← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/oneiric/bioperl/oneiric

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/crab.njb

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Matt Hope
  • Date: 2004-04-18 14:24:11 UTC
  • mfrom: (1.2.1 upstream) (2.1.1 warty)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20040418142411-gr92uexquw4w8liq
Tags: 1.4-1
* New upstream release
* Examples and working code are installed by default to usr/bin,
  this has been moved to usr/share/doc/bioperl/bin

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/crab.njb
 
1
   13 sequences     1000 bootstraping
 
2
1 A-salina
 
3
2 C-vittat
 
4
3 C-sp.
 
5
4 L-aequit
 
6
5 P-camtsc
 
7
6 E-tenuim
 
8
7 L-splend
 
9
8 P-bernha
 
10
9 P-acadia
 
11
10 P-p(NE)
 
12
11 P-p(GU)
 
13
12 P-l(NE)
 
14
13 P-l(GU)
 
15
 14 and   2        0.098857      1000
 
16
 14 and   3        0.127932      1000
 
17
 15 and   1        0.197471      1000
 
18
 15 and  14        0.029273       874
 
19
 16 and  10        0.011732      1000
 
20
 16 and  11        0.004529      1000
 
21
 17 and  12        0.002258      1000
 
22
 17 and  13        0.000428      1000
 
23
 18 and  16        0.017512      1000
 
24
 18 and  17        0.010824       998
 
25
 19 and   4        0.006534      1000
 
26
 19 and   5        0.006992      1000
 
27
 20 and  15        0.070461      1000
 
28
 20 and  18        0.030579       998
 
29
 21 and   8        0.003339      1000
 
30
 21 and   9        0.002042      1000
 
31
 22 and   6        0.011142      1000
 
32
 22 and  21        0.010693       983
 
33
 23 and  20        0.020714       996
 
34
 23 and  19        0.020350      1000
 
35
 24 and  23        0.008665       826
 
36
 24 and  22        0.013457       972
 
37
 24 and   7        0.025598      1000
 
38
 
 
39
JC distance was used
 
40
 
 
41
Number of nucleotide sites compared 373 (nsite=421)
 
42
seed=27165 ninap=0