
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5749
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5750
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6753
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6754
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6755
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6756
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6757
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6758
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6759
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6760
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5751
6761
Setting up quadratic distribution...
5752
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5753
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5754
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65220
5755
 
 
5756
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124490
5757
 
 
5758
 
 
5759
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124490
5760
 
 
 
6762
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6763
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6764
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32419
 
6765
 
 
6766
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124490
 
6767
 
 
6768
 
 
6769
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124490
 
6770
 
 
6771
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6772
Geom step, scf iteration, dmax:  60  1    0.863463
5761
6773
 
5762
6774
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6775
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5763
6776
 
5764
6777
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5765
6778
----------------------------------------
5766
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6779
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5767
6780
----------------------------------------
5768
 
   Max    0.014834
 
6781
   Max    0.014835
5769
6782
   Res    0.006528    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5770
6783
----------------------------------------
5771
 
   Max    0.014834    constrained
 
6784
   Max    0.014835    constrained
5772
6785
 
5773
6786
Stress-tensor-Voigt (kbar):      -49.22      -49.22      -49.22       -2.69       -2.69       -2.69
5774
6787
(Free)E + p*V (eV/cell)    -6791.5202
5779
6792
        -0.001676   -0.030722   -0.001676
5780
6793
        -0.001676   -0.001676   -0.030722
5781
6794
 
5782
 
siesta: Pressure (static):         49.22280758  kBar
 
6795
siesta: Pressure (static):         49.22280717  kBar
5783
6796
 
5784
6797
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5785
6798
        -0.030723   -0.001676   -0.001676
5786
6799
        -0.001676   -0.030723   -0.001676
5787
6800
        -0.001676   -0.001676   -0.030723
5788
6801
 
5789
 
siesta: Pressure (total):         49.22418472  kBar
 
6802
siesta: Pressure (total):         49.22418432  kBar
5790
6803
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5791
6804
FIRE:     60    7.2579  20    0.0869      0.0025
5792
6805
 
5806
6819
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5807
6820
<dSpData1D:S at geom step 61
5808
6821
  <sparsity:sparsity for geom step 61
5809
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5810
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6822
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6823
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5811
6824
refcount: 1>
5812
 
New_DM. Step:    61
 
6825
new_DM -- step:    61
5813
6826
Initializing Density Matrix...
5814
 
DM after filling with atomic data:
5815
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6827
DM filled with atomic data:
 
6828
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5816
6829
  <sparsity:sparsity for geom step 61
5817
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5818
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6830
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6831
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5819
6832
refcount: 1>
 
6833
 
 
6834
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5820
6835
New grid distribution:   1
5821
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5822
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5823
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5824
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6836
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6837
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6838
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6839
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6840
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6841
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6842
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6843
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5825
6844
 
5826
6845
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5827
6846
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5828
6847
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5829
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6848
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5830
6849
New grid distribution:   2
5831
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5832
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5833
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5834
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6850
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6851
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6852
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6853
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6854
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6855
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6856
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6857
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5835
6858
New grid distribution:   3
5836
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5837
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5838
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5839
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6859
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6860
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6861
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6862
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6863
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6864
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6865
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6866
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5840
6867
Setting up quadratic distribution...
5841
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5842
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5843
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65252
5844
 
 
5845
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124450
5846
 
 
5847
 
 
5848
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124450
5849
 
 
 
6868
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6869
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6870
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32411
 
6871
 
 
6872
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124450
 
6873
 
 
6874
 
 
6875
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124450
 
6876
 
 
6877
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6878
Geom step, scf iteration, dmax:  61  1    0.863463
5850
6879
 
5851
6880
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6881
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5852
6882
 
5853
6883
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5854
6884
----------------------------------------
5855
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
6885
   Tot    0.000000    0.000000    0.000000
5856
6886
----------------------------------------
5857
6887
   Max    0.026149
5858
6888
   Res    0.009744    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5868
6898
        -0.001922   -0.031171   -0.001922
5869
6899
        -0.001922   -0.001922   -0.031171
5870
6900
 
5871
 
siesta: Pressure (static):         49.94142005  kBar
 
6901
siesta: Pressure (static):         49.94141991  kBar
5872
6902
 
5873
6903
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5874
6904
        -0.031171   -0.001922   -0.001922
5875
6905
        -0.001922   -0.031171   -0.001922
5876
6906
        -0.001922   -0.001922   -0.031171
5877
6907
 
