← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/warty/ncbi-tools6/warty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/KSpyr.flt

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2002-04-04 22:13:09 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20020404221309-vfze028rfnlrldct
Tags: upstream-6.1.20011220a
Import upstream version 6.1.20011220a

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
data/KSpyr.flt
 
1
; comments must have a semicolon in the first column or else
 
2
; unpredictable behavior after reading the file will result
 
3
; the first value is the type of filter; the second is info; then data
 
4
1                   1 = filter      2 = matrix
 
5
250                 if 1, window    if 2, cutoff
 
6
0                   { symbol "A", name "Adenine" },
 
7
67                  { symbol "B" , name "G or T or C" },
 
8
100                 { symbol "C", name "Cytosine" },
 
9
33                  { symbol "D", name "G or A or T" },
 
10
;                   { symbol "", name "" },
 
11
;                   { symbol "", name "" },
 
12
0                   { symbol "G", name "Guanine" },
 
13
67                  { symbol "H", name "A or C or T" } ,
 
14
;                   { symbol "", name "" },
 
15
;                   { symbol "", name "" },
 
16
50                  { symbol "K", name "G or T" },
 
17
;                   { symbol "", name ""},
 
18
50                  { symbol "M", name "A or C" },
 
19
50                  { symbol "N", name "A or G or C or T" } ,
 
20
;                   { symbol "", name "" },
 
21
;                   { symbol "", name "" },
 
22
;                   { symbol "", name ""},
 
23
0                   { symbol "R", name "G or A"},
 
24
50                  { symbol "S", name "G or C"},
 
25
100                 { symbol "T", name "Thymine"},
 
26
;                   { symbol "", name ""},
 
27
33                  { symbol "V", name "G or C or A"},
 
28
0                   { symbol "W", name "A or T" },
 
29
;                   { symbol "", name ""},
 
30
100                 { symbol "Y", name "T or C"}