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Viewing changes to src/test/java/org/apache/commons/math/distribution/FDistributionTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

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removed removed

Lines of Context:
src/test/java/org/apache/commons/math/distribution/FDistributionTest.java
 
1
/*
 
2
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
 
3
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
 
4
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
 
5
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
 
6
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
 
7
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
 
8
 * 
 
9
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 
10
 * 
 
11
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 
12
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
 
13
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
 
14
 * See the License for the specific language governing permissions and
 
15
 * limitations under the License.
 
16
 */
 
17
package org.apache.commons.math.distribution;
 
18
 
 
19
 
 
20
/**
 
21
 * Test cases for FDistribution.
 
22
 * Extends ContinuousDistributionAbstractTest.  See class javadoc for
 
23
 * ContinuousDistributionAbstractTest for details.
 
24
 * 
 
25
 * @version $Revision: 762087 $ $Date: 2009-04-05 10:20:18 -0400 (Sun, 05 Apr 2009) $
 
26
 */
 
27
public class FDistributionTest extends ContinuousDistributionAbstractTest {
 
28
 
 
29
    /**
 
30
     * Constructor for FDistributionTest.
 
31
     * @param name
 
32
     */
 
33
    public FDistributionTest(String name) {
 
34
        super(name);
 
35
    }
 
36
 
 
37
    //-------------- Implementations for abstract methods -----------------------
 
38
    
 
39
    /** Creates the default continuous distribution instance to use in tests. */
 
40
    @Override
 
41
    public ContinuousDistribution makeDistribution() {
 
42
        return new FDistributionImpl(5.0, 6.0);
 
43
    }   
 
44
    
 
45
    /** Creates the default cumulative probability distribution test input values */
 
46
    @Override
 
47
    public double[] makeCumulativeTestPoints() {
 
48
        // quantiles computed using R version 1.8.1 (linux version)
 
49
        return new double[] {0.03468084d ,0.09370091d, 0.1433137d,
 
50
            0.2020084d, 0.2937283d, 20.80266d, 8.745895d, 5.987565d, 
 
51
            4.387374d, 3.107512d};
 
52
    }
 
53
    
 
54
    /** Creates the default cumulative probability density test expected values */
 
55
    @Override
 
56
    public double[] makeCumulativeTestValues() {
 
57
        return new double[] {0.001d, 0.01d, 0.025d, 0.05d, 0.1d, 0.999d,
 
58
                0.990d, 0.975d, 0.950d, 0.900d}; 
 
59
    }
 
60
    
 
61
    // --------------------- Override tolerance  --------------
 
62
    @Override
 
63
    protected void setUp() throws Exception {
 
64
        super.setUp();
 
65
        setTolerance(4e-6);
 
66
    }
 
67
 
 
68
    //---------------------------- Additional test cases -------------------------
 
69
 
 
70
    public void testCumulativeProbabilityExtremes() throws Exception {
 
71
        setCumulativeTestPoints(new double[] {-2, 0});
 
72
        setCumulativeTestValues(new double[] {0, 0});
 
73
        verifyCumulativeProbabilities();
 
74
    }
 
75
 
 
76
    public void testInverseCumulativeProbabilityExtremes() throws Exception {
 
77
        setInverseCumulativeTestPoints(new double[] {0, 1});
 
78
        setInverseCumulativeTestValues(new double[] {0, Double.POSITIVE_INFINITY});
 
79
        verifyInverseCumulativeProbabilities();
 
80
    }
 
81
    
 
82
    public void testDfAccessors() {
 
83
        FDistribution distribution = (FDistribution) getDistribution();
 
84
        assertEquals(5d, distribution.getNumeratorDegreesOfFreedom(), Double.MIN_VALUE);
 
85
        distribution.setNumeratorDegreesOfFreedom(4d);
 
86
        assertEquals(4d, distribution.getNumeratorDegreesOfFreedom(), Double.MIN_VALUE);
 
87
        assertEquals(6d, distribution.getDenominatorDegreesOfFreedom(), Double.MIN_VALUE);
 
88
        distribution.setDenominatorDegreesOfFreedom(4d);
 
89
        assertEquals(4d, distribution.getDenominatorDegreesOfFreedom(), Double.MIN_VALUE);
 
90
        try {
 
91
            distribution.setNumeratorDegreesOfFreedom(0d);
 
92
            fail("Expecting IllegalArgumentException for df = 0");
 
93
        } catch (IllegalArgumentException ex) {
 
94
            // expected
 
95
        }
 
96
        try {
 
97
            distribution.setDenominatorDegreesOfFreedom(0d);
 
98
            fail("Expecting IllegalArgumentException for df = 0");
 
99
        } catch (IllegalArgumentException ex) {
 
100
            // expected
 
101
        }
 
102
    } 
 
103
 
 
104
    public void testLargeDegreesOfFreedom() throws Exception {
 
105
        org.apache.commons.math.distribution.FDistributionImpl fd =
 
106
            new org.apache.commons.math.distribution.FDistributionImpl(
 
107
                100000., 100000.);
 
108
        double p = fd.cumulativeProbability(.999);
 
109
        double x = fd.inverseCumulativeProbability(p);
 
110
        assertEquals(.999, x, 1.0e-5);
 
111
    }
 
112
 
 
113
    public void testSmallDegreesOfFreedom() throws Exception {
 
114
        org.apache.commons.math.distribution.FDistributionImpl fd =
 
115
            new org.apache.commons.math.distribution.FDistributionImpl(
 
116
                1.0, 1.0);
 
117
        double p = fd.cumulativeProbability(0.975);
 
118
        double x = fd.inverseCumulativeProbability(p);
 
119
        assertEquals(0.975, x, 1.0e-5);
 
120
 
 
121
        fd.setDenominatorDegreesOfFreedom(2.0);
 
122
        p = fd.cumulativeProbability(0.975);
 
123
        x = fd.inverseCumulativeProbability(p);
 
124
        assertEquals(0.975, x, 1.0e-5);
 
125
    }
 
126
 
 
127
}