5878
 
siesta: Pressure (total):         49.94278638  kBar
 
6908
siesta: Pressure (total):         49.94278623  kBar
5879
6909
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5880
6910
FIRE:     61    3.6289   0    0.1000      0.0000
5881
6911
 
5895
6925
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5896
6926
<dSpData1D:S at geom step 62
5897
6927
  <sparsity:sparsity for geom step 62
5898
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5899
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
6928
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
6929
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5900
6930
refcount: 1>
5901
 
New_DM. Step:    62
 
6931
new_DM -- step:    62
5902
6932
Initializing Density Matrix...
5903
 
DM after filling with atomic data:
5904
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
6933
DM filled with atomic data:
 
6934
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5905
6935
  <sparsity:sparsity for geom step 62
5906
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5907
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
6936
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
6937
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5908
6938
refcount: 1>
 
6939
 
 
6940
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5909
6941
New grid distribution:   1
5910
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5911
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5912
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5913
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6942
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
6943
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
6944
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
6945
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
6946
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
6947
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
6948
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
6949
           8       1:   24   13:   24   19:   24
5914
6950
 
5915
6951
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
5916
6952
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
5917
6953
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
5918
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
6954
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
5919
6955
New grid distribution:   2
5920
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5921
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5922
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5923
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6956
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6957
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6958
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6959
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6960
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6961
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6962
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6963
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5924
6964
New grid distribution:   3
5925
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
5926
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
5927
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
5928
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
6965
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
6966
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
6967
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
6968
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
6969
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
6970
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
6971
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
6972
           8       1:   12   13:   24    1:   12
5929
6973
Setting up quadratic distribution...
5930
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
5931
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
5932
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65252
5933
 
 
5934
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124645
5935
 
 
5936
 
 
5937
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124645
5938
 
 
 
6974
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
6975
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
6976
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32411
 
6977
 
 
6978
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124645
 
6979
 
 
6980
 
 
6981
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124645
 
6982
 
 
6983
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
6984
Geom step, scf iteration, dmax:  62  1    0.863519
5939
6985
 
5940
6986
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
6987
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5941
6988
 
5942
6989
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
5943
6990
----------------------------------------
5944
 
   Tot   -0.000000    0.000000   -0.000000
 
6991
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
5945
6992
----------------------------------------
5946
6993
   Max    0.020105
5947
6994
   Res    0.006997    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
5957
7004
        -0.001945   -0.031093   -0.001945
5958
7005
        -0.001945   -0.001945   -0.031093
5959
7006
 
5960
 
siesta: Pressure (static):         49.81642638  kBar
 
7007
siesta: Pressure (static):         49.81642684  kBar
5961
7008
 
5962
7009
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
5963
7010
        -0.031093   -0.001945   -0.001945
5964
7011
        -0.001945   -0.031093   -0.001945
5965
7012
        -0.001945   -0.001945   -0.031093
5966
7013
 
5967
 
siesta: Pressure (total):         49.81642638  kBar
 
7014
siesta: Pressure (total):         49.81642684  kBar
5968
7015
FIRE: istep, dt, firenpos, firealf, magv
5969
7016
FIRE:     62    3.6289   1    0.1000      0.0004
5970
7017
 
5984
7031
outcell: Cell volume (Ang**3)        :   1280.8241
5985
7032
<dSpData1D:S at geom step 63
5986
7033
  <sparsity:sparsity for geom step 63
5987
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 7>
5988
 
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=8432, refcount: 1>
 
7034
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 7>
 
7035
  <dData1D:(new from dSpData1D) n=5616, refcount: 1>
5989
7036
refcount: 1>
5990
 
New_DM. Step:    63
 
7037
new_DM -- step:    63
5991
7038
Initializing Density Matrix...
5992
 
DM after filling with atomic data:
5993
 
<dSpData2D:(DM initialized from atoms)
 
