← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/stretch/openbabel/stretch

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/obprop.html

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Michael Banck
  • Date: 2008-07-22 23:54:58 UTC
  • mfrom: (3.1.10 intrepid)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080722235458-3o606czluviz4akx
Tags: 2.2.0-2
* Upload to unstable.
* debian/control: Updated descriptions.
* debian/patches/gauss_cube_format.patch: New patch, makes the 
  gaussian cube format available again.
* debian/rules (DEB_DH_MAKESHLIBS_ARGS_libopenbabel3): Removed.
* debian/rules (DEB_CONFIGURE_EXTRA_FLAGS): Likewise.
* debian/libopenbabel3.install: Adjust formats directory to single 
  version hierarchy.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
doc/obprop.html
1
 
<!-- manual page source format generated by PolyglotMan v3.0.8+XFree86, -->
 
1
<!-- manual page source format generated by PolyglotMan v3.2, -->
2
2
<!-- available at http://polyglotman.sourceforge.net/ -->
3
3
 
4
4
<html>
5
5
<head>
6
 
<title>man page(1) manual page</title>
 
6
<title>obprop</title>
7
7
</head>
8
 
<body bgcolor='#efefef' text='black' link='blue' vlink='#551A8B' alink='red'>
 
8
<body bgcolor='white'>
9
9
<a href='#toc'>Table of Contents</a><p>
10
10
 
11
11
<h2><a name='sect0' href='#toc0'>Name</a></h2>
32
32
 
33
33
name [<i>Name</i>]<br>
34
34
 
 
35
formula [<i>Formula</i>]<br>
 
36
 
35
37
mol_weight [<i>Molecular</i> <i>Weight</i>]<br>
36
38
 
 
39
exact_mass [<i>Isotopic</i> <i>Mass</i>]<br>
 
40
 
 
41
canonical_SMILES [<i>String</i>]<br>
 
42
 
 
43
num_atoms [<i>Number</i>]<br>
 
44
 
 
45
num_bonds [<i>Number</i>]<br>
 
46
 
 
47
num_residues [<i>Number</i>]<br>
 
48
 
 
49
sequence [<i>Residue</i> <i>Sequence</i>]<br>
 
50
 
37
51
num_rings [<i>Number</i> <i>of</i> <i>Rings</i> <i>(by</i> <i>SSSR)</i>]<br>
38
52
 
 
53
logP [<i>Number</i> <i>(octanol-water</i> <i>partition)</i>]<br>
 
54
 
 
55
PSA [<i>Number</i> <i>(topological</i> <i>polar</i> <i>surface</i> <i>area)</i>]
 
56
MR [<i>Number</i> <i>(molar</i> <i>refractivity)</i>]<br>
 
57
 
39
58
$$$
40
59
 
41
60
<p><p>
42
 
The $$$ is the separator between multiple molecular entries in a file
 
61
The &ldquo;$$$&rdquo; is the separator between multiple molecular entries in a file
43
62
 
44
63
<p>
45
64
<h2><a name='sect3' href='#toc3'><b>Examples</b></a></h2>
46
65
 
47
66
<p>
48
 
obprop pyridines.sdf
 
67
<pre>obprop pyridines.sdf</pre>
49
68
 
50
69
<p>
51
70
<h2><a name='sect4' href='#toc4'><b>See</b> <b>Also</b></a></h2>
52
71
 
53
72
<p>
54
 
<a href='babel.1.html'>babel(1)</a>
55
 
, <a href='obchiral.1.html'>obchiral(1)</a>
56
 
, <a href='obfit.1.html'>obfit(1)</a>
57
 
, <a href='obgrep.1.html'>obgrep(1)</a>
58
 
, <a href='obrotate.1.html'>obrotate(1)</a>
 
73
<a href='babel.html'>babel(1)</a>
 
74
, <a href='obchiral.html'>obchiral(1)</a>
 
75
, <a href='obfit.html'>obfit(1)</a>
 
76
, <a href='obgrep.html'>obgrep(1)</a>
 
77
, <a href='obrotate.html'>obrotate(1)</a>
59
78
.
60
79
 
61
80
<p><p>
62
 
The web pages for Open Babel can be found at: &lt;<b>http://openbabel.sourceforge.net/</b>&gt;
 
81
The web pages for Open Babel can be found at: &lt;<b><a href="http://openbabel.org/">http://openbabel.org/</a></b>&gt;
63
82
 
64
83
<p>
65
84
<h2><a name='sect5' href='#toc5'><b>Authors</b></a></h2>
71
90
Open Babel is developed by a cast of many, including currrent maintainers
72
91
Geoff Hutchison, Chris Morley, Michael Banck, and innumerable others who
73
92
have contributed fixes and additions. For more contributors to Open
74
 
Babel, see &lt;<b>http://openbabel.sourceforge.net/THANKS.shtml</b>&gt;
 
93
Babel, see &lt;<b><a href="http://openbabel.org/wiki/THANKS">http://openbabel.org/wiki/THANKS</a></b>&gt;
75
94
 
76
95
<p>
77
96
<h2><a name='sect6' href='#toc6'><b>Copyright</b></a></h2>
78
97
 
79
98
<p>
80
 
Copyright (C) 1998-2001 by OpenEye Scientific Software, Inc. Some portions
81
 
Copyright (C) 2001-2005 by Geoffrey R. Hutchison and other contributors.
 
99
Copyright (C) 2003 by Fabien Fontaine<br>
 
100
 
 
101
Some portions Copyright (C) 2004-2007 by Geoffrey R. Hutchison and other
 
102
contributors.
82
103
 
83
104
<p><p>
84
105
This program is free software; you can redistribute it and/or modify it