~ubuntu-branches/ubuntu/precise/openwalnut/precise

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#ifndef WMDETTRACTCLUSTERINGCUDAKERNEL_H

#define WMDETTRACTCLUSTERINGCUDAKERNEL_H

 

class ProgressWrapper;

 

/**

 * Initialize upper trigonal matrix distmat with Zhang metric. The longest tract has a length of maxlength points.

 *

 * \param distmat Upper trigonal matrix with Zhang metric.

 * \param ncoords Total number of coords (x,y,z interleaved)

 * \param ntracts How many tracts

 * \param sizes Array of number of coords per tract

 * \param offsets Where the coords of the tracts do start

 * \param threshold The 'proximity threshold

 * \param progress Wrapped WProgress indicator for reporting the progress

 *

 * \return True on success, false otherwise (e.g. if maxlength is longer than can be handled by the CUDA kernel)

 */

extern "C" bool distCuda( float *distmat,

                          const int ncoords,

                          const float *coords,

                          const int ntracts,

                          const int *offsets,

                          const int *sizes,

                          const float threshold,

                          ProgressWrapper *progress );

 

#endif  // WMDETTRACTCLUSTERINGCUDAKERNEL_H