7039
DM filled with atomic data:
 
7040
<dSpData2D:DM initialized from atoms
5994
7041
  <sparsity:sparsity for geom step 63
5995
 
    nrows_g=257 nrows=72 sparsity=.1277 nnzs=8432, refcount: 8>
5996
 
  <dData2D:(DMatomic) n=8432 m=1, refcount: 1>
 
7042
    nrows_g=257 nrows=48 sparsity=.0850 nnzs=5616, refcount: 8>
 
7043
  <dData2D:DM n=5616 m=1, refcount: 1>
5997
7044
refcount: 1>
 
7045
 
 
7046
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
5998
7047
New grid distribution:   1
5999
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
6000
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
6001
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
6002
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
7048
           1       1:   24    1:   12    1:    6
 
7049
           2       1:   24    1:   12    7:   12
 
7050
           3       1:   24    1:   12   13:   18
 
7051
           4       1:   24    1:   12   19:   24
 
7052
           5       1:   24   13:   24    1:    6
 
7053
           6       1:   24   13:   24    7:   12
 
7054
           7       1:   24   13:   24   13:   18
 
7055
           8       1:   24   13:   24   19:   24
6003
7056
 
6004
7057
InitMesh: MESH =    48 x    48 x    48 =      110592
6005
7058
InitMesh: (bp) =    24 x    24 x    24 =       13824
6006
7059
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =    40.000    53.991 Ry
6007
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
 
7060
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    30 =       51840
6008
7061
New grid distribution:   2
6009
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
6010
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
6011
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
6012
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
7062
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
7063
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
7064
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
7065
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
7066
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
7067
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
7068
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
7069
           8       1:   12   13:   24    1:   12
6013
7070
New grid distribution:   3
6014
 
           1       1:   24    1:   12    1:   12
6015
 
           2       1:   24    1:   12   13:   24
6016
 
           3       1:   24   13:   24    1:   12
6017
 
           4       1:   24   13:   24   13:   24
 
7071
           1       1:   12   13:   24   13:   24
 
7072
           2      13:   24    1:   12    1:   12
 
7073
           3      13:   24    1:   12   13:   24
 
7074
           4      13:   24   13:   24    1:   12
 
7075
           5       1:   12    1:   12   13:   24
 
7076
           6       1:   12    1:   12    1:   12
 
7077
           7      13:   24   13:   24   13:   24
 
7078
           8       1:   12   13:   24    1:   12
6018
7079
Setting up quadratic distribution...
6019
 
ExtMesh (bp) on 0 =    48 x    36 x    36 =       62208
6020
 
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 3456
6021
 
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                65252
6022
 
 
6023
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124735
6024
 
 
6025
 
 
6026
 
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124735
6027
 
 
 
7080
ExtMesh (bp) on 0 =    36 x    36 x    36 =       46656
 
7081
PhiOnMesh: Number of (b)points on node 0 =                 1728
 
7082
PhiOnMesh: nlist on node 0 =                32411
 
7083
 
 
7084
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124735
 
7085
 
 
7086
 
 
7087
siesta: Eharris(eV) =   -6832.124735
 
7088
 
 
7089
SCF_NOT_CONV: SCF did not converge in maximum number of steps.
 
7090
Geom step, scf iteration, dmax:  63  1    0.863540
6028
7091
 
6029
7092
Using DM_out to compute the final energy and forces
 
7093
No. of atoms with KB's overlaping orbs in proc 0. Max # of overlaps:      34      24
6030
7094
 
6031
7095
siesta: Atomic forces (eV/Ang):
6032
7096
----------------------------------------
6033
 
   Tot   -0.000000   -0.000000   -0.000000
 
7097
   Tot    0.000000   -0.000000    0.000000
6034
7098
----------------------------------------
6035
7099
   Max    0.009790
6036
7100
   Res    0.004009    sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
6046
7110
        -0.001872   -0.031018   -0.001872
6047
7111
        -0.001872   -0.001872   -0.031018
6048
7112
 
6049
 
siesta: Pressure (static):         49.69761349  kBar
 
7113
siesta: Pressure (static):         49.69761431  kBar
6050
7114
 
6051
7115
siesta: Stress tensor (total) (eV/Ang**3):
6052
7116
        -0.031018   -0.001872   -0.001872
6053
7117
        -0.001872   -0.031018   -0.001872
6054
7118
        -0.001872   -0.001872   -0.031018
6055
7119
 
