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Viewing changes to dist/etc/jobtypes/permstep.vjt

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Michael Hanke
  • Date: 2010-06-06 11:33:11 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20100606113311-v3c13imdkkd5n7ae
Tags: upstream-1.8.5~svn1172
Import upstream version 1.8.5~svn1172

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Lines of Context:
dist/etc/jobtypes/permstep.vjt
 
1
shortname permstep2 
 
2
description permutes data 
 
3
invocation script
 
4
requires cpu
 
5
 
 
6
argument
 
7
 name=matrixstemname
 
8
 argdesc=name of directory with glm information
 
9
 type=string
 
10
 default=none
 
11
 low=none
 
12
 high=none
 
13
end
 
14
argument
 
15
 name=permdir
 
16
 argdesc=Permutation directory name
 
17
 type=string
 
18
 default=none
 
19
 low=none
 
20
 high=none
 
21
end
 
22
argument
 
23
 name=permtype
 
24
 argdesc=type of permutation
 
25
 type=long
 
26
 default=none
 
27
 low=none
 
28
 high=none
 
29
end
 
30
argument
 
31
 name=steps
 
32
 argdesc=number of steps to process regression
 
33
 type=long
 
34
 default=1
 
35
 low=none
 
36
 high=none
 
37
end
 
38
argument
 
39
 name=contrast
 
40
 argdesc=contrast values
 
41
 type=string
 
42
 default=none
 
43
 low=none
 
44
 high=none
 
45
end
 
46
argument
 
47
 name=pseudot
 
48
 argdesc=pseudot values for smoothing
 
49
 type=string
 
50
 default=0
 
51
 low=none
 
52
 high=none
 
53
end
 
54
argument
 
55
 name=permindex
 
56
 argdesc=index of permutation to be generated
 
57
 type=long
 
58
 default=none
 
59
 low=none
 
60
 high=none
 
61
end
 
62
command permstep -m $(matrixstemname) -d $(permdir) -t $(permtype) -s $(steps) -c $(contrast) -p $(pseudot) -n $(permindex) -e
 
63
 
 
64
 
 
65
 
 
66