~ubuntu-branches/ubuntu/oneiric/commons-math/oneiric

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/java/org/apache/commons/math/ode/DormandPrince54Integrator.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
/*
2
 
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
3
 
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
4
 
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
5
 
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
6
 
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
7
 
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
8
 
 *
9
 
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
10
 
 *
11
 
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
12
 
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
13
 
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
14
 
 * See the License for the specific language governing permissions and
15
 
 * limitations under the License.
16
 
 */
17
 
 
18
 
package org.apache.commons.math.ode;
19
 
 
20
 
/**
21
 
 * This class implements the 5(4) Dormand-Prince integrator for Ordinary
22
 
 * Differential Equations.
23
 
 
24
 
 * <p>This integrator is an embedded Runge-Kutta integrator
25
 
 * of order 5(4) used in local extrapolation mode (i.e. the solution
26
 
 * is computed using the high order formula) with stepsize control
27
 
 * (and automatic step initialization) and continuous output. This
28
 
 * method uses 7 functions evaluations per step. However, since this
29
 
 * is an <i>fsal</i>, the last evaluation of one step is the same as
30
 
 * the first evaluation of the next step and hence can be avoided. So
31
 
 * the cost is really 6 functions evaluations per step.</p>
32
 
 *
33
 
 * <p>This method has been published (whithout the continuous output
34
 
 * that was added by Shampine in 1986) in the following article :
35
 
 * <pre>
36
 
 *  A family of embedded Runge-Kutta formulae
37
 
 *  J. R. Dormand and P. J. Prince
38
 
 *  Journal of Computational and Applied Mathematics
39
 
 *  volume 6, no 1, 1980, pp. 19-26
40
 
 * </pre></p>
41
 
 *
42
 
 * @version $Revision: 620312 $ $Date: 2008-02-10 12:28:59 -0700 (Sun, 10 Feb 2008) $
43
 