6056
 
siesta: Pressure (total):         49.69764780  kBar
 
7120
siesta: Pressure (total):         49.69764862  kBar
6057
7121
 
6058
7122
outcoor: Relaxed atomic coordinates (scaled):               
6059
7123
   -0.00000485   -0.00000485   -0.00000485   1       1  Si
6064
7128
    0.74911820    0.24914622    0.74911820   1       6  Si
6065
7129
    0.49947078    0.49947078   -0.00174822   1       7  Si
6066
7130
    0.74911820    0.74911820    0.24914622   1       8  Si
6067
 
    0.99965940    0.00169872    0.00169872   1       9  Si
6068
 
    1.25034060    0.24830128    0.24830128   1      10  Si
 
7131
    0.99965940    0.00169873    0.00169873   1       9  Si
 
7132
    1.25034060    0.24830127    0.24830127   1      10  Si
6069
7133
    0.99847216    0.49523600    0.49523600   1      11  Si
6070
7134
    1.25256849    0.73904643    0.73904643   1      12  Si
6071
7135
    1.49897585    0.00003695    0.50070940   1      13  Si
6072
7136
    1.74929060    0.24996305    0.75102415   1      14  Si
6073
7137
    1.49897585    0.50070940    0.00003695   1      15  Si
6074
7138
    1.74929060    0.75102415    0.24996305   1      16  Si
6075
 
    0.00169872    0.99965940    0.00169872   1      17  Si
6076
 
    0.24830128    1.25034060    0.24830128   1      18  Si
 
7139
    0.00169873    0.99965940    0.00169872   1      17  Si
 
7140
    0.24830127    1.25034060    0.24830127   1      18  Si
6077
7141
    0.00003695    1.49897585    0.50070940   1      19  Si
6078
7142
    0.24996305    1.74929060    0.75102415   1      20  Si
6079
7143
    0.49523600    0.99847216    0.49523600   1      21  Si
6080
7144
    0.73904643    1.25256849    0.73904643   1      22  Si
6081
7145
    0.50070940    1.49897585    0.00003695   1      23  Si
6082
7146
    0.75102415    1.74929060    0.24996305   1      24  Si
6083
 
    0.00169872    0.00169872    0.99965940   1      25  Si
6084
 
    0.24830128    0.24830128    1.25034060   1      26  Si
 
7147
    0.00169873    0.00169873    0.99965940   1      25  Si
 
7148
    0.24830127    0.24830127    1.25034060   1      26  Si
6085
7149
    0.00003695    0.50070940    1.49897585   1      27  Si
6086
7150
    0.24996305    0.75102415    1.74929060   1      28  Si
6087
7151
    0.50070940    0.00003695    1.49897585   1      29  Si
6090
7154
    0.73904643    0.73904643    1.25256849   1      32  Si
6091
7155
    0.99984001    0.99984001    0.00085257   1      33  Si
6092
7156
    1.25015999    1.25015999    0.24914743   1      34  Si
6093
 
    1.00146700    1.49930500    0.49957947   1      35  Si
 
7157
    1.00146700    1.49930501    0.49957947   1      35  Si
6094
7158
    1.24853300    1.75042053    0.75069500   1      36  Si
6095
 
    1.49930500    1.00146700    0.49957947   1      37  Si
 
7159
    1.49930501    1.00146700    0.49957947   1      37  Si
6096
7160
    1.75042053    1.24853300    0.75069500   1      38  Si
6097
7161
    1.50088180    1.50088180    0.00085378   1      39  Si
6098
7162
    1.75052922    1.75052922    0.25174822   1      40  Si
6099
7163
    0.99984001    0.00085257    0.99984001   1      41  Si
6100
7164
    1.25015999    0.24914743    1.25015999   1      42  Si
6101
 
    1.00146700    0.49957947    1.49930500   1      43  Si
 
7165
    1.00146700    0.49957947    1.49930501   1      43  Si
6102
7166
    1.24853300    0.75069500    1.75042053   1      44  Si
6103
7167
    1.50088180    0.00085378    1.50088180   1      45  Si
6104
7168
    1.75052922    0.25174822    1.75052922   1      46  Si
6105
 
    1.49930500    0.49957947    1.00146700   1      47  Si
 
7169
    1.49930501    0.49957947    1.00146700   1      47  Si
6106
7170
    1.75042053    0.75069500    1.24853300   1      48  Si
6107
7171
    0.00085257    0.99984001    0.99984001   1      49  Si
6108
7172
    0.24914743    1.25015999    1.25015999   1      50  Si
6109
7173
    0.00085378    1.50088180    1.50088180   1      51  Si
6110
7174
    0.25174822    1.75052922    1.75052922   1      52  Si
6111
 
    0.49957947    1.00146700    1.49930500   1      53  Si
 
7175
    0.49957947    1.00146700    1.49930501   1      53  Si
6112
7176
    0.75069500    1.24853300    1.75042053   1      54  Si
6113
 
    0.49957947    1.49930500    1.00146700   1      55  Si
 
7177
    0.49957947    1.49930501    1.00146700   1      55  Si
6114
7178
    0.75069500    1.75042053    1.24853300   1      56  Si
6115
7179
    0.94954240    0.94954240    0.94954240   1      57  Si
6116
7180
    1.30045760    1.30045760    1.30045760   1      58  Si
6123
7187
    1.12500000    1.12500000    1.12500000   2      65  H
6124
7188
 
6125
7189
siesta: Program's energy decomposition (eV):
6126
 
siesta: Ebs     =     -1985.324035
 
7190
siesta: Ebs     =     -1985.324036
6127
7191
siesta: Eions   =     12205.375272
6128
7192
siesta: Ena     =      3580.587855
6129
7193
siesta: Ekin    =      2732.770470
6133
7197
siesta: DEna    =       197.450969
6134
7198
siesta: DUscf   =         5.558051
6135
7199
siesta: DUext   =         0.000000
6136
 
siesta: Exc     =     -2100.153128
 
7200
siesta: Exc     =     -2100.153129
6137
7201
siesta: eta*DQ  =         0.000000
6138
7202
siesta: Emadel  =         0.000000
6139
7203
siesta: Emeta   =         0.000000
6140
7204
siesta: Emolmec =         0.000000
6141
7205
siesta: Ekinion =         0.000041
6142
 
siesta: Eharris =     -6832.124693
6143
 
siesta: Etot    =     -6830.836612
 
7206
siesta: Eharris =     -6832.124694
 
7207
siesta: Etot    =     -6830.836613
6144
7208
siesta: FreeEng =     -6830.871270
6145
7209
 
6146
7210
siesta: Final energy (eV):
6147
 
siesta:  Band Struct. =   -1985.324035
 
7211
siesta:  Band Struct. =   -1985.324036
6148
7212
siesta:       Kinetic =    2732.770470
6149
7213
siesta:       Hartree =     493.162455
6150
7214
siesta:       Eldau   =       0.000000
6151
7215
siesta:       Eso     =       0.000000
6152
7216
siesta:    Ext. field =       0.000000
6153
 
siesta:   Exch.-corr. =   -2100.153128
6154
 
siesta:  Ion-electron =   -3000.435872
6155
 
siesta:       Ion-ion =   -4956.180578
 
7217
siesta:   Exch.-corr. =   -2100.153129
 
7218
siesta:  Ion-electron =   -3000.435874
 
7219
siesta:       Ion-ion =   -4956.180577
6156
7220
siesta:       Ekinion =       0.000041
6157
 
siesta:         Total =   -6830.836612
 
7221
siesta:         Total =   -6830.836613
6158
7222
siesta:         Fermi =      -1.286537
6159
7223
 
6160
7224
siesta: Stress tensor (static) (eV/Ang**3):
6168
7232
siesta:                Solid            Molecule  Units
6169
7233
siesta:           0.00033783          0.00033874  Ry/Bohr**3
6170
7234
siesta:           0.03101848          0.03110228  eV/Ang**3
6171
 
siesta:          49.69761349         49.83188715  kBar
6172
 
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =       -6818.317331
6173
 
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =       -6819.605412
6174
 
>> End of run:  18-AUG-2016   9:11:36
 
7235
siesta:          49.69761431         49.83188278  kBar
 
7236
(Free)E+ p_basis*V_orbitals  =       -6818.317332
 
7237
(Free)Eharris+ p_basis*V_orbitals  =       -6819.605413
 
7238
>> End of run:   2-JUL-2017  12:01:12
 
7239
Job completed