 * @since 1.2
44
 
 */
45
 
 
46
 
public class DormandPrince54Integrator
47
 
  extends EmbeddedRungeKuttaIntegrator {
48
 
 
49
 
  /** Integrator method name. */
50
 
  private static final String methodName = "Dormand-Prince 5(4)";
51
 
 
52
 
  /** Time steps Butcher array. */
53
 
  private static final double[] staticC = {
54
 
    1.0/5.0, 3.0/10.0, 4.0/5.0, 8.0/9.0, 1.0, 1.0
55
 
  };
56
 
 
57
 
  /** Internal weights Butcher array. */
58
 
  private static final double[][] staticA = {
59
 
    {1.0/5.0},
60
 
    {3.0/40.0, 9.0/40.0},
61
 
    {44.0/45.0, -56.0/15.0, 32.0/9.0},
62
 
    {19372.0/6561.0, -25360.0/2187.0, 64448.0/6561.0,  -212.0/729.0},
63
 
    {9017.0/3168.0, -355.0/33.0, 46732.0/5247.0, 49.0/176.0, -5103.0/18656.0},
64
 
    {35.0/384.0, 0.0, 500.0/1113.0, 125.0/192.0, -2187.0/6784.0, 11.0/84.0}
65
 
  };
66
 
 
67
 
  /** Propagation weights Butcher array. */
68
 
  private static final double[] staticB = {
69
 
    35.0/384.0, 0.0, 500.0/1113.0, 125.0/192.0, -2187.0/6784.0, 11.0/84.0, 0.0
70
 
  };
71
 
 
72
 
  /** Error array, element 1. */
73
 
  private static final double e1 =     71.0 / 57600.0;
74
 
 
75
 
  // element 2 is zero, so it is neither stored nor used
76
 
 
77
 
  /** Error array, element 3. */
78
 
  private static final double e3 =    -71.0 / 16695.0;
79
 
 
80
 
  /** Error array, element 4. */
81
 
  private static final double e4 =     71.0 / 1920.0;
82
 
 
83
 
  /** Error array, element 5. */
84
 
  private static final double e5 = -17253.0 / 339200.0;
85
 
 
86
 
  /** Error array, element 6. */
87
 
  private static final double e6 =     22.0 / 525.0;
88
 
 
89
 
  /** Error array, element 7. */
90
 
  private static final double e7 =     -1.0 / 40.0;
91
 
 
92
 
  /** Simple constructor.
93
 
   * Build a fifth order Dormand-Prince integrator with the given step bounds
94
 
   * @param minStep minimal step (must be positive even for backward
95
 
   * integration), the last step can be smaller than this
96
 
   * @param maxStep maximal step (must be positive even for backward
97
 
   * integration)
98
 
   * @param scalAbsoluteTolerance allowed absolute error
99
 
   * @param scalRelativeTolerance allowed relative error
100
 
   */
101
 
  public DormandPrince54Integrator(double minStep, double maxStep,
102
 
                                   double scalAbsoluteTolerance,
103
 
                                   double scalRelativeTolerance) {
104
 
    super(true, staticC, staticA, staticB, new DormandPrince54StepInterpolator(),
105
 
          minStep, maxStep, scalAbsoluteTolerance, scalRelativeTolerance);
106
 
  }
107
 
 
108
 
  /** Simple constructor.
109
 
   * Build a fifth order Dormand-Prince integrator with the given step bounds
110
 
   * @param minStep minimal step (must be positive even for backward
111
 
   * integration), the last step can be smaller than this
112
 
   * @param maxStep maximal step (must be positive even for backward
113
 
   * integration)
114
 
   * @param vecAbsoluteTolerance allowed absolute error
115
 
   * @param vecRelativeTolerance allowed relative error
116
 
   */
117
 
  public DormandPrince54Integrator(double minStep, double maxStep,
118
 
                                   double[] vecAbsoluteTolerance,
119
 
                                   double[] vecRelativeTolerance) {
120
 
    super(true, staticC, staticA, staticB, new DormandPrince54StepInterpolator(),
121
 
          minStep, maxStep, vecAbsoluteTolerance, vecRelativeTolerance);
122
 
  }
123
 
 
124
 
  /** Get the name of the method.
125
 
   * @return name of the method
126
 
   */
127
 
  public String getName() {
128
 
    return methodName;
129
 
  }
130
 
 
131
 
  /** Get the order of the method.
132
 
   * @return order of the method
133
 
   */
134
 
  public int getOrder() {
135
 
    return 5;
136
 
  }
137
 
 
138
 
  /** Compute the error ratio.
139
 
   * @param yDotK derivatives computed during the first stages
140
 
   * @param y0 estimate of the step at the start of the step
141
 
   * @param y1 estimate of the step at the end of the step
142
 
   * @param h  current step
143
 
   * @return error ratio, greater than 1 if step should be rejected
144
 
   */
145
 
  protected double estimateError(double[][] yDotK,
146
 
                                 double[] y0, double[] y1,
147
 
                                 double h) {
148
 
 
149
 
    double error = 0;
150
 
 
151
 
    for (int j = 0; j < y0.length; ++j) {
152
 
      double errSum = e1 * yDotK[0][j] +  e3 * yDotK[2][j] +
153
 
                      e4 * yDotK[3][j] +  e5 * yDotK[4][j] +
154
 
                      e6 * yDotK[5][j] +  e7 * yDotK[6][j];
155
 
 
156
 
      double yScale = Math.max(Math.abs(y0[j]), Math.abs(y1[j]));
157
 
      double tol = (vecAbsoluteTolerance == null) ?
158
 
                   (scalAbsoluteTolerance + scalRelativeTolerance * yScale) :
159
 
                   (vecAbsoluteTolerance[j] + vecRelativeTolerance[j] * yScale);
160
 
      double ratio  = h * errSum / tol;
161
 
      error += ratio * ratio;
162
 
 
163
 
    }
164
 
 
165
 
    return Math.sqrt(error / y0.length);
166
 
 
167
 
  }
168
 
 
169
